BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-166K08
Chromosome15 (Build37)
Map Location 60,905,831 - 61,045,875
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040323
Upstream geneLOC100040266, LOC623048, LOC211832, LOC623094, EG632412, LOC100040311, D330050I23Rik, 9930014A18Rik, A1bg
Downstream geneMyc, Pvt1, LOC100040584
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-166K08.bB6Ng01-166K08.g
ACCDH958363DH958364
length1,0411,139
definitionDH958363|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166K08, 5' end.DH958364|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166K08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,044,840 - 61,045,875)(60,905,831 - 60,906,983)
sequence
gaattcagtcaaaacaaagttattcttctgttgtcagtgtaaaaataacc
taagggtctaagctacatacctaaactgcagagagaagaattgctttgct
gctaatttatgaggtgttttttagtaaagtgcttctcctcttcagcatga
aattttcttgtgtgtatggtgactgaattctagggtcccttctagcttta
aatagtgtcattgaaggatgatggccatcactcaaggacaaacaaaatat
gagcaagcagcatagctacaggagatgttggcaaactgttgactgcattc
ctagtctgtaattcctggtcctccattctgtaatatgcgaatcaaggtca
cagtttcttgtttcttccttcactgtgtcctaatctaaaatcctcctcct
cataatctgtgctcaatagaatctttgtaaagttggtccttagaacaagg
tttcaagcttagctccaactcaggggtcaggtgcaatggtaatatggata
cattccaatgggaacaaacacagtttaggggggtctatggtgggtttatt
aggtctcagctctagccagacatcagaattatgttagctttgaaaaatcc
cagagtccaggctactacactaaaagaattaaattagaatctctggatgt
ttatttgatattctttggatcactgtaatgggcagctgtggccaagaact
tgcagacatgctcaaggtgctggctgtgggcaacattaagccaggatagc
tatgaatgtagcacagcccaatgctgggacttatttaaaatttcaacatt
attattattattattattactattactattattattaatgatgatgatgt
gtgtgcttgtatgtgtgtgttagagggagagggcatggacatgctatagc
gctgatgtggatgtcagaggatgaccgagtaaagtcagtatcgcccttca
catttatgtggatttcagagctcattaaattttggctgccagatacctct
catcctcagagacttctttttttcttgtgggaatgtgatat
gaattcttttatttaatcctaaggttttaattttctttcatatcatttaa
ggacttgattgctaatctctttttagtgatgaacgttccattatctcaat
atatgagtgtgccactgtaattctctttgtgctccagcaactgtttttta
agtgtagaacaggccctcatacagtgagtgaaaggaagtaacatgatgaa
gacaaaggaaacctgaccaagaatggaagtgttggtgtagaagactttta
atctagcaacatggctgctctggcaaggactttcacccaaagatatgatc
cagctgggatgcagacagaccacatacctttaatccctctggctgaaata
cagacatgcctttagtacacacctgtattcccaaacaatgatgtctgata
gtggggtaaagtgacaaatctgagaaagaattgacaggatgagtcagaga
taggatacgcccagctctcatgagaacagacagggaagagaagctactta
aagagcagtgaggaagagagaattcagttcagttccgttaagttctgttc
agtttggagcagctcagctcagagcagttcagtgcagtgcagttgagctg
agttgtgctcggttgtgtttgagttgagtgcagttgtgttcagatcagtt
tggagcagttcaatgcctggagttcagaggcagtcttttcaaacaaaaca
ctcagtcagaagccaggagaagccaattcaaatcagtcagcttggagaag
aatttgaggcagaacatctgagttgaatcagcttcagaaactgaaacatt
ctaagttaacagagggaggctggaagctaaaaccttcaaggtccaggcct
aaagaagactagattgtacagaggctacgcttccaagcctagatctagga
ataatagtatagagacatgctgggaacaactctaatcccatcacttcatc
tgagaaatggaagtgcatttacatttacagttgggagctcaaaatactag
tatatgccgtatcattttttgagtgtgcattatgccttgtggtagtacat
gcactgttctgtgatgaacgagaaaaataaacctgatctctctcctccct
gtgagtgagtacatatatattccattccttctcactctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_61044840_61045875
seq2: B6Ng01-166K08.b_45_1085 (reverse)

seq1  ATATCA------CACAAG-AAAAAAGAAGTCTCCTGAGGATGAGAGGTAT  43
      ||||||      |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  ATATCACATTCCCACAAGAAAAAAAGAAGTCT-CTGAGGATGAGAGGTAT  49

seq1  CTGGCAGCCAAAATTTAATGAGCTCTGAAATCCACATAAATGTGAAGGGC  93
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCAGCCAAAATTTAATGAGCTCTGAAATCCACATAAATGTGAAGGGC  99

seq1  GATACTTGACTTTACTCGGTCATCCTCTGACATCCACATCAGCGCTATAG  143
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAC-TGACTTTACTCGGTCATCCTCTGACATCCACATCAGCGCTATAG  148

seq1  CATGTCCATGCCCTCTCCCTCTAACACACACATACAAGCACACACATCAT  193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTCCATGCCCTCTCCCTCTAACACACACATACAAGCACACACATCAT  198

seq1  CATCATTAATAATAATAGTAATAGTAATAATAATAATAATAATAATGTTG  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATTAATAATAATAGTAATAGTAATAATAATAATAATAATAATGTTG  248

seq1  AAATTTTAAATAAGTCCCAGCATTGGGCTGTGCTACATTCATAGCTATCC  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTTAAATAAGTCCCAGCATTGGGCTGTGCTACATTCATAGCTATCC  298

seq1  TGGCTTAATGTTGCCCACAGCCAGCACCTTGAGCATGTCTGCAAGTTCTT  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTAATGTTGCCCACAGCCAGCACCTTGAGCATGTCTGCAAGTTCTT  348

seq1  GGCCACAGCTGCCCATTACAGTGATCCAAAGAATATCAAATAAACATCCA  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCACAGCTGCCCATTACAGTGATCCAAAGAATATCAAATAAACATCCA  398

seq1  GAGATTCTAATTTAATTCTTTTAGTGTAGTAGCCTGGACTCTGGGATTTT  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATTCTAATTTAATTCTTTTAGTGTAGTAGCCTGGACTCTGGGATTTT  448

seq1  TCAAAGCTAACATAATTCTGATGTCTGGCTAGAGCTGAGACCTAATAAAC  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGCTAACATAATTCTGATGTCTGGCTAGAGCTGAGACCTAATAAAC  498

seq1  CCACCATAGACCCCCCTAAACTGTGTTTGTTCCCATTGGAATGTATCCAT  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCATAGACCCCCCTAAACTGTGTTTGTTCCCATTGGAATGTATCCAT  548

seq1  ATTACCATTGCACCTGACCCCTGAGTTGGAGCTAAGCTTGAAACCTTGTT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACCATTGCACCTGACCCCTGAGTTGGAGCTAAGCTTGAAACCTTGTT  598

seq1  CTAAGGACCAACTTTACAAAGATTCTATTGAGCACAGATTATGAGGAGGA  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGACCAACTTTACAAAGATTCTATTGAGCACAGATTATGAGGAGGA  648

seq1  GGATTTTAGATTAGGACACAGTGAAGGAAGAAACAAGAAACTGTGACCTT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTTAGATTAGGACACAGTGAAGGAAGAAACAAGAAACTGTGACCTT  698

seq1  GATTCGCATATTACAGAATGGAGGACCAGGAATTACAGACTAGGAATGCA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCGCATATTACAGAATGGAGGACCAGGAATTACAGACTAGGAATGCA  748

seq1  GTCAACAGTTTGCCAACATCTCCTGTAGCTATGCTGCTTGCTCATATTTT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAACAGTTTGCCAACATCTCCTGTAGCTATGCTGCTTGCTCATATTTT  798

seq1  GTTTGTCCTTGAGTGATGGCCATCATCCTTCAATGACACTATTTAAAGCT  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTCCTTGAGTGATGGCCATCATCCTTCAATGACACTATTTAAAGCT  848

seq1  AGAAGGGACCCTAGAATTCAGTCACCATACACACAAGAAAATTTCATGCT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGGACCCTAGAATTCAGTCACCATACACACAAGAAAATTTCATGCT  898

seq1  GAAGAGGAGAAGCACTTTACTAAAAAACACCTCATAAATTAGCAGCAAAG  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGGAGAAGCACTTTACTAAAAAACACCTCATAAATTAGCAGCAAAG  948

seq1  CAATTCTTCTCTCTGCAGTTTAGGTATGTAGCTTAGACCCTTAGGTTATT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTCTTCTCTCTGCAGTTTAGGTATGTAGCTTAGACCCTTAGGTTATT  998

seq1  TTTACACTGACAACAGAAGAATAACTTTGTTTTGACTGAATTC  1036
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACACTGACAACAGAAGAATAACTTTGTTTTGACTGAATTC  1041

seq1: chr15_60905831_60906983
seq2: B6Ng01-166K08.g_67_1205

seq1  GAATTCTTTTATTTAATCCTAAGGTTTTAATTTTCTTTCATATCATTTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTATTTAATCCTAAGGTTTTAATTTTCTTTCATATCATTTAA  50

seq1  GGACTTGATTGCTAATCTCTTTTTAGTGATGAACGTTCCATTATCTCAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTGATTGCTAATCTCTTTTTAGTGATGAACGTTCCATTATCTCAAT  100

seq1  ATATGAGTGTGCCACTGTAATTCTCTTTGTGCTCCAGCAACTGTTTTTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAGTGTGCCACTGTAATTCTCTTTGTGCTCCAGCAACTGTTTTTTA  150

seq1  AGTGTAGAACAGGCCCTCATACAGTGAGTGAAAGGAAGTAACATGATGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTAGAACAGGCCCTCATACAGTGAGTGAAAGGAAGTAACATGATGAA  200

seq1  GACAAAGGAAACCTGACCAAGAATGGAAGTGTTGGTGTAGAAGACTTTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAAGGAAACCTGACCAAGAATGGAAGTGTTGGTGTAGAAGACTTTTA  250

seq1  ATCTAGCAACATGGCTGCTCTGGCAAGGACTTTCACCCAAAGATATGATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAGCAACATGGCTGCTCTGGCAAGGACTTTCACCCAAAGATATGATC  300

seq1  CAGCTGGGATGCAGACAGACCACATACCTTTAATCCCTCTGGCTGAAATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGGGATGCAGACAGACCACATACCTTTAATCCCTCTGGCTGAAATA  350

seq1  CAGACATGCCTTTAGTACACACCTGTATTCCCAAACAATGATGTCTGATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACATGCCTTTAGTACACACCTGTATTCCCAAACAATGATGTCTGATA  400

seq1  GTGGGGTAAAGTGACAAATCTGAGAAAGAATTGACAGGATGAGTCAGAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGTAAAGTGACAAATCTGAGAAAGAATTGACAGGATGAGTCAGAGA  450

seq1  TAGGATACGCCCAGCTCTCATGAGAACAGACAGGGAAGAGAAGCTACTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGATACGCCCAGCTCTCATGAGAACAGACAGGGAAGAGAAGCTACTTA  500

seq1  AAGAGCAGTGAGGAAGAGAGAATTCAGTTCAGTTCCGTTAAGTTCTGTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCAGTGAGGAAGAGAGAATTCAGTTCAGTTCCGTTAAGTTCTGTTC  550

seq1  AGTTTGGAGCAGCTCAGCTCAGAGCAGTTCAGTGCAGTGCAGTTGAGCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGGAGCAGCTCAGCTCAGAGCAGTTCAGTGCAGTGCAGTTGAGCTG  600

seq1  AGTTGTGCTCGGTTGTGTTTGAGTTGAGTGCAGTTGTGTTCAGATCAGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGTGCTCGGTTGTGTTTGAGTTGAGTGCAGTTGTGTTCAGATCAGTT  650

seq1  TGGAGCAGTTCAATGCCTGGAGTTCAGAGGCAGTCTTTTCAAACAAAACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCAGTTCAATGCCTGGAGTTCAGAGGCAGTCTTTTCAAACAAAACA  700

seq1  CTCAGTCAGAAGCCAGGAGAAGCCAATTCAAATCAGTCAGCTTGGAGAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTCAGAAGCCAGGAGAAGCCAATTCAAATCAGTCAGCTTGGAGAAG  750

seq1  AATTTGAGGCAGAACATCTGAGTTGAATCAGCTTCAGAAACTGAAACATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGAGGCAGAACATCTGAGTTGAATCAGCTTCAGAAACTGAAACATT  800

seq1  CTAAGTTAACAGAGGGAGGCTGGAAGCTAAAACCTTCAAGGTCCAGGCCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGTTAACAGAGGGAGGCTGGAAGCTAAAACCTTCAAGGTCCAGGCCT  850

seq1  AAAGAAGACTAGATTGTACAGAGGCTACGCTTCCAAGCCTAGATCTAGGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAGACTAGATTGTACAGAGGCTACGCTTCCAAGCCTAGATCTAGGA  900

seq1  ATAATAGTATAGAGACATGCTGGGAACAACTCTAATCCCATCACTTCATC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAGTATAGAGACATGCTGGGAACAACTCTAATCCCATCACTTCATC  950

seq1  TGAGAAAATGGAAGTGGCATTTACATTTACAGGTTGGGAGCTCAAAATAC  1000
      |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TGAG-AAATGGAAGT-GCATTTACATTTACA-GTTGGGAGCTCAAAATAC  997

seq1  TTAAGTAATATGCCGTATCATTTTTTTTGAGTTGTTGCATTATGCC-TGT  1049
      |  ||| |||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||| |||
seq2  T--AGT-ATATGCCGTATCA--TTTTTTGAGT--GTGCATTATGCCTTGT  1040

seq1  GGTAGTTACCATGCACTGTTTCTGTGATGAACGAG-AAAATAAACTTGAT  1098
      ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||
seq2  GGTAGT--ACATGCACTG-TTCTGTGATGAACGAGAAAAATAAACCTGAT  1087

seq1  CTCTCTCTTCCCTGTAGATGAGGTACATATATTAGTGCCCTTTCCTTCT-  1147
      ||||||| |||||||   ||| ||||||||| || |  || |||||||| 
seq2  CTCTCTCCTCCCTGTGAGTGA-GTACATATA-TATT--CCATTCCTTCTC  1133

seq1  ACTCTC  1153
      ||||||
seq2  ACTCTC  1139