BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-189D15
Chromosome15 (Build37)
Map Location 65,604,722 - 65,749,209
singlet/doubletdoublet
Overlap geneC920006C10Rik, Oc90
Upstream geneAdcy8, LOC268812, LOC100040790, LOC665836
Downstream geneF930104E18Rik, LOC100040835, Kcnq3, Lrrc6, LOC100040860, Tmem71, LOC100040881, Phf20l1, Tg, Sla, Wisp1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-189D15.bB6Ng01-189D15.g
ACCGA013309GA013310
length1,137935
definitionB6Ng01-189D15.b B6Ng01-189D15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(65,604,722 - 65,605,842)(65,748,289 - 65,749,209)
sequence
ggaattcatgcttactttgaaaacaatttagcaatcattttgtgctagag
tagtattcaaaaccaataaaacagttcatgaagggaatatctgacttact
aaataatatgccacccactttgcaatatgctgttttaaatttgaagctca
aataaaagctccaagtagtcgtggaattgaagtacttcaagttctgcatt
cggagtcatgctgctgctgttctttatttaaaatccacttttaagttgca
gggatatgttctgccatagagtttgaagacaggtgagtcagaatggcatt
tgaacaatccaggcccactgtggactggcttagagaaggaacatgtttcc
atgtataaaacaccttgccctttcccttcctacttccttcctgtcctttc
ctcccctcctcctctctttcgctttcctttctttatccttttccatctcc
tgtcctccttttctctcttctctagctcttccctcttcttttctcttctt
tccaagccagaggctggattcagtatcttagctcaagcagtcaccttgcc
ttagcttgctgagcagctaaggctactggaatataccactaaaactaact
aagttccaactttataactgggggttctttaaagtaacttccatatagaa
tagtaaaccaaaggagaagccaaacatatgctaattgcacaaaacatttt
agaacacaacaatagccacagaaattaattagaaccaagcaaaagacttt
tgccagagagcattttattgtccacactgttgactatgtgcagtcagcac
atagtcaagataaaagagaagacagaggaaatgcttttgttatgctatta
ggttctctaataagctgtataccactttgtagactgcatcttaaattcac
ctaccttactgggaatataatagagcagcttagccaatccctctgtgtaa
taaatagacctctgtacttcaatatctcccttttccacctaagttggttt
gcagcccttaacaatttaaaaatttatatgttgtttgagtactcatttaa
aggtctgcctaacccaccattgtttgtcattgtttaattagtggttcctt
gagggttcctttaacaacctaacatggtaactttaca
gaattctcatccaaggtatatgcaaataatttaaagcagagaggacaaga
aatcctccattgacttggtgagggttccgaagtcaaggacagaactccct
ctctttggtgtgtgggcatagaacagctagcccgcacattatctaatatc
tcatctttccttactaacctgctgaaacctgtaaacacgttacatttact
gatgagtgtattaatgagtttaaatgacttaaatgcaaattggggagatg
agttggatacagttgggtattagggcaatagcagctgtgcagaaagtgaa
aacgcatagctgtgccttcctccactctgctgccgcaagggggctctcct
aagaatcccttagaatggacctgacctgtgctttccctcaagaagaacct
gaactatagctggtactgtttgattttatgtctctgttctattccaatct
tgatgccctttcttgctctttcagccttgaagcaaaaatgtcttgagaat
gtctgcaagtctgtgtgagcacctaacagtaactttctggcaccaaacct
tcaccctggttttcatttccagctcagctgtatttttcagaatccagcat
gcccgagccaagtcatctgtagaagggaagggttttttctttggaagcag
agaactttttgtgtcctgtcaatctgtgtaatgcaacaaaaggcagaagc
tttataatcaatggagtaacaccaggctttctcttgcttgcctcagtgca
aaggaaaagttatgatttgggtttgagaacctaccatttattgcctgcag
cagtcttgataccaggaggactgggatgtaggcttcatattactgtgcat
acagcccaccaagaatgataaactgaaaagcctgacacacttccagagag
ctccttatatgggcactgtacaacttgatgactac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_65604722_65605842
seq2: B6Ng01-189D15.b_48_1183

seq1  GAATTCATGCTTACTTTGAAAACAATTTAGCAATCATTTTGTGCTAGAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGCTTACTTTGAAAACAATTTAGCAATCATTTTGTGCTAGAGT  50

seq1  AGTATTCAAAACCAATAAAACAGTTCATGAAGGGAATATCTGACTTACTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTCAAAACCAATAAAACAGTTCATGAAGGGAATATCTGACTTACTA  100

seq1  AATAATATGCCACCCACTTTGCAATATGCTGTTTTAAATTTGAAGCTCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATATGCCACCCACTTTGCAATATGCTGTTTTAAATTTGAAGCTCAA  150

seq1  ATAAAAGCTCCAAGTAGTCGTGGAATTGAAGTACTTCAAGTTCTGCATTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAGCTCCAAGTAGTCGTGGAATTGAAGTACTTCAAGTTCTGCATTC  200

seq1  GGAGTCATGCTGCTGCTGTTCTTTATTTAAAATCCACTTTTAAGTTGCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTCATGCTGCTGCTGTTCTTTATTTAAAATCCACTTTTAAGTTGCAG  250

seq1  GGATATGTTCTGCCATAGAGTTTGAAGACAGGTGAGTCAGAATGGCATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATGTTCTGCCATAGAGTTTGAAGACAGGTGAGTCAGAATGGCATTT  300

seq1  GAACAATCCAGGCCCACTGTGGACTGGCTTAGAGAAGGAACATGTTTCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAATCCAGGCCCACTGTGGACTGGCTTAGAGAAGGAACATGTTTCCA  350

seq1  TGTATAAAACACCTTGCCCTTTCCCTTCCTACTTCCTTCCTGTCCTTTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATAAAACACCTTGCCCTTTCCCTTCCTACTTCCTTCCTGTCCTTTCC  400

seq1  TCCCCTCCTCCTCTCTTTCGCTTTCCTTTCTTTATCCTTTTCCATCTCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTCCTCCTCTCTTTCGCTTTCCTTTCTTTATCCTTTTCCATCTCCT  450

seq1  GTCCTCCTTTTCTCTCTTCTCTAGCTCTTCCCTCTTCTTTTCTCTTCTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTCCTTTTCTCTCTTCTCTAGCTCTTCCCTCTTCTTTTCTCTTCTTT  500

seq1  CCAAGCCAGAGGCTGGATTCAGTATCTTAGCTCAAGCAGTCACCTTGCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGCCAGAGGCTGGATTCAGTATCTTAGCTCAAGCAGTCACCTTGCCT  550

seq1  TAGCTTGCTGAGCAGCTAAGGCTACTGGAATATACCACTAAAACTAACTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTGCTGAGCAGCTAAGGCTACTGGAATATACCACTAAAACTAACTA  600

seq1  AGTTCCAACTTTATAACTGGGGGTTCTTTAAAGTAACTTCCATATAGAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCCAACTTTATAACTGGGGGTTCTTTAAAGTAACTTCCATATAGAAT  650

seq1  AGTAAACCAAAGGAGAAGCCAAACATATGCTAATTGCACAAAACATTTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAACCAAAGGAGAAGCCAAACATATGCTAATTGCACAAAACATTTTA  700

seq1  GAACACAACAATAGCCACAGAAATTAATTAGAACCAAGCAAAAGAC-TTT  749
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GAACACAACAATAGCCACAGAAATTAATTAGAACCAAGCAAAAGACTTTT  750

seq1  GCCAGAGAGCATTTTATTGTCCACACTGTTGACTATGTGCAGTCAGCACA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGAGAGCATTTTATTGTCCACACTGTTGACTATGTGCAGTCAGCACA  800

seq1  TAGTCAAGATAAAAGAGAAGACAGAGGAAATGCTTTTGTTATTGCTATTA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TAGTCAAGATAAAAGAGAAGACAGAGGAAATGCTTTTGTTA-TGCTATTA  849

seq1  GGTTCTCTAATAAGCTGTATACCACTTTGTAGACTGCATCTTAAATTCAC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCTCTAATAAGCTGTATACCACTTTGTAGACTGCATCTTAAATTCAC  899

seq1  CTACC-TACTGGG-ATATAATAGAGCAGC-TAGCCAATCCC-CTGTGTAA  945
      ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
seq2  CTACCTTACTGGGAATATAATAGAGCAGCTTAGCCAATCCCTCTGTGTAA  949

seq1  TAAATAGACCTCTGTACTTCAATATCTCCTTTTCCAACTTAAGTTGGTTT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||
seq2  TAAATAGACCTCTGTACTTCAATATCTCCCTTTTCCACCTAAGTTGGTTT  999

seq1  GCAGCCCTT-ACAATTTATAA--TTATATGTTTGTTTGAGTACTCATTT-  1041
      ||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| 
seq2  GCAGCCCTTAACAATTTAAAAATTTATATG-TTGTTTGAGTACTCATTTA  1048

seq1  AAGGTCTGCCTAACC--ACATTG-TTGTCATTG-TTAATTAGTGG-TCCT  1086
      |||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||
seq2  AAGGTCTGCCTAACCCACCATTGTTTGTCATTGTTTAATTAGTGGTTCCT  1098

seq1  TGTGGG-TCCTTTAGC-ACCCAACATGGT-ACTTTACA  1121
      || ||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||||
seq2  TGAGGGTTCCTTTAACAACCTAACATGGTAACTTTACA  1136

seq1: chr15_65748289_65749209
seq2: B6Ng01-189D15.g_69_1003 (reverse)

seq1  GTAGTCATC-AGTTGTACAGTG-CCATATTGAGAGCTCTCTGG-AGTGTG  47
      ||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||
seq2  GTAGTCATCAAGTTGTACAGTGCCCATATAAGGAGCTCTCTGGAAGTGTG  50

seq1  TCAGGCCTTTTCAGTTTATCA-TCTT-GTGGGCTGTATGCACAGTAATAT  95
      ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGG-CTTTTCAGTTTATCATTCTTGGTGGGCTGTATGCACAGTAATAT  99

seq1  GAAGCCTACATCCCAGTCCTCCTGGTATCAAGACTGCTGCAGGCA--TAA  143
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
seq2  GAAGCCTACATCCCAGTCCTCCTGGTATCAAGACTGCTGCAGGCAATAAA  149

seq1  TGGTAGGTTCTCAAACCCAAATCATAAC-TTTCCTTTGCACTGAGGCAAG  192
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAGGTTCTCAAACCCAAATCATAACTTTTCCTTTGCACTGAGGCAAG  199

seq1  C-AGAG-AAGCCTGGTGTTACTCCATTGATTATAAAGCTTCTGCC-TTTG  239
      | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CAAGAGAAAGCCTGGTGTTACTCCATTGATTATAAAGCTTCTGCCTTTTG  249

seq1  TTGCATTACACAGATTGACAGGACAC-AAAAGTTCTCTGCTTCCAAAG-A  287
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
seq2  TTGCATTACACAGATTGACAGGACACAAAAAGTTCTCTGCTTCCAAAGAA  299

seq1  AAAACCCTTCCCTTCTACAGATGACTTGGCTCGGGCATGCTGGATTCTGA  337
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACCCTTCCCTTCTACAGATGACTTGGCTCGGGCATGCTGGATTCTGA  349

seq1  AAAATACAGCTGAGCTGGAAATG-AAACCAGGGTGAAGGTTTGGTGCCAG  386
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATACAGCTGAGCTGGAAATGAAAACCAGGGTGAAGGTTTGGTGCCAG  399

seq1  -AAGTTACTGTTAGGTGCTCACACAGACTTGCAGACATTCTCAAGACATT  435
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTACTGTTAGGTGCTCACACAGACTTGCAGACATTCTCAAGACATT  449

seq1  TTTGCTTCAAGGCTGAAAGAGCAAGAAAGGGCATCAAGATTGGAATAGAA  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTTCAAGGCTGAAAGAGCAAGAAAGGGCATCAAGATTGGAATAGAA  499

seq1  CAGAGACATAAAATCAAACAGTACCAGCTATAGTTCAGGTTCTTCTTGAG  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGACATAAAATCAAACAGTACCAGCTATAGTTCAGGTTCTTCTTGAG  549

seq1  GGAAAGCACAGGTCAGGTCCATTCTAAGGGATTCTTAGGAGAGCCCCCTT  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGCACAGGTCAGGTCCATTCTAAGGGATTCTTAGGAGAGCCCCCTT  599

seq1  GCGGCAGCAGAGTGGAGGAAGGCACAGCTATGCGTTTTCACTTTCTGCAC  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGCAGCAGAGTGGAGGAAGGCACAGCTATGCGTTTTCACTTTCTGCAC  649

seq1  AGCTGCTATTGCCCTAATACCCAACTGTATCCAACTCATCTCCCCAATTT  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCTATTGCCCTAATACCCAACTGTATCCAACTCATCTCCCCAATTT  699

seq1  GCATTTAAGTCATTTAAACTCATTAATACACTCATCAGTAAATGTAACGT  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTTAAGTCATTTAAACTCATTAATACACTCATCAGTAAATGTAACGT  749

seq1  GTTTACAGGTTTCAGCAGGTTAGTAAGGAAAGATGAGATATTAGATAATG  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTACAGGTTTCAGCAGGTTAGTAAGGAAAGATGAGATATTAGATAATG  799

seq1  TGCGGGCTAGCTGTTCTATGCCCACACACCAAAGAGAGGGAGTTCTGTCC  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGGGCTAGCTGTTCTATGCCCACACACCAAAGAGAGGGAGTTCTGTCC  849

seq1  TTGACTTCGGAACCCTCACCAAGTCAATGGAGGATTTCTTGTCCTCTCTG  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTTCGGAACCCTCACCAAGTCAATGGAGGATTTCTTGTCCTCTCTG  899

seq1  CTTTAAATTATTTGCATATACCTTGGATGAGAATTC  921
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAAATTATTTGCATATACCTTGGATGAGAATTC  935