BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-234N07
Chromosome15 (Build37)
Map Location 73,431,502 - 73,617,978
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlc45a4, Gpr20, LOC100040946, pPtp4a3, Gm628
Upstream gene1810044A24Rik, LOC665621, Peg13, LOC100041120, Chrac1, Eif2c2, Ptk2, LOC666053, LOC100040929, Dennd3
Downstream geneLOC100041273, EG625276, LOC100040966, EG666113, LOC100041307, LOC100040984, Bai1, 1700016M24Rik, Arc, Jrk, 4933427E11Rik, Psca, 4930572J05Rik, Slurp1, Lypd2, 2300005B03Rik, Lynx1, Ly6d, D730001G18Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-234N07.bB6Ng01-234N07.g
ACCGA046476GA046477
length7161,145
definitionB6Ng01-234N07.b B6Ng01-234N07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,431,502 - 73,432,213)(73,616,836 - 73,617,978)
sequence
gaattcaagacctgtctgagctatagagggagttcaagggcagcctggga
gactgagagtctgtcttgaaacaagcaggcaagcaaaacaaacaaacaaa
caaacaaacacctagcaggtttggtggtgagcacctttaatcccactacc
tgggaggcagaggtaggcagatctctgtgagtttgaagctagcctggtct
acatagcaagtttgagaacagccaggggaacacagagagagagagagaga
ccctgtctcaaaaatcaaaagtaaaaagttcaaactgagccaagggtgtg
acccagtggcagagcatgtgccaaccatgcagcaggagagagagagagag
agagagagagagagagagagagagagagagagagagactgtctctaaata
aaaggttcaaagtatcaatagtaagaagaattaatattctgaacactcct
gcatggtgggaagctgaggacacaggctgggatcttatgagaaaaagaag
tctcttggtctgtcacgtctcaagctgagtaacacggtgatgccgaccct
gagaaaaagaccctggtgtccaggagctcatgcccttgtccttacccagg
tgttcttgcttagggttttcactttccttggcagctgtgcaaagtgatgt
ggctccacgcctcttgtgggagctccaggtaaaaggaggaaccgccactc
aggctcacatgtgcca
gaattcacagaagaggggagatggctctctcaaaggaatgtgttccctga
tactgcaggaacttgtcctaccacactaaggtggcttagggagtcacctt
ccctgaaggtgggctctgtttcaccacacctacctgcctgcctgggtcac
tactattcaggtctcacctggtccagccccttcaatactagcaagccttg
cagaaaagatacctgccatgtctcatggctaccaccagagggcgcatgag
attgccaggcatagtcgcgaccaggtatgtcagtagcaaagggcaggtca
gttttgtgaagtaagccccactttgtggaacaaaggcaccaccaggctgt
ctgtgtacccttcccacagttacttgggagcaaggggtacacagctcaga
agaaaagaatctagtgagatgccaagatctgaaccctacccaagggcctt
acatgtattatatggccatgaagctgtgtggacaggtgggccctttggga
aaaggtggtgatagagtcgtttctgtctctacatcttacaaagcaactgg
tgactggaagactacttgatgctgcagaaaatacaaccaaggactggtgt
ccacattgggaactaatagcattgacccagtctcctgtttgatgctactc
attacgtctcctgtcctatcacttgggactggctgcctgtcacctctgtg
caggaacgttgacctaagaaatggagccatctccgcaggtcaccaaatag
caaacggccagagtttcctaatggactcatgagagtctgactgggcactt
ctgtgaccgccccaccctttccctgaacgtgccagtggtaaacactgttg
aaggtccttacgtgaacgatcagccatatctttttgaggaccagggaaag
gtatttatccagtccttttttaaaccttttaagaggaccagtgggatgac
tactacatagaggtcactctaacttctatggcctgagtttgatccataat
ccatagtaagaaagaactaactgctgaagtttgccttctggttttccaac
acaacatgctgctggccttgctggcatgcatgccatgctcaatatgcacg
ccttacacgcatgcttattacattaactaattttgctaagagctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_73431502_73432213
seq2: B6Ng01-234N07.b_46_761

seq1  GAATTCAAGACCTGTCTGAGCTATAGAGGGAGTTCAAGGGCAGCCTGGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGACCTGTCTGAGCTATAGAGGGAGTTCAAGGGCAGCCTGGGA  50

seq1  GACTGAGAGTCTGTCTTGAAACAAGCAGGCAAGCAAAACAAACAAACAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGAGAGTCTGTCTTGAAACAAGCAGGCAAGCAAAACAAACAAACAAA  100

seq1  CAAACAAACACCTAGCAGGTTTGGTGGTGAGCACCTTTAATCCCACTACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAAACACCTAGCAGGTTTGGTGGTGAGCACCTTTAATCCCACTACC  150

seq1  TGGGAGGCAGAGGTAGGCAGATCTCTGTGAGTTTGAAGCTAGCCTGGTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGGCAGAGGTAGGCAGATCTCTGTGAGTTTGAAGCTAGCCTGGTCT  200

seq1  ACATAGCAAGTTTGAGAACAGCCAGGGGAACACAGAGAGAGAGAGAGAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGCAAGTTTGAGAACAGCCAGGGGAACACAGAGAGAGAGAGAGAGA  250

seq1  CCCTGTCTCAAAAATCAAAAGTAAAAAGTTCAAACTGAGCCAAGGGTGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTCTCAAAAATCAAAAGTAAAAAGTTCAAACTGAGCCAAGGGTGTG  300

seq1  ACCCAGTGGCAGAGCATGTGCCAACCATGCAGCAGGAGAGAGAGAGAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGTGGCAGAGCATGTGCCAACCATGCAGCAGGAGAGAGAGAGAGAG  350

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTGTCTCTAAATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTGTCTCTAAATA  400

seq1  AAAGGTTCAAAGTATCAATAGTAAGAAGAATTAATATTCTGAACACTCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTTCAAAGTATCAATAGTAAGAAGAATTAATATTCTGAACACTCCT  450

seq1  GCATGGTGGGAAGCTGAGGACACAGGCTGGGATCTTATGAGAAAAAGAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGTGGGAAGCTGAGGACACAGGCTGGGATCTTATGAGAAAAAGAAG  500

seq1  TCTCTTGGTCTGTCACGTCTCAAGCTGAGTAACACGGTGATGCCGACCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTGGTCTGTCACGTCTCAAGCTGAGTAACACGGTGATGCCGACCCT  550

seq1  GAGAAAAAGACCCTGGTGTCCAGGAGCTCAGGCCCTTGTCCTTACCCAGG  600
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAAAGACCCTGGTGTCCAGGAGCTCATGCCCTTGTCCTTACCCAGG  600

seq1  TGTTCTTGCTTAGGG-TTTCACTTTCCTTGGCAGCTGTGCAAAGTGATGT  649
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTTGCTTAGGGTTTTCACTTTCCTTGGCAGCTGTGCAAAGTGATGT  650

seq1  GGC-CCAGGCCTC-TGTGGGAGC-CCAGGT-AAAGGAGGAACCGCCACTC  695
      ||| ||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||
seq2  GGCTCCACGCCTCTTGTGGGAGCTCCAGGTAAAAGGAGGAACCGCCACTC  700

seq1  AGGGCTCACATGTGCCA  712
      | |||||||||||||||
seq2  A-GGCTCACATGTGCCA  716

seq1: chr15_73616836_73617978
seq2: B6Ng01-234N07.g_67_1211 (reverse)

seq1  AAGCTCTTAGCAAATTTTAATTTTATTGTTTATTTAGCATGCGTGTAA-G  49
      |||||||||||||| ||  | || |   | || | ||||||||||||| |
seq2  AAGCTCTTAGCAAAATT--AGTTAA---TGTAATAAGCATGCGTGTAAGG  45

seq1  CGTGCATATGTGTGCAT-GCATGCATGCAGGCA--GGCAGCAGCATG-TG  95
      ||||||||| || |||| ||||||||||  |||  | |||||||||| ||
seq2  CGTGCATAT-TGAGCATGGCATGCATGCCAGCAAGGCCAGCAGCATGTTG  94

seq1  TGT--GGAAACCAGAGGGCAACTTTCAGCAGTTTGTTCTTTCTTACTATG  143
      |||  | |||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TGTTGGAAAACCAGAAGGCAAACTTCAGCAGTTAGTTCTTTCTTACTATG  144

seq1  GATTATGGGATCAAACTCAGGCCATAGAAGTT-GAGTGACTTCTATGTAG  192
      |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||
seq2  GATTAT-GGATCAAACTCAGGCCATAGAAGTTAGAGTGACCTCTATGTAG  193

seq1  TAGTCATCCCCACTGGTCCTCTTAAAAGGTTTTAAAAAGGACCTGGATAA  242
      ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
seq2  TAGTCAT-CCCACTGGTCCTCTTAAAAGGTTTAAAAAAGGA-CTGGATAA  241

seq1  ATACCTTTCCCTGGTCCTC-AAAAGATATGGCTGATCGTTCACGTAAGGA  291
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTTTCCCTGGTCCTCAAAAAGATATGGCTGATCGTTCACGTAAGGA  291

seq1  CCTTCAACAGTGTTTACCACTGGCACGTTCAGGG-AAGGGTGGGGCGGTC  340
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CCTTCAACAGTGTTTACCACTGGCACGTTCAGGGAAAGGGTGGGGCGGTC  341

seq1  ACAGAAGTGCCCAGTCAGACTCTCATGAGTCCATTAGG-AACTCTGGCCG  389
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ACAGAAGTGCCCAGTCAGACTCTCATGAGTCCATTAGGAAACTCTGGCCG  391

seq1  TTTGCTATTTGGTGACCTGCGGAGATGGCTCCATTTCTTAGGTCAACGTT  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTATTTGGTGACCTGCGGAGATGGCTCCATTTCTTAGGTCAACGTT  441

seq1  CCTGCACAGAGGTGACAGGCAGCCAGTCCCAAGTGATAGGACAGGAGACG  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCACAGAGGTGACAGGCAGCCAGTCCCAAGTGATAGGACAGGAGACG  491

seq1  TAATGAGTAGCATCAAACAGGAGACTGGGTCAATGCTATTAGTTCCCAAT  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGAGTAGCATCAAACAGGAGACTGGGTCAATGCTATTAGTTCCCAAT  541

seq1  GTGGACACCAGTCCTTGGTTGTATTTTCTGCAGCATCAAGTAGTCTTCCA  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGACACCAGTCCTTGGTTGTATTTTCTGCAGCATCAAGTAGTCTTCCA  591

seq1  GTCACCAGTTGCTTTGTAAGATGTAGAGACAGAAACGACTCTATCACCAC  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACCAGTTGCTTTGTAAGATGTAGAGACAGAAACGACTCTATCACCAC  641

seq1  CTTTTCCCAAAGGGCCCACCTGTCCACACAGCTTCATGGCCATATAATAC  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCCCAAAGGGCCCACCTGTCCACACAGCTTCATGGCCATATAATAC  691

seq1  ATGTAAGGCCCTTGGGTAGGGTTCAGATCTTGGCATCTCACTAGATTCTT  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAAGGCCCTTGGGTAGGGTTCAGATCTTGGCATCTCACTAGATTCTT  741

seq1  TTCTTCTGAGCTGTGTACCCCTTGCTCCCAAGTAACTGTGGGAAGGGTAC  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCTGAGCTGTGTACCCCTTGCTCCCAAGTAACTGTGGGAAGGGTAC  791

seq1  ACAGACAGCCTGGTGGTGCCTTTGTTCCACAAAGTGGGGCTTACTTCACA  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACAGCCTGGTGGTGCCTTTGTTCCACAAAGTGGGGCTTACTTCACA  841

seq1  AAACTGACCTGCCCTTTGCTACTGACATACCTGGTCGCGACTATGCCTGG  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGACCTGCCCTTTGCTACTGACATACCTGGTCGCGACTATGCCTGG  891

seq1  CAATCTCATGCGCCCTCTGGTGGTAGCCATGAGACATGGCAGGTATCTTT  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCTCATGCGCCCTCTGGTGGTAGCCATGAGACATGGCAGGTATCTTT  941

seq1  TCTGCAAGGCTTGCTAGTATTGAAGGGGCTGGACCAGGTGAGACCTGAAT  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAAGGCTTGCTAGTATTGAAGGGGCTGGACCAGGTGAGACCTGAAT  991

seq1  AGTAGTGACCCAGGCAGGCAGGTAGGTGTGGTGAAACAGAGCCCACCTTC  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGTGACCCAGGCAGGCAGGTAGGTGTGGTGAAACAGAGCCCACCTTC  1041

seq1  AGGGAAGGTGACTCCCTAAGCCACCTTAGTGTGGTAGGACAAGTTCCTGC  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAAGGTGACTCCCTAAGCCACCTTAGTGTGGTAGGACAAGTTCCTGC  1091

seq1  AGTATCAGGGAACACATTCCTTTGAGAGAGCCATCTCCCCTCTTCTGTGA  1139
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATCAGGGAACACATTCCTTTGAGAGAGCCATCTCCCCTCTTCTGTGA  1141

seq1  ATTC  1143
      ||||
seq2  ATTC  1145