BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-211B23
Chromosome15 (Build37)
Map Location 4,876,419 - 5,002,786
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4930455B06Rik, C7
Upstream geneFbxo4, AW549877, LOC100039196, Oxct1, Plcxd3, C6, LOC100039214
Downstream geneCard6, Rpl37, LOC100039281, Prkaa1, Ttc33, Ptger4, LOC100039322, LOC100039308, LOC666291, LOC666319, LOC100039358, LOC666323
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-211B23.bB6Ng01-211B23.g
ACCGA029285GA029286
length1,0901,083
definitionB6Ng01-211B23.b B6Ng01-211B23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(5,001,689 - 5,002,786)(4,876,419 - 4,877,508)
sequence
gaattctctagtggaatttttagggtcacttatatatactatcatatcat
ctgcaaaaagtgatattttgacttcttcctttcaaatttgtatccccttg
atctccttttgttgtctaattgctctggctacgacttcaagtacaatgtt
gaaaaggtagggagagagtggacagccttgtctagtccctgattttagtg
ggattgcttcaagcttctcaccatttactttgatgctggctactggtttg
ctgtagattgcttttatcatgtttaggtatgggccttgaattcctgatct
ttccaagacccttatcatgaatgggtgttggattttgtcaaatgctttct
cagcatctaacgagatgatcatgtggtttttgtctttgagtttgtttata
tactggattatgttgatgatataagtgaaactttaatgaacattttttta
tacgaagaaatcagtcgtatgttcccattatcttcttatgatataatgtt
tgatttaaaggtcctgagcttttgaatggctaaatagtttaaatgtttca
gtttggataaagcatatattaaaagtaaactatttttaccctttattata
tttaaaattgtatctgtgtatatgatgtatatgtataaacatatgtgtat
gcatatatgtatatgtatgggcacatatggcctacagcacatgtatagag
gtcatagaacaatttgtaatagtctgttatctttctttacaatgcaggcc
ttgggaattaaactctgattattagacttagcagcaagtgcttctaaaca
ctgatctatcttgtctctccatatttaaactattaaaataacagatctat
catgtcttgatcatttgactaagatcaggcatagaataacagctctatca
cagaaaatgacttttgttttgaatcttctttagcatcacgttctcaccca
tttctcttgtagtacttgtttgtggtcaaaccaggttattggcatgttgg
acacactctaccattgagctttctctaagcacgatcatcatcatcatgat
caccatcatcattttatttgaaaccagctatcagtagcat
gaattcaaagtttagttttacagcatgggtctccagaaaggttggttaag
taggtcacaaaagaattctgcaaatctgtagacttgcaagacttgtgagt
cttatctgaaagcaggtgtgtggaggtctccctgattgtctccacttttg
cttctgccttccactgcagagcctcttgatgtcaggatctggtagaattt
tgcattggtgtgaacaaaataaattcacagagaagcaacttaagggagtg
aagttttaagctggctcacagtttcagagagctctttcaatggtttatgg
gatcaggagtacaggctgaaggttctccatggcacacaagaatgatgggg
gataagaaaacgccaagaacaagatactccctatcttctgagctcagccc
cacctcctaatatttccaaaatctcaaaatagtatcattatctgagatca
agcacaaaacttgagcctctgggggacgttctatatacagaccataatat
tgcccttggctcatattcctatatgcatgtgacaagaataggttcgtagg
gaattcataaaattttagatatcagcacatgccaggagaaggatgcaggg
cagtaagtcccacaccttagtccccagagaattgtctgacaatcagttat
tcaataagtcagtttttaggaataaatgacaaaatctgtttgtttaacaa
gtccctggtatttctagggaaatgtgtccctgtcaggaagaacaaagaga
gtggcactcactgatctcagatctgtcttccaggagtttacagaaagtga
gatgttatcaggcaggaaatcaatgaaagtggtcagggtacagcagagta
gatagtctaggtcagatcagtggtctgattgatcgttgtctcagcgctgg
ttctgcgaaaggtcctgaggaattgttagcactgcccgtcacttataggg
agcagtctcattcctatgaggacagcctatgaggtacagcctcaccatca
ctatatcacactcatttccaggacattctgtctgacagctcactgtcact
agaatgacttcagtctcctactataaaatgttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_5001689_5002786
seq2: B6Ng01-211B23.b_44_1133 (reverse)

seq1  ATGCTACTGATTAAGGCTTGGTTTTAAAAATAAAATGATGATGGTGATCA  50
      |||||||||||  ||   ||||||   |||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTACTGAT--AG--CTGGTTT--CAAATAAAATGATGATGGTGATCA  44

seq1  TGATGATGATGATCGTGCTTAGAGAAAGCTCAATGGTAGAGTGTGTCCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATGATGATCGTGCTTAGAGAAAGCTCAATGGTAGAGTGTGTCCAA  94

seq1  CATGCCCAATAACCTGGGTTTGACCACAAACAAGTACTACAAGAGAAATG  150
      |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATG-CCAATAACCT-GGTTTGACCACAAACAAGTACTACAAGAGAAATG  142

seq1  GGTGAGAACGTGATGCTAAAGAAGATTCAAAACAAAAGTCATTTTCTGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGAACGTGATGCTAAAGAAGATTCAAAACAAAAGTCATTTTCTGTG  192

seq1  ATAGAGCTGTTATTCTATGCCTGATCTTAGTCAAATGATCAAGACATGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGCTGTTATTCTATGCCTGATCTTAGTCAAATGATCAAGACATGAT  242

seq1  AGATCTGTTATTTTAATAGTTTAAATATGGAGAGACAAGATAGATCAGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTGTTATTTTAATAGTTTAAATATGGAGAGACAAGATAGATCAGTG  292

seq1  TTTAGAAGCACTTGCTGCTAAGTCTAATAATCAGAGTTTAATTCCCAAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAAGCACTTGCTGCTAAGTCTAATAATCAGAGTTTAATTCCCAAGG  342

seq1  CCTGCATTGTAAAGAAAGATAACAGACTATTACAAATTGTTCTATGACCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCATTGTAAAGAAAGATAACAGACTATTACAAATTGTTCTATGACCT  392

seq1  CTATACATGTGCTGTAGGCCATATGTGCCCATACATATACATATATGCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATACATGTGCTGTAGGCCATATGTGCCCATACATATACATATATGCAT  442

seq1  ACACATATGTTTATACATATACATCATATACACAGATACAATTTTAAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATATGTTTATACATATACATCATATACACAGATACAATTTTAAATA  492

seq1  TAATAAAGGGTAAAAATAGTTTACTTTTAATATATGCTTTATCCAAACTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAAAGGGTAAAAATAGTTTACTTTTAATATATGCTTTATCCAAACTG  542

seq1  AAACATTTAAACTATTTAGCCATTCAAAAGCTCAGGACCTTTAAATCAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATTTAAACTATTTAGCCATTCAAAAGCTCAGGACCTTTAAATCAAA  592

seq1  CATTATATCATAAGAAGATAATGGGAACATACGACTGATTTCTTCGTATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATATCATAAGAAGATAATGGGAACATACGACTGATTTCTTCGTATA  642

seq1  AAAAAATGTTCATTAAAGTTTCACTTATATCATCAACATAATCCAGTATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAATGTTCATTAAAGTTTCACTTATATCATCAACATAATCCAGTATA  692

seq1  TAAACAAACTCAAAGACAAAAACCACATGATCATCTCGTTAGATGCTGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACAAACTCAAAGACAAAAACCACATGATCATCTCGTTAGATGCTGAG  742

seq1  AAAGCATTTGACAAAATCCAACACCCATTCATGATAAGGGTCTTGGAAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCATTTGACAAAATCCAACACCCATTCATGATAAGGGTCTTGGAAAG  792

seq1  ATCAGGAATTCAAGGCCCATACCTAAACATGATAAAAGCAATCTACAGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGAATTCAAGGCCCATACCTAAACATGATAAAAGCAATCTACAGCA  842

seq1  AACCAGTAGCCAGCATCAAAGTAAATGGTGAGAAGCTTGAAGCAATCCCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAGTAGCCAGCATCAAAGTAAATGGTGAGAAGCTTGAAGCAATCCCA  892

seq1  CTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGTCCACTCTCTCCCTACCTTTTCAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGTCCACTCTCTCCCTACCTTTTCAA  942

seq1  CATTGTACTTGAAGTCGTAGCCAGAGCAATTAGACAACAAAAGGAGATCA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTACTTGAAGTCGTAGCCAGAGCAATTAGACAACAAAAGGAGATCA  992

seq1  AGGGGATACAAATTTGAAAGGAAGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGAT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGATACAAATTTGAAAGGAAGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGAT  1042

seq1  GATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAAAAATTCCACTAGAGAATTC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAAAAATTCCACTAGAGAATTC  1090

seq1: chr15_4876419_4877508
seq2: B6Ng01-211B23.g_65_1147

seq1  GAATTCAAAGTTTAGTTTTACAGCATGGGTCTCCAGAAAGGTTGGTTAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGTTTAGTTTTACAGCATGGGTCTCCAGAAAGGTTGGTTAAG  50

seq1  TAGGTCACAAAAGAATTCTGCAAATCTGTAGACTTGCAAGACTTGTGAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTCACAAAAGAATTCTGCAAATCTGTAGACTTGCAAGACTTGTGAGT  100

seq1  CTTATCTGAAAGCAGGTGTGTGGAGGTCTCCCTGATTGTCTCCACTTTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATCTGAAAGCAGGTGTGTGGAGGTCTCCCTGATTGTCTCCACTTTTG  150

seq1  CTTCTGCCTTCCACTGCAGAGCCTCTTGATGTCAGGATCTGGTAGAATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGCCTTCCACTGCAGAGCCTCTTGATGTCAGGATCTGGTAGAATTT  200

seq1  TGCATTGGTGTGAACAAAATAAATTCACAGAGAAGCAACTTAAGGGAGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTGGTGTGAACAAAATAAATTCACAGAGAAGCAACTTAAGGGAGTG  250

seq1  AAGTTTTAAGCTGGCTCACAGTTTCAGAGAGCTCTTTCAATGGTTTATGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTTAAGCTGGCTCACAGTTTCAGAGAGCTCTTTCAATGGTTTATGG  300

seq1  GATCAGGAGTACAGGCTGAAGGTTCTCCATGGCACACAAGAATGATGGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAGGAGTACAGGCTGAAGGTTCTCCATGGCACACAAGAATGATGGGG  350

seq1  GATAAGAAAACGCCAAGAACAAGATACTCCCTATCTTCTGAGCTCAGCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAGAAAACGCCAAGAACAAGATACTCCCTATCTTCTGAGCTCAGCCC  400

seq1  CACCTCCTAATATTTCCAAAATCTCAAAATAGTATCATTATCTGAGATCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTCCTAATATTTCCAAAATCTCAAAATAGTATCATTATCTGAGATCA  450

seq1  AGCACAAAACTTGAGCCTCTGGGGGACGTTCTATATACAGACCATAATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACAAAACTTGAGCCTCTGGGGGACGTTCTATATACAGACCATAATAT  500

seq1  TGCCCTTGGCTCATATTCCTATATGCATGTGACAAGAATAGGTTCGTAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTTGGCTCATATTCCTATATGCATGTGACAAGAATAGGTTCGTAGG  550

seq1  GAATTCATAAAATTTTAGATATCAGCACATGCCAGGAGAAGGATGCAGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATAAAATTTTAGATATCAGCACATGCCAGGAGAAGGATGCAGGG  600

seq1  CAGTAAGTCCCACACCTTAGTCCCCAGAGAATTGTCTGACAATCAGTTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAGTCCCACACCTTAGTCCCCAGAGAATTGTCTGACAATCAGTTAT  650

seq1  TCAATAAGTCAGTTTTTAGGAATAAATGACAAAATCTGTTTGTTTAACAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATAAGTCAGTTTTTAGGAATAAATGACAAAATCTGTTTGTTTAACAA  700

seq1  GTCCCTGGTATTTCTAGGGAAATGTGTCCCTGTCAGGAAGAACAAAGAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCTGGTATTTCTAGGGAAATGTGTCCCTGTCAGGAAGAACAAAGAGA  750

seq1  GTGGCACTCACTGATCTCAGATCTGTCTTCCAGGAGTTTACAGAAAGTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCACTCACTGATCTCAGATCTGTCTTCCAGGAGTTTACAGAAAGTGA  800

seq1  GATGTTATCAGGCAGGGAATCAATGAAAGTGGTCAGGGTACAGCAGAGTA  850
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTATCAGGCAGGAAATCAATGAAAGTGGTCAGGGTACAGCAGAGTA  850

seq1  GATAGTCTAGGTCAGATCAGTGGTCTGATTGATCGTTGTCTCAGCGCTGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGTCTAGGTCAGATCAGTGGTCTGATTGATCGTTGTCTCAGCGCTGG  900

seq1  TTCTGCGAAAGGTCCTGAGGAAATTGTTAGCACTG-CCGTCACTTATAGG  949
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TTCTGCGAAAGGTCCTGAGG-AATTGTTAGCACTGCCCGTCACTTATAGG  949

seq1  GAGCAGTCTCATTCCTATGAGGACAGCCTATGAGGTACAGCCTCACCATC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGTCTCATTCCTATGAGGACAGCCTATGAGGTACAGCCTCACCATC  999

seq1  ACTAATAATCACACTCATTTCAAGGACAATCTGTCTGACAAGGCTCACTG  1049
      ||||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||
seq2  ACTA--TATCACACTCATTTCCAGGACATTCTGTCTGACA--GCTCACTG  1045

seq1  TCACTTAGAAATGACTTCAGTCTCCTACTATAAAAATGTTG  1090
      |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TCAC-TAG-AATGACTTCAGTCTCCTACTAT-AAAATGTTG  1083