BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-244I13
Chromosome15 (Build37)
Map Location 25,250,990 - 25,347,746
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4930445E18Rik, Basp1, EG432939, LOC100040583
Upstream geneLOC666999, LOC100040492, LOC100040499, LOC100040529, 9230109A22Rik
Downstream geneMyo10, LOC100040602, Ppia-ps15_175.1, 1810015C04Rik, Zfp622, AK162044
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-244I13.bB6Ng01-244I13.g
ACCGA053643GA053644
length1,1741,146
definitionB6Ng01-244I13.b B6Ng01-244I13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(25,250,990 - 25,252,150)(25,346,613 - 25,347,746)
sequence
gaattcaacttatcatggtcaagtactgggaaggaacttaaagtaatttg
accgcttgggtatttccaggttctttttggttataaagttaagcagtgta
tttagtactcattagagctatttacacatattcaaactactgtattcagg
gactcgtggccaaattgtgttttctgggattcatacagtgatgtatgtcc
tgtgatgaatcctggctaaggcataatgtaagagcactccctttctgagg
aggctactagttcatgtcttcaattacctatagttgaaaaggctttttaa
gttttaagaactagccagtcagagataatacactgtgttcattaagtatc
cagcatttgagctacggtagagaaggtgcctcgggctgacagttttaagt
tctagcaaatctatcgagccatttgtccagcctgtaaagtctggtaaatt
ctggtataaaattagtaaagtctgaatctggggagaggaggaagtaaatg
gctcaaagagaactagaatcaagaaagcgataacaagctgtcagcaagaa
taaggcccaggcaagactgagaaaacagacttccccattcaagacaaaag
gaagcaacacaagcagcctgagaccctgtagggaagcattaactagacct
accttcagcagagtccctggctacaccaagacactggacaacagcactac
agaagtcggagctccccatggtcagcataacctatgaaggtggcattaga
ctgtggtccattgaaaatctcaatgatgcagagacatatgtcccgtagct
tgtagagacagttaaatatatgttttagcgatcaaagaggcaagattgct
taataattggcttaataaaaaggctttcattccctaactatgccaagtaa
atgaagtgttggaatatcaaatgaattctctgccaattatatgttatata
ctgagaaaacagaactgcttttagaaccaagagttaccaagattgagaaa
ttctagcaaccaagacaggaacctcctttcttcacttttccccttggggg
tggttgccaagaagacctgcaagagaacaagcttgaaagagccaaaggtc
aatgggcaaggtctttatttcttgctcagagaaaagaagagcttggcagt
taacctgcgagcacctcactcact
gaattcaaattcctcagtggcgatctttggccttgttcttgaagcaaccc
gcctggtttctgttgcagaggttgaagccccccccaccccccactccccg
ggctcctaaagggagctatgaggagtctgacctaagtttgtctgtgatac
cctgtggatgacaatcgaacaaaggcagcttgcactgcatgcagcactac
ggaaaacaaacaaataaaaaaataaataaataaacaaagaaaacaaataa
agaacaaaacctaaaccaaaccaaaccaaaccaccaccaccaccaccacc
accaccaccaccaccaccaccaccaccaatcaccacccctgccgctgcca
ccaccaccactatcaaagtcaacttgccttctccaactcaatagaatcac
atactcaattttcaaccagaagttctcagcctcttcattcttaacacgac
tgatattttgggctggagactcctctcctgagggactctcccttggcttc
taccacccagataccaaccagttccatctcacacgacaacccgataacat
tgccaaatgttgtctgggaagcaagacaactcgcagcactgttcacacca
aggaaaccctttccttgggctacatgacactgggattggagagggggaag
gaaaaaaaaagacacatagatcttgatatttttccctttgaagaaaatct
tgatatttggggaaagagcagttgatgtataacattaatcttttgtttat
aatctgtaggtgagatctgttggttctgtggccatttttttttaaatgtt
agtagagtggaatatacttttcaaaatgggtctttggggatttgggtcac
cccagtgacttgagtgggcagacactggtggtctctcttcattcaatatt
atttttattggggtgaactgagggtgacagacgctcgggccttgggtggg
gagaggttagggccaggactcagaggtaagacaggaaggtggagacgagc
tctatctacctaactcaatgtcggtggttaactggtaatgcagcccagga
tttagagccagaatatatgggggtgaacatctttttagtgaccagggagt
ccttatgcctggccaaacagtttgtgcaagtcattagtaacaagaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_25250990_25252150
seq2: B6Ng01-244I13.b_45_1218

seq1  GAATTCAACTTATCATGGTCAAGTACTGGGAAGGAACTTAAAGTAATTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACTTATCATGGTCAAGTACTGGGAAGGAACTTAAAGTAATTTG  50

seq1  ACCGCTTGGGTATTTCCAGGTTCTTTTTGGTTATAAAGTTAAGCAGTGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGCTTGGGTATTTCCAGGTTCTTTTTGGTTATAAAGTTAAGCAGTGTA  100

seq1  TTTAGTACTCATTAGAGCTATTTACACATATTCAAACTACTGTATTCAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTACTCATTAGAGCTATTTACACATATTCAAACTACTGTATTCAGG  150

seq1  GACTCGTGGCCAAATTGTGTTTTCTGGGATTCATACAGTGATGTATGTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCGTGGCCAAATTGTGTTTTCTGGGATTCATACAGTGATGTATGTCC  200

seq1  TGTGATGAATCCTGGCTAAGGCATAATGTAAGAGCACTCCCTTTCTGAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATGAATCCTGGCTAAGGCATAATGTAAGAGCACTCCCTTTCTGAGG  250

seq1  AGGCTACTAGTTCATGTCTTCAATTACCTATAGTTGAAAAGGCTTTTTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTACTAGTTCATGTCTTCAATTACCTATAGTTGAAAAGGCTTTTTAA  300

seq1  GTTTTAAGAACTAGCCAGTCAGAGATAATACACTGTGTTCATTAAGTATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTAAGAACTAGCCAGTCAGAGATAATACACTGTGTTCATTAAGTATC  350

seq1  CAGCATTTGAGCTACGGTAGAGAAGGTGCCTCGGGCTGACAGTTTTAAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATTTGAGCTACGGTAGAGAAGGTGCCTCGGGCTGACAGTTTTAAGT  400

seq1  TCTAGCAAATCTATCGAGCCATTTGTCCAGCCTGTAAAGTCTGGTAAATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGCAAATCTATCGAGCCATTTGTCCAGCCTGTAAAGTCTGGTAAATT  450

seq1  CTGGTATAAAATTAGTAAAGTCTGAATCTGGGGAGAGGAGGAAGTAAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTATAAAATTAGTAAAGTCTGAATCTGGGGAGAGGAGGAAGTAAATG  500

seq1  GCTCAAAGAGAACTAGAATCAAGAAAGCGATAACAAGCTGTCAGCAAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAAAGAGAACTAGAATCAAGAAAGCGATAACAAGCTGTCAGCAAGAA  550

seq1  TAAGGCCCAGGCAAGACTGAGAAAACAGACTTCCCCATTCAAGACAAAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGCCCAGGCAAGACTGAGAAAACAGACTTCCCCATTCAAGACAAAAG  600

seq1  GAAGCAACACAAGCAGCCTGAGACCCTGTAGGGAAGCATTAACTAGACCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCAACACAAGCAGCCTGAGACCCTGTAGGGAAGCATTAACTAGACCT  650

seq1  ACCTTCAGCAGAGTCCCTGGCTACACCAAGACACTGGACAACAGCACTAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTCAGCAGAGTCCCTGGCTACACCAAGACACTGGACAACAGCACTAC  700

seq1  AGAAGTCGGAGCTCCCCATGGTCAGCATAACCTATGAAGGTGGCATTAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTCGGAGCTCCCCATGGTCAGCATAACCTATGAAGGTGGCATTAGA  750

seq1  CTGTGGTCCATTGAAAATCTCAATGATGCAGAGACATATGTCCCGTAGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGTCCATTGAAAATCTCAATGATGCAGAGACATATGTCCCGTAGCT  800

seq1  TGTAGAGACAGTTAAATATATGTTTTAGCGATCAAAGAGGCAAGATTGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGAGACAGTTAAATATATGTTTTAGCGATCAAAGAGGCAAGATTGCT  850

seq1  TAATAATTGGCTTAATAAAAAGGCTTTCATTCCCTAACTATGCCAAGTAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAATTGGCTTAATAAAAAGGCTTTCATTCCCTAACTATGCCAAGTAA  900

seq1  ATGAAGTGTTGGAATATCAAATGAATTCTCTGCCAATTATATGTTATATA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGTGTTGGAATATCAAATGAATTCTCTGCCAATTATATGTTATATA  950

seq1  CTGAGAAAACAGAACTGCTTTTAGAACCAAGAGTTACCAAGATTGAGGAA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CTGAGAAAACAGAACTGCTTTTAGAACCAAGAGTTACCAAGATTGA-GAA  999

seq1  ATTCTAGCAACCAAGACAGGAACCTCCTTTCTTCACTTTTCCCCTTGGGG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTAGCAACCAAGACAGGAACCTCCTTTCTTCACTTTTCCCCTTGGGG  1049

seq1  --TGTTGCCAAG-AGACCTGCAAGAG-ACAAGC-TGAAAGAGC--AAAGT  1093
         ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||
seq2  GTGGTTGCCAAGAAGACCTGCAAGAGAACAAGCTTGAAAGAGCCAAAGGT  1099

seq1  C-ATGGGCAGGGTC-TTATT--CTGCCCAGAGAA---GAGAGCTGGGAAG  1136
      | ||||||| |||| |||||   ||| |||||||    |||||| || ||
seq2  CAATGGGCAAGGTCTTTATTTCTTGCTCAGAGAAAAGAAGAGCTTGGCAG  1149

seq1  TTTAACCAG-AAGCACCTCACTCACT  1161
       |||||| |  |||||||||||||||
seq2  -TTAACCTGCGAGCACCTCACTCACT  1174

seq1: chr15_25346613_25347746
seq2: B6Ng01-244I13.g_66_1211 (reverse)

seq1  TTCTTGTTCCTAAATGACTTGCCACAAAACTGTTTG--CA-GCATAAGG-  46
      |||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||  || |||||||| 
seq2  TTCTTGTTACT-AATGACTTG-CAC-AAACTGTTTGGCCAGGCATAAGGA  47

seq1  CCCCCT-GTCACTAAAAAGATG-TCA-CCCCATATATTCT-GCTCTTAAA  92
      | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || 
seq2  CTCCCTGGTCACTAAAAAGATGTTCACCCCCATATATTCTGGCTCTAAAT  97

seq1  CCTGGGGCCTGCATTACCAGTTAAACCACCGACATTGAGTTAGGTAGATA  142
      ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGG--CTGCATTACCAGTT-AACCACCGACATTGAGTTAGGTAGATA  144

seq1  GAGCTCGTCT-CACCTTCCTGTCTTACCTCTGAGTCCTTGCCCT-ACCTC  190
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
seq2  GAGCTCGTCTCCACCTTCCTGTCTTACCTCTGAGTCCTGGCCCTAACCTC  194

seq1  TCCC--ACCAAGG-CCGAGCGTCTGTCACCCTCAGTTCA-CCCAAT-AAA  235
      ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
seq2  TCCCCACCCAAGGCCCGAGCGTCTGTCACCCTCAGTTCACCCCAATAAAA  244

seq1  ATAATA-TGAATGAAGAGAGACCA-CAGTGTCTGCCCACTCAAGTCACTG  283
      |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATATTGAATGAAGAGAGACCACCAGTGTCTGCCCACTCAAGTCACTG  294

seq1  GGGTGACCCAAATCCCCAAAGACCCATTTTG-AAAGTATATTCCACTCTA  332
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GGGTGACCCAAATCCCCAAAGACCCATTTTGAAAAGTATATTCCACTCTA  344

seq1  CTAACATTT-AAAAAAAATGGCCACAGAACCAACAGATCTCACCTACAGA  381
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACATTTAAAAAAAAATGGCCACAGAACCAACAGATCTCACCTACAGA  394

seq1  TTATAAACAAAAGATTAATGTTATACATCAACCTGCTCTTTCCCCAAATA  431
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTATAAACAAAAGATTAATGTTATACATCAA-CTGCTCTTTCCCCAAATA  443

seq1  TCAAGATTTTCTTCAAAGGGAAAAATATCAAGATCTATGTGTCTTTTTTT  481
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGATTTTCTTCAAAGGGAAAAATATCAAGATCTATGTGTCTTTTTTT  493

seq1  TTCCTTCCCCCTCTCCAATCCCAGTGTCATGTAGCCCAAGGAAAGGGTTT  531
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTCCCCCTCTCCAATCCCAGTGTCATGTAGCCCAAGGAAAGGGTTT  543

seq1  CCTTGGTGTGAACAGTGCTGCGAGTTGTCTTGCTTCCCAGACAACATTTG  581
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGTGTGAACAGTGCTGCGAGTTGTCTTGCTTCCCAGACAACATTTG  593

seq1  GCAATGTTATCGGGTTGTCGTGTGAGATGGAACTGGTTGGTATCTGGGTG  631
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATGTTATCGGGTTGTCGTGTGAGATGGAACTGGTTGGTATCTGGGTG  643

seq1  GTAGAAGCCAAGGGAGAGTCCCTCAGGAGAGGAGTCTCCAGCCCAAAATA  681
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAAGCCAAGGGAGAGTCCCTCAGGAGAGGAGTCTCCAGCCCAAAATA  693

seq1  TCAGTCGTGTTAAGAATGAAGAGGCTGAGAACTTCTGGTTGAAAATTGAG  731
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCGTGTTAAGAATGAAGAGGCTGAGAACTTCTGGTTGAAAATTGAG  743

seq1  TATGTGATTCTATTGAGTTGGAGAAGGCAAGTTGACTTTGATAGTGGTGG  781
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGATTCTATTGAGTTGGAGAAGGCAAGTTGACTTTGATAGTGGTGG  793

seq1  TGGTGGCAGCGGCAGGGGTGGTGATTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGT  831
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGGCAGCGGCAGGGGTGGTGATTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGT  843

seq1  GGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTAGGTTTTGT  881
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTAGGTTTTGT  893

seq1  TCTTTATTTGTTTTCTTTGTTTATTTATTTATTTTTTTATTTGTTTGTTT  931
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTATTTGTTTTCTTTGTTTATTTATTTATTTTTTTATTTGTTTGTTT  943

seq1  TCCGTAGTGCTGCATGCAGTGCAAGCTGCCTTTGTTCGATTGTCATCCAC  981
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGTAGTGCTGCATGCAGTGCAAGCTGCCTTTGTTCGATTGTCATCCAC  993

seq1  AGGGTATCACAGACAAACTTAGGTCAGACTCCTCATAGCTCCCTTTAGGA  1031
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTATCACAGACAAACTTAGGTCAGACTCCTCATAGCTCCCTTTAGGA  1043

seq1  GCCCGGGGAGTGGGGGGTGGGGGGGGCTTCAACCTCTGCAACAGAAACCA  1081
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCGGGGAGTGGGGGGTGGGGGGGGCTTCAACCTCTGCAACAGAAACCA  1093

seq1  GGCGGGTTGCTTCAAGAACAAGGCCAAAGATCGCCACTGAGGAATTTGAA  1131
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGGGTTGCTTCAAGAACAAGGCCAAAGATCGCCACTGAGGAATTTGAA  1143

seq1  TTC  1134
      |||
seq2  TTC  1146