seq1: chr14_9478206_9478311
seq2: B6Ng01-227F16.b_251_323 (reverse)
seq1 ACATACACACTCACATACACACACAGAGAGGGGGGAGACAAAGAGAGAGA 50
|||||||||||||||||||||||| |
seq2 ACATACACACTCACATACACACAC-------------------------A 25
seq1 CAGACACAGAGAGACAGACACAGAGAGACTTAGAGAGAGACAGAAAAAGA 100
|| ||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| | |||
seq2 CACACACAGAGAGAGAG----AGAGAG----AGAGAGAGAGAGAGAGAGA 67
seq1 GAGAGA 106
||||||
seq2 GAGAGA 73
| seq1: chr15_87784916_87785954
seq2: B6Ng01-227F16.g_72_1121
seq1 GAATTCTTATCTGGAGGAAGTAGGGCCCGAGGAAACTTTTGGGATCTTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCTTATCTGGAGGAAGTAGGGCCCGAGGAAACTTTTGGGATCTTCT 50
seq1 GGCTCTTAGGAAACGTTTTTCCTTTCCGGTTGTCTCGATGGCCTCACTGA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGCTCTTAGGAAACGTTTTTCCTTTCCGGTTGTCTCGATGGCCTCACTGA 100
seq1 GATGTGGCAGATCACATGTGTTCCCCTGGCTTTCTCACACCCATGTTTAT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GATGTGGCAGATCACATGTGTTCCCCTGGCTTTCTCACACCCATGTTTAT 150
seq1 GCCCAGAAGGCTCTTACCTGCAGACACAATGGCAGCTTTATTTAGAACAC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCCCAGAAGGCTCTTACCTGCAGACACAATGGCAGCTTTATTTAGAACAC 200
seq1 CTTGGAAACGCCCGCTGTACAGAAGGCAAGTCCCGTGCTCATTTAGCACA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTGGAAACGCCCGCTGTACAGAAGGCAAGTCCCGTGCTCATTTAGCACA 250
seq1 TACCTCCCAGGGGCCTATGCACATCCTACACTACACTCTGATGGAACAGA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TACCTCCCAGGGGCCTATGCACATCCTACACTACACTCTGATGGAACAGA 300
seq1 GTTGGTAAAAAGCAAACACATAATGCTGCTAGAGGCTTCTTGATGCTCAG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTTGGTAAAAAGCAAACACATAATGCTGCTAGAGGCTTCTTGATGCTCAG 350
seq1 GTCCTGGTGGGGAAGATGGAGCTGGTCTCCCAGCCCAGGTTTGGCCACTC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTCCTGGTGGGGAAGATGGAGCTGGTCTCCCAGCCCAGGTTTGGCCACTC 400
seq1 TTCTGCCTATTTTGTCTTGCCTTTTCTCTCCGTACATTCACAATGCCATT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCTGCCTATTTTGTCTTGCCTTTTCTCTCCGTACATTCACAATGCCATT 450
seq1 TGTTTTCTGTGTACATCAGTAGAAGGTTGTTCTGGGCCCAGCTTGTAAAC 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTTTTCTGTGTACATCAGTAGAAGGTTGTTCTGGGCCCAGCTTGTAAAC 500
seq1 CAGTGCTCACATTCAGTAGCAGCTTGCAGAGATGGTCACATCTTTCTGGG 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGTGCTCACATTCAGTAGCAGCTTGCAGAGATGGTCACATCTTTCTGGG 550
seq1 AACACACAGCCATTCATGGGCAAGAAGCACTGCTTGACT-GGGTGTTCAC 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2 AACACACAGCCATTCATGGGCAAGAAGCACTGCTTGACTGGGGTGTTCAC 600
seq1 TGAGATGTACATGGAAGTCCCAGGGCCTCAGAATGAGAGATTAGACAACT 649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGAGATGTACATGGAAGTCCCAGGGCCTCAGAATGAGAGATTAGACAACT 650
seq1 GGCCCCGATATGGGCTATAATCCTCACTCCACAGACCAGAATGGTGGCTG 699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGCCCCGATATGGGCTATAATCCTCACTCCACAGACCAGAATGGTGGCTG 700
seq1 GCTGTGCAGGCTGGGGAGTATTCTCCACTCT-CCCTTGCCAGTCAACTTA 748
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2 GCTGTGCAGGCTGGGGAGTATTCTCCACTCTCCCCTTGCCAGTCAACTTA 750
seq1 CCAAACAGAAAAGTGGTCAGT-GGGTACATCATGATGGATGATCACAGGA 797
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCAAACAGAAAAGTGGTCAGTGGGGTACATCATGATGGATGATCACAGGA 800
seq1 CGG-TCATGTGGGGTACTGTGTTTTCCTTCAGAGACATGAACACATATC- 845
||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2 CGGTTCATGTGGGGTACTGTGTTTT-CTTCAGAGACATGAACACATATCT 849
seq1 TATTCACCTCAGATTTAGGGAACCACTAACTGAAGAAGTGATTCAGTCCA 895
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||
seq2 TATTCACCTCAGATTTAGGGAACCACT-ACTG-AGAAGTGATTCAGTCCC 897
seq1 AGTCTAGTTTAGAGAACTTGTGAGTTTACTGGGATAACATATAGCAACAA 945
||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTCTAGTTTAGAGACCTTGTGAGTCTACTGGGATAACATATAGCAACAA 947
seq1 GGGTGTCTCAAAAGCAGC-CG-CATGGAAAAGTCCACTCCAGT-ATGGC- 991
|||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| |||| |||||
seq2 GGGTGTCTCAAAAGCAGCTCGCCATTG-CAAGTCCACTTCAGTAATGGCT 996
seq1 TGCCTA-CTCCAGTATGGCT-GCCTGTG--AATG-CTGC-ATAGCTGGAA 1035
|||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||
seq2 TGCCTACCTCCAGTATGGCTGGCCTGTGGAAATGCCTGCAATAGCTGGAA 1046
seq1 CTCT 1039
|||
seq2 ATCT 1050
|