BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-197K08
Chromosome15 (Build37)
Map Location 63,972,482 - 64,126,861
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDdef1
Upstream geneEG239502, EG432959, LOC672194, Mlze, AI987692, Gsdmdc2, 9930109F21Rik, LOC665769, 9030605I04Rik, 4933426G20Rik, 0910001A06Rik
Downstream geneAdcy8, LOC268812, LOC100040790, LOC665836
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-197K08.bB6Ng01-197K08.g
ACCGA019454GA019455
length1,1391,130
definitionB6Ng01-197K08.b B6Ng01-197K08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,125,727 - 64,126,861)(63,972,482 - 63,973,620)
sequence
gaattctttgtaagttttgttataaaccatcatcctctggcatatagcca
tccctttcattagagtagctgtagaaagcctcaagattcagcttgttgat
tcttgatgtttcctcagagagggatctaggaagagtcattggacccttgc
ttgatctcagtcccttcccccactccctgtgcacctcctatttagctgta
tataattctgtccctgattgcatgtggtcacaggatctctgaaactgctc
cgttatggaaggttaactaggagttagggaggagggtcctgggacttcat
ctgtgaaactgtgagacttctggagttgtggaattgctttgggattgttc
atgcttctatgagactgctctcacccatattctgcaagtagtaccaataa
gctcattgagtccccaagttggaccttggaggatttgtttttgtacttat
agaaaatgaataagataacttgttacttttctattgctgcgataaaacat
catgaccaagttataaaagaaagcatttaatttgggacttgaagttctag
aggttagagtccatgatcatcatgatagggagcctggcaggaaacgggca
ggcatgacactggaacagtgcagagagcttatatcttgatccagtcaggg
agaactaggtcactgggaatggtgtgggtattgccagtaagacatttcct
ccaacaaggccacctctcttaatccttcccacacagttccaccaacaggg
gaccaagcattgaaacagttgaacctgtgggggccattctcattcaaccc
accagaatagatgttatcgcatctccctaaggaaagcactcttgcaaaag
atgtgcatggcatcactagcattagagataccacagtgtttgctgggttc
ttggccactaaaactattttggggagaagattagaataatgtccctggag
tattgtccccctcctttatttacctgaacaggcaagctctgttgtggcta
ctgggtcctcttgttgagtgctttttttttttttttaattagagaacttt
aactgtaacagctaattttaattgatgccttgttgaatgtggtaaattcg
tttgcctctttaaaacccctcaacacctggttaagtatg

gaattcagtattagctgcgcatagacaagtcagccagcgtcctctcttct
cattgctaagtactcactggcttcaaagtatctgctggacagcttcacat
aagggctgaacccgtttactccactagcaataatacttgggtgatattta
tcctacagaatggtcaggctgcggcgtcaacacgaacctcaagtgacagg
gacacatcctgcctataccacacatattctcccccaggctgaactgcaat
aggtgtagcaaacaaagcagctgctacccaatgctgagcagagggacatg
agaaaaaggcttagggacggacgggcctggggaatgttctactcaagtcc
gaagagctttagcagaagcacagaaattagcaataatggtaattctagct
gtttgtttaagttacgaaatttcaaaaccactcttgacatttagactaaa
ttataggtatattgatgaaagacgacaatctttccacagattaaaatgag
agcaaaactaaacaacttggcccagctgcatcgtggtggggcagtccagg
aagtaaagtatgtatatactgtccccttcccactcgaacccctccacatc
tttctttccggtgtctagaggccgtggttcctgagccagcagccttcctc
tcacacaagccgcccatctctatggctgttttcctttcaaacaatggtgt
gcttcgtgcttactaaactatgccatgtatacagcaagcactcaaatatc
aatcaaagtcctaccttccaagaacacagtaaatacttcctgtacattcg
aagaaatgcttttagtttcctttactagacaacatgagggagagagatgc
taatgaccttccccagcatgctgagtaagccagtggctgaagggaccaga
gcccccactcttccctacaccaccgtgcaggccagcaggaaaggcagaat
agcggcagccctcaggaggtggctgcgtatctgattcccacccaattcct
aagtcagctgatgagagacatttcagaaggtgaaatagtttctcattcat
ttgggtactaaggttcttccacgtctttagtgctcgtgaaagcaccgctg
tcaccagctctagaaagctgattattctga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_64125727_64126861
seq2: B6Ng01-197K08.b_41_1179 (reverse)

seq1  CATACCTTAACCAGTGGTTGTGAGGTTTAAATGA-GCAAACTGAATTAAC  49
      |||| |||||||||  |||| | ||||| || || |||||| ||||| ||
seq2  CATA-CTTAACCAGGTGTTGAGGGGTTTTAAAGAGGCAAAC-GAATTTAC  48

seq1  CACATTCAACAAGCATTCAATAAAAATTAGCTGTTACAGTTAAAGTTCTC  99
      |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTCAACAAGGCATCAATTAAAATTAGCTGTTACAGTTAAAGTTCTC  98

seq1  TACATATAAAAAAAAAAAAAGCACTCAACAAAGAAGACCCAGTAGCCACA  149
      ||  || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
seq2  TAATTAAAAAAAAAAAAAAAGCACTCAAC-AAGAGGACCCAGTAGCCACA  147

seq1  ACAGAGCTTGCCTG-TCAGGTAAATAAAG--AGGGGACAATACTCCAGGG  196
      |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGCTTGCCTGTTCAGGTAAATAAAGGAGGGGGACAATACTCCAGGG  197

seq1  ACATTATTCTAATC-TCTCCC--AGATAGTTTTAGTGGCCAAGAACCCAG  243
      |||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTATTCTAATCTTCTCCCCAAAATAGTTTTAGTGGCCAAGAACCCAG  247

seq1  CAAACACTGTGGTATCTCTAATGCTAGTGATGCCATGCACATCTTTTGCA  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACACTGTGGTATCTCTAATGCTAGTGATGCCATGCACATCTTTTGCA  297

seq1  AGAGTGCTTTCCTTAGGGAGATGCGATAACATCTATTCTGGTGGGTTGAA  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGCTTTCCTTAGGGAGATGCGATAACATCTATTCTGGTGGGTTGAA  347

seq1  TGAGAATGGCCCCCACAGGTTCAACTGTTTCAATGCTTGGTCCCCTGTTG  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAATGGCCCCCACAGGTTCAACTGTTTCAATGCTTGGTCCCCTGTTG  397

seq1  GTGGAACTGTGTGGGAAGGATTAAGAGAGGTGGCCTTGTTGGAGGAAATG  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAACTGTGTGGGAAGGATTAAGAGAGGTGGCCTTGTTGGAGGAAATG  447

seq1  TCTTACTGGCAATACCCACACCATTCCCAGTGACCTAGTTCTCCCTGACT  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTACTGGCAATACCCACACCATTCCCAGTGACCTAGTTCTCCCTGACT  497

seq1  GGATCAAGATATAAGCTCTCTGCACTGTTCCAGTGTCATGCCTGCCCGTT  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCAAGATATAAGCTCTCTGCACTGTTCCAGTGTCATGCCTGCCCGTT  547

seq1  TCCTGCCAGGCTCCCTATCATGATGATCATGGACTCTAACCTCTAGAACT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGCCAGGCTCCCTATCATGATGATCATGGACTCTAACCTCTAGAACT  597

seq1  TCAAGTCCCAAATTAAATGCTTTCTTTTATAACTTGGTCATGATGTTTTA  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTCCCAAATTAAATGCTTTCTTTTATAACTTGGTCATGATGTTTTA  647

seq1  TCGCAGCAATAGAAAAGTAACAAGTTATCTTATTCATTTTCTATAAGTAC  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCAGCAATAGAAAAGTAACAAGTTATCTTATTCATTTTCTATAAGTAC  697

seq1  AAAAACAAATCCTCCAAGGTCCAACTTGGGGACTCAATGAGCTTATTGGT  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACAAATCCTCCAAGGTCCAACTTGGGGACTCAATGAGCTTATTGGT  747

seq1  ACTACTTGCAGAATATGGGTGAGAGCAGTCTCATAGAAGCATGAACAATC  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACTTGCAGAATATGGGTGAGAGCAGTCTCATAGAAGCATGAACAATC  797

seq1  CCAAAGCAATTCCACAACTCCAGAAGTCTCACAGTTTCACAGATGAAGTC  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGCAATTCCACAACTCCAGAAGTCTCACAGTTTCACAGATGAAGTC  847

seq1  CCAGGACCCTCCTCCCTAACTCCTAGTTAACCTTCCATAACGGAGCAGTT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGACCCTCCTCCCTAACTCCTAGTTAACCTTCCATAACGGAGCAGTT  897

seq1  TCAGAGATCCTGTGACCACATGCAATCAGGGACAGAATTATATACAGCTA  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGATCCTGTGACCACATGCAATCAGGGACAGAATTATATACAGCTA  947

seq1  AATAGGAGGTGCACAGGGAGTGGGGGAAGGGACTGAGATCAAGCAAGGGT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGGAGGTGCACAGGGAGTGGGGGAAGGGACTGAGATCAAGCAAGGGT  997

seq1  CCAATGACTCTTCCTAGATCCCTCTCTGAGGAAACATCAAGAATCAACAA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGACTCTTCCTAGATCCCTCTCTGAGGAAACATCAAGAATCAACAA  1047

seq1  GCTGAATCTTGAGGCTTTCTACAGCTACTCTAATGAAAGGGATGGCTATA  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAATCTTGAGGCTTTCTACAGCTACTCTAATGAAAGGGATGGCTATA  1097

seq1  TGCCAGAGGATGATGGTTTATAACAAAACTTACAAAGAATTC  1135
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGAGGATGATGGTTTATAACAAAACTTACAAAGAATTC  1139


seq1: chr15_63972482_63973620
seq2: B6Ng01-197K08.g_62_1191

seq1  GAATTCAGTATTAGCTGCGCATAGACAAGTCAGCCAGCGTCCTCTCTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTATTAGCTGCGCATAGACAAGTCAGCCAGCGTCCTCTCTTCT  50

seq1  CATTGCTAAGTACTCACTGGCTTCAAAGTATCTGCTGGACAGCTTCACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCTAAGTACTCACTGGCTTCAAAGTATCTGCTGGACAGCTTCACAT  100

seq1  AAGGGCTGAACCCGTTTACTCCACTAGCAATAATACTTGGGTGATATTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCTGAACCCGTTTACTCCACTAGCAATAATACTTGGGTGATATTTA  150

seq1  TCCTACAGAATGGTCAGGCTGCGGCGTCAACACGAACCTCAAGTGACAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTACAGAATGGTCAGGCTGCGGCGTCAACACGAACCTCAAGTGACAGG  200

seq1  GACACATCCTGCCTATACCACACATATTCTCCCCCAGGCTGAACTGCAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACATCCTGCCTATACCACACATATTCTCCCCCAGGCTGAACTGCAAT  250

seq1  AGGTGTAGCAAACAAAGCAGCTGCTACCCAATGCTGAGCAGAGGGACATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTAGCAAACAAAGCAGCTGCTACCCAATGCTGAGCAGAGGGACATG  300

seq1  AGAAAAAGGCTTAGGGACGGACGGGCCTGGGGAATGTTCTACTCAAGTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAAGGCTTAGGGACGGACGGGCCTGGGGAATGTTCTACTCAAGTCC  350

seq1  GAAGAGCTTTAGCAGAAGCACAGAAATTAGCAATAATGGTAATTCTAGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGCTTTAGCAGAAGCACAGAAATTAGCAATAATGGTAATTCTAGCT  400

seq1  GTTTGTTTAAGTTACGAAATTTCAAAACCACTCTTGACATTTAGACTAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTTTAAGTTACGAAATTTCAAAACCACTCTTGACATTTAGACTAAA  450

seq1  TTATAGGTATATTGATGAAAGACGACAATCTTTCCACAGATTAAAATGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGGTATATTGATGAAAGACGACAATCTTTCCACAGATTAAAATGAG  500

seq1  AGCAAAACTAAACAACTTGGCCCAGCTGCATCGTGGTGGGGCAGTCCAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAAACTAAACAACTTGGCCCAGCTGCATCGTGGTGGGGCAGTCCAGG  550

seq1  AAGTAAAGTATGTATATACTGTCCCCTTCCCACTCGAACCCCTCCACATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAAAGTATGTATATACTGTCCCCTTCCCACTCGAACCCCTCCACATC  600

seq1  TTTCTTTCCGGTGTCTAGAGGCCGTGGTTCCTGAGCCAGCAGCCTTCCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTCCGGTGTCTAGAGGCCGTGGTTCCTGAGCCAGCAGCCTTCCTC  650

seq1  TCACACAAGCCGCCCATCTCTATGGCTGTTTTCCTTTCAAACAATGGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACAAGCCGCCCATCTCTATGGCTGTTTTCCTTTCAAACAATGGTGT  700

seq1  GCTTCGTGCTTACTAAACTATGCCATGTATACAGCAAGCACTCAAATATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCGTGCTTACTAAACTATGCCATGTATACAGCAAGCACTCAAATATC  750

seq1  AATCAAAGTCCTACCTTCCAAGAACACAGTAAATACTTCCTGTACATTCG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAAAGTCCTACCTTCCAAGAACACAGTAAATACTTCCTGTACATTCG  800

seq1  AAGAAATGCTTTTAGTTTCCTTTACTAGACAACATGAGGGAGAGAGATGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAATGCTTTTAGTTTCCTTTACTAGACAACATGAGGGAGAGAGATGC  850

seq1  TAATGACCTTCCCCAGCATGCTGAGTAAGCCAGTGGCTGAGGGGACCAGA  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TAATGACCTTCCCCAGCATGCTGAGTAAGCCAGTGGCTGAAGGGACCAGA  900

seq1  GCCCCCACTCTTCCCTACACCACCGTGCAGGCCAGCAGGGAAAGGCAGAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
seq2  GCCCCCACTCTTCCCTACACCACCGTGCAGGCCAGCA-GGAAAGGCAG-A  948

seq1  ATAGCGGCAGCCCTCAGGGAGTGGCTGCGTATCTGATTCCCACCCAAATT  1000
      ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  ATAGCGGCAGCCCTCAGGAGGTGGCTGCGTATCTGATTCCCACCC-AATT  997

seq1  CCTAAGTCAGCTGGATGAAGAGACATTTCAGAAGGTGAAATAGTTTCTCA  1050
      |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAGTCAGCT-GATG-AGAGACATTTCAGAAGGTGAAATAGTTTCTCA  1045

seq1  TTCATTTGGTTACTAAAGGTTCTTCCACGTCTTTAAGTGCTCGTGAAAAG  1100
      ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||
seq2  TTCATTTGGGTACT-AAGGTTCTTCCACGTCTTT-AGTGCTCGTG-AAAG  1092

seq1  CACCGCTGTCACCAGCTCTAGGAAAAGCTGATTA-TCTGA  1139
      |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||
seq2  CACCGCTGTCACCAGCTCTAG--AAAGCTGATTATTCTGA  1130


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |