BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-213L21
Chromosome15 (Build37)
Map Location 72,971,478 - 73,167,947
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEif2c2, Ptk2
Upstream geneKcnk9, 1810044A24Rik, LOC665621, Peg13, LOC100041120, Chrac1
Downstream geneLOC666053, LOC100040929, Dennd3, Slc45a4, Gpr20, LOC100040946, pPtp4a3, Gm628, LOC100041273, EG625276, LOC100040966, EG666113, LOC100041307
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-213L21.bB6Ng01-213L21.g
ACCGA031180GA031181
length9491,143
definitionB6Ng01-213L21.b B6Ng01-213L21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,167,009 - 73,167,947)(72,971,478 - 72,972,634)
sequence
gaattctttatcactgtggtctttgataagttgtttctcagccagtaaaa
tgagccaagtcaaaccagattaaaatatatataaatgcaggtttattcgg
aagttgctcttgggtaggtgagttcagtggtcacaaggaaggaggtcagg
gaagtcgccataggaaaggagaaaggggaaagagagaaagtgcacagagg
tggggggggacagagagagagagagaaagaaaaaaatgtctgtgttatat
agcaaagagcctctgggggaatgacagctaagcctctggactggaaagtt
cagggttgggggtagggtatgccagttaggaattgaggggtgctttgaga
atctacaggccaggtctgctttggtgtgtaaaatatgcacctgaaaccag
tcttgggcagggagattctggccaactcaaggctagtttctattctaagc
ctcagtgagttggggacttaaatgcaagtacctgaagtcggctcaacagg
actcttccagacttgtgctctccaaaccccaaacataatacttatgtgtc
atttatgtcttcgcatttgtggtgatttgttatagcaccagcagggaact
aatacagttgctgtatgccatccagagataaagttctttgctttagaggg
agctttagatagacttctgggccaggtgtcaagaattctgaagctctgca
cccttattttgagatagttagcagagtgagtgagatagggaaggaaggaa
aagagaagcacatttgaggtgaggtcactgccccatcttagaaatagaat
acagtctgcagtgtttattaggggcttttggtagtttcctctagtaagga
aacctagtaataagcattgtagaagatagggaagtccttttcctacacct
tagctgatgtttgcagtggtaatgcctgtcacttgacattatcgctcat
gaattcactgtgggtctagaacagtttcaaagccacagcccaggagatca
gcaaagcccagagctgcagaggtggcaatttctaagccaaaaaagatggc
aactgggttgattccctcaacatactgcacatgacatcccataggtgagt
caggattacagtgtgtgagtgtgtggttcagccacaaaggtggcatatgg
cctaagggagatagataatgcatggtgacaattcctatagaaagggactg
tatatagcacaaacgccaagttggtggtcacacaaaccaaaaggaatctt
caaggggtctaggaggtggctcagtcagggaagtgcttgccacaggctga
gggcctgagttttgatcactgtgctggagaaacaaagagagctggattct
acgagctcaaacgccagccagcctggtgtaacctgtaagcttcaggtcca
tgtgacagaccctgacacagaaacaaggacaacaacgcttgaggaacgac
acagaaagttgacccctgatttccacacacatattcactcacacacacac
acgcacacaccacatttaagggaaagcaataaaagttatcccaattcaca
gagtattttgcttcttagctcacagcccccttgacataaactatccctgg
cctagcatgtatagagccacaattctgaggccagcattgtccatgcattt
cgaaaggccaagaaacatgaatcccaaaagatttacacatgggcacactg
tagtcatataatggaaaagtaatattaaaaataagaatattattaatatt
actaaagaactagctcagcagttaaaatttggctgttcttgtataacatc
cagttcaattcccaacactcacgcggcagtttataactgtctgtaactcc
agtcccaggggagccacttctggcccctgctggttccatgcacacaggtg
gtacacaaacacacagaccaacactcatacacataaataaaattaacttg
ccaactttttttttctttgtgtatatgtttgaaagaaaagtcatgttcac
ctgctggtctggaaccttctatgtagactggtctgccttcacttaaagat
gtgctatgtgaggttaaagcatacaatccagctggacctagaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_73167009_73167947
seq2: B6Ng01-213L21.b_43_991 (reverse)

seq1  ATGAGCGATAATGTCAAGTGAAAGGCATAACACATGCAAACATCAGCTAA  50
      ||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||
seq2  ATGAGCGATAATGTCAAGTGACAGGCATTACCACTGCAAACATCAGCTAA  50

seq1  TGTGTGGGAAA--GGCTTCCCTATCTTCT--CATGCTTATTACTAGG-TT  95
       |||| |||||  | ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||
seq2  GGTGTAGGAAAAGGACTTCCCTATCTTCTACAATGCTTATTACTAGGTTT  100

seq1  CCTTACTAGA-GAAACTACCAAAAGCCCCT-ATTAACACTGCAGACTGTA  143
      |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
seq2  CCTTACTAGAGGAAACTACCAAAAGCCCCTAATAAACACTGCAGACTGTA  150

seq1  TTCTATTTCTAAGAT-GGGCAGTGACCTCACCTC-AATGTGCTTCTC-TT  190
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||
seq2  TTCTATTTCTAAGATGGGGCAGTGACCTCACCTCAAATGTGCTTCTCTTT  200

seq1  TCCTTCCTTCCCTATCTCACTCACTCTGCTAACTATCTCAAAATAAGGGT  240
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCCTTCCCTATCTCACTCACTCTGCTAACTATCTCAAAATAAGGGT  250

seq1  GCAGAGCTTCAGAATTCTTGACACCTGGCCCAGAAGTCTATCTAAAGCTC  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGCTTCAGAATTCTTGACACCTGGCCCAGAAGTCTATCTAAAGCTC  300

seq1  CCTCTAAAGCAAAGAACTTTATCTCTGGATGGCATACAGCAACTGTATTA  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTAAAGCAAAGAACTTTATCTCTGGATGGCATACAGCAACTGTATTA  350

seq1  GTTCCCTGCTGGTGCTATAACAAATCACCACAAATGCGAAGACATAAATG  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCCTGCTGGTGCTATAACAAATCACCACAAATGCGAAGACATAAATG  400

seq1  ACACATAAGTATTATGTTTGGGGTTTGGAGAGCACAAGTCTGGAAGAGTC  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATAAGTATTATGTTTGGGGTTTGGAGAGCACAAGTCTGGAAGAGTC  450

seq1  CTGTTGAGCCGACTTCAGGTACTTGCATTTAAGTCCCCAACTCACTGAGG  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTGAGCCGACTTCAGGTACTTGCATTTAAGTCCCCAACTCACTGAGG  500

seq1  CTTAGAATAGAAACTAGCCTTGAGTTGGCCAGAATCTCCCTGCCCAAGAC  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGAATAGAAACTAGCCTTGAGTTGGCCAGAATCTCCCTGCCCAAGAC  550

seq1  TGGTTTCAGGTGCATATTTTACACACCAAAGCAGACCTGGCCTGTAGATT  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTCAGGTGCATATTTTACACACCAAAGCAGACCTGGCCTGTAGATT  600

seq1  CTCAAAGCACCCCTCAATTCCTAACTGGCATACCCTACCCCCAACCCTGA  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAAGCACCCCTCAATTCCTAACTGGCATACCCTACCCCCAACCCTGA  650

seq1  ACTTTCCAGTCCAGAGGCTTAGCTGTCATTCCCCCAGAGGCTCTTTGCTA  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCCAGTCCAGAGGCTTAGCTGTCATTCCCCCAGAGGCTCTTTGCTA  700

seq1  TATAACACAGACATTTTTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTGTCCCCCCCCAC  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAACACAGACATTTTTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTGTCCCCCCCCAC  750

seq1  CTCTGTGCACTTTCTCTCTTTCCCCTTTCTCCTTTCCTATGGCGACTTCC  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTGCACTTTCTCTCTTTCCCCTTTCTCCTTTCCTATGGCGACTTCC  800

seq1  CTGACCTCCTTCCTTGTGACCACTGAACTCACCTACCCAAGAGCAACTTC  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACCTCCTTCCTTGTGACCACTGAACTCACCTACCCAAGAGCAACTTC  850

seq1  CGAATAAACCTGCATTTATATATATTTTAATCTGGTTTGACTTGGCTCAT  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAATAAACCTGCATTTATATATATTTTAATCTGGTTTGACTTGGCTCAT  900

seq1  TTTACTGGCTGAGAAACAACTTATCAAAGACCACAGTGATAAAGAATTC  939
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTGGCTGAGAAACAACTTATCAAAGACCACAGTGATAAAGAATTC  949

seq1: chr15_72971478_72972634
seq2: B6Ng01-213L21.g_67_1209

seq1  GAATTCACTGTGGGTCTAGAACAGTTTCAAAGCCACAGCCCAGGAGATCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTGTGGGTCTAGAACAGTTTCAAAGCCACAGCCCAGGAGATCA  50

seq1  GCAAAGCCCAGAGCTGCAGAGGTGGCAATTTCTAAGCCAAAAAAGATGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGCCCAGAGCTGCAGAGGTGGCAATTTCTAAGCCAAAAAAGATGGC  100

seq1  AACTGGGTTGATTCCCTCAACATACTGCACATGACATCCCATAGGTGAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGGTTGATTCCCTCAACATACTGCACATGACATCCCATAGGTGAGT  150

seq1  CAGGATTACAGTGTGTGAGTGTGTGGTTCAGCCACAAAGGTGGCATATGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATTACAGTGTGTGAGTGTGTGGTTCAGCCACAAAGGTGGCATATGG  200

seq1  CCTAAGGGAGATAGATAATGCATGGTGACAATTCCTATAGAAAGGGACTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAGGGAGATAGATAATGCATGGTGACAATTCCTATAGAAAGGGACTG  250

seq1  TATATAGCACAAACGCCAAGTTGGTGGTCACACAAACCAAAAGGAATCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAGCACAAACGCCAAGTTGGTGGTCACACAAACCAAAAGGAATCTT  300

seq1  CAAGGGGTCTAGGAGGTGGCTCAGTCAGGGAAGTGCTTGCCACAGGCTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGGGTCTAGGAGGTGGCTCAGTCAGGGAAGTGCTTGCCACAGGCTGA  350

seq1  GGGCCTGAGTTTTGATCACTGTGCTGGAGAAACAAAGAGAGCTGGATTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCTGAGTTTTGATCACTGTGCTGGAGAAACAAAGAGAGCTGGATTCT  400

seq1  ACGAGCTCAAACGCCAGCCAGCCTGGTGTAACCTGTAAGCTTCAGGTCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGAGCTCAAACGCCAGCCAGCCTGGTGTAACCTGTAAGCTTCAGGTCCA  450

seq1  TGTGACAGACCCTGACACAGAAACAAGGACAACAACGCTTGAGGAACGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACAGACCCTGACACAGAAACAAGGACAACAACGCTTGAGGAACGAC  500

seq1  ACAGAAAGTTGACCCCTGATTTCCACACACATATTCACTCACACACACAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAAGTTGACCCCTGATTTCCACACACATATTCACTCACACACACAC  550

seq1  ACGCACACACCACATTTAAGGGAAAGCAATAAAAGTTATCCCAATTCACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCACACACCACATTTAAGGGAAAGCAATAAAAGTTATCCCAATTCACA  600

seq1  GAGTATTTTGCTTCTTAGCTCACAGCCCCCTTGACATAAACTATCCCTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTATTTTGCTTCTTAGCTCACAGCCCCCTTGACATAAACTATCCCTGG  650

seq1  CCTAGCATGTATAGAGCCACAATTCTGAGGCCAGCATTGTCCATGCATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGCATGTATAGAGCCACAATTCTGAGGCCAGCATTGTCCATGCATTT  700

seq1  CGAAAGGCCAAGAAACATGAATCCCAAAAGATTTACACATGGGCACACTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAAGGCCAAGAAACATGAATCCCAAAAGATTTACACATGGGCACACTG  750

seq1  TAGTCATATAATGGAAAAGTAATATTAAAAATAAGAATATTATTAATATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCATATAATGGAAAAGTAATATTAAAAATAAGAATATTATTAATATT  800

seq1  ACTAAAGAACTAGCTCAGCAGTTAAAA-TTGGCTGTTCTTGTATAACATC  849
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAAGAACTAGCTCAGCAGTTAAAATTTGGCTGTTCTTGTATAACATC  850

seq1  CAGTTCAATTCCCAACACTCACGCGGCAGTTTATAACTGTCTGTAACTCC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTCAATTCCCAACACTCACGCGGCAGTTTATAACTGTCTGTAACTCC  900

seq1  AGTCCCAGGGGAGCCACTTCTGGCCCCTGCTGGTTCCATGCACACAGGTG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCCAGGGGAGCCACTTCTGGCCCCTGCTGGTTCCATGCACACAGGTG  950

seq1  GTACACAAACACACAGACCAAACACTCATACACATAAATAAAATTAACTT  999
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACACAAACACACAGACC-AACACTCATACACATAAATAAAATTAACTT  999

seq1  GCCAACTTTTTTTTTCTTTTGTGTATATGTTTGAAAG-AAAGTCATTGTT  1048
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||
seq2  GCCAACTTTTTTTTTC-TTTGTGTATATGTTTGAAAGAAAAGTCA-TGTT  1047

seq1  CAACCCTGGCTGGTCTGGAACCTTCTATGTAGACTGGTCTGGCCTTCAAC  1098
      ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
seq2  CA--CCT-GCTGGTCTGGAACCTTCTATGTAGACTGGTCT-GCCTTC-AC  1092

seq1  TTAGAGATGTGCCTAAATGTTGAGGTTAAAGGCATACAACACCCAGCTTG  1148
      ||| ||||||||    ||| |||||||||| |||||||  | |||||| |
seq2  TTAAAGATGTGC---TATG-TGAGGTTAAA-GCATACA--ATCCAGCTGG  1135

seq1  ACCTCAGAA  1157
      |||| ||||
seq2  ACCT-AGAA  1143