BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-191B15
Chromosome15 (Build37)
Map Location 64,126,856 - 64,310,011
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDdef1
Upstream geneEG239502, EG432959, LOC672194, Mlze, AI987692, Gsdmdc2, 9930109F21Rik, LOC665769, 9030605I04Rik, 4933426G20Rik, 0910001A06Rik
Downstream geneAdcy8, LOC268812, LOC100040790, LOC665836
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-191B15.bB6Ng01-191B15.g
ACCGA014687GA014688
length1,109639
definitionB6Ng01-191B15.b B6Ng01-191B15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,126,856 - 64,127,966)(64,309,374 - 64,310,011)
sequence
gaattcttcatttctgccacaggcacagtcagtagggtgtaacagaaaac
gtgcatcctctgctgcatcacctcttaaccacgccacatggccgagcctt
gctttctgcagctcagggctgtagctccctgctacactactgactcttcg
agagggccatcagactctggctgggggctgctgatcttggtttgcttgct
gctccaagagctcataaaccacataagagttcattcctcggccatacccc
tgagggcagctgttgctgagctcttagtacacaatgggtgattcagaatc
gaagctgacggcccgcaatcaaaatcacaaggttggagctggagatgtac
tctaggtggcagagtgttcacctaccatgcgtgaggctctgggttgaatg
gccaacatttcataaaagccagtgtagctgcacacacctaatcccagttg
gagatggtagcagaaggatcaaggcaactcttggccacagagcaagctca
gggccagcatggaacacaggagaacctttctaagaaaaagaaaatcacaa
ggtggggacagaatgacagaaacacgtgcacattaataagtaagtgcctt
actatcctattcttccatgtgagctgaaaagcagtcaggaagactgcatc
tgaagagacggtgggctgtatacaagcctcaagctcatggatgcctccgt
aggctggacacataccggtggagcaactctgcattagggagacactaagt
ctctgcctgttggggaatgagagtcacttcacctgtactcagcacctacc
agcactcactctctctcttgggagactgagctgacgtctctaaactatca
tttcttcaggaagacaacacacatgacattctttgtaatcaacatgtctc
ataaaagtgatagaaaccttttaaagcaacaaaataaatcacatgccaca
gatgggggcaataatgttgttgccttgtggtgaacaagtagttaacgggt
gagcaaacttcaggcagtagttttgagcagaatcacaggatccatgaagg
cattcagagcttgaggaagccatgtgaacacagtcaacatggtgagctct
ttttctgct

gaattcaatattattaaaagatgcagatttctttgtgtgtgcacacttgt
gtgcacattctcacagtaggcagaggaggatgttaagtatctttccctat
cattctttgccttgtttctatgagttagggtctccccccgaatatgcagc
taggctagtgtctacaagccctggatcctaccttctctatctccacagtt
ctggggttatagatgtaggtatagccatactggcttagtcatgtgggtga
tgcttagaacaagtaaccaggagccccagatgggttgaggtagagaaaaa
aaaagcagaaataagaaagaggattttaaaaatgtgataaagagattccc
ataaaaataggaaagaagggaagaaaaggaaatggaagaaaacagtactt
agaacaggatttgataagttttaaggacctaaccatgagcagcaagaagg
gctaagctaatcttcaaaaactgatctcagagtcaccagaactgctttag
gttctatattgtgttttgaagtgtttgggatgattttggtttgtctgttg
ttgatatgtttgttgttgttgatgatgtcattgtcatttttattgtgacg
ggggccttaactgctatgcagcctgaatacggccttgaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_64126856_64127966
seq2: B6Ng01-191B15.b_42_1150

seq1  GAATTCTTCATTTCTGCCACAGGCACAGTCAGTAGGGTGTAACAGAAAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCATTTCTGCCACAGGCACAGTCAGTAGGGTGTAACAGAAAAC  50

seq1  GTGCATCCTCTGCTGCATCACCTCTTAACCACGCCACATGGCCGAGCCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCATCCTCTGCTGCATCACCTCTTAACCACGCCACATGGCCGAGCCTT  100

seq1  GCTTTCTGCAGCTCAGGGCTGTAGCTCCCTGCTACACTACTGACTCTTCG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCTGCAGCTCAGGGCTGTAGCTCCCTGCTACACTACTGACTCTTCG  150

seq1  AGAGGGCCATCAGACTCTGGCTGGGGGCTGCTGATCTTGGTTTGCTTGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGCCATCAGACTCTGGCTGGGGGCTGCTGATCTTGGTTTGCTTGCT  200

seq1  GCTCCAAGAGCTCATAAACCACATAAGAGTTCATTCCTCGGCCATACCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCAAGAGCTCATAAACCACATAAGAGTTCATTCCTCGGCCATACCCC  250

seq1  TGAGGGCAGCTGTTGCTGAGCTCTTAGTACACAATGGGTGATTCAGAATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGCAGCTGTTGCTGAGCTCTTAGTACACAATGGGTGATTCAGAATC  300

seq1  GAAGCTGACGGCCCGCAATCAAAATCACAAGGTTGGAGCTGGAGATGTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCTGACGGCCCGCAATCAAAATCACAAGGTTGGAGCTGGAGATGTAC  350

seq1  TCTAGGTGGCAGAGTGTTCACCTACCATGCGTGAGGCTCTGGGTTGAATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGTGGCAGAGTGTTCACCTACCATGCGTGAGGCTCTGGGTTGAATG  400

seq1  GCCAACATTTCATAAAAGCCAGTGTAGCTGCACACACCTAATCCCAGTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAACATTTCATAAAAGCCAGTGTAGCTGCACACACCTAATCCCAGTTG  450

seq1  GAGATGGTAGCAGAAGGATCAAGGCAACTCTTGGCCACAGAGCAAGCTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGGTAGCAGAAGGATCAAGGCAACTCTTGGCCACAGAGCAAGCTCA  500

seq1  GGGCCAGCATGGAACACAGGAGAACCTTTCTAAGAAAAAGAAAATCACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCAGCATGGAACACAGGAGAACCTTTCTAAGAAAAAGAAAATCACAA  550

seq1  GGTGGGGACAGAATGACAGAAACACGTGCACATTAATAAGTAAGTGCCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGGGACAGAATGACAGAAACACGTGCACATTAATAAGTAAGTGCCTT  600

seq1  ACTATCCTATTCTTCCATGTGAGCTGAAAAGCAGTCAGGAAGACTGCATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATCCTATTCTTCCATGTGAGCTGAAAAGCAGTCAGGAAGACTGCATC  650

seq1  TGAAGAGACGGTGGGCTGTATACAAGCCTCAAGCTCATGGATGCCTCCGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAGACGGTGGGCTGTATACAAGCCTCAAGCTCATGGATGCCTCCGT  700

seq1  AGGCTGGACACATACCGGTGGAGCAACTCTGCATTAGGGAGACACTAAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGGACACATACCGGTGGAGCAACTCTGCATTAGGGAGACACTAAGT  750

seq1  CTCTGCCTGTTGGGGAATGAGAGTCACTTCACCTGTACTCAGCACCTACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCCTGTTGGGGAATGAGAGTCACTTCACCTGTACTCAGCACCTACC  800

seq1  AGCACTCACTCTCTCTCTTGGGAGACTGAGCTGACGTCTCTAAACTATCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACTCACTCTCTCTCTTGGGAGACTGAGCTGACGTCTCTAAACTATCA  850

seq1  TTTCTTCAGGAAGACAACACACATGACATTCTTTGTAATCAACATGTCTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTCAGGAAGACAACACACATGACATTCTTTGTAATCAACATGTCTC  900

seq1  ATAAAAGTGATAGAAACC-TTTAAAGCAAACAAAATAAATCACATGCCAC  949
      |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAGTGATAGAAACCTTTTAAAGC-AACAAAATAAATCACATGCCAC  949

seq1  AGATGGGGGCAAATAATGTTG-TGCCTTGTGGTGAACAAGTAGTT-ACGG  997
      |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AGATGGGGGC-AATAATGTTGTTGCCTTGTGGTGAACAAGTAGTTAACGG  998

seq1  GTGAGCAAAC-TCAGGCAGTAGTTTTGAGCAGATCAACAGAATCCATGAG  1046
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| 
seq2  GTGAGCAAACTTCAGGCAGTAGTTTTGAGCAGAATCACAGGATCCATGAA  1048

seq1  GGAATCAGGAGCTTGAGGAAGCCAATGTGAACCACAAGTTCAACATGGTG  1096
      || ||   ||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||| 
seq2  GGCATTCAGAGCTTGAGGAAGCC-ATGTGAA-CACA--GTCAACATGGT-  1093

seq1  GAGCTC-TTTTCTGCT  1111
      |||||| |||||||||
seq2  GAGCTCTTTTTCTGCT  1109


seq1: chr15_64309374_64310011
seq2: B6Ng01-191B15.g_62_700 (reverse)

seq1  TTCAAGGCCGTCTTCA-GCTGCATAGCAGTTTAAGGCCCCGTCACAATAA  49
      ||||||||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||
seq2  TTCAAGGCCGTATTCAGGCTGCATAGCAGTTAAGGCCCCCGTCACAATAA  50

seq1  AAATGACAATGACATCATCAACAACAACAAACATATCAACAACAGACAAA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGACAATGACATCATCAACAACAACAAACATATCAACAACAGACAAA  100

seq1  CCAAAATCATCCCAAACACTTCAAAACACAATATAGAACCTAAAGCAGTT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAATCATCCCAAACACTTCAAAACACAATATAGAACCTAAAGCAGTT  150

seq1  CTGGTGACTCTGAGATCAGTTTTTGAAGATTAGCTTAGCCCTTCTTGCTG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGACTCTGAGATCAGTTTTTGAAGATTAGCTTAGCCCTTCTTGCTG  200

seq1  CTCATGGTTAGGTCCTTAAAACTTATCAAATCCTGTTCTAAGTACTGTTT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGGTTAGGTCCTTAAAACTTATCAAATCCTGTTCTAAGTACTGTTT  250

seq1  TCTTCCATTTCCTTTTCTTCCCTTCTTTCCTATTTTTATGGGAATCTCTT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCATTTCCTTTTCTTCCCTTCTTTCCTATTTTTATGGGAATCTCTT  300

seq1  TATCACATTTTTAAAATCCTCTTTCTTATTTCTGCTTTTTTTTTCTCTAC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCACATTTTTAAAATCCTCTTTCTTATTTCTGCTTTTTTTTTCTCTAC  350

seq1  CTCAACCCATCTGGGGCTCCTGGTTACTTGTTCTAAGCATCACCCACATG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACCCATCTGGGGCTCCTGGTTACTTGTTCTAAGCATCACCCACATG  400

seq1  ACTAAGCCAGTATGGCTATACCTACATCTATAACCCCAGAACTGTGGAGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAGCCAGTATGGCTATACCTACATCTATAACCCCAGAACTGTGGAGA  450

seq1  TAGAGAAGGTAGGATCCAGGGCTTGTAGACACTAGCCTAGCTGCATATTC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAAGGTAGGATCCAGGGCTTGTAGACACTAGCCTAGCTGCATATTC  500

seq1  GGGGGGAGACCCTAACTCATAGAAACAAGGCAAAGAATGATAGGGAAAGA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGAGACCCTAACTCATAGAAACAAGGCAAAGAATGATAGGGAAAGA  550

seq1  TACTTAACATCCTCCTCTGCCTACTGTGAGAATGTGCACACAAGTGTGCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTAACATCCTCCTCTGCCTACTGTGAGAATGTGCACACAAGTGTGCA  600

seq1  CACACAAAGAAATCTGCATCTTTTAATAATATTGAATTC  638
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACAAAGAAATCTGCATCTTTTAATAATATTGAATTC  639


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |