seq1: chr15_6670811_6671758
seq2: B6Ng01-200I04.b_48_1005 (reverse)
seq1 --ATATATATATAT--ATTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTTGGAGA-CAGA 45
||| |||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||||
seq2 ATATAAATATATATGAATATTTTTTTTTTTTTGAAATTTTGGAGACCAGA 50
seq1 TCTCACGTAGT-CCAGACT-GGCCTCCAATTCCCAGTCCTGACACTACCT 93
||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||
seq2 TCTCACGTAGTCCCAGACTGGGCCTACCATTCCCAGTCCTGACACTACCT 100
seq1 CCTAAGTGCT-GGTATTAGCAGCATGGA-CCACTGTGCTCAGCTGGTGAT 141
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2 CCTAAGTGCTGGGTATTAGCAGCATGGACCCACTGTGCTCAGCTGGTGAT 150
seq1 CTC-TTTTTATATTGTTGGCCCTCTTCTCCTCCCCTTCCCTCCTTTCCTT 190
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCTTTTTTATATTGTTGGCCCTCTTCTCCTCCCCTTCCCTCCTTTCCTT 200
seq1 TCTTTCTGTCTTCAGATTTCTTCTATCTTTTTCCCTCTATTTTTTTTCCT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTTTCTGTCTTCAGATTTCTTCTATCTTTTTCCCTCTATTTTTTTTCCT 250
seq1 TTCATTTCTTTTTGTCTTGCTGAGATTGAACCTAAGATGTCACTTAAGGT 290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCATTTCTTTTTGTCTTGCTGAGATTGAACCTAAGATGTCACTTAAGGT 300
seq1 AGGGCAGTGTTCTACCACTGGACTATAATACATCTTTTTCATAGCCCTTG 340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGGCAGTGTTCTACCACTGGACTATAATACATCTTTTTCATAGCCCTTG 350
seq1 CCATTGGTGATGTTATAGTATATATTTATCGTTTGTCTTCCTGCAGTGAA 390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCATTGGTGATGTTATAGTATATATTTATCGTTTGTCTTCCTGCAGTGAA 400
seq1 AATGTTGTGAGCATGCGTATTTTGTTTTGCTCATTATTGTATTGATGACT 440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATGTTGTGAGCATGCGTATTTTGTTTTGCTCATTATTGTATTGATGACT 450
seq1 GGAACAGCTCTGGCATGCTGTATATGCCTAATAAATATTTATTAAGTGAC 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGAACAGCTCTGGCATGCTGTATATGCCTAATAAATATTTATTAAGTGAC 500
seq1 GATCAGGTTTATGTTTTAGTCTGACAGCTTCAGAGCAATTTTGTATTGCT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GATCAGGTTTATGTTTTAGTCTGACAGCTTCAGAGCAATTTTGTATTGCT 550
seq1 TACAATATCTTAACCATGTAGGCAAGTACACTAAACTTAATGGTTTAAAA 590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TACAATATCTTAACCATGTAGGCAAGTACACTAAACTTAATGGTTTAAAA 600
seq1 TTACAAATTCTCTTATTCTAAAAATGCTTTCCTATTTCTCACCTGTGTTA 640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTACAAATTCTCTTATTCTAAAAATGCTTTCCTATTTCTCACCTGTGTTA 650
seq1 AGAGAAGTGCTTTAATTGGGCCAAATCAGATACCCTAGAGCCATCCTAAC 690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGAGAAGTGCTTTAATTGGGCCAAATCAGATACCCTAGAGCCATCCTAAC 700
seq1 CTTGTTTCTTGTCCCTGTTCCACAAATCCAATTTTGAGTGGGATGATGGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTGTTTCTTGTCCCTGTTCCACAAATCCAATTTTGAGTGGGATGATGGT 750
seq1 ACAGTTTCTATTTCTGAAATACACAGAAGGTCTGGTGTTGCCTGCCTGCT 790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACAGTTTCTATTTCTGAAATACACAGAAGGTCTGGTGTTGCCTGCCTGCT 800
seq1 GTTGTAGCTTTACTCAGGCCTTGCTCTTCTTGGCTGATTGGAATGCTATA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTTGTAGCTTTACTCAGGCCTTGCTCTTCTTGGCTGATTGGAATGCTATA 850
seq1 TGTCCACTCCTTCAGAAGGTCTCTTTCCCTCGTCTGTTCTCTCTTCTGTA 890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTCCACTCCTTCAGAAGGTCTCTTTCCCTCGTCTGTTCTCTCTTCTGTA 900
seq1 TTGTAGCCAGCGCATTGTCTGAGAAGTTAGCAGTAACTTCCCAAATAGGG 940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGTAGCCAGCGCATTGTCTGAGAAGTTAGCAGTAACTTCCCAAATAGGG 950
seq1 TTGAATTC 948
||||||||
seq2 TTGAATTC 958
| seq1: chr15_6473166_6473312
seq2: B6Ng01-200I04.g_70_216
seq1 TTTATCCTTGACACTGAACAGGGTTGAGTGACGGCGTAGCACCATCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTATCCTTGACACTGAACAGGGTTGAGTGACGGCGTAGCACCATCGTCA 50
seq1 GGTTCCTGAGTGAGCACCTTAGGTCTCCAACAAAGATTCCAGTGATGTGC 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGTTCCTGAGTGAGCACCTTAGGTCTCCAACAAAGATTCCAGTGATGTGC 100
seq1 AATGGGCAGCCTTGCTGCTGAGGGTTTGAAAATATGGGGGGGGGGGG 147
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATGGGCAGCCTTGCTGCTGAGGGTTTGAAAATATGGGGGGGGGGGG 147
|
