BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-224D02
Chromosome15 (Build37)
Map Location 58,944,519 - 59,059,396
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG268809
Upstream geneAtad2, LOC665244, 2410187C16Rik, Fbxo32, 8230402K04Rik, Anxa13, LOC100040231, D15Ertd621e, EG631797, Tmem65, EG546638, Trmt12, Rnf139, Tatdn1, Ndufb9, Mtss1, LOC100040330
Downstream geneLOC665565, Sqle, E430025E21Rik, Nsmce2, Trib1, LOC665602, EG632248, LOC665613, 4933412E24Rik, LOC100040266
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-224D02.bB6Ng01-224D02.g
ACCGA038723GA038724
length1,1661,123
definitionB6Ng01-224D02.b B6Ng01-224D02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(58,944,519 - 58,945,682)(59,058,280 - 59,059,396)
sequence
gaattctccaaaatagatcacctaagtgtctcactctaaaaacttcgatc
gtgtcttttcagtccggaagtccaaatcaaggttaaataatccttggggg
ccacccccagctggtgctcgaagtttcccccagcaaggcacagctgatcc
tgtcggcgtttcctcagttcagtgctatggggtatacatacaccagagaa
gactgcttggacaagtggttaagctgtttagttaaggttttactgttgac
caaggcaactcttaaaaaggacaactttagctggggcaggcttacagttt
cagaggtttagtccattatcatcatgggggaaagcatggcagcatccagg
caggcatggtgctgaaggagctgagagttctacatcttcacccaaaggaa
gccaggagcagactgtttccaggcagctaagagaaaggtcccaaagccca
cctccacagtgacatacttcctccaacaaggccacacccactccaacaag
gccacacctcttaatagtgccactcccttgcactagcatattcaaacctc
cagcagcctctgtaagcctgttggcaactacaccgggtgttcaggacccc
aatgcagcactgaacctttctcagggtaagctcctaaacacaaaaccgta
tcctggcttgacacacttcagttaacaagaacagttagccagaagctgag
gttcaaaagctaaaacgcaaaatcagtaaatttagagactttcccagacc
tctatggactttgatggattagtcccttattttagttttggcaagtgcat
gctgaatgacacttttatcatggagtcaattgtgctaaggtctggggccc
tgttgcattcaggagccacttgctgactaactgttgtttccatccacact
cttgttggtttctccttccttgtcagccatgtttcttttctggatcatga
gtgggaaacccagaacagagccattcccttgctcttcagccaccttcact
gagtcaccagtcctctcatctgctaggcacatgtgtcatcaggagctctg
gtgggggacagaagaacatggaaaatgagttagatatgggtcttcttcct
tggaaagcatgaacatacctctccacggctgcctttggccagtatttcca
gagcctgtgtcttagt
gaattcacctgctgaaatctccaatcctcaaggaagagaccacaggagat
tgtgccgagagctggttccgtcacagaggcactgagagagacaccatcct
aactgacacagtgagaagatattaattatgaaccacgaagcaggtcctcc
ttagatactggactactggcatctggatcttcaacttcctggactccaga
tggtgaacagaagtttctgccatgtctgactaagcttcttgatttccagc
atggtgtcagagcagcactgctatactaagagggtgactctgagtccctg
agagaagcctcacgctctaagcacttccacttaaccaccttctgataggg
aactctgcttatctgctacatactctgtcctgcgactttggcttctcata
gagtgctacaaggacactgtggaaccaaagagagaggtcaacccttgatt
ctgcctgcttgtgctggtgtgtggtttttgtcctccgtggatccccttat
tctgctctttttccaagtctaccccattctgcacctggacagatcaatga
accccagagctccttctcgtgcttcctgttccattatttaagtctaggag
ggaagttctgcagctactgggccaggatttgcaggtcacagctcatccag
cgtccactcttctgaccatgaaaattcagaaagtgcagacacctttctca
gggcagagattagggctgctccgagccccacactttcgtcagccctttgt
ccttcatggtgattatcctgagctatacaatgtctaagactttcaggaga
cagggaaacgcaagtcagacagctgaatacctctcagaaggagctaatca
tgtccaagtccagctttaacaccacagggttaaactgaggcaggcagccc
atagcccctctcagatgacatggggcaagccatttacagggttcagcact
actgatgaaacaaaactttattatctggggctggcagatatccagtgaag
aatctctggaactttgtttactcttaagtgtgcagcagaaaggaaaggac
gagagaaggctaccaatcatgacatactacacaccacactgggtcagtcc
tctacatctgtttcaccagtttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_58944519_58945682
seq2: B6Ng01-224D02.b_46_1211

seq1  GAATTCTCCAAAATAGATCACCTAAGTGTCTCACTCTAAAAACTTCGATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCAAAATAGATCACCTAAGTGTCTCACTCTAAAAACTTCGATC  50

seq1  GTGTCTTTTCAGTCCGGAAGTCCAAATCAAGGTTAAATAATCCTTGGGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTTTTCAGTCCGGAAGTCCAAATCAAGGTTAAATAATCCTTGGGGG  100

seq1  CCACCCCCAGCTGGTGCTCGAAGTTTCCCCCAGCAAGGCACAGCTGATCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCCCCAGCTGGTGCTCGAAGTTTCCCCCAGCAAGGCACAGCTGATCC  150

seq1  TGTCGGCGTTTCCTCAGTTCAGTGCTATGGGGTATACATACACCAGAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCGGCGTTTCCTCAGTTCAGTGCTATGGGGTATACATACACCAGAGAA  200

seq1  GACTGCTTGGACAAGTGGTTAAGCTGTTTAGTTAAGGTTTTACTGTTGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCTTGGACAAGTGGTTAAGCTGTTTAGTTAAGGTTTTACTGTTGAC  250

seq1  CAAGGCAACTCTTAAAAAGGACAACTTTAGCTGGGGCAGGCTTACAGTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGCAACTCTTAAAAAGGACAACTTTAGCTGGGGCAGGCTTACAGTTT  300

seq1  CAGAGGTTTAGTCCATTATCATCATGGGGGAAAGCATGGCAGCATCCAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGTTTAGTCCATTATCATCATGGGGGAAAGCATGGCAGCATCCAGG  350

seq1  CAGGCATGGTGCTGAAGGAGCTGAGAGTTCTACATCTTCACCCAAAGGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCATGGTGCTGAAGGAGCTGAGAGTTCTACATCTTCACCCAAAGGAA  400

seq1  GCCAGGAGCAGACTGTTTCCAGGCAGCTAAGAGAAAGGTCCCAAAGCCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGGAGCAGACTGTTTCCAGGCAGCTAAGAGAAAGGTCCCAAAGCCCA  450

seq1  CCTCCACAGTGACATACTTCCTCCAACAAGGCCACACCCACTCCAACAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCACAGTGACATACTTCCTCCAACAAGGCCACACCCACTCCAACAAG  500

seq1  GCCACACCTCTTAATAGTGCCACTCCCTTGCACTAGCATATTCAAACCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACACCTCTTAATAGTGCCACTCCCTTGCACTAGCATATTCAAACCTC  550

seq1  CAGCAGCCTCTGTAAGCCTGTTGGCAACTACACCGGGTGTTCAGGACCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGCCTCTGTAAGCCTGTTGGCAACTACACCGGGTGTTCAGGACCCC  600

seq1  AATGCAGCACTGAACCTTTCTCAGGGTAAGCTCCTAAACACAAAACCGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCAGCACTGAACCTTTCTCAGGGTAAGCTCCTAAACACAAAACCGTA  650

seq1  TCCTGGCTTGACACACTTCAGTTAACAAGAACAGTTAGCCAGAAGCTGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGCTTGACACACTTCAGTTAACAAGAACAGTTAGCCAGAAGCTGAG  700

seq1  GTTCAAAAGCTAAAACGCAAAATCAGTAAATTTAGAGACTTTCCCAGACC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAAAGCTAAAACGCAAAATCAGTAAATTTAGAGACTTTCCCAGACC  750

seq1  TCTATGGACTTTGATGGATTAGTCCCTTATTTTAGTTTTGGCAAGTGCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATGGACTTTGATGGATTAGTCCCTTATTTTAGTTTTGGCAAGTGCAT  800

seq1  GCTGAATGACACTTTTATCATGGAGTCAATTGTGCTAAGGTCTGGGGCCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAATGACACTTTTATCATGGAGTCAATTGTGCTAAGGTCTGGGGCCC  850

seq1  TGTTGCATTCAGGAGCCACTTGCTGACTAACTGTTGTTTCCATCCACACT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGCATTCAGGAGCCACTTGCTGACTAACTGTTGTTTCCATCCACACT  900

seq1  CTTGTTGGTTTCTCCTTCCTTGTCAGCCATGTTTCTTTTCTGGATCATGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTGGTTTCTCCTTCCTTGTCAGCCATGTTTCTTTTCTGGATCATGA  950

seq1  GT-GGAAACCCAGAACAGAGCCATT-CCTTGCTCTTCAGCCACCTTCACT  998
      || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGAAACCCAGAACAGAGCCATTCCCTTGCTCTTCAGCCACCTTCACT  1000

seq1  GAGTCACCAGTCCTCTCATCTGCTAGGCACATGTGTCAATCAGGAGCTCT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GAGTCACCAGTCCTCTCATCTGCTAGGCACATGTGTC-ATCAGGAGCTCT  1049

seq1  -GTGGGGACCAG-AGAACATGGAAAATGAGTTAGAATTATGGGCCTTC-T  1095
       ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |
seq2  GGTGGGGGACAGAAGAACATGGAAAATGAGTTAGA--TATGGGTCTTCTT  1097

seq1  CCTTGGGAAGCATGAACATACCTCTCCAC-GCTGCTTTTGGCCAGTATTT  1144
      |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
seq2  CCTTGGAAAGCATGAACATACCTCTCCACGGCTGCCTTTGGCCAGTATTT  1147

seq1  CCAGAGCTTGTTGTCTTAGT  1164
      ||||||| || |||||||||
seq2  CCAGAGCCTG-TGTCTTAGT  1166

seq1: chr15_59058280_59059396
seq2: B6Ng01-224D02.g_70_1192 (reverse)

seq1  GAAATTGGTGAAACAGATGGTAGA-GACTGA-CCAGTGTGTGTGTGT-GT  47
      |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||
seq2  GAAACTGGTGAAACAGAT-GTAGAGGACTGACCCAGTGTG-GTGTGTAGT  48

seq1  GTGT-GTGTGTGTGTGGCCTTCTCTCTGTCCTTTTCTTTCTTGCTGGCCA  96
       |||  ||  || || |||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||
seq2  ATGTCATGATTG-GTAGCCTTCTCTC-GTCCTTTCCTTTC-TGCTGCACA  95

seq1  CTTAAGAGTTAAACAAGTT-CAGAGATTC-TCACTGGATATTCTTGCCAG  144
      ||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||
seq2  CTTAAGAGTAAACAAAGTTCCAGAGATTCTTCACTGGATAT--CTGCCAG  143

seq1  CCCCAGATAATTAAGTTTTGTTTCATCAGTAGTGCTG-ACCCTGTAAATT  193
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| 
seq2  CCCCAGATAATAAAGTTTTGTTTCATCAGTAGTGCTGAACCCTGTAAATG  193

seq1  GCCTG-CCCATGTCATCTGAGAGGGGCTATTGGCTGCCTGCCTCAGTTT-  241
      || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| 
seq2  GCTTGCCCCATGTCATCTGAGAGGGGCTATGGGCTGCCTGCCTCAGTTTA  243

seq1  ACCCTGTGGTGTTAAAGCTGGACTTGGACATGATTAGCTCCTTCTGAGAG  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGTGGTGTTAAAGCTGGACTTGGACATGATTAGCTCCTTCTGAGAG  293

seq1  GTATTCAGCTGTCTGACTTGCG-TTCCCTGTCTCCTG-AAGTCTTAGACA  339
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GTATTCAGCTGTCTGACTTGCGTTTCCCTGTCTCCTGAAAGTCTTAGACA  343

seq1  TTGTATAGCTCAGGATAATCACCATGAAGGAC-AAGGGCTGACGAAAGTG  388
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTGTATAGCTCAGGATAATCACCATGAAGGACAAAGGGCTGACGAAAGTG  393

seq1  TGGGGCTCGGAGCAGCCCTAATCTCTGCCCTGAGAAAGGTGTCTGCAC-T  437
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TGGGGCTCGGAGCAGCCCTAATCTCTGCCCTGAGAAAGGTGTCTGCACTT  443

seq1  TCTGAATTTTCATGGTCAGAAGAGTGGACGCTGGATGAGCTGTGACCTGC  487
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAATTTTCATGGTCAGAAGAGTGGACGCTGGATGAGCTGTGACCTGC  493

seq1  AAATCCTGGCCCAGTAGCTGCAGAACTTCCCTCCTAGACTTAAATAATGG  537
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCCTGGCCCAGTAGCTGCAGAACTTCCCTCCTAGACTTAAATAATGG  543

seq1  AACAGGAAGCACGAGAAGGAGCTCTGGGGTTCATTGATCTGTCCAGGTGC  587
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGAAGCACGAGAAGGAGCTCTGGGGTTCATTGATCTGTCCAGGTGC  593

seq1  AGAATGGGGTAGACTTGGAAAAAGAGCAGAATAAGGGGATCCACGGAGGA  637
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGGGGTAGACTTGGAAAAAGAGCAGAATAAGGGGATCCACGGAGGA  643

seq1  CAAAAACCACACACCAGCACAAGCAGGCAGAATCAAGGGTTGACCTCTCT  687
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAACCACACACCAGCACAAGCAGGCAGAATCAAGGGTTGACCTCTCT  693

seq1  CTTTGGTTCCACAGTGTCCTTGTAGCACTCTATGAGAAGCCAAAGTCGCA  737
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGGTTCCACAGTGTCCTTGTAGCACTCTATGAGAAGCCAAAGTCGCA  743

seq1  GGACAGAGTATGTAGCAGATAAGCAGAGTTCCCTATCAGAAGGTGGTTAA  787
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGAGTATGTAGCAGATAAGCAGAGTTCCCTATCAGAAGGTGGTTAA  793

seq1  GTGGAAGTGCTTAGAGCGTGAGGCTTCTCTCAGGGACTCAGAGTCACCCT  837
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAAGTGCTTAGAGCGTGAGGCTTCTCTCAGGGACTCAGAGTCACCCT  843

seq1  CTTAGTATAGCAGTGCTGCTCTGACACCATGCTGGAAATCAAGAAGCTTA  887
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGTATAGCAGTGCTGCTCTGACACCATGCTGGAAATCAAGAAGCTTA  893

seq1  GTCAGACATGGCAGAAACTTCTGTTCACCATCTGGAGTCCAGGAAGTTGA  937
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGACATGGCAGAAACTTCTGTTCACCATCTGGAGTCCAGGAAGTTGA  943

seq1  AGATCCAGATGCCAGTAGTCCAGTATCTAAGGAGGACCTGCTTCGTGGTT  987
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCCAGATGCCAGTAGTCCAGTATCTAAGGAGGACCTGCTTCGTGGTT  993

seq1  CATAATTAATATCTTCTCACTGTGTCAGTTAGGATGGTGTCTCTCTCAGT  1037
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAATTAATATCTTCTCACTGTGTCAGTTAGGATGGTGTCTCTCTCAGT  1043

seq1  GCCTCTGTGACGGAACCAGCTCTCGGCACAATCTCCTGTGGTCTCTTCCT  1087
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTGTGACGGAACCAGCTCTCGGCACAATCTCCTGTGGTCTCTTCCT  1093

seq1  TGAGGATTGGAGATTTCAGCAGGTGAATTC  1117
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGATTGGAGATTTCAGCAGGTGAATTC  1123