BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-225B19
Chromosome15 (Build37)
Map Location 19,008,726 - 19,122,289
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC666835, LOC666839, Cdh10, EG666857
Downstream geneEG666875, LOC621884, LOC100040265
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-225B19.bB6Ng01-225B19.g
ACCGA039389GA039390
length1,1891,113
definitionB6Ng01-225B19.b B6Ng01-225B19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(19,121,097 - 19,122,289)(19,008,726 - 19,009,758)
sequence
gaattcctgacataatgaaaagtatttatccaactaaaagaatgataaac
acctactaagagaagacagaagcaataagttgcttgtagggtctatggga
aaaggaatcaaagtgagaaagaagattgtcaataatataaatatctatag
agaggcctgtaagacagaaatccaatagtgtcaccagtggttttgtaaag
tgaaattcaccttacctagtgtgaagctcatggtaaactaagccatgaat
ttttatttaaatgttaacctagaaaacttttacctatggaacagagttag
gaagcaactgaaacaataatcagccggattacgattattgggaaggattg
gatttgtgttcattgtgtgataaaatggtgtaaaggaaatttatatgata
attcaatagagagttagaaatgtagacatattatcatttacaaaggcact
cagacctttattttacaaatgtgtcatatctgagagagttaagtgccatt
cagtcctgaggccaggtcatgaagaatcttgtccagagactgcaaagaag
tccatgatttgcatagctatgtggacttcttggcataaaacctactaatg
accctgttgaaatgcaaatactttattacattgaattgcataagcttcat
aaagagcataatgcacataaatcctatgaaaactgtttgtgtagaggagc
taaaatgaattaacatgagccggtgcatattttagataatgcctgcaaag
cagccttgtaaagacattgcattttatttgccatttagtgctttcatttt
cccagtttgttatgaaataacccattccacccgcatcaactggcagataa
ttggagctgaatatgtgcatctgattagatatgtagactgatagacatac
ctctaaatgtatcagataagcacaccatttgttgtgtttgttcttttctt
cattgaatacatttgtgtttccatcattagttttcaatacatattttcta
attatggatgaagtcatgccaacttttgaagcaataaaacatgaaggtaa
atatttttccagcattaaaacagtctgtattgttgttagtatctgaacaa
tataaaaaaaactacacactataaagaaatgactactgataaactttcca
catctggtagcatcacgaaaaagctgttttctctgtaag

gaattctcctgtgttcatctttaaaaagaaaatctgggaaatggaggatg
ttgacagacctaatatagattaataaaatcatttgagcatgggctcctta
aggctagaatcccattgcattccttgttacctaagaaatggcctattaga
gtgatttaaaagatggctttttcacaatttctttacatgaacaaagtaca
gaaagatttgctttctgggtgccaaatttaactacttgttgccaattaaa
agggaccattgtagagccttgccacaaggagttttaaatagtcctacatt
atacgaacattttatacaacagtcattagcaaaaatgcataagctatttc
ctcaatccatatcttactgttatataggtgacattttgcttgctatttca
aataaatatcttagaaaaaaatgaatgataaagagaatttaacttgctgg
agattatatatatgctcctgaaaaaaatacaaaaaggaaactctattaat
tacttagagtataagataagtctacatgaaattccatcatagaagataca
catcaggagataccaatgaataagtcttaatagttaatcgtcaattaaac
tagtcatgtcagacactagtctagttagatagactagttcatacacctca
gagatccacagaatatgtcatttaaagatgtcctactattttaagacttc
tttggacaatgaaacatgttagctcctagcagcaccaccattctacctca
aagaagattatgagccttgaagaagctctgtataaagtttgatgcaaata
tggcaagctagccactgggcttcagaaactgacaacatgctcttcaaaat
gtacaacatcatcatcaatgtaattgtcataatcatcatcatagtcgtca
tcatcatcatcattatcaacatcataatgagatgtagggaagtcaacttc
caagttttgcaagaacagataggcaaacacttcataattcctactatgca
aaacatcagtcagatattttcaccagaagtctgtagatgtcctttacaag
acaagatgggtgaaccctttataatcctactatgtaaaccatcagccaga
atatttcaccaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_19121097_19122289
seq2: B6Ng01-225B19.b_44_1232 (reverse)

seq1  CTTAC--AGAAAACAGCTTTTTTGTGGATGCTTACAGATGT-GAAAGTTT  47
      |||||  ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||||
seq2  CTTACAGAGAAAACAGCTTTTTCGT-GATGCTACCAGATGTGGAAAGTTT  49

seq1  ATCAGTAGTCATTTCTTTTATAGTTGGTGTAGTTTTTTTTATAATTGTTC  97
      ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||
seq2  ATCAGTAGTCATTTC-TTTATAGT--GTGTAGTTTTTTTTAT-ATTGTTC  95

seq1  AGATTAACTTAC-ACAATACAGACTGTTTTAAATGCTGGAAAAATATTTA  146
      ||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AGAT--ACTAACAACAATACAGACTGTTTT-AATGCTGGAAAAATATTTA  142

seq1  CCTTCAATGTTTATTGCTTCAAAAGTTGGCATGACTTCATCCATAATTAG  196
      ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCATGTTTTATTGCTTCAAAAGTTGGCATGACTTCATCCATAATTAG  192

seq1  AAAATATGTATTGAAAACTAATGATGGAAACACAAATGTATTCAATGAAG  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATGTATTGAAAACTAATGATGGAAACACAAATGTATTCAATGAAG  242

seq1  AAAAGAACAAACACAACAAATGGTGTGCTTATCTGATACATTTAGAGGTA  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAACAAACACAACAAATGGTGTGCTTATCTGATACATTTAGAGGTA  292

seq1  TGTCTATCAGTCTACATATCTAATCAGATGCACATATTCAGCTCCAATTA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTATCAGTCTACATATCTAATCAGATGCACATATTCAGCTCCAATTA  342

seq1  TCTGCCAGTTGATGCGGGTGGAATGGGTTATTTCATAACAAACTGGGAAA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCAGTTGATGCGGGTGGAATGGGTTATTTCATAACAAACTGGGAAA  392

seq1  ATGAAAGCACTAAATGGCAAATAAAATGCAATGTCTTTACAAGGCTGCTT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAGCACTAAATGGCAAATAAAATGCAATGTCTTTACAAGGCTGCTT  442

seq1  TGCAGGCATTATCTAAAATATGCACCGGCTCATGTTAATTCATTTTAGCT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGCATTATCTAAAATATGCACCGGCTCATGTTAATTCATTTTAGCT  492

seq1  CCTCTACACAAACAGTTTTCATAGGATTTATGTGCATTATGCTCTTTATG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTACACAAACAGTTTTCATAGGATTTATGTGCATTATGCTCTTTATG  542

seq1  AAGCTTATGCAATTCAATGTAATAAAGTATTTGCATTTCAACAGGGTCAT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTATGCAATTCAATGTAATAAAGTATTTGCATTTCAACAGGGTCAT  592

seq1  TAGTAGGTTTTATGCCAAGAAGTCCACATAGCTATGCAAATCATGGACTT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTAGGTTTTATGCCAAGAAGTCCACATAGCTATGCAAATCATGGACTT  642

seq1  CTTTGCAGTCTCTGGACAAGATTCTTCATGACCTGGCCTCAGGACTGAAT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCAGTCTCTGGACAAGATTCTTCATGACCTGGCCTCAGGACTGAAT  692

seq1  GGCACTTAACTCTCTCAGATATGACACATTTGTAAAATAAAGGTCTGAGT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACTTAACTCTCTCAGATATGACACATTTGTAAAATAAAGGTCTGAGT  742

seq1  GCCTTTGTAAATGATAATATGTCTACATTTCTAACTCTCTATTGAATTAT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTGTAAATGATAATATGTCTACATTTCTAACTCTCTATTGAATTAT  792

seq1  CATATAAATTTCCTTTACACCATTTTATCACACAATGAACACAAATCCAA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATAAATTTCCTTTACACCATTTTATCACACAATGAACACAAATCCAA  842

seq1  TCCTTCCCAATAATCGTAATCCGGCTGATTATTGTTTCAGTTGCTTCCTA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCCCAATAATCGTAATCCGGCTGATTATTGTTTCAGTTGCTTCCTA  892

seq1  ACTCTGTTCCATAGGTAAAAGTTTTCTAGGTTAACATTTAAATAAAAATT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGTTCCATAGGTAAAAGTTTTCTAGGTTAACATTTAAATAAAAATT  942

seq1  CATGGCTTAGTTTACCATGAGCTTCACACTAGGTAAGGTGAATTTCACTT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCTTAGTTTACCATGAGCTTCACACTAGGTAAGGTGAATTTCACTT  992

seq1  TACAAAACCACTGGTGACACTATTGGATTTCTGTCTTACAGGCCTCTCTA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAAACCACTGGTGACACTATTGGATTTCTGTCTTACAGGCCTCTCTA  1042

seq1  TAGATATTTATATTATTGACAATCTTCTTTCTCACTTTGATTCCTTTTCC  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATATTTATATTATTGACAATCTTCTTTCTCACTTTGATTCCTTTTCC  1092

seq1  CATAGACCCTACAAGCAACTTATTGCTTCTGTCTTCTCTTAGTAGGTGTT  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGACCCTACAAGCAACTTATTGCTTCTGTCTTCTCTTAGTAGGTGTT  1142

seq1  TATCATTCTTTTAGTTGGATAAATACTTTTCATTATGTCAGGAATTC  1193
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCATTCTTTTAGTTGGATAAATACTTTTCATTATGTCAGGAATTC  1189


seq1: chr15_19008726_19009758
seq2: B6Ng01-225B19.g_153_1180

seq1  AGCATGGGCTCCTTAAGGCTAGAATCCCATTGCATTCCTTGTTACCTAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATGGGCTCCTTAAGGCTAGAATCCCATTGCATTCCTTGTTACCTAAG  50

seq1  AAATGGCCTATTAGAGTGATTTAAAAGATGGCTTTTTCACAATTTCTTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGCCTATTAGAGTGATTTAAAAGATGGCTTTTTCACAATTTCTTTA  100

seq1  CATGAACAAAGTACAGAAAGATTTGCTTTCTGGGTGCCAAATTTAACTAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAACAAAGTACAGAAAGATTTGCTTTCTGGGTGCCAAATTTAACTAC  150

seq1  TTGTTGCCAATTAAAAGGGACCATTGTAGAGCCTTGCCACAAGGAGTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGCCAATTAAAAGGGACCATTGTAGAGCCTTGCCACAAGGAGTTTT  200

seq1  AAATAGTCCTACATTATACGAACATTTTATACAACAGTCATTAGCAAAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGTCCTACATTATACGAACATTTTATACAACAGTCATTAGCAAAAA  250

seq1  TGCATAAGCTATTTCCTCAATCCATATCTTACTGTTATATAGGTGACATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATAAGCTATTTCCTCAATCCATATCTTACTGTTATATAGGTGACATT  300

seq1  TTGCTTGCTATTTCAAATAAATATCTTAGAAAAAAATGAATGATAAAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTGCTATTTCAAATAAATATCTTAGAAAAAAATGAATGATAAAGAG  350

seq1  AATTTAACTTGCTGGAGATTATATATATGCTCCTGAAAAAAATACAAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTAACTTGCTGGAGATTATATATATGCTCCTGAAAAAAATACAAAAA  400

seq1  GGAAACTCTATTAATTACTTAGAGTATAAGATAAGTCTACATGAAATTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACTCTATTAATTACTTAGAGTATAAGATAAGTCTACATGAAATTCC  450

seq1  ATCATAGAAGATACACATCAGGAGATACCAATGAATAAGTCTTAATAGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATAGAAGATACACATCAGGAGATACCAATGAATAAGTCTTAATAGTT  500

seq1  AATCGTCAATTAAACTAGTCATGTCAGACACTAGTCTAGTTAGATAGACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCGTCAATTAAACTAGTCATGTCAGACACTAGTCTAGTTAGATAGACT  550

seq1  AGTTCATACACCTCAGAGATCCACAGAATATGTCATTTAAAGATGTCCTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCATACACCTCAGAGATCCACAGAATATGTCATTTAAAGATGTCCTA  600

seq1  CTATTTTAAGACTTCTTTGGACAATGAAACATGTTAGCTCCTAGCAGCAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTTAAGACTTCTTTGGACAATGAAACATGTTAGCTCCTAGCAGCAC  650

seq1  CACCATTCTACCTCAAAGAAGATTATGAGCCTTGAAGAAGCTCTGTATAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATTCTACCTCAAAGAAGATTATGAGCCTTGAAGAAGCTCTGTATAA  700

seq1  AGTTTGATGCAAATATGGCAAGCTAGCCACTGGGCTTCAGAAACTGACAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGATGCAAATATGGCAAGCTAGCCACTGGGCTTCAGAAACTGACAA  750

seq1  CATGCTCTTCAAAATGTACAACATCATCATCAATGTAATTGTCATAATCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTCTTCAAAATGTACAACATCATCATCAATGTAATTGTCATAATCA  800

seq1  TCATCATAGTCGTCATCATCATCATCATTATCAACATCATAATGAGATGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCATAGTCGTCATCATCATCATCATTATCAACATCATAATGAGATGT  850

seq1  AGGGAAGTCAACTTCCAAGTTTTGCAAGAACAAGATAGGCAAACACTTCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AGGGAAGTCAACTTCCAAGTTTTGCAAGAAC-AGATAGGCAAACACTTCA  899

seq1  TAATTCCTACTATGCAAAAACATCAGTCAGATATTTTCACCAGAAGTCTG  950
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTCCTACTATGC-AAAACATCAGTCAGATATTTTCACCAGAAGTCTG  948

seq1  TAGATGTCCTTTACAAGGACAAGATGGGTGAACCCTTTATAATTCCTACT  1000
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TAGATGTCCTTTACAA-GACAAGATGGGTGAACCCTTTATAA-TCCTACT  996

seq1  ATGTAAAACCATCAGCCAGATATTTTCACCAGA  1033
      |||| |||||||||||||||   ||||||||||
seq2  ATGT-AAACCATCAGCCAGAATATTTCACCAGA  1028


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |