BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-232C21
Chromosome15 (Build37)
Map Location 18,958,091 - 19,083,772
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG666857
Upstream geneLOC666835, LOC666839, Cdh10
Downstream geneEG666875, LOC621884, LOC100040265
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-232C21.bB6Ng01-232C21.g
ACCGA044581GA044582
length1,0431,152
definitionB6Ng01-232C21.b B6Ng01-232C21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(18,958,091 - 18,958,881)(19,082,623 - 19,083,772)
sequence
gaattctttcccttacaagtatgaactattacctagaagtgtaagatgaa
ctagaccttttccacccaagttctttatgtaaaattaaatcaaccacttt
caccccaattatttttagtcacctttttatcatggcagtagaaacttaat
tagcacacccccataattcttatctcccaacaacatcttctgaacaaatc
ccccattatctttgtctctttcctttgatgttatatactacatttaatca
gaattgctagtatatgcctggctcaaagtttgtttcaatgagggcaactt
acccagtgtctaaaccacagaggtatatagtttaatctcacccagcaact
ttaaactgcttatggaagtttggagcctaatgaggctcttccaatctctg
atgaaactttaataagttatgtctcctgcagatcttgagcagataaccac
aaccctttcagagatgttgcagcaatgacatgttcatattcagaatctta
cagcactgtcctgcctctgaacattggagggaatggtatagatatcccat
ttagggatgaacattcaatagtaacttattttttttaattaattacttaa
ttttcattacacctaaaccatagtttctccttcctcctctgcttccacct
cccctttcccattcacctttcttccctccctcttcaaaacagggggagtc
tcccatggatgccaatgagcctccacatatcaatttgcagtaagactagg
caaagcatctcccattgagtctagaagcagcagcccaaaaaagagagaga
gagatccagagtcagaagacaaaatcagagagagcccctgcttctgttct
tgggagtccacataaagatcaagctgcatcactgttaacatatgtgcaga
gggcctaggttatgcatgctctcttgttggtggtacagtgtctgtaggcc
actatggtgccaggttggttattctgtaggttttcttatggtatccttga
acattctggtgcctttttccctacttccaacgaattccccaag
gaattcatctcctttttgtaagacatttattaaataaatccacaaatatg
caaaataatgttacttttttatttcatgtgtatgaggtattgcctaaatg
catgtctgttcaccacttgcatgcagtgctcaaagaggccacaagaggta
gttatctcatggaaccagagttactaaggattgttagccaatgaatgggt
ggtgagaacagaacctaaaatcttggcaatattatcaagtgctcttaatt
gtgagccatgtcttcagcccactttatcattacctttttcacattgtata
atgaattaatttttatgaaatatcattcatataaacatagagtatttatt
atcctaaaattacctaagttattaaatggtccaagttgttttaatcaatt
tctacaatgataaatgttcatagaggttactacataaaacattattaaag
ttgttcaattactttaagaatttacaaaagtcttacaatgacaactttaa
acaattactattttatttcttttgctggcatgaaagtattagaaaatata
ttcctatgctttaacaagaagatacatatatatgtatattcaagaacctc
ttaatagatgcaaaaggaagcattatagaatgaatgtaaaacaatataaa
ctcaagtcccatccagtccctgatagcacctgggtagcttgggtgtggag
tctgctgacacctgcaggctacccacaagaccctccacgagatcttaaga
cctctggtgagtggaacacagctgctgctccaaaccaatctccgggtacc
tgagactgcattaattagggaagcattaacccaggcctgatcagaggcac
aagtcgcttccggtccatgccagcagcggggtaccttgggcatggagtct
tcggacacccgcaaggtatacacaggaccctcaacgggatcttaagacct
ctgtgaatggatcacacttctgccaggaggcagattcaaacaccatatat
ccgtcaccttccctgcaagaggaagagctttgccttgcagagagtacttc
tgaacccttgaacttcaaggagagagctagtcctcccaggtcttgctgat
agaggcttacataaaatcttgagacagatctaaccaagacacttacaaca
cc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_18958091_18958881
seq2: B6Ng01-232C21.b_47_837

seq1  GAATTCTTTCCCTTACAAGTATGAACTATTACCTAGAAGTGTAAGATGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCCCTTACAAGTATGAACTATTACCTAGAAGTGTAAGATGAA  50

seq1  CTAGACCTTTTCCACCCAAGTTCTTTATGTAAAATTAAATCAACCACTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGACCTTTTCCACCCAAGTTCTTTATGTAAAATTAAATCAACCACTTT  100

seq1  CACCCCAATTATTTTTAGTCACCTTTTTATCATGGCAGTAGAAACTTAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCAATTATTTTTAGTCACCTTTTTATCATGGCAGTAGAAACTTAAT  150

seq1  TAGCACACCCCCATAATTCTTATCTCCCAACAACATCTTCTGAACAAATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCACACCCCCATAATTCTTATCTCCCAACAACATCTTCTGAACAAATC  200

seq1  CCCCATTATCTTTGTCTCTTTCCTTTGATGTTATATACTACATTTAATCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATTATCTTTGTCTCTTTCCTTTGATGTTATATACTACATTTAATCA  250

seq1  GAATTGCTAGTATATGCCTGGCTCAAAGTTTGTTTCAATGAGGGCAACTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGCTAGTATATGCCTGGCTCAAAGTTTGTTTCAATGAGGGCAACTT  300

seq1  ACCCAGTGTCTAAACCACAGAGGTATATAGTTTAATCTCACCCAGCAACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGTGTCTAAACCACAGAGGTATATAGTTTAATCTCACCCAGCAACT  350

seq1  TTAAACTGCTTATGGAAGTTTGGAGCCTAATGAGGCTCTTCCAATCTCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACTGCTTATGGAAGTTTGGAGCCTAATGAGGCTCTTCCAATCTCTG  400

seq1  ATGAAACTTTAATAAGTTATGTCTCCTGCAGATCTTGAGCAGATAACCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAACTTTAATAAGTTATGTCTCCTGCAGATCTTGAGCAGATAACCAC  450

seq1  AACCCTTTCAGAGATGTTGCAGCAATGACATGTTCATATTCAGAATCTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTTTCAGAGATGTTGCAGCAATGACATGTTCATATTCAGAATCTTA  500

seq1  CAGCACTGTCCTGCCTCTGAACATTGGAGGGAATGGTATAGATATCCCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACTGTCCTGCCTCTGAACATTGGAGGGAATGGTATAGATATCCCAT  550

seq1  TTAGGGATGAACATTCAATAGTAACTTATTTTTTTTAATTAATTACTTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGGATGAACATTCAATAGTAACTTATTTTTTTTAATTAATTACTTAA  600

seq1  TTTTCATTACACCTAAACCATAGTTTCTCCTTCCTCCTCTGCTTCCACCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCATTACACCTAAACCATAGTTTCTCCTTCCTCCTCTGCTTCCACCT  650

seq1  CCCCTTTCCCATTCACCTTTCTTCCCTCCCTCTTCAAAACAGGGGGAGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTTTCCCATTCACCTTTCTTCCCTCCCTCTTCAAAACAGGGGGAGTC  700

seq1  TCCCATGGATGCCAATGAGCCTCCACATATCAATTTGCAGTAAGACTAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATGGATGCCAATGAGCCTCCACATATCAATTTGCAGTAAGACTAGG  750

seq1  CAAAGCATCTCCCATTGAGTCTAGAAGCAGCAGCCCAAAAA  791
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCATCTCCCATTGAGTCTAGAAGCAGCAGCCCAAAAA  791

seq1: chr15_19082623_19083772
seq2: B6Ng01-232C21.g_68_1219 (reverse)

seq1  GTTGTTGTAGTTGTCTTTGGTTAGATCTTGTTCCTCAGGTTTTTATGTTA  50
      | |||||||  |||| ||||||||||| |||  |||| | |||||||| |
seq2  GGTGTTGTAAGTGTC-TTGGTTAGATC-TGT--CTCAAGATTTTATGTAA  46

seq1  GCCTCTATCAGC-AGACCTGGGA-GACTAGCTCTCTCCT--GAGTTTCAG  96
      |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   ||||  ||
seq2  GCCTCTATCAGCAAGACCTGGGAGGACTAGCTCTCTCCTTGAAGTTCAAG  96

seq1  GGTTCAG-AGTACTCTCTGC-AGGC-AAGCTC-TCCTCTTGCAGGGAAGG  142
      ||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||
seq2  GGTTCAGAAGTACTCTCTGCAAGGCAAAGCTCTTCCTCTTGCAGGGAAGG  146

seq1  TGACCGGATATATGGTGTTTGAATCTGCCTCCTGGCAGAAGTTGTGATCC  192
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TGA-CGGATATATGGTGTTTGAATCTGCCTCCTGGCAGAAG-TGTGATCC  194

seq1  ATTCACAGAGGTCTTAAGATCCCGTTGAGGGTCCTGTGTATACCTTGCGG  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACAGAGGTCTTAAGATCCCGTTGAGGGTCCTGTGTATACCTTGCGG  244

seq1  GTGTCCGAAGACTCCATGCCCAAGGTACCCCGCTGCTGGCATGGACCGGA  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCGAAGACTCCATGCCCAAGGTACCCCGCTGCTGGCATGGACCGGA  294

seq1  AGCGACTTGTGCCTCTGATCAGGCCTGGGTTAATGCTTCCCTAATTAATG  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGACTTGTGCCTCTGATCAGGCCTGGGTTAATGCTTCCCTAATTAATG  344

seq1  CAGTCTCAGGTACCCGGAGATTGGTTTGGAGCAGCAGCTGTGTTCCACTC  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTCAGGTACCCGGAGATTGGTTTGGAGCAGCAGCTGTGTTCCACTC  394

seq1  ACCAGAGGTCTTAAGATCTCGTGGAGGGTCTTGTGGGTAGCCTGCAGGTG  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGAGGTCTTAAGATCTCGTGGAGGGTCTTGTGGGTAGCCTGCAGGTG  444

seq1  TCAGCAGACTCCACACCCAAGCTACCCAGGTGCTATCAGGGACTGGATGG  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAGACTCCACACCCAAGCTACCCAGGTGCTATCAGGGACTGGATGG  494

seq1  GACTTGAGTTTATATTGTTTTACATTCATTCTATAATGCTTCCTTTTGCA  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTGAGTTTATATTGTTTTACATTCATTCTATAATGCTTCCTTTTGCA  544

seq1  TCTATTAAGAGGTTCTTGAATATACATATATATGTATCTTCTTGTTAAAG  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATTAAGAGGTTCTTGAATATACATATATATGTATCTTCTTGTTAAAG  594

seq1  CATAGGAATATATTTTCTAATACTTTCATGCCAGCAAAAGAAATAAAATA  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGGAATATATTTTCTAATACTTTCATGCCAGCAAAAGAAATAAAATA  644

seq1  GTAATTGTTTAAAGTTGTCATTGTAAGACTTTTGTAAATTCTTAAAGTAA  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATTGTTTAAAGTTGTCATTGTAAGACTTTTGTAAATTCTTAAAGTAA  694

seq1  TTGAACAACTTTAATAATGTTTTATGTAGTAACCTCTATGAACATTTATC  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACAACTTTAATAATGTTTTATGTAGTAACCTCTATGAACATTTATC  744

seq1  ATTGTAGAAATTGATTAAAACAACTTGGACCATTTAATAACTTAGGTAAT  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTAGAAATTGATTAAAACAACTTGGACCATTTAATAACTTAGGTAAT  794

seq1  TTTAGGATAATAAATACTCTATGTTTATATGAATGATATTTCATAAAAAT  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGGATAATAAATACTCTATGTTTATATGAATGATATTTCATAAAAAT  844

seq1  TAATTCATTATACAATGTGAAAAAGGTAATGATAAAGTGGGCTGAAGACA  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTCATTATACAATGTGAAAAAGGTAATGATAAAGTGGGCTGAAGACA  894

seq1  TGGCTCACAATTAAGAGCACTTGATAATATTGCCAAGATTTTAGGTTCTG  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCACAATTAAGAGCACTTGATAATATTGCCAAGATTTTAGGTTCTG  944

seq1  TTCTCACCACCCATTCATTGGCTAACAATCCTTAGTAACTCTGGTTCCAT  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCACCACCCATTCATTGGCTAACAATCCTTAGTAACTCTGGTTCCAT  994

seq1  GAGATAACTACCTCTTGTGGCCTCTTTGAGCACTGCATGCAAGTGGTGAA  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATAACTACCTCTTGTGGCCTCTTTGAGCACTGCATGCAAGTGGTGAA  1044

seq1  CAGACATGCATTTAGGCAATACCTCATACACATGAAATAAAAAAGTAACA  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACATGCATTTAGGCAATACCTCATACACATGAAATAAAAAAGTAACA  1094

seq1  TTATTTTGCATATTTGTGGATTTATTTAATAAATGTCTTACAAAAAGGAG  1142
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTGCATATTTGTGGATTTATTTAATAAATGTCTTACAAAAAGGAG  1144

seq1  ATGAATTC  1150
      ||||||||
seq2  ATGAATTC  1152