BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-238H02
Chromosome15 (Build37)
Map Location 73,295,754 - 73,444,191
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDennd3, Slc45a4
Upstream geneKcnk9, 1810044A24Rik, LOC665621, Peg13, LOC100041120, Chrac1, Eif2c2, Ptk2, LOC666053, LOC100040929
Downstream geneGpr20, LOC100040946, pPtp4a3, Gm628, LOC100041273, EG625276, LOC100040966, EG666113, LOC100041307, LOC100040984, Bai1, 1700016M24Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-238H02.bB6Ng01-238H02.g
ACCGA049137GA049138
length1,118689
definitionB6Ng01-238H02.b B6Ng01-238H02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,443,104 - 73,444,191)(73,295,754 - 73,296,442)
sequence
gaattctggattgcagggtgatatgtttagttcagactgggtcctatatc
tgcacccttttcatcccaccagcagtgactgagcaaggctgtaccacatc
tcactagtgcttggtgtttggatttgggcaattctggcaggtgtgtagag
acctggcacttaggtgacacatgaaggacctttttccataactttgcatg
ctttcatatatctgtgtcttttgacctctcttttaggagccttgactaat
tttgggggtttgtttttaatttttgagacagagtctcgtgtcatgtagcc
caggctggctttgaactcaatacccagcctaggccaatcctgaactactc
tctgaccctccctgttttttttagcccacatgttagggctccagactttt
gcaaccatgcctggcctcagcctgtctctaatcaggctgttttcttagca
tgtgttttggataactatcttttgccagctgtgttctttgtaaatcctta
ctcctagtctgtggcttatcttctcattctcttaatacagcatcaaactc
attgcttacgtgctgttcagtaaaaaacaggcttgctgtgtactatattt
atttcatttgtaccatgggcacttcagactgcctgggttcaactgatctt
ttaaattcttggtccactcattgatattctttgctgtctgctgcctgcca
ttggtccagttttactggtttgtgggtgtttctgatcatctggagagagg
tgctagtggggatcaggaagctgtgaacatcatgtcagtgaatatcattc
agggctgtttgtggttccatttactacctagtactacactggtgatcttc
tgtcagatttccccagcaactttctgggatttatgtttgatgtggaaaag
ggcaagtggtttactccctcctccataacttaactttgaactttgaattt
ttgatccccccacatcaggggtagcaaattggttaaaagtccttttctct
atgtgtcctcaaaaggtccaggacttccacctggcttctggggagttagc
ttgataacgatttcttaagatgcgtctatggcacatgggtgggaataggg
gtgaaatcaccatatttt
gaattccacaccaatggctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgtgcaggacacaaggattaacaacaggtctgagat
gaatgactgatatacagtgaccctcctcctcttccagcgagggaactact
gcagtccatggcctagatctcaaggctcgtccataagcggtcacagctgc
tctgaaaatgatgatcattatgcccggagaacagtgctctatagtaactt
ggctttgggcaggtgcccccgagatggctgaaggctggtggaagacttgt
ccagtcactttgcaacaaattgccctagagggacacaaggtgaccagggt
ccattcatttgctttaaaactataaatgggatctgtgttcttgggtaaag
agtcacaccgtgggaaattgtgcaagatgcacacatgatcctcctacccc
caggcctgccctactctgcttcacagccgaagcctgccaggacgctccat
tccaacgcaaagcttggggggaacttgggcatctgacagatttctcttcc
cactcaggctgtgaccctgcaaggtcatgcgagggcttgtggccacagtc
tcacatgtctctagtcacttggccccctcagcactatcagccctatctgt
gcctctgtccctgaatgcccaggtgactgggatctgtca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_73443104_73444191
seq2: B6Ng01-238H02.b_46_1163 (reverse)

seq1  AAAATATGGTGATTCTACCCCTAT--CCACCC-TGTGGCATA---GCCTT  44
      ||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||| ||||   || | 
seq2  AAAATATGGTGATTTCACCCCTATTCCCACCCATGTGCCATAGACGCATC  50

seq1  CTAAGAACT-GTTATC-AGCT-ACTCCCAAGA--GCAGGTGGAAGT-CTG  88
       |||||| | |||||| |||| |||||| |||   ||||||||||| |||
seq2  TTAAGAAATCGTTATCAAGCTAACTCCCCAGAAGCCAGGTGGAAGTCCTG  100

seq1  GA-CTTTTGAGGA-ACATAGAG-AAAGGACTTT--ACCAAATTGCTA-CC  132
      || |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||
seq2  GACCTTTTGAGGACACATAGAGAAAAGGACTTTTAACCAATTTGCTACCC  150

seq1  CTGATGT-GGGGGATC-AAAATTCAAAGTTCAAAGTTAAG-TATGGA-GA  178
      ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||
seq2  CTGATGTGGGGGGATCAAAAATTCAAAGTTCAAAGTTAAGTTATGGAGGA  200

seq1  GGGAGT-AACCACCTG-CCTTTTTCACATC-AACATAAAT-CCAGAAAGT  224
      |||||| |||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||
seq2  GGGAGTAAACCACTTGCCCTTTTCCACATCAAACATAAATCCCAGAAAGT  250

seq1  TGCTGGGGAAATCTGACAG-AGATCA-CAGTGTAGTACTAGGTAGT-AAT  271
      ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||
seq2  TGCTGGGGAAATCTGACAGAAGATCACCAGTGTAGTACTAGGTAGTAAAT  300

seq1  GGAACCACAAACAGCCCTGAATGATATTCACTGACATGATGTTCACAGCT  321
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACCACAAACAGCCCTGAATGATATTCACTGACATGATGTTCACAGCT  350

seq1  TCCTGATCCCCACTAGCACCTCTCTCCAGATGATCAGAAACA-CCACAAA  370
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TCCTGATCCCCACTAGCACCTCTCTCCAGATGATCAGAAACACCCACAAA  400

seq1  CCAGTAAAACTGGACCAATGGCAGGCAGCAGACAGCAAAGAATATCAATG  420
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTAAAACTGGACCAATGGCAGGCAGCAGACAGCAAAGAATATCAATG  450

seq1  AGTGGACCAAGAATTTAAAAGATCAGTTGAACCCAGGCAGTCTGAAGTGC  470
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGACCAAGAATTTAAAAGATCAGTTGAACCCAGGCAGTCTGAAGTGC  500

seq1  CCATGGTACAAATGAAATAAATATAGTACACAGCAAGCCTGTTTTTTACT  520
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGTACAAATGAAATAAATATAGTACACAGCAAGCCTGTTTTTTACT  550

seq1  GAACAGCACGTAAGCAATGAGTTTGATGCTGTATTAAGAGAATGAGAAGA  570
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGCACGTAAGCAATGAGTTTGATGCTGTATTAAGAGAATGAGAAGA  600

seq1  TAAGCCACAGACTAGGAGTAAGGATTTACAAAGAACACAGCTGGCAAAAG  620
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCCACAGACTAGGAGTAAGGATTTACAAAGAACACAGCTGGCAAAAG  650

seq1  ATAGTTATCCAAAACACATGCTAAGAAAACAGCCTGATTAGAGACAGGCT  670
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTATCCAAAACACATGCTAAGAAAACAGCCTGATTAGAGACAGGCT  700

seq1  GAGGCCAGGCATGGTTGCAAAAGTCTGGAGCCCTAACATGTGGGCTAAAA  720
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCCAGGCATGGTTGCAAAAGTCTGGAGCCCTAACATGTGGGCTAAAA  750

seq1  AAAACAGGGAGGGTCAGAGAGTAGTTCAGGATTGGCCTAGGCTGGGTATT  770
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAGGGAGGGTCAGAGAGTAGTTCAGGATTGGCCTAGGCTGGGTATT  800

seq1  GAGTTCAAAGCCAGCCTGGGCTACATGACACGAGACTCTGTCTCAAAAAT  820
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCAAAGCCAGCCTGGGCTACATGACACGAGACTCTGTCTCAAAAAT  850

seq1  TAAAAACAAACCCCCAAAATTAGTCAAGGCTCCTAAAAGAGAGGTCAAAA  870
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAACAAACCCCCAAAATTAGTCAAGGCTCCTAAAAGAGAGGTCAAAA  900

seq1  GACACAGATATATGAAAGCATGCAAAGTTATGGAAAAAGGTCCTTCATGT  920
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACAGATATATGAAAGCATGCAAAGTTATGGAAAAAGGTCCTTCATGT  950

seq1  GTCACCTAAGTGCCAGGTCTCTACACACCTGCCAGAATTGCCCAAATCCA  970
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACCTAAGTGCCAGGTCTCTACACACCTGCCAGAATTGCCCAAATCCA  1000

seq1  AACACCAAGCACTAGTGAGATGTGGTACAGCCTTGCTCAGTCACTGCTGG  1020
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACCAAGCACTAGTGAGATGTGGTACAGCCTTGCTCAGTCACTGCTGG  1050

seq1  TGGGATGAAAAGGGTGCAGATATAGGACCCAGTCTGAACTAAACATATCA  1070
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATGAAAAGGGTGCAGATATAGGACCCAGTCTGAACTAAACATATCA  1100

seq1  CCCTGCAATCCAGAATTC  1088
      ||||||||||||||||||
seq2  CCCTGCAATCCAGAATTC  1118

seq1: chr15_73295754_73296442
seq2: B6Ng01-238H02.g_67_755

seq1  GAATTCCACACCAATGGCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACACCAATGGCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  50

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGGACACAAGGATTAACAACAGGTCTGAGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGGACACAAGGATTAACAACAGGTCTGAGAT  100

seq1  GAATGACTGATATACAGTGACCCTCCTCCTCTTCCAGCGAGGGAACTACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGACTGATATACAGTGACCCTCCTCCTCTTCCAGCGAGGGAACTACT  150

seq1  GCAGTCCATGGCCTAGATCTCAAGGCTCGTCCATAAGCGGTCACAGCTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTCCATGGCCTAGATCTCAAGGCTCGTCCATAAGCGGTCACAGCTGC  200

seq1  TCTGAAAATGATGATCATTATGCCCGGAGAACAGTGCTCTATAGTAACTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAAAATGATGATCATTATGCCCGGAGAACAGTGCTCTATAGTAACTT  250

seq1  GGCTTTGGGCAGGTGCCCCCGAGATGGCTGAAGGCTGGTGGAAGACTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTGGGCAGGTGCCCCCGAGATGGCTGAAGGCTGGTGGAAGACTTGT  300

seq1  CCAGTCACTTTGCAACAAATTGCCCTAGAGGGACACAAGGTGACCAGGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTCACTTTGCAACAAATTGCCCTAGAGGGACACAAGGTGACCAGGGT  350

seq1  CCATTCATTTGCTTTAAAACTATAAATGGGATCTGTGTTCTTGGGTAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTCATTTGCTTTAAAACTATAAATGGGATCTGTGTTCTTGGGTAAAG  400

seq1  AGTCACACCGTGGGAAATTGTGCAAGATGCACACATGATCCTCCTACCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCACACCGTGGGAAATTGTGCAAGATGCACACATGATCCTCCTACCCC  450

seq1  CAGGCCTGCCCTACTCTGCTTCACAGCCGAAGCCTGCCAGGACGCTCCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCCTGCCCTACTCTGCTTCACAGCCGAAGCCTGCCAGGACGCTCCAT  500

seq1  TCCAACGCAAAGCTTGGGGGGAACTTGGGCATCTGACAGATTTCTCTTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAACGCAAAGCTTGGGGGGAACTTGGGCATCTGACAGATTTCTCTTCC  550

seq1  CACTCAGGCTGTGACCCTGCAAGGTCATGCGAGGGCTTGTGGCCACAGTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCAGGCTGTGACCCTGCAAGGTCATGCGAGGGCTTGTGGCCACAGTC  600

seq1  TCACATGTCTCTAGTCACTTGGCCCCCTCAGCACTATCAGCCCTATCTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATGTCTCTAGTCACTTGGCCCCCTCAGCACTATCAGCCCTATCTGT  650

seq1  GCCTCTGTCCCTGAATGCCCAGGTGACTGGGATCTGTCA  689
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTGTCCCTGAATGCCCAGGTGACTGGGATCTGTCA  689