BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-196H18
Chromosome15 (Build37)
Map Location 57,767,767 - 57,905,584
singlet/doubletdoublet
Overlap geneWdr67, BC030396, 9130401M01Rik, Zhx1
Upstream geneLOC100040067, LOC100039984, BC026439, Zhx2, Derl1
Downstream geneAtad2, LOC665244, 2410187C16Rik, Fbxo32, 8230402K04Rik, Anxa13, LOC100040231, D15Ertd621e, EG631797, Tmem65, EG546638, Trmt12, Rnf139, Tatdn1, Ndufb9, Mtss1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-196H18.bB6Ng01-196H18.g
ACCGA018613GA018614
length9981,055
definitionB6Ng01-196H18.b B6Ng01-196H18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(57,767,767 - 57,768,774)(57,904,517 - 57,905,584)
sequence
gaattcctgcctgatagctttgatgccggttccaatcaggtgagtagcag
tagctcttgcttccagacctgtgttggctctgatgttcatacacttcttc
tcttctgcagtaatccttattctttaaaagtccccacacttacacagtgt
atggtagccatttccacccacacaggtgccctccggtgccccgtggttcc
ctgcttctcctccatcccagctctatcttcatcagctctcagcgtagcta
gcatcacagctgacttgaatctaaaactttgggtagtttatttttgtgaa
gaatctagagttgaaaaaagaattcaaaatcttgtgttatttatttaata
ttactgacaagtaattgtttaactttttttatattgacagtcgtagtgaa
tttcaaagttaaattcaacatgtttcatgtggttgcatacatacacgcac
atgcagtatgtaagcatgtcggtatctgtctcatttaagatttctaaatt
gttgatgtgttcttatagttggaaatgtaaaacttacagttggaaatgta
aaacttacaagtgggtgttggtggtaagcctcatcctgtctcctgttgtc
tgggtattcacttcttcccacaactactgttgttacatataatatgtttc
ctctgcagatacaaccttacaccttttttctgaatttggaaatgattctg
aaattatcatcagtacaaaatgtcttcctctttcatggctctatatttca
tgtttctctttaaactagccctctgttactgggcacttaatctattctta
gtcccttttctgttatgaataatgccttgcaaatgacgaaatttttacaa
atgtcctttttcctatcctattgtaggataaaaatccagagttgagatag
tttcatgaagcatatggtccttgcaaattgtctcaagcagctgctgcaca
cgtggacagctatgcgctggcagcagcatcaacagcacattttctctg
gaattccaggacagccagggctacacagagaaaccctgtctcgaaacaaa
caaacaaacaaaatgagaaaaaataaactccaagagtcctagtgacttcc
gtaacttatgacagtcctgagccatttgtacattctcaaaagagcttaat
gtttttggtagagatgctttaaacatacaggtcaggtataaccagcttat
agctcagcatttggaacaccaactttaactatgtgctgttctttgctttt
cccacagtgcatatagctctagtgttatactcacttctgaacagattagt
ctggcaaaccagagaggcatacatagataccagatggtttgaaaatatgc
taaggctgaaaacataaatgtgtctgtgtagaagatgctcatcggtagct
tcgtctccaagcatctgaacttgcttggcttgagggtaggacacgaaaga
tgtcacagtggttttacctttcaggattcttggttttgctgaaaaggagc
agaggtttgctgtcttactaatgtagttgatagcatacacatggaggctt
gtttcaaagagttcctgttttgtttaattcacactcatatggaaaagtga
tgtgatgaggtattttctcttttactgtcatgcactctttttttaaaagt
ttatttatttataagtgctctactacatgtgcacctgcatgacagaagag
ggcatcagattcctttatagatggccatgagccaccatgtgggggctggg
aattgaactcaggacctgtggagaatagccagtgctcttaactgctgagc
catctctccagaccctactttcatgcactctttttaaaagttatatattg
cttgtgtttgggcattttgtctacatgtaatatctgtgcaccgtgatatg
cagtgctctcagagggcagaggagtggctggatcccgtgaactggagtat
aggcaagatgtgagctttcatgtggtgctggatgacccaggtccttctct
cctctgaggacagccaatactttaaagactgaccttctctcagatctgtt
catgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_57767767_57768774
seq2: B6Ng01-196H18.b_45_1042

seq1  GAATTCCTGCCTGATAGCTTTGATGCCGGTTCCAATCAGGTGAGTAGCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGCCTGATAGCTTTGATGCCGGTTCCAATCAGGTGAGTAGCAG  50

seq1  TAGCTCTTGCTTCCAGACCTGTGTTGGCTCTGATGTTCATACACTTCTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTCTTGCTTCCAGACCTGTGTTGGCTCTGATGTTCATACACTTCTTC  100

seq1  TCTTCTGCAGTAATCCTTATTCTTTAAAAGTCCCCACACTTACACAGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTGCAGTAATCCTTATTCTTTAAAAGTCCCCACACTTACACAGTGT  150

seq1  ATGGTAGCCATTTCCACCCACACAGGTGCCCTCCGGTGCCCCGTGGTTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTAGCCATTTCCACCCACACAGGTGCCCTCCGGTGCCCCGTGGTTCC  200

seq1  CTGCTTCTCCTCCATCCCAGCTCTATCTTCATCAGCTCTCAGCGTAGCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTCTCCTCCATCCCAGCTCTATCTTCATCAGCTCTCAGCGTAGCTA  250

seq1  GCATCACAGCTGACTTGAATCTAAAACTTTGGGTAGTTTATTTTTGTGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCACAGCTGACTTGAATCTAAAACTTTGGGTAGTTTATTTTTGTGAA  300

seq1  GAATCTAGAGTTGAAAAAAGAATTCAAAATCTTGTGTTATTTATTTAATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTAGAGTTGAAAAAAGAATTCAAAATCTTGTGTTATTTATTTAATA  350

seq1  TTACTGACAAGTAATTGTTTAACTTTTTTTATATTGACAGTCGTAGTGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTGACAAGTAATTGTTTAACTTTTTTTATATTGACAGTCGTAGTGAA  400

seq1  TTTCAAAGTTAAATTCAACATGTTTCATGTGGTTGCATACATACACGCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAAGTTAAATTCAACATGTTTCATGTGGTTGCATACATACACGCAC  450

seq1  ATGCAGTATGTAAGCATGTCGGTATCTGTCTCATTTAAGATTTCTAAATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGTATGTAAGCATGTCGGTATCTGTCTCATTTAAGATTTCTAAATT  500

seq1  GTTGATGTGTTCTTATAGTTGGAAATGTAAAACTTACAGTTGGAAATGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGATGTGTTCTTATAGTTGGAAATGTAAAACTTACAGTTGGAAATGTA  550

seq1  AAACTTACAAGTGGGTGTTGGTGGTAAGCCTCATCCTGTCTCCTGTTGTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTACAAGTGGGTGTTGGTGGTAAGCCTCATCCTGTCTCCTGTTGTC  600

seq1  TGGGTATTCACTTCTTCCCACAACTACTGTTGTTACATATAATATGTTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTATTCACTTCTTCCCACAACTACTGTTGTTACATATAATATGTTTC  650

seq1  CTCTGCAGATACAACCTTACACCTTTTTTCTGAATTTGGAAATGATTCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCAGATACAACCTTACACCTTTTTTCTGAATTTGGAAATGATTCTG  700

seq1  AAATTATCATCAGTACAAAATGTCTTCCTCTTTCATGGCTCTATATTTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTATCATCAGTACAAAATGTCTTCCTCTTTCATGGCTCTATATTTCA  750

seq1  TGTTTCTCTTTAAACTAGCCCTCTGTTACTGGGCACTTAATCTATTCTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCTCTTTAAACTAGCCCTCTGTTACTGGGCACTTAATCTATTCTTA  800

seq1  GT-CCTTTTCTGTTATGAATAATGCCTTGCAAATGACGAAATTTTTACAA  849
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCTTTTCTGTTATGAATAATGCCTTGCAAATGACGAAATTTTTACAA  850

seq1  ATGTCCTTTTTCCTATCCTATTTGTAGGATAAAAATCCCAGAGTTGAGAT  899
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  ATGTCCTTTTTCCTATCCTA-TTGTAGGATAAAAAT-CCAGAGTTGAGAT  898

seq1  AGTTTCATGAAGGCATATGGTCCTTGCAAATTGTCCTCAAGGCAGCCTGC  949
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||
seq2  AGTTTCATGAA-GCATATGGTCCTTGCAAATTGT-CTCAA-GCAG-CTGC  944

seq1  TGCACACGTGGACAGCTATGCGCTGCCAGCCAGCCATTCAAACAGCACAT  999
      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||   ||||||||||
seq2  TGCACACGTGGACAGCTATGCGCTGGCAG-CAG-CAT--CAACAGCACAT  990

seq1  TTTCCTCTG  1008
      ||| |||||
seq2  TTT-CTCTG  998

seq1: chr15_57904517_57905584
seq2: B6Ng01-196H18.g_67_1121 (reverse)

seq1  ACATGACCAAGATCTGGAGAGAGGCTCAGTCCTTAAAAGTATTGGCTGTC  50
      |||||| | |||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||
seq2  ACATGAAC-AGATCT-GAGAGAAGGTCAGT-CTTTAAAGTATTGGCTGTC  47

seq1  CTTCCAGAGGAGAG-AGGACCTGGGTTCAATTCCCAGCACCAACATGAAG  99
      ||  |||||||||| |||||||||| |||    |||||||| ||||||| 
seq2  CT--CAGAGGAGAGAAGGACCTGGG-TCA---TCCAGCACC-ACATGAAA  90

seq1  GCTCACATC-TGCCTATACCTCCAGTTCCACGGGATCCAGCCACCTCCTC  148
      ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||
seq2  GCTCACATCTTGCCTATA-CTCCAGTT-CACGGGATCCAGCCA-CTCCTC  137

seq1  TGCCCTCTGAGGGCACTGCATATCACGGTGCACAGATA-TACATGTAGAC  197
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TGCCCTCTGAGAGCACTGCATATCACGGTGCACAGATATTACATGTAGAC  187

seq1  AAAATGCCCAAACACAAGCAATATTATAACTTTTTAAAAAGAGTGCATGA  247
      ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||
seq2  AAAATGCCCAAACACAAGCAATA-TATAAC-TTTTAAAAAGAGTGCATGA  235

seq1  AAGTAGGGTCTGGAGAGATGGCTCAGCAGTTAAGAGCACTGGCTATTCTT  297
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AAGTAGGGTCTGGAGAGATGGCTCAGCAGTTAAGAGCACTGGCTATTC-T  284

seq1  CCACAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCCCCCACATGGTGGCTCATGGCCA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCCCCCACATGGTGGCTCATGGCCA  334

seq1  TCTATAAAGGAATCTGATGCCCTCTTCTGTCATGCAGGTGCACATGTAGT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATAAAGGAATCTGATGCCCTCTTCTGTCATGCAGGTGCACATGTAGT  384

seq1  AGAGCACTTATAAATAAATAAACTTTTAAAAAAAGAGTGCATGACAGTAA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCACTTATAAATAAATAAACTTTTAAAAAAAGAGTGCATGACAGTAA  434

seq1  AAGAGAAAATACCTCATCACATCACTTTTCCATATGAGTGTGAATTAAAC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAAAATACCTCATCACATCACTTTTCCATATGAGTGTGAATTAAAC  484

seq1  AAAACAGGAACTCTTTGAAACAAGCCTCCATGTGTATGCTATCAACTACA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAGGAACTCTTTGAAACAAGCCTCCATGTGTATGCTATCAACTACA  534

seq1  TTAGTAAGACAGCAAACCTCTGCTCCTTTTCAGCAAAACCAAGAATCCTG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTAAGACAGCAAACCTCTGCTCCTTTTCAGCAAAACCAAGAATCCTG  584

seq1  AAAGGTAAAACCACTGTGACATCTTTCGTGTCCTACCCTCAAGCCAAGCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTAAAACCACTGTGACATCTTTCGTGTCCTACCCTCAAGCCAAGCA  634

seq1  AGTTCAGATGCTTGGAGACGAAGCTACCGATGAGCATCTTCTACACAGAC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCAGATGCTTGGAGACGAAGCTACCGATGAGCATCTTCTACACAGAC  684

seq1  ACATTTATGTTTTCAGCCTTAGCATATTTTCAAACCATCTGGTATCTATG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTATGTTTTCAGCCTTAGCATATTTTCAAACCATCTGGTATCTATG  734

seq1  TATGCCTCTCTGGTTTGCCAGACTAATCTGTTCAGAAGTGAGTATAACAC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCTCTCTGGTTTGCCAGACTAATCTGTTCAGAAGTGAGTATAACAC  784

seq1  TAGAGCTATATGCACTGTGGGAAAAGCAAAGAACAGCACATAGTTAAAGT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGCTATATGCACTGTGGGAAAAGCAAAGAACAGCACATAGTTAAAGT  834

seq1  TGGTGTTCCAAATGCTGAGCTATAAGCTGGTTATACCTGACCTGTATGTT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTTCCAAATGCTGAGCTATAAGCTGGTTATACCTGACCTGTATGTT  884

seq1  TAAAGCATCTCTACCAAAAACATTAAGCTCTTTTGAGAATGTACAAATGG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGCATCTCTACCAAAAACATTAAGCTCTTTTGAGAATGTACAAATGG  934

seq1  CTCAGGACTGTCATAAGTTACGGAAGTCACTAGGACTCTTGGAGTTTATT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGACTGTCATAAGTTACGGAAGTCACTAGGACTCTTGGAGTTTATT  984

seq1  TTTTCTCATTTTGTTTGTTTGTTTGTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTCATTTTGTTTGTTTGTTTGTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTA  1034

seq1  GCCCTGGCTGTCCTGGAATTC  1068
      |||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTGGCTGTCCTGGAATTC  1055