BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-191A05
Chromosome15 (Build37)
Map Location 7,462,553 - 7,594,375
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039396, LOC100039412, Fyb, LOC100039453, EG665511, 4921505C17Rik, Osmr, Lifr, Egflam
Downstream geneGdnf, Wdr70, LOC665556, LOC621001, Nup155, 2410089E03Rik, LOC100039599, Nipbl, EG666437, LOC100039560, LOC100039633, Slc1a3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-191A05.bB6Ng01-191A05.g
ACCGA014623GA014624
length1,131569
definitionB6Ng01-191A05.b B6Ng01-191A05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(7,593,242 - 7,594,375)(7,462,553 - 7,463,127)
sequence
gaattcactatcaaattgagaccattccatggctaactgcatgccaggga
cattccagtgaaaggatagaatgaaggaagacaattcttcccaccaattc
tcccaggacttgccaggtgttgtggcatggagtggtgcttaacatttgct
gtgtacaactacgggttgagcttcttgttctccattgcaatgaactacta
ttccaaacttgcttgtgcataactaaaggagccctatttaaattcaacta
gccaaatgtcaatcaaatgactgcaaactccctctacacctgaagcaagc
ataagctgggcttactttaatttcacctccctagctgacaccatctttag
gctgtgcctagtgtctttaggggaaccccccttcagccgtggcacacata
tctcaggatgatccactgaagaatttgacaagaaggtggtacatttgtgc
catgagcttttatgtgtgaataaaattgccaacttttccaagcccttccc
caaataggagagttttggaaaagcccacagtgatattaaaatatattaag
tttacagaaattgagtaagtcttcattagcatagggcagcaggaaagcgt
ttgtgaatgagggcagctgctctggggtctggggcgtctatctgccttct
tgctgttagagtagctgtgaccttttcagtaatgctggttatgctcggga
gggtagtttcaatgatttcccttattgtatcttgccgatcaatctccgac
atggctgctccatttaacctgtattccctaggtcatttcttaagcgattt
attgaacattatcctaaattgaactgcatttactatcctttgacccaatt
acttaaatggttccacgtccatttgattttaatcattcatcctcttgcgt
cttgcttttcctcttcttttcctgtcagtcacacaggagtctattcagct
caaaatctcttccttctcaaaccactcagcttgagcggaacgacacccca
ttcccagctctccacttgaatcctggttacaagcaacaatcattctacaa
aattcaacatagagctgggctgagtgaggacttatttgtctgtttctcct
ttgaggtaaatttgcttggccaaaggtctct
aaggccagcctgaacgccacagtaagatgctgtcttagaaaacaacaaca
accaaaagaaaaaggaaaaaaaaaaatcaaaacgttgaactgatgttttt
caactatgaataagaatctagcctcggaaactatctgatttgtgcataat
tgatgcttcatgcctggagttcttcggggcctaagagttaaaaggtattt
cttgatattcgcatgtgctggttttctggggaatccacaaagacccacag
aggacctaacgatcaatattcctgctcatcaaaaacttttcctcacgcag
tcaccctggtgggggtggccaagagccttccaattggaaagaataatact
ccagtaatgcgccaaaatgtctcagagcttgaggggatatttcagaagtg
gcttttcacgtcaacattctttcaacaattcggtcgacttctcataaaat
taatagtaaatactttctttaaggggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgctgg
tatttgggcatgatttgttttgtgttattgaaatatgctactctggaaag
tactcagctgtatatgcca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_7593242_7594375
seq2: B6Ng01-191A05.b_45_1175 (reverse)

seq1  AGAGA-CTTTTGCCAAGCAAATTTACTCCAAAGGAGAAACAGGACAAATA  49
      ||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||
seq2  AGAGACCTTTGGCCAAGCAAATTTACCTCAAAGGAGAAACA-GACAAATA  49

seq1  GGTCCTCACTCAGCCCAGGCTCTATGTGAATTTTTGTAGAATTGAATTGT  99
       |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||   |||||
seq2  AGTCCTCACTCAGCCCA-GCTCTATGTTGAATTTTGTAGAAT--GATTGT  96

seq1  TGC-TGTAACCAGGATTCAAGTGGAGAGCTGGGAATGGGGGTGTCGTTCC  148
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGCTTGTAACCAGGATTCAAGTGGAGAGCTGGGAAT-GGGGTGTCGTTCC  145

seq1  GCTCAAGCTGAGTGGTTTGAGAAGGAAGAGATTTTGAGCTGAATAGACTC  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAAGCTGAGTGGTTTGAGAAGGAAGAGATTTTGAGCTGAATAGACTC  195

seq1  CTGTGTGACTGACAGGAAAAGAAGAGGAAAAGCAAGACGCAAGAGGATGA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTGACTGACAGGAAAAGAAGAGGAAAAGCAAGACGCAAGAGGATGA  245

seq1  ATGATTAAAATCAAATGGACGTGGAACCATTTAAGTAATTGGGTCAAAGG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTAAAATCAAATGGACGTGGAACCATTTAAGTAATTGGGTCAAAGG  295

seq1  ATAGTAAATGCAGTTCAATTTAGGATAATGTTCAATAAATCGCTTAAGAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTAAATGCAGTTCAATTTAGGATAATGTTCAATAAATCGCTTAAGAA  345

seq1  ATGACCTAGGGAATACAGGTTAAATGGAGCAGCCATGTCGGAGATTGATC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCTAGGGAATACAGGTTAAATGGAGCAGCCATGTCGGAGATTGATC  395

seq1  GGCAAGATACAATAAGGGAAATCATTGAAACTACCCTCCCGAGCATAACC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGATACAATAAGGGAAATCATTGAAACTACCCTCCCGAGCATAACC  445

seq1  AGCATTACTGAAAAGGTCACAGCTACTCTAACAGCAAGAAGGCAGATAGA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTACTGAAAAGGTCACAGCTACTCTAACAGCAAGAAGGCAGATAGA  495

seq1  CGCCCCAGACCCCAGAGCAGCTGCCCTCATTCACAAACGCTTTCCTGCTG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCCCAGACCCCAGAGCAGCTGCCCTCATTCACAAACGCTTTCCTGCTG  545

seq1  CCCTATGCTAATGAAGACTTACTCAATTTCTGTAAACTTAATATATTTTA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTATGCTAATGAAGACTTACTCAATTTCTGTAAACTTAATATATTTTA  595

seq1  ATATCACTGTGGGCTTTTCCAAAACTCTCCTATTTGGGGAAGGGCTTGGA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCACTGTGGGCTTTTCCAAAACTCTCCTATTTGGGGAAGGGCTTGGA  645

seq1  AAAGTTGGCAATTTTATTCACACATAAAAGCTCATGGCACAAATGTACCA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTGGCAATTTTATTCACACATAAAAGCTCATGGCACAAATGTACCA  695

seq1  CCTTCTTGTCAAATTCTTCAGTGGATCATCCTGAGATATGTGTGCCACGG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTTGTCAAATTCTTCAGTGGATCATCCTGAGATATGTGTGCCACGG  745

seq1  CTGAAGGGGGGTTCCCCTAAAGACACTAGGCACAGCCTAAAGATGGTGTC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGGGGGGTTCCCCTAAAGACACTAGGCACAGCCTAAAGATGGTGTC  795

seq1  AGCTAGGGAGGTGAAATTAAAGTAAGCCCAGCTTATGCTTGCTTCAGGTG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGGGAGGTGAAATTAAAGTAAGCCCAGCTTATGCTTGCTTCAGGTG  845

seq1  TAGAGGGAGTTTGCAGTCATTTGATTGACATTTGGCTAGTTGAATTTAAA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGGAGTTTGCAGTCATTTGATTGACATTTGGCTAGTTGAATTTAAA  895

seq1  TAGGGCTCCTTTAGTTATGCACAAGCAAGTTTGGAATAGTAGTTCATTGC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGCTCCTTTAGTTATGCACAAGCAAGTTTGGAATAGTAGTTCATTGC  945

seq1  AATGGAGAACAAGAAGCTCAACCCGTAGTTGTACACAGCAAATGTTAAGC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGAGAACAAGAAGCTCAACCCGTAGTTGTACACAGCAAATGTTAAGC  995

seq1  ACCACTCCATGCCACAACACCTGGCAAGTCCTGGGAGAATTGGTGGGAAG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACTCCATGCCACAACACCTGGCAAGTCCTGGGAGAATTGGTGGGAAG  1045

seq1  AATTGTCTTCCTTCATTCTATCCTTTCACTGGAATGTCCCTGGCATGCAG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGTCTTCCTTCATTCTATCCTTTCACTGGAATGTCCCTGGCATGCAG  1095

seq1  TTAGCCATGGAATGGTCTCAATTTGATAGTGAATTC  1134
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCCATGGAATGGTCTCAATTTGATAGTGAATTC  1131

seq1: chr15_7462553_7463127
seq2: B6Ng01-191A05.g_65_639

seq1  GAATTCAAGGCCAGCCTGAACGCCACAGTAAGATGCTGTCTTAGAAAACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGCCAGCCTGAACGCCACAGTAAGATGCTGTCTTAGAAAACA  50

seq1  ACAACAACCAAAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAATCAAAACGTTGAACTGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAACCAAAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAATCAAAACGTTGAACTGAT  100

seq1  GTTTTTCAACTATGAATAAGAATCTAGCCTCGGAAACTATCTGATTTGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTCAACTATGAATAAGAATCTAGCCTCGGAAACTATCTGATTTGTG  150

seq1  CATAATTGATGCTTCATGCCTGGAGTTCTTCGGGGCCTAAGAGTTAAAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAATTGATGCTTCATGCCTGGAGTTCTTCGGGGCCTAAGAGTTAAAAG  200

seq1  GTATTTCTTGATATTCGCATGTGCTGGTTTTCTGGGGAATCCACAAAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTCTTGATATTCGCATGTGCTGGTTTTCTGGGGAATCCACAAAGAC  250

seq1  CCACAGAGGACCTAACGATCAATATTCCTGCTCATCAAAAACTTTTCCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGAGGACCTAACGATCAATATTCCTGCTCATCAAAAACTTTTCCTC  300

seq1  ACGCAGTCACCCTGGTGGGGGTGGCCAAGAGCCTTCCAATTGGAAAGAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCAGTCACCCTGGTGGGGGTGGCCAAGAGCCTTCCAATTGGAAAGAAT  350

seq1  AATACTCCAGTAATGCGCCAAAATGTCTCAGAGCTTGAGGGGATATTTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACTCCAGTAATGCGCCAAAATGTCTCAGAGCTTGAGGGGATATTTCA  400

seq1  GAAGTGGCTTTTCACGTCAACATTCTTTCAACAATTCGGTCGACTTCTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGGCTTTTCACGTCAACATTCTTTCAACAATTCGGTCGACTTCTCA  450

seq1  TAAAATTAATAGTAAATACTTTCTTTAAGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATTAATAGTAAATACTTTCTTTAAGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  500

seq1  TGCTGGTATTTGGGCATGATTTGTTTTGTGTTATTGAAATATGCTACCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TGCTGGTATTTGGGCATGATTTGTTTTGTGTTATTGAAATATGCTACTCT  550

seq1  GGAAAGTACTCAGCTGTAAATGCCA  575
      |||||||||||||||||| ||||||
seq2  GGAAAGTACTCAGCTGTATATGCCA  575