BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-166N09
Chromosome15 (Build37)
Map Location 70,170,696 - 70,321,028
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC383050
Downstream geneLOC383051, 1700010C24Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-166N09.bB6Ng01-166N09.g
ACCDH958498DH958499
length7181,157
definitionDH958498|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166N09, 5' end.DH958499|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166N09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,170,696 - 70,171,413)(70,319,860 - 70,321,028)
sequence
gaattctgaatgtatgtgtctttccaaaatctatatgctgaaatctattt
ttaatctaacttccaatgtttggataagaagaggccagatcatctctagc
cagtgactaaagtgtgaagataaagaaaatgccatgaacgagtaagtgac
cctatagaaaccttgctttccagcactggacatgatttctctattgttaa
gcagatctcaacaccaaatacattttgtataattttaacacagattaatt
ttatgtagaaattttgaaataatctaaaagccaaatcatagaaagcacat
gacgctgatcttgctagcttaacagctcttaggtctgctttctgcactgc
aggtagagtacacaaaatagaccacaggatatttctaatcatcttagtag
atttagaactagattcacacagatacatgaagtaggaatcccaatgagca
atacataaagatggatctataacccttcatattgtcaaggtcattcacat
cctatatatgttttaaaagcttatggtgcagtctctgggttctacatgca
tgtgtacatatccatacaacaaacaaacacagtagtcttcaaaaagaaat
atgcatatttgtgctgaggatctacctcagtggatatcacttaagcttag
tatgtaaagaaagtcttgaaatcaatcttcagaagagacagagggttggg
agggagggagagggaagg
gaattctcctcccatctccacaccatgtgtctcaagcgctaaggtcacca
aggcatactgtcatgctcatctttttacttaggagcctgaaatctcaatt
cgggttctcatgcctataaagcaatcacattctccatttttctagctctg
gaattcttgtgctttaaaaatctcatttcttttcacttagtcttttaaga
aaatttttgttaagggcaggaaatttacattaattaatgaagcagtaata
agttaagtaatgaaaaagcagtttgttatggacttatttctctgccttga
gtcatgatattgctatagttttagctgacctggaactcattatgtagcta
aggctagcctcaagctcacgatatccttatgtccagcttctccattacta
gcataatgttgtgaaccattcactatgccttgctttggtacatatttatt
tatagaatcctcacaggattttttagtatattttttaattcaggaaacac
aattaatgtttacagtacaattttattgttgagctaaaatgcataggttt
actatgcacacttttttgagcaaattatacatcactgtatcctcagcctg
gggacatagtggtaaggcatcattgtgctttgaccttccctagtcctata
tggactgttccacaatatttttttcctgtatgtgtttccatttcattatc
ttactttttagagtgaagattctggaggaaaaacaacctaattaatgtcc
ataaaaacaagttgacagtgggaaggaaagtacacagtactaagtcccca
gctgagacagcatcctttcttctcagtttgttttcataattatgctttca
tcatttctaatgagctgtcaatttcctatgcaaattacatagagtagaca
tgaacagatttacattgagtcctaaaactggtgccggtattgctatgaga
gctctgacctgtaaatattcttaaaaatggatcaaacaagaaagtacttt
tatttttatttaatctatgtttctctctcaagggagtctgcaaaaataat
ttaaatctaacacagcacttgcaacttcccagctgtttaagatgttaacc
attgatgtcactgatctgatatatcacataaaaccctcctgttccattcc
tagcttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_70170696_70171413
seq2: B6Ng01-166N09.b_44_761

seq1  GAATTCTGAATGTATGTGTCTTTCCAAAATCTATATGCTGAAATCTATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGAATGTATGTGTCTTTCCAAAATCTATATGCTGAAATCTATTT  50

seq1  TTAATCTAACTTCCAATGTTTGGATAAGAAGAGGCCAGATCATCTCTAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCTAACTTCCAATGTTTGGATAAGAAGAGGCCAGATCATCTCTAGC  100

seq1  CAGTGACTAAAGTGTGAAGATAAAGAAAATGCCATGAACGAGTAAGTGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGACTAAAGTGTGAAGATAAAGAAAATGCCATGAACGAGTAAGTGAC  150

seq1  CCTATAGAAACCTTGCTTTCCAGCACTGGACATGATTTCTCTATTGTTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATAGAAACCTTGCTTTCCAGCACTGGACATGATTTCTCTATTGTTAA  200

seq1  GCAGATCTCAACACCAAATACATTTTGTATAATTTTAACACAGATTAATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATCTCAACACCAAATACATTTTGTATAATTTTAACACAGATTAATT  250

seq1  TTATGTAGAAATTTTGAAATAATCTAAAAGCCAAATCATAGAAAGCACAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTAGAAATTTTGAAATAATCTAAAAGCCAAATCATAGAAAGCACAT  300

seq1  GACGCTGATCTTGCTAGCTTAACAGCTCTTAGGTCTGCTTTCTGCACTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGCTGATCTTGCTAGCTTAACAGCTCTTAGGTCTGCTTTCTGCACTGC  350

seq1  AGGTAGAGTACACAAAATAGACCACAGGATATTTCTAATCATCTTAGTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGAGTACACAAAATAGACCACAGGATATTTCTAATCATCTTAGTAG  400

seq1  ATTTAGAACTAGATTCACACAGATACATGAAGTAGGAATCCCAATGAGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAGAACTAGATTCACACAGATACATGAAGTAGGAATCCCAATGAGCA  450

seq1  ATACATAAAGATGGATCTATAACCCTTCATATTGTCAAGGTCATTCACAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATAAAGATGGATCTATAACCCTTCATATTGTCAAGGTCATTCACAT  500

seq1  CCTATATATGTTTTAAAAGCTTATGGTGCAGTCTCTGGGTTCTACATGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATATATGTTTTAAAAGCTTATGGTGCAGTCTCTGGGTTCTACATGCA  550

seq1  TGTGTACATATCCATACAACAAACAAACACAGTAGTCTTCAAAAAGAAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTACATATCCATACAACAAACAAACACAGTAGTCTTCAAAAAGAAAT  600

seq1  ATGCATATTTGTGCTGAGGATCTACCTCAGTGGATATCACTTAAGCTTAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATATTTGTGCTGAGGATCTACCTCAGTGGATATCACTTAAGCTTAG  650

seq1  TATGTAAAGAAAGTCTTGAAATCAATCTTCAGAAGAGACAGAGGGTTGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTAAAGAAAGTCTTGAAATCAATCTTCAGAAGAGACAGAGGGTTGGG  700

seq1  AGGGAGGGAGAGGGAAGG  718
      ||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGGGAGAGGGAAGG  718

seq1: chr15_70319860_70321028
seq2: B6Ng01-166N09.g_69_1225 (reverse)

seq1  GAAGACTAGGAATGAGAACAGGA-GGTTTTATTGTATTAATCAGACTCAG  49
      |||| ||||||||| |||||||| ||||||||   ||  |||||| ||||
seq2  GAAG-CTAGGAATG-GAACAGGAGGGTTTTATGTGATATATCAGA-TCAG  47

seq1  TGACATCAATTGTTTAACATCTTAAAACAGCTGGGAAGTTTGCAAAGTGC  99
      ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||
seq2  TGACATCAA-TGGTTAACATCTT-AAACAGCTGGGAAG-TTGC-AAGTGC  93

seq1  TGTGTTAGATTTAAAATTATTTTTGCAGACTTCCCTTGAGAGTAGAACAT  149
      |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   |||||
seq2  TGTGTTAGATTT-AAATTATTTTTGCAGAC-TCCCTTGAGAGAGAAACAT  141

seq1  AGATTAAATTAAAAATAAAAGTACTTTCTTGTTTGATCCATTTTTTAAGA  199
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AGATTAAA-TAAAAATAAAAGTACTTTCTTGTTTGATCCA-TTTTTAAGA  189

seq1  ATATTTACAGGTCAGAGCCTTCTCATAGCAATACCGGCACCAGTTTTAGG  249
      ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTACAGGTCAGAGC--TCTCATAGCAATACCGGCACCAGTTTTAGG  237

seq1  ACTCAATGTAAATCTGTTCATGTCTACTCTATGTAATTTGCATAGGAAAT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAATGTAAATCTGTTCATGTCTACTCTATGTAATTTGCATAGGAAAT  287

seq1  TGACAGCTCATTAGAAATGATGAAAGCATAATTATGAAAACAAACTGAGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGCTCATTAGAAATGATGAAAGCATAATTATGAAAACAAACTGAGA  337

seq1  AGAAAGGATGCTGTCTCAGCTGGGGACTTAGTACTGTGTACTTTCCTTCC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGATGCTGTCTCAGCTGGGGACTTAGTACTGTGTACTTTCCTTCC  387

seq1  CACTGTCAACTTGTTTTTATGGACATTAATTAGGTTGTTTTTCCTCCAGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTCAACTTGTTTTTATGGACATTAATTAGGTTGTTTTTCCTCCAGA  437

seq1  ATCTTCACTCTAAAAAGTAAGATAATGAAATGGAAACACATACAGGAAAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCACTCTAAAAAGTAAGATAATGAAATGGAAACACATACAGGAAAA  487

seq1  AAATATTGTGGAACAGTCCATATAGGACTAGGGAAGGTCAAAGCACAATG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATTGTGGAACAGTCCATATAGGACTAGGGAAGGTCAAAGCACAATG  537

seq1  ATGCCTTACCACTATGTCCCCAGGCTGAGGATACAGTGATGTATAATTTG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTTACCACTATGTCCCCAGGCTGAGGATACAGTGATGTATAATTTG  587

seq1  CTCAAAAAAGTGTGCATAGTAAACCTATGCATTTTAGCTCAACAATAAAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAAAAAGTGTGCATAGTAAACCTATGCATTTTAGCTCAACAATAAAA  637

seq1  TTGTACTGTAAACATTAATTGTGTTTCCTGAATTAAAAAATATACTAAAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTACTGTAAACATTAATTGTGTTTCCTGAATTAAAAAATATACTAAAA  687

seq1  AATCCTGTGAGGATTCTATAAATAAATATGTACCAAAGCAAGGCATAGTG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCTGTGAGGATTCTATAAATAAATATGTACCAAAGCAAGGCATAGTG  737

seq1  AATGGTTCACAACATTATGCTAGTAATGGAGAAGCTGGACATAAGGATAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGTTCACAACATTATGCTAGTAATGGAGAAGCTGGACATAAGGATAT  787

seq1  CGTGAGCTTGAGGCTAGCCTTAGCTACATAATGAGTTCCAGGTCAGCTAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGAGCTTGAGGCTAGCCTTAGCTACATAATGAGTTCCAGGTCAGCTAA  837

seq1  AACTATAGCAATATCATGACTCAAGGCAGAGAAATAAGTCCATAACAAAC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATAGCAATATCATGACTCAAGGCAGAGAAATAAGTCCATAACAAAC  887

seq1  TGCTTTTTCATTACTTAACTTATTACTGCTTCATTAATTAATGTAAATTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTTTCATTACTTAACTTATTACTGCTTCATTAATTAATGTAAATTT  937

seq1  CCTGCCCTTAACAAAAATTTTCTTAAAAGACTAAGTGAAAAGAAATGAGA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCCCTTAACAAAAATTTTCTTAAAAGACTAAGTGAAAAGAAATGAGA  987

seq1  TTTTTAAAGCACAAGAATTCCAGAGCTAGAAAAATGGAGAATGTGATTGC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAAAGCACAAGAATTCCAGAGCTAGAAAAATGGAGAATGTGATTGC  1037

seq1  TTTATAGGCATGAGAACCCGAATTGAGATTTCAGGCTCCTAAGTAAAAAG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAGGCATGAGAACCCGAATTGAGATTTCAGGCTCCTAAGTAAAAAG  1087

seq1  ATGAGCATGACAGTATGCCTTGGTGACCTTAGCGCTTGAGACACATGGTG  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGCATGACAGTATGCCTTGGTGACCTTAGCGCTTGAGACACATGGTG  1137

seq1  TGGAGATGGGAGGAGAATTC  1169
      ||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGATGGGAGGAGAATTC  1157