BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-214D18
Chromosome15 (Build37)
Map Location 72,971,478 - 73,129,390
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEif2c2, Ptk2
Upstream geneKcnk9, 1810044A24Rik, LOC665621, Peg13, LOC100041120, Chrac1
Downstream geneLOC666053, LOC100040929, Dennd3, Slc45a4, Gpr20, LOC100040946, pPtp4a3, Gm628, LOC100041273, EG625276, LOC100040966, EG666113, LOC100041307
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-214D18.bB6Ng01-214D18.g
ACCGA031539GA031540
length1,166895
definitionB6Ng01-214D18.b B6Ng01-214D18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,971,478 - 72,972,655)(73,128,496 - 73,129,390)
sequence
gaattcactgtgggtctagaacagtttcaaagccacagcccaggagatca
gcaaagcccagagctgcagaggtggcaatttctaagccaaaaaagatggc
aactgggttgattccctcaacatactgcacatgacatcccataggtgagt
caggattacagtgtgtgagtgtgtggttcagccacaaaggtggcatatgg
cctaagggagatagataatgcatggtgacaattcctatagaaagggactg
tatatagcacaaacgccaagttggtggtcacacaaaccaaaaggaatctt
caaggggtctaggaggtggctcagtcagggaagtgcttgccacaggctga
gggcctgagttttgatcactgtgctggagaaacaaagagagctggattct
acgagctcaaacgccagccagcctggtgtaacctgtaagcttcaggtcca
tgtgacagaccctgacacagaaacaaggacaacaacgcttgaggaacgac
acagaaagttgacccctgatttccacacacatattcactcacacacacac
acgcacacaccacatttaagggaaagcaataaaagttatcccaattcaca
gagtattttgcttcttagctcacagcccccttgacataaactatccctgg
cctagcatgtatagagccacaattctgaggccagcattgtccatgcattt
cgaaaggccaagaaacatgaatcccaaaagatttacacatgggcacactg
tagtcatataatggaaaagtaatattaaaaataagaatattattaatatt
actaaagaactagctcagcagttaaaattggctgttcttgtataacatcc
agttcaattcccaacactcacgcggcagtttataactgtctgtaactcca
gtcccaggggagccacttctgggccctgctggttccatgcacacaggtgg
tacacaaacacacagaccaaacactcatacacataaataaattaacttgc
caactttttttttcttgtgtatatgttgaaagaaagtcatgttcaaccct
ggctggtctgacttctaatgtagactgtctggcttcacttagagaatgtg
cctaaatgttgaagctatggccatacaacacctagccttgacctcgatca
tggggttcaactgcag
gaattcctactgggaagacatttctataatactcagcaaatgaaagcagg
tataaagactgttagttcaaagccagcttaggctcttagagggagttcaa
ggcccgcttgggctacgtgatgatactttgtcaacaaacaaactataaaa
gacctttggtcttctgcttagattttgttgtgaatagctcctattatcat
gccaaggactttgtattctattctaccttctgcttacagctcctgttgta
aattatgtgaacatttgtgctggtaataagccatcaattccttatagtac
tgcattgttctgtaaatgcttccatattatatttttagcttgtatatttt
tgtcaactatttaaatatctgctctcattgagaattcaatcaggcttctt
gaattagacaggtagtttatggcagtagttcattctcctgtcttccttca
ttcctatctatggaagctgagttttctcttaccctcttatttatctggtt
ctcctaaagatgtcatcacagttgagcatgcctaaacctggaaggaagcc
cataaggctactgcatgatatccatcagagaaaaatgtccctgactctta
aggctcttgagaataggctggtagttggggtcagaaagaataacatcaat
gctagcagatcccaggcactgaagacttctccatggcctaagagctatat
ctttctttcctaaagcccacacacctagcagactttaaccaagtgcagac
catccagtactcaaacagtgaagacaaagacaggaaaggaatgctacaac
tcaaaatcgctggtgctcctgaggtaaggcactcttgctcttaaagaatt
tgatcaagaaaaaaggttgggtgagtagagaggtggataggatgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_72971478_72972655
seq2: B6Ng01-214D18.b_44_1209

seq1  GAATTCACTGTGGGTCTAGAACAGTTTCAAAGCCACAGCCCAGGAGATCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTGTGGGTCTAGAACAGTTTCAAAGCCACAGCCCAGGAGATCA  50

seq1  GCAAAGCCCAGAGCTGCAGAGGTGGCAATTTCTAAGCCAAAAAAGATGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGCCCAGAGCTGCAGAGGTGGCAATTTCTAAGCCAAAAAAGATGGC  100

seq1  AACTGGGTTGATTCCCTCAACATACTGCACATGACATCCCATAGGTGAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGGTTGATTCCCTCAACATACTGCACATGACATCCCATAGGTGAGT  150

seq1  CAGGATTACAGTGTGTGAGTGTGTGGTTCAGCCACAAAGGTGGCATATGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATTACAGTGTGTGAGTGTGTGGTTCAGCCACAAAGGTGGCATATGG  200

seq1  CCTAAGGGAGATAGATAATGCATGGTGACAATTCCTATAGAAAGGGACTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAGGGAGATAGATAATGCATGGTGACAATTCCTATAGAAAGGGACTG  250

seq1  TATATAGCACAAACGCCAAGTTGGTGGTCACACAAACCAAAAGGAATCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAGCACAAACGCCAAGTTGGTGGTCACACAAACCAAAAGGAATCTT  300

seq1  CAAGGGGTCTAGGAGGTGGCTCAGTCAGGGAAGTGCTTGCCACAGGCTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGGGTCTAGGAGGTGGCTCAGTCAGGGAAGTGCTTGCCACAGGCTGA  350

seq1  GGGCCTGAGTTTTGATCACTGTGCTGGAGAAACAAAGAGAGCTGGATTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCTGAGTTTTGATCACTGTGCTGGAGAAACAAAGAGAGCTGGATTCT  400

seq1  ACGAGCTCAAACGCCAGCCAGCCTGGTGTAACCTGTAAGCTTCAGGTCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGAGCTCAAACGCCAGCCAGCCTGGTGTAACCTGTAAGCTTCAGGTCCA  450

seq1  TGTGACAGACCCTGACACAGAAACAAGGACAACAACGCTTGAGGAACGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACAGACCCTGACACAGAAACAAGGACAACAACGCTTGAGGAACGAC  500

seq1  ACAGAAAGTTGACCCCTGATTTCCACACACATATTCACTCACACACACAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAAGTTGACCCCTGATTTCCACACACATATTCACTCACACACACAC  550

seq1  ACGCACACACCACATTTAAGGGAAAGCAATAAAAGTTATCCCAATTCACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCACACACCACATTTAAGGGAAAGCAATAAAAGTTATCCCAATTCACA  600

seq1  GAGTATTTTGCTTCTTAGCTCACAGCCCCCTTGACATAAACTATCCCTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTATTTTGCTTCTTAGCTCACAGCCCCCTTGACATAAACTATCCCTGG  650

seq1  CCTAGCATGTATAGAGCCACAATTCTGAGGCCAGCATTGTCCATGCATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGCATGTATAGAGCCACAATTCTGAGGCCAGCATTGTCCATGCATTT  700

seq1  CGAAAGGCCAAGAAACATGAATCCCAAAAGATTTACACATGGGCACACTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAAGGCCAAGAAACATGAATCCCAAAAGATTTACACATGGGCACACTG  750

seq1  TAGTCATATAATGGAAAAGTAATATTAAAAATAAGAATATTATTAATATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCATATAATGGAAAAGTAATATTAAAAATAAGAATATTATTAATATT  800

seq1  ACTAAAGAACTAGCTCAGCAGTTAAAATTGGCTGTTCTTGTATAACATCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAAGAACTAGCTCAGCAGTTAAAATTGGCTGTTCTTGTATAACATCC  850

seq1  AGTTCAATTCCCAACACTCACGCGGCAGTTTATAACTGTCTGTAACTCCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCAATTCCCAACACTCACGCGGCAGTTTATAACTGTCTGTAACTCCA  900

seq1  GTCCCAGGGGAGCCACTTCTGGCCCCTGCTGGTTCCATGCACACAGGTGG  950
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCAGGGGAGCCACTTCTGGGCCCTGCTGGTTCCATGCACACAGGTGG  950

seq1  TACACAAACACACAGACCAAACACTCATACACATAAATAAAATTAACTTG  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TACACAAACACACAGACCAAACACTCATACACATAAAT-AAATTAACTTG  999

seq1  CCAACTTTTTTTTTCTTTTGTGTATATGTTTGAAAGAAAGTCATTGTTCA  1050
      |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||
seq2  CCAACTTTTTTTTTC--TTGTGTATATG-TTGAAAGAAAGTCA-TGTTCA  1045

seq1  ACCCTGGCTGGTCTGGAACCTTCT-ATGTAGACTGGTCTGGCCTTCAACT  1099
      |||||||||||||||    ||||| ||||||||| |||||| |||| |||
seq2  ACCCTGGCTGGTCTG---ACTTCTAATGTAGACT-GTCTGG-CTTC-ACT  1089

seq1  TAGAG-ATGTGCCTAAATGTTGAGGTTAAAGGCATACAACACCCAG-CTT  1147
      ||||| ||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||| || |||
seq2  TAGAGAATGTGCCTAAATGTTGAAGCTATGGCCATACAACACCTAGCCTT  1139

seq1  GACCTCAGAAACAAAGGGTGTTCAACTGCAG  1178
      |||||| ||     | || ||||||||||||
seq2  GACCTC-GA---TCATGGGGTTCAACTGCAG  1166

seq1: chr15_73128496_73129390
seq2: B6Ng01-214D18.g_61_955 (reverse)

seq1  ACATCCTATCCACCTCTCTACTCACCCAACCTTTTTTCTTGATCAAATTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCCTATCCACCTCTCTACTCACCCAACCTTTTTTCTTGATCAAATTC  50

seq1  TTTAAGAGCAAGAGTGCCTTACCTCAGGAGCACCAGCGATTTTGAGTTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGAGCAAGAGTGCCTTACCTCAGGAGCACCAGCGATTTTGAGTTGT  100

seq1  AGCATTCCTTTCCTGTCTTTGTCTTCACTGTTTGAGTACTGGATGGTCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTCCTTTCCTGTCTTTGTCTTCACTGTTTGAGTACTGGATGGTCTG  150

seq1  CACTTGGTTAAAGTCTGCTAGGTGTGTGGGCTTTAGGAAAGAAAGATATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGGTTAAAGTCTGCTAGGTGTGTGGGCTTTAGGAAAGAAAGATATA  200

seq1  GCTCTTAGGCCATGGAGAAGTCTTCAGTGCCTGGGATCTGCTAGCATTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTAGGCCATGGAGAAGTCTTCAGTGCCTGGGATCTGCTAGCATTGA  250

seq1  TGTTATTCTTTCTGACCCCAACTACCAGCCTATTCTCAAGAGCCTTAAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATTCTTTCTGACCCCAACTACCAGCCTATTCTCAAGAGCCTTAAGA  300

seq1  GTCAGGGACATTTTTCTCTGATGGATATCATGCAGTAGCCTTATGGGCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGGGACATTTTTCTCTGATGGATATCATGCAGTAGCCTTATGGGCTT  350

seq1  CCTTCCAGGTTTAGGCATGCTCAACTGTGATGACATCTTTAGGAGAACCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCAGGTTTAGGCATGCTCAACTGTGATGACATCTTTAGGAGAACCA  400

seq1  GATAAATAAGAGGGTAAGAGAAAACTCAGCTTCCATAGATAGGAATGAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAATAAGAGGGTAAGAGAAAACTCAGCTTCCATAGATAGGAATGAAG  450

seq1  GAAGACAGGAGAATGAACTACTGCCATAAACTACCTGTCTAATTCAAGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACAGGAGAATGAACTACTGCCATAAACTACCTGTCTAATTCAAGAA  500

seq1  GCCTGATTGAATTCTCAATGAGAGCAGATATTTAAATAGTTGACAAAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGATTGAATTCTCAATGAGAGCAGATATTTAAATAGTTGACAAAAAT  550

seq1  ATACAAGCTAAAAATATAATATGGAAGCATTTACAGAACAATGCAGTACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAAGCTAAAAATATAATATGGAAGCATTTACAGAACAATGCAGTACT  600

seq1  ATAAGGAATTGATGGCTTATTACCAGCACAAATGTTCACATAATTTACAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGGAATTGATGGCTTATTACCAGCACAAATGTTCACATAATTTACAA  650

seq1  CAGGAGCTGTAAGCAGAAGGTAGAATAGAATACAAAGTCCTTGGCATGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGCTGTAAGCAGAAGGTAGAATAGAATACAAAGTCCTTGGCATGAT  700

seq1  AATAGGAGCTATTCACAACAAAATCTAAGCAGAAGACCAAAGGTCTTTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGGAGCTATTCACAACAAAATCTAAGCAGAAGACCAAAGGTCTTTTA  750

seq1  TAGTTTGTTTGTTGACAAAGTATCATCACGTAGCCCAAGCGGGCCTTGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTGTTTGTTGACAAAGTATCATCACGTAGCCCAAGCGGGCCTTGAA  800

seq1  CTCCCTCTAAGAGCCTAAGCTGGCTTTGAACTAACAGTCTTTATACCTGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTCTAAGAGCCTAAGCTGGCTTTGAACTAACAGTCTTTATACCTGC  850

seq1  TTTCATTTGCTGAGTATTATAGAAATGTCTTCCCAGTAGGAATTC  895
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATTTGCTGAGTATTATAGAAATGTCTTCCCAGTAGGAATTC  895