BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-203O05
Chromosome15 (Build37)
Map Location 35,971,730 - 36,117,966
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRgs22, Fbxo43, 1700074I03Rik, Polr2k, Spag1
Upstream geneStk3, Osr2, Vps13b, EG666183, Cox6c
Downstream geneRnf19, LOC670773, EG268795, EG545101, Ankrd46, 4631426E05Rik, Pabpc1, LOC626746, Ywhaz, Zfp706, LOC670911, LOC667492
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-203O05.bB6Ng01-203O05.g
ACCGA023983GA023984
length1,164741
definitionB6Ng01-203O05.b B6Ng01-203O05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(36,116,803 - 36,117,966)(35,971,730 - 35,972,469)
sequence
gaattccatatcatatggtttagggcacagacgcacaaacttaacacaca
gtgctccattagtgactacaaattcactgattacagatggcagcgtttcc
cactacctgtgagcccctaatgaggagcacagaggtgcaggaaggtaaat
tatgagagagcagactgatggaaatgttttagaaataaaaccaaagattc
tagaaaaactgaggggcagttagatggctcagtgggtagacatgcttgct
gccaagcctaaagacctcagctctatctcccaaatccacagggcagatgg
agagaacccacagcactaaatctgacgtgcacacagtagtatggcataca
cacacacacacacatgtgtacatatatatgtatatatacatacatatata
ctgtgcgtgcatatgttaaatatatttatatttcaatatattttattaaa
tattatattaattattaaataatatatattaaaaagctaaatagccaggc
atgatggtgatgcacacctttaatcccaggacttggaaggcagaggcagt
cagattcctgtgaatttcagaccaggctgaccagggctacatagtaaaac
cctatttaaaaatagtaataaataaacacaagtcaataacaacaaaaata
taagaataacaagaacaggaagatggaaagacgggtagtcattctgtcaa
acaacagggtgagcaggcactcaaaggcctagatttgactttaagtgaac
tggatggacttggagctccaacagaccccgtcttcatgaaactcatgagg
taaaaaggagagttgcaagactaaatagggaccaagtacaaagaatgaaa
accagagaagcatgtgccccagggagtggaggggtctctaagtgcttgca
acaccactcaaagtgggcagtcagctggcttctacagcaacacagcctct
gcacctccccagaaagacagggttcttccctgaaggagaatatcctctat
gctcttaaaaatgatcagagtagagagacagaatggcaaaaataaagagg
aaaaatgctgaccctaaaatgcacaccttcagaaagctatcagaatacag
cttatacaagaagacagcttgggcttgtatagtcaaagccttgttaattc
ccagctatttggga
gaattccgcctggagaggggtagcctgcgctgcagctgaaagggaaaagc
accaggccgtggtgagtggtggccattaacccaagcgcaggcatagatgc
ctgtcactccttagcaaggcagagccatgctctctgcacaaacacttaag
actcttagcatctgctccgcattaagattacaaccctataaataggaaca
agtatggattaaagtgggatgtttatttaaaacccactcaacaaagactg
ttttaaggcctgattcttaagacactaaaacttagccatttaactaaaac
ctgtaatttaaataaatagaaaataatgcaaaatatagatcataataata
taaaatatatgctcattatacttagtatttcaataaaaatataacaaaaa
caaacctttcaaaagatcgcctcccttcaagaggcagccgggaagagagc
ttcctggcagacccaagcatcctctgactttaggagaaacctttatcttt
gctctaatttgaacgaaccacctaggcctcagttttcatgacccagaggg
taaccctctggagcctgcagactcactaacaggactatgctcatcatact
tgctaaaagcacaataagccattatacaaaagcatcccattacagcgatt
ttaatcatctacaaaatcacagttgctgtagttgctttcaagctaagcta
taatttgaagttcaagggtgggggttggggggggataagaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_36116803_36117966
seq2: B6Ng01-203O05.b_45_1208 (reverse)

seq1  TCCCAAATAGCTGGGA--TTACAAGGCTGTG-CTAT-CAGGCCC-AGCTG  45
      ||||||||||||||||  | |||||||| || |||| || |||| |||||
seq2  TCCCAAATAGCTGGGAATTAACAAGGCTTTGACTATACAAGCCCAAGCTG  50

seq1  TCCTCTTGTATAAGCTGTA-TCTGATAGCCTTTTCTGAAGGTGTGCATTT  94
      || |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTTGTATAAGCTGTATTCTGATAGC--TTTCTGAAGGTGTGCATTT  98

seq1  TAGGGTCAGCATTTTTCCTCTTTTATTTTTTGCCATTCTGTCTCTTCTAC  144
      |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||
seq2  TAGGGTCAGCATTTTTCCTCTTT--ATTTTTGCCATTCTGTCTC-TCTAC  145

seq1  TCTGATCATTTTTTAAGAGCATAGAGGATATTCTCCTTCAGGGAAGAACC  194
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGATCA-TTTTTAAGAGCATAGAGGATATTCTCCTTCAGGGAAGAACC  194

seq1  CTGTCTTTCTGGGGAGGTGCAGAGGCTGTGTTGCTGTAGAAGCCAGCTGA  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTTTCTGGGGAGGTGCAGAGGCTGTGTTGCTGTAGAAGCCAGCTGA  244

seq1  CTGCCCACTTTGAGTGGTGTTGCAAGCACTTAGAGACCCCTCCACTCCCT  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCACTTTGAGTGGTGTTGCAAGCACTTAGAGACCCCTCCACTCCCT  294

seq1  GGGGCACATGCTTCTCTGGTTTTCATTCTTTGTACTTGGTCCCTATTTAG  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCACATGCTTCTCTGGTTTTCATTCTTTGTACTTGGTCCCTATTTAG  344

seq1  TCTTGCAACTCTCCTTTTTACCTCATGAGTTTCATGAAGACGGGGTCTGT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGCAACTCTCCTTTTTACCTCATGAGTTTCATGAAGACGGGGTCTGT  394

seq1  TGGAGCTCCAAGTCCATCCAGTTCACTTAAAGTCAAATCTAGGCCTTTGA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCTCCAAGTCCATCCAGTTCACTTAAAGTCAAATCTAGGCCTTTGA  444

seq1  GTGCCTGCTCACCCTGTTGTTTGACAGAATGACTACCCGTCTTTCCATCT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCTGCTCACCCTGTTGTTTGACAGAATGACTACCCGTCTTTCCATCT  494

seq1  TCCTGTTCTTGTTATTCTTATATTTTTGTTGTTATTGACTTGTGTTTATT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTTCTTGTTATTCTTATATTTTTGTTGTTATTGACTTGTGTTTATT  544

seq1  TATTACTATTTTTAAATAGGGTTTTACTATGTAGCCCTGGTCAGCCTGGT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTACTATTTTTAAATAGGGTTTTACTATGTAGCCCTGGTCAGCCTGGT  594

seq1  CTGAAATTCACAGGAATCTGACTGCCTCTGCCTTCCAAGTCCTGGGATTA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAATTCACAGGAATCTGACTGCCTCTGCCTTCCAAGTCCTGGGATTA  644

seq1  AAGGTGTGCATCACCATCATGCCTGGCTATTTAGCTTTTTAATATATATT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGTGCATCACCATCATGCCTGGCTATTTAGCTTTTTAATATATATT  694

seq1  ATTTAATAATTAATATAATATTTAATAAAATATATTGAAATATAAATATA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAATAATTAATATAATATTTAATAAAATATATTGAAATATAAATATA  744

seq1  TTTAACATATGCACGCACAGTATATATGTATGTATATATACATATATATG  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACATATGCACGCACAGTATATATGTATGTATATATACATATATATG  794

seq1  TACACATGTGTGTGTGTGTGTGTATGCCATACTACTGTGTGCACGTCAGA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACATGTGTGTGTGTGTGTGTATGCCATACTACTGTGTGCACGTCAGA  844

seq1  TTTAGTGCTGTGGGTTCTCTCCATCTGCCCTGTGGATTTGGGAGATAGAG  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTGCTGTGGGTTCTCTCCATCTGCCCTGTGGATTTGGGAGATAGAG  894

seq1  CTGAGGTCTTTAGGCTTGGCAGCAAGCATGTCTACCCACTGAGCCATCTA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGTCTTTAGGCTTGGCAGCAAGCATGTCTACCCACTGAGCCATCTA  944

seq1  ACTGCCCCTCAGTTTTTCTAGAATCTTTGGTTTTATTTCTAAAACATTTC  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCCCCTCAGTTTTTCTAGAATCTTTGGTTTTATTTCTAAAACATTTC  994

seq1  CATCAGTCTGCTCTCTCATAATTTACCTTCCTGCACCTCTGTGCTCCTCA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGTCTGCTCTCTCATAATTTACCTTCCTGCACCTCTGTGCTCCTCA  1044

seq1  TTAGGGGCTCACAGGTAGTGGGAAACGCTGCCATCTGTAATCAGTGAATT  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGGGCTCACAGGTAGTGGGAAACGCTGCCATCTGTAATCAGTGAATT  1094

seq1  TGTAGTCACTAATGGAGCACTGTGTGTTAAGTTTGTGCGTCTGTGCCCTA  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGTCACTAATGGAGCACTGTGTGTTAAGTTTGTGCGTCTGTGCCCTA  1144

seq1  AACCATATGATATGGAATTC  1164
      ||||||||||||||||||||
seq2  AACCATATGATATGGAATTC  1164

seq1: chr15_35971730_35972469
seq2: B6Ng01-203O05.g_62_802

seq1  GAATTCCGCCTGGAGAGGGGTAGCCTGCGCTGCAGCTGAAAGGGAAAAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCGCCTGGAGAGGGGTAGCCTGCGCTGCAGCTGAAAGGGAAAAGC  50

seq1  ACCAGGCCGTGGTGAGTGGTGGCCATTAACCCAAGCGCAGGCATAGATGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGGCCGTGGTGAGTGGTGGCCATTAACCCAAGCGCAGGCATAGATGC  100

seq1  CTGTCACTCCTTAGCAAGGCAGAGCCATGCTCTCTGCACAAACACTTAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCACTCCTTAGCAAGGCAGAGCCATGCTCTCTGCACAAACACTTAAG  150

seq1  ACTCTTAGCATCTGCTCCGCATTAAGATTACAACCCTATAAATAGGAACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTAGCATCTGCTCCGCATTAAGATTACAACCCTATAAATAGGAACA  200

seq1  AGTATGGATTAAAGTGGGATGTTTATTTAAAACCCACTCAACAAAGACTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATGGATTAAAGTGGGATGTTTATTTAAAACCCACTCAACAAAGACTG  250

seq1  TTTTAAGGCCTGATTCTTAAGACACTAAAACTTAGCCATTTAACTAAAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAGGCCTGATTCTTAAGACACTAAAACTTAGCCATTTAACTAAAAC  300

seq1  CTGTAATTTAAATAAATAGAAAATAATGCAAAATATAGATCATAATAATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAATTTAAATAAATAGAAAATAATGCAAAATATAGATCATAATAATA  350

seq1  TAAAATATATGCTCATTATACTTAGTATTTCAATAAAAATATAACAAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATATATGCTCATTATACTTAGTATTTCAATAAAAATATAACAAAAA  400

seq1  CAAACCTTTCAAAAGATCGCCTCCCTTCAAGAGGCAGCCGGGAAGAGAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCTTTCAAAAGATCGCCTCCCTTCAAGAGGCAGCCGGGAAGAGAGC  450

seq1  TTCCTGGCAGACCCAAGCATCCTCTGACTTTAGGAGAAACCTTTATCTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGGCAGACCCAAGCATCCTCTGACTTTAGGAGAAACCTTTATCTTT  500

seq1  GCTCTAATTTGAACGAACCACCTAGGCCTCAGTTTTCATGACCCAGAGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTAATTTGAACGAACCACCTAGGCCTCAGTTTTCATGACCCAGAGGG  550

seq1  TAACCCTCTGGAGCCTGCAGACTCACTAACAGGACTATGCTCATCATACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCCTCTGGAGCCTGCAGACTCACTAACAGGACTATGCTCATCATACT  600

seq1  TGCTAAAAGCACAATAAGCCATTATACAAAAGCATCCCATTACAGCGATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAAAAGCACAATAAGCCATTATACAAAAGCATCCCATTACAGCGATT  650

seq1  TTAATCATCTACAAAATCACAGTTGCTGTAGTTGCTTTCAAGCTAAGCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCATCTACAAAATCACAGTTGCTGTAGTTGCTTTCAAGCTAAGCTA  700

seq1  TAATTTGAAGTTCAAGGGTGGGGGTT-GGGGGGGATAAGAA  740
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TAATTTGAAGTTCAAGGGTGGGGGTTGGGGGGGGATAAGAA  741