BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-205E22
Chromosome15 (Build37)
Map Location 65,646,424 - 65,828,760
singlet/doubletdoublet
Overlap geneC920006C10Rik, Oc90, F930104E18Rik, LOC100040835, Kcnq3
Upstream geneAdcy8, LOC268812, LOC100040790, LOC665836
Downstream geneLrrc6, LOC100040860, Tmem71, LOC100040881, Phf20l1, Tg, Sla, Wisp1, Ndrg1, LOC100040667
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-205E22.bB6Ng01-205E22.g
ACCGA025026GA025027
length1,1961,200
definitionB6Ng01-205E22.b B6Ng01-205E22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(65,827,575 - 65,828,760)(65,646,424 - 65,647,618)
sequence
gaattcaatgcatcataaaattgtcatgatgattcaatgagctaacacat
gtgaattatgtagaatggtcactgctgtacacgcattccatggtactttc
ttaatagatgtcaattctctgcccaccatttcatgttcctttctgttctc
ttttgctctagtcccaatctgtgggttattttcaagaggaggcctcagtt
atggataagggtcattcagggtgcaaagagaggttcacataatacacccc
atgtagcttatctctgcagtccactagataaataactccattacattcct
ccaggaataatatcctccaggatgatccatcaccccaaactaaaccaata
tcaaggaattgagagaaaatgtcagtgattggtctcctgcttcttatttt
taaattttaatttctaatcctgattcttgtgttcactagccctgtgacct
tacacaggttatgttatctctctggtcactgctttgtcatgtgtgaaaca
gaaatcacaatagcattgaccttgtaaggttgtaaaaattaggccaataa
agtgcatggcataaagtcaaatagctactgccttataactacacctcgga
tgtacattagccatgacctgtcatgagactccgaacctcattaagccaat
gaggtttttcatttgcctgattttgtgacctgtgaactgtctgaaaagga
agagcacacacaaaggtacacagacttgtgtgtattcacagatgtgaatt
gtcagggaagggacacctctctcacacagagatgtgcatgcactttgcat
ttgcgcttccacacattcctatttatgaatgccgggcccaaagcagaagc
accttctataactgcctgagggtcccaattgggtctctaggtttgtaaaa
ctccattttttgctgtcactgccctccagtgcttaggttacccaagtatt
aataacaaaacactaaacaacctatatgcttacttagaagaaaatttaca
caaaacaaggaaccctcacgttcttgactgaacttctaccatatctccag
aggaggacattgaaagccctgtaacaccttattcaccaaacctgtctgtg
gaattcatctttggacctcgagggtcatccttgttcttgtggtatttcta
aatgaatgtttaattggatacaggctctagcaggaaatatggaaac
gaattcacccaccagcagagtttagaaatgaaagataagacctgtccgta
aagttagcatgtcccaggaaagacagatgagccgttaaattagaggctta
tctgctacagtaggatttgtgagtatctgtgcataggtaccactgtgtcg
gagtttgttgcagctgattttgtcttctgactcctaaggtaaattgagta
gggaagaatctactaaattgatctctcaggtaactgtttctgaacttact
tctagttctacttaaagccatatccttaacttttatgtcttactggatga
tataattatccacagcaatgtctaaatttgatgtgtgattgaagatgtaa
taattaatagactaaacccctgttaaacttatctttaaatggacagtgag
tgttcagaagcgtgaacttctggataattttgcaatactaatctttatat
tcttttttcatttttttaaacaggggtgtgctgctgctgctctgctttgc
gtcctcgctacaaacgtctggtggacaacatattccctgaagatcccaaa
gtaacttgatctccatgcactgctccttctctttctgacccattctgccc
ctgctcagctccctaaggttcccctcatttcattgctcttttgtcccaac
atctcatcaagtgaactttaaacttttaatttttacatgccccttgcttg
cttacctttctcagataataggtacaaatctgaaatgatagctgcatggt
gtccttttccatttagatagattagtaacactcatcaaacattcaggatc
ctgtgccatatactatgtgctcaggatacagctgaattgtgagtggtttc
tgcatccagtaagcatagatggaatatcagcaattttcacacagtggggg
aaatgtgatagagaattaaataaatgcagggtgctgcatgatagatgcga
atgatggccagttgggattaggagaagaaagacaaggaattgaaatctaa
gtttagacccaaaccaatatttacaccagttagggataaggccatctatc
ctttttgttgtggttgtgtttttaagattgagatcatggaaggacttttt
gtaagaaccaggcatttggccctttaaaaggtacctcctctgaactctgg
ggttgttgttagcctttatgtcacctgacaccacgcttagacgtcagtgg

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_65827575_65828760
seq2: B6Ng01-205E22.b_48_1244 (reverse)

seq1  GTTTCCATATCTCCTGCTAGAAGGCCCTGTATACAAATTAACATTCATTT  50
      |||||||||| ||||||||||    ||||||| ||| | |||||||||||
seq2  GTTTCCATATTTCCTGCTAGA---GCCTGTATCCAATTAAACATTCATTT  47

seq1  AGAAATA-CACA--GACAAGGATGACACTGGAG--TCAAAGATTGAAAAT  95
      ||||||| ||||   ||||||||||| || |||   |||||||   || |
seq2  AGAAATACCACAAGAACAAGGATGACCCTCGAGGTCCAAAGAT--GAATT  95

seq1  CCACAGACAG--TTTGTGAATAA-GTGTTACA-GGCTTTCATTGTCCTCC  141
      ||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||
seq2  CCACAGACAGGTTTGGTGAATAAGGTGTTACAGGGCTTTCAATGTCCTCC  145

seq1  TCTGGAAGATATGGTAGGAGTTCAGTCAAG-ACGTG-GGGTT-CTTGTTT  188
      ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||
seq2  TCTGG-AGATATGGTAGAAGTTCAGTCAAGAACGTGAGGGTTCCTTGTTT  194

seq1  TGTGTAAATTTTCTTCTAAGTAAGCATATAGGTTG-TTAGTG-TTTGTTA  236
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
seq2  TGTGTAAATTTTCTTCTAAGTAAGCATATAGGTTGTTTAGTGTTTTGTTA  244

seq1  TTAATACTT-GGTAACCTAAGCACTGGAGGGCAGTGACAGC-AAAAATGG  284
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TTAATACTTGGGTAACCTAAGCACTGGAGGGCAGTGACAGCAAAAAATGG  294

seq1  AGTTTTACAAACCTAGAGACCCAATTGGGACCCTCAGGCAGTTATAGAAG  334
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTACAAACCTAGAGACCCAATTGGGACCCTCAGGCAGTTATAGAAG  344

seq1  GTGCTTCTGCTTTGGGCCCGGCATTCATAAATAGGAATGTGTGG-AGCGC  383
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GTGCTTCTGCTTTGGGCCCGGCATTCATAAATAGGAATGTGTGGAAGCGC  394

seq1  AAATGCAAAGTGCATGCACATCTCTGTGTGAGAGAGGTGTCCCTTCCCTG  433
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCAAAGTGCATGCACATCTCTGTGTGAGAGAGGTGTCCCTTCCCTG  444

seq1  ACAATTCACATCTGTGAATACACACAAGTCTGTGTACCTTTGTGTGTGCT  483
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTCACATCTGTGAATACACACAAGTCTGTGTACCTTTGTGTGTGCT  494

seq1  CTTCCTTTTCAGACAGTTCACAGGTCACAAAATCAGGCAAATGAAAAACC  533
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTTTTCAGACAGTTCACAGGTCACAAAATCAGGCAAATGAAAAACC  544

seq1  TCATTGGCTTAATGAGGTTCGGAGTCTCATGACAGGTCATGGCTAATGTA  583
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTGGCTTAATGAGGTTCGGAGTCTCATGACAGGTCATGGCTAATGTA  594

seq1  CATCCGAGGTGTAGTTATAAGGCAGTAGCTATTTGACTTTATGCCATGCA  633
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCGAGGTGTAGTTATAAGGCAGTAGCTATTTGACTTTATGCCATGCA  644

seq1  CTTTATTGGCCTAATTTTTACAACCTTACAAGGTCAATGCTATTGTGATT  683
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATTGGCCTAATTTTTACAACCTTACAAGGTCAATGCTATTGTGATT  694

seq1  TCTGTTTCACACATGACAAAGCAGTGACCAGAGAGATAACATAACCTGTG  733
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTTCACACATGACAAAGCAGTGACCAGAGAGATAACATAACCTGTG  744

seq1  TAAGGTCACAGGGCTAGTGAACACAAGAATCAGGATTAGAAATTAAAATT  783
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGTCACAGGGCTAGTGAACACAAGAATCAGGATTAGAAATTAAAATT  794

seq1  TAAAAATAAGAAGCAGGAGACCAATCACTGACATTTTCTCTCAATTCCTT  833
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATAAGAAGCAGGAGACCAATCACTGACATTTTCTCTCAATTCCTT  844

seq1  GATATTGGTTTAGTTTGGGGTGATGGATCATCCTGGAGGATATTATTCCT  883
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTGGTTTAGTTTGGGGTGATGGATCATCCTGGAGGATATTATTCCT  894

seq1  GGAGGAATGTAATGGAGTTATTTATCTAGTGGACTGCAGAGATAAGCTAC  933
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGAATGTAATGGAGTTATTTATCTAGTGGACTGCAGAGATAAGCTAC  944

seq1  ATGGGGTGTATTATGTGAACCTCTCTTTGCACCCTGAATGACCCTTATCC  983
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGGTGTATTATGTGAACCTCTCTTTGCACCCTGAATGACCCTTATCC  994

seq1  ATAACTGAGGCCTCCTCTTGAAAATAACCCACAGATTGGGACTAGAGCAA  1033
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTGAGGCCTCCTCTTGAAAATAACCCACAGATTGGGACTAGAGCAA  1044

seq1  AAGAGAACAGAAAGGAACATGAAATGGTGGGCAGAGAATTGACATCTATT  1083
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAACAGAAAGGAACATGAAATGGTGGGCAGAGAATTGACATCTATT  1094

seq1  AAGAAAGTACCATGGAATGCGTGTACAGCAGTGACCATTCTACATAATTC  1133
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAGTACCATGGAATGCGTGTACAGCAGTGACCATTCTACATAATTC  1144

seq1  ACATGTGTTAGCTCATTGAATCATCATGACAATTTTATGATGCATTGAAT  1183
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTGTTAGCTCATTGAATCATCATGACAATTTTATGATGCATTGAAT  1194

seq1  TCC  1186
      |||
seq2  TCC  1197

seq1: chr15_65646424_65647618
seq2: B6Ng01-205E22.g_68_1267

seq1  GAATTCACCCACCAGCAGAGTTTAGAAATGAAAGATAAGACCTGTCCGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCCACCAGCAGAGTTTAGAAATGAAAGATAAGACCTGTCCGTA  50

seq1  AAGTTAGCATGTCCCAGGAAAGACAGATGAGCCGTTAAATTAGAGGCTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTAGCATGTCCCAGGAAAGACAGATGAGCCGTTAAATTAGAGGCTTA  100

seq1  TCTGCTACAGTAGGATTTGTGAGTATCTGTGCATAGGTACCACTGTGTCG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTACAGTAGGATTTGTGAGTATCTGTGCATAGGTACCACTGTGTCG  150

seq1  GAGTTTGTTGCAGCTGATTTTGTCTTCTGACTCCTAAGGTAAATTGAGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTTGTTGCAGCTGATTTTGTCTTCTGACTCCTAAGGTAAATTGAGTA  200

seq1  GGGAAGAATCTACTAAATTGATCTCTCAGGTAACTGTTTCTGAACTTACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAGAATCTACTAAATTGATCTCTCAGGTAACTGTTTCTGAACTTACT  250

seq1  TCTAGTTCTACTTAAAGCCATATCCTTAACTTTTATGTCTTACTGGATGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGTTCTACTTAAAGCCATATCCTTAACTTTTATGTCTTACTGGATGA  300

seq1  TATAATTATCCACAGCAATGTCTAAATTTGATGTGTGATTGAAGATGTAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATTATCCACAGCAATGTCTAAATTTGATGTGTGATTGAAGATGTAA  350

seq1  TAATTAATAGACTAAACCCCTGTTAAACTTATCTTTAAATGGACAGTGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTAATAGACTAAACCCCTGTTAAACTTATCTTTAAATGGACAGTGAG  400

seq1  TGTTCAGAAGCGTGAACTTCTGGATAATTTTGCAATACTAATCTTTATAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCAGAAGCGTGAACTTCTGGATAATTTTGCAATACTAATCTTTATAT  450

seq1  TCTTTTTTCATTTTTTTAAACAGGGGTGTGCTGCTGCTGCTCTGCTTTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTTTCATTTTTTTAAACAGGGGTGTGCTGCTGCTGCTCTGCTTTGC  500

seq1  GTCCTCGCTACAAACGTCTGGTGGACAACATATTCCCTGAAGATCCCAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTCGCTACAAACGTCTGGTGGACAACATATTCCCTGAAGATCCCAAA  550

seq1  GTAACTTGATCTCCATGCACTGCTCCTTCTCTTTCTGACCCATTCTGCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACTTGATCTCCATGCACTGCTCCTTCTCTTTCTGACCCATTCTGCCC  600

seq1  CTGCTCAGCTCCCTAAGGTTCCCCTCATTTCATTGCTCTTTTGTCCCAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCAGCTCCCTAAGGTTCCCCTCATTTCATTGCTCTTTTGTCCCAAC  650

seq1  ATCTCATCAAGTGAACTTTAAACTTTTAATTTTTACATGCCCCTTGCTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCATCAAGTGAACTTTAAACTTTTAATTTTTACATGCCCCTTGCTTG  700

seq1  CTTACCTTTCTCAGATAATAGGTACAAATCTGAAATGATAGCTGCATGGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACCTTTCTCAGATAATAGGTACAAATCTGAAATGATAGCTGCATGGT  750

seq1  GTCCTTTTCCATTTAGATAGATTAGTAACACTCATCAAACATTCAGGATC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTTTCCATTTAGATAGATTAGTAACACTCATCAAACATTCAGGATC  800

seq1  CTGTGCCATATACTATGTGCTCAGGATACAGCTGAATTGTGAGTGGTTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCCATATACTATGTGCTCAGGATACAGCTGAATTGTGAGTGGTTTC  850

seq1  TGCATCCAGTAAGCATAGATGGAATATCAGCAATTTTCACACAGTGGGGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATCCAGTAAGCATAGATGGAATATCAGCAATTTTCACACAGTGGGGG  900

seq1  AAATGTGATAGAGAATTAAATAAATGCAGGGTGCTGCATGAATAGATGCG  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AAATGTGATAGAGAATTAAATAAATGCAGGGTGCTGCATG-ATAGATGCG  949

seq1  AATGATGGCCAGTTTGGGATTAGGAGAAGAAAGACAAAGGAAATGAAATC  1000
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
seq2  AATGATGGCCAG-TTGGGATTAGGAGAAGAAAGAC-AAGGAATTGAAATC  997

seq1  TAAGTTTAGACCCAAACAATAATTTACAACAGTTAGGGAT-AGGCCATCT  1049
      ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||
seq2  TAAGTTTAGACCCAAACCAATATTTACACCAGTTAGGGATAAGGCCATCT  1047

seq1  ATTCTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTTTTTAAGAATTGAGATCAT-GAGAGA  1098
      || ||||||||||| |||||   |||||||| ||||||||||| ||  ||
seq2  ATCCTTTTTGTTGTGGTTGT--GTTTTTAAG-ATTGAGATCATGGAAGGA  1094

seq1  C-TTTTGTAGACAGAAGCTATTTGCCTTTTAAAAAAGTACTTCTT-----  1142
      | |||||||   |  ||  ||||| |  || |||| |||| || |     
seq2  CTTTTTGTAAGAACCAGGCATTTGGCCCTTTAAAAGGTACCTCCTCTGAA  1144

seq1  AGCTGGGTGTGTTGGTTAG-CTTTATGTCACCTTGACACAGC---TAGA-  1187
        |||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||  |   |||| 
seq2  CTCTGGGGTTGTT-GTTAGCCTTTATGTCACC-TGACACCACGCTTAGAC  1192

seq1  GTCAGTGG  1195
      ||||||||
seq2  GTCAGTGG  1200