BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-162M02
Chromosome15 (Build37)
Map Location 94,121,404 - 94,281,485
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdamts20
Upstream geneYaf2, Zcrb1, Pphln1, LOC627623, Prickle1, Zfp42-ps1, LOC100042627, LOC100042631, D630010B17Rik
Downstream genePus7l, Irak4, Twf1, Tmem117, LOC100043315, Nell2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-162M02.bB6Ng01-162M02.g
ACCDH955513DH955514
length4531,113
definitionDH955513|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-162M02, 5' end.DH955514|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-162M02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(94,121,404 - 94,121,862)(94,280,361 - 94,281,485)
sequence
ataacctcaaaaaatgaagtcaaaatgaagtcactgaattattttaccaa
tagaattaagcaaaggcaacaatactgtacagtgcagaaaatgccacaat
gaaagacactctgaagaaataaaactttcaaaactacttcaaacaactac
tgagcttgggatgttaaaatgtaagtataaatatctagagatagttagat
agatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatacatag
atacatagatacatagatagatacatagatagatacatagatagatacat
agatagatacatagatagacacatagatagatacatagatagatgataga
tagacagacagacagacagacagacagacagatagatagatgatagatgg
atggatagatgaatagatagatgatagataaatagatagatgatagatag
ata
gaattctttatttactgaggtgttgttgtccattaagtagtcaggaactt
aagtaagataaacacatttccccagcctcattcttggggactatgtcaaa
gacaactgcgtatttcccaggatcaagagttgaatcagaagtccagcagc
tggttaaatgcgcaatgagatatcacagtttactttctaggacttgcaag
agctttcaaactggccattgtacgtcttagaaggtgatggaggaatgagg
attctttttcatccgaatcagttgtaaaatggcacctaacaacttaaatt
cccatcagtggcaagattttccctgtccaatctatttaattattagtgca
gcaggaggcctgtgattggccagggaaaagggaggtggagctaagagttg
cagggacagagagcaactcaggagggaggggggaaagaggcaagctggaa
ggtggtgaacaggatgtggctttaaatagccacaggtaaatatgttatcc
tatagagatagaataattagggtaccttgtctaatctaagtaggcagctt
gtaccatcattcaattggccctgaaattattgtgtgggcgtcttgtgaat
tgagaatttattgatatataaatctgtctaactataagcttctagagttt
tgtttctactgggttgctgggtgttgtggcagttgacagaggggtgggct
gtcgttgcgtggggctggcatggtagtgacctgccaagggaacttaggga
atccggtacagacatttcaggtgctctaggccggaaaccactgagtggag
aacacccggctggagctattcctgcaacacccatcagaaatagaaggcag
cacaggttgttacatagtcatgagcaggtggttgctgagtagagaagaga
cgttacattaatgcaaacattctcatgggggtggcagagctactgtgctg
tatgggaaaaactagaggattatgctagatggggcaaactgtaactttgc
aagtttatttgtactgtttgtgttttaatatagtacacaaaagcaacaga
tgtgggccactatgctgtgcacaaacaggagacaaaggtgaatctcttaa
acattagctttgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_94121404_94121862
seq2: B6Ng01-162M02.b_44_502

seq1  GAATTCATAACCTCAAAAAATGAAGTCAAAATGAAGTCACTGAATTATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATAACCTCAAAAAATGAAGTCAAAATGAAGTCACTGAATTATTT  50

seq1  TACCAATAGAATTAAGCAAAGGCAACAATACTGTACAGTGCAGAAAATGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAATAGAATTAAGCAAAGGCAACAATACTGTACAGTGCAGAAAATGC  100

seq1  CACAATGAAAGACACTCTGAAGAAATAAAACTTTCAAAACTACTTCAAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATGAAAGACACTCTGAAGAAATAAAACTTTCAAAACTACTTCAAAC  150

seq1  AACTACTGAGCTTGGGATGTTAAAATGTAAGTATAAATATCTAGAGATAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTACTGAGCTTGGGATGTTAAAATGTAAGTATAAATATCTAGAGATAG  200

seq1  TTAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT  250

seq1  ACATAGATACATAGATACATAGATAGATACATAGATAGATACATAGATAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGATACATAGATACATAGATAGATACATAGATAGATACATAGATAG  300

seq1  ATACATAGATAGATACATAGATAGACACATAGATAGATACATAGATAGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATAGATAGATACATAGATAGACACATAGATAGATACATAGATAGAT  350

seq1  GATAGATAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGATAGATAGATGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGATAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGATAGATAGATGAT  400

seq1  AGATGGATGGATAGATGAATAGATAGATGATAGATAAATAGATAGATGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGATGGATAGATGAATAGATAGATGATAGATAAATAGATAGATGAT  450

seq1  AGATAGATA  459
      |||||||||
seq2  AGATAGATA  459

seq1: chr15_94280361_94281485
seq2: B6Ng01-162M02.g_69_1181 (reverse)

seq1  ACAAAGCTAATGTTTTAGGAGAATCACCTTTGTGCTCCTGTTTGGTGCAC  50
      |||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||
seq2  ACAAAGCTAATG-TTTAAGAGATTCACCTTTGT-CTCCTGTTT-GTGCAC  47

seq1  AGCAATAGTGGGCACACATCTGTGTGCTTTTTTGTGTACCTATATTAAAA  100
      ||| ||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||
seq2  AGC-ATAGT-GGCCCACATCTGT-TGC--TTTTGTGTA-CTATATTAAAA  91

seq1  CACAAACAGTACAAATAAAACTTGCAAAAGTTACAGTTTGCCCCATCTAG  150
      |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAACAGTACAAAT-AAACTTGC-AAAGTTACAGTTTGCCCCATCTAG  139

seq1  CATAATCCTCTAGTTTTTTCCCATACAGCACAGTAGCTCTGCCACCCCCA  200
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAATCCTCTAG-TTTTTCCCATACAGCACAGTAGCTCTGCCACCCCCA  188

seq1  TGAGAATGTTTGCATTAATGTAACGTCTCTTCTCTACTCAGCAACCACCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAATGTTTGCATTAATGTAACGTCTCTTCTCTACTCAGCAACCACCT  238

seq1  GCTCATGACTATGTAACAACCTGTGCTGCCTTCTATTTCTGATGGGTGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCATGACTATGTAACAACCTGTGCTGCCTTCTATTTCTGATGGGTGTT  288

seq1  GCAGGAATAGCTCCAGCCGGGTGTTCTCCACTCAGTGGTTTCCGGCCTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGAATAGCTCCAGCCGGGTGTTCTCCACTCAGTGGTTTCCGGCCTAG  338

seq1  AGCACCTGAAATGTCTGTACCGGATTCCCTAAGTTCCCTTGGCAGGTCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACCTGAAATGTCTGTACCGGATTCCCTAAGTTCCCTTGGCAGGTCAC  388

seq1  TACCATGCCAGCCCCACGCAACGACAGCCCACCCCTCTGTCAACTGCCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCATGCCAGCCCCACGCAACGACAGCCCACCCCTCTGTCAACTGCCAC  438

seq1  AACACCCAGCAACCCAGTAGAAACAAAACTCTAGAAGCTTATAGTTAGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACCCAGCAACCCAGTAGAAACAAAACTCTAGAAGCTTATAGTTAGAC  488

seq1  AGATTTATATATCAATAAATTCTCAATTCACAAGACGCCCACACAATAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTATATATCAATAAATTCTCAATTCACAAGACGCCCACACAATAAT  538

seq1  TTCAGGGCCAATTGAATGATGGTACAAGCTGCCTACTTAGATTAGACAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGGGCCAATTGAATGATGGTACAAGCTGCCTACTTAGATTAGACAAG  588

seq1  GTACCCTAATTATTCTATCTCTATAGGATAACATATTTACCTGTGGCTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCCTAATTATTCTATCTCTATAGGATAACATATTTACCTGTGGCTAT  638

seq1  TTAAAGCCACATCCTGTTCACCACCTTCCAGCTTGCCTCTTTCCCCCCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGCCACATCCTGTTCACCACCTTCCAGCTTGCCTCTTTCCCCCCTC  688

seq1  CCTCCTGAGTTGCTCTCTGTCCCTGCAACTCTTAGCTCCACCTCCCTTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTGAGTTGCTCTCTGTCCCTGCAACTCTTAGCTCCACCTCCCTTTT  738

seq1  CCCTGGCCAATCACAGGCCTCCTGCTGCACTAATAATTAAATAGATTGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGCCAATCACAGGCCTCCTGCTGCACTAATAATTAAATAGATTGGA  788

seq1  CAGGGAAAATCTTGCCACTGATGGGAATTTAAGTTGTTAGGTGCCATTTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGAAAATCTTGCCACTGATGGGAATTTAAGTTGTTAGGTGCCATTTT  838

seq1  ACAACTGATTCGGATGAAAAAGAATCCTCATTCCTCCATCACCTTCTAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTGATTCGGATGAAAAAGAATCCTCATTCCTCCATCACCTTCTAAG  888

seq1  ACGTACAATGGCCAGTTTGAAAGCTCTTGCAAGTCCTAGAAAGTAAACTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTACAATGGCCAGTTTGAAAGCTCTTGCAAGTCCTAGAAAGTAAACTG  938

seq1  TGATATCTCATTGCGCATTTAACCAGCTGCTGGACTTCTGATTCAACTCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATCTCATTGCGCATTTAACCAGCTGCTGGACTTCTGATTCAACTCT  988

seq1  TGATCCTGGGAAATACGCAGTTGTCTTTGACATAGTCCCCAAGAATGAGG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCCTGGGAAATACGCAGTTGTCTTTGACATAGTCCCCAAGAATGAGG  1038

seq1  CTGGGGAAATGTGTTTATCTTACTTAAGTTCCTGACTACTTAATGGACAA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGAAATGTGTTTATCTTACTTAAGTTCCTGACTACTTAATGGACAA  1088

seq1  CAACACCTCAGTAAATAAAGAATTC  1125
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACACCTCAGTAAATAAAGAATTC  1113