BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-246F11
Chromosome15 (Build37)
Map Location 85,962,722 - 86,157,343
singlet/doubletdoublet
Overlap geneBC021523, Cerk, LOC100042300, Tbc1d22a
Upstream geneRibc2, Fbln1, Atxn10, EG223745, Wnt7b, LOC100042240, Ppara, 2210021J22Rik, Pkdrej, AW124722, Gtse1, Trmu, Celsr1
Downstream geneLOC100042309
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-246F11.bB6Ng01-246F11.g
ACCGA054979GA054980
length7231,125
definitionB6Ng01-246F11.b B6Ng01-246F11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,156,621 - 86,157,343)(85,962,722 - 85,963,844)
sequence
gaattccataacaatccatcagtgcgctggcagacatctgtcttctcagg
ttgtcagttgaaacacaaagtgacaaatcagaacacagtgaaaggacctc
ataactcaggggaatgcctgtgacccaacacaaacaaggccacacctcag
gaggagctgctggcaactcctgggtagtcactactgactccaaatcagac
aggccaggaacctctggaagcacaagggcaagggcaagtccagagccaga
catcttcctaagaagccttcacaggcttccttcccagaaacatccatcag
aggctgccacaaggcaaccaagatggcggctacattgctacaaagctgcc
cgcactgaccaatcttccacttcctactaacccagaaccagaacattcct
gctgggcacagtcactcatgtaccatgcccaagagactaccagtcacgga
tgtgcctgccccaccccccgccctcagtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgt
gtctgtgtgtgtcacaggaatgtgagtatgggagagaatactaactgctg
ctgctgctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcacaggaatgtg
agtatgggagagaatactaactgctgctgctgctgctgtgtgtgtgtgtg
tgtctgtgtcacaggaatgtgagtatgggagagaatactagctgctgctg
ctgctgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gaattctcatatcattagcatcaaggtaccaacctgatgccagcccaagc
gtgccctgacactttggcttgagggtacaacctgtcacagatacctcaag
actgggttgtccagtcagccttctggaaaggtgtccagtaaatgcctgag
atgcggagtctcctcctctgctgcaggcttggtgtagggaaagctgccat
aagtcagtaaggactgcagtttggtttggttaccgtcagaggaaagcccc
cgtcgccctgacactaggcgacctcactcctaacaggcctccttccccac
cccttccgtggactctgtgtgtattcccggtgctgggatggaaccagggc
tggcctgtgccgggtgaacactatgtcaccatcagcccacacttggacct
gctctgctggtccctcgtggatgtggttacatctttaacaagttggtgct
gccaggcaccagcctaggtcaaggcccaggtattcccagaggaaggaaat
cccaggtctgtttcctctatcagtgtgcgagaatggctggcgctgctgcc
tcattaaccgagaccggaagatgcccacggactacatcaggaacggggtt
ctgtatgtgacagagaagtgagtgatgccacaggcccaagcacgactgtc
ggggaggaagtgggagagggtcttccccgggtcccagacacacgcccagg
tccagcaagcaggttccgcagtgctctggcccaacctctgttccacactc
tgcctagctctctggacttcctaactccattccctggccagccctgccct
cccttgggctcatgaattctctcatttgggatgctcgtgtggggttcgtg
gctattcagatggacaggggtagaatcttctcagaaagtgggctttaata
gtgaacctttgagggtccagtccatgtggcttgctgtctgagctaggcta
atcggtagcttttggcctttcctcacctcatgggactataagccactttg
tccatgctatgcctcagcaccttgtggagatcttggagggagggctacac
atggtaggtacataaatggccatcctcatgggaccattacattctgggtc
ccaaacctgtcatcaatagtcatag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_86156621_86157343
seq2: B6Ng01-246F11.b_45_767 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACACAGCAGCAGCAGCAGCTAGTATTCTCTCCCATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACAGCAGCAGCAGCAGCTAGTATTCTCTCCCATA  50

seq1  CTCACATTCCTGTGACACAGACACACACACACACACAGCAGCAGCAGCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACATTCCTGTGACACAGACACACACACACACACAGCAGCAGCAGCAG  100

seq1  CAGTTAGTATTCTCTCCCATACTCACATTCCTGTGACACACACACACACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTAGTATTCTCTCCCATACTCACATTCCTGTGACACACACACACACA  150

seq1  CACACACACACACACAGCAGCAGCAGCAGTTAGTATTCTCTCCCATACTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACAGCAGCAGCAGCAGTTAGTATTCTCTCCCATACTC  200

seq1  ACATTCCTGTGACACACACAGACACACACACACACAGACACACACACTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCCTGTGACACACACAGACACACACACACACAGACACACACACTGA  250

seq1  GGGCGGGGGGTGGGGCAGGCACATCCGTGACTGGTAGTCTCTTGGGCATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCGGGGGGTGGGGCAGGCACATCCGTGACTGGTAGTCTCTTGGGCATG  300

seq1  GTACATGAGTGACTGTGCCCAGCAGGAATGTTCTGGTTCTGGGTTAGTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATGAGTGACTGTGCCCAGCAGGAATGTTCTGGTTCTGGGTTAGTAG  350

seq1  GAAGTGGAAGATTGGTCAGTGCGGGCAGCTTTGTAGCAATGTAGCCGCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGGAAGATTGGTCAGTGCGGGCAGCTTTGTAGCAATGTAGCCGCCA  400

seq1  TCTTGGTTGCCTTGTGGCAGCCTCTGATGGATGTTTCTGGGAAGGAAGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGTTGCCTTGTGGCAGCCTCTGATGGATGTTTCTGGGAAGGAAGCC  450

seq1  TGTGAAGGCTTCTTAGGAAGATGTCTGGCTCTGGACTTGCCCTTGCCCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAGGCTTCTTAGGAAGATGTCTGGCTCTGGACTTGCCCTTGCCCTT  500

seq1  GTGCTTCCAGAGGTTCCTGGCCTGTCTGATTTGGAGTCAGTAGTGACTAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTTCCAGAGGTTCCTGGCCTGTCTGATTTGGAGTCAGTAGTGACTAC  550

seq1  CCAGGAGTTGCCAGCAGCTCCTCCTGAGGTGTGGCCTTGTTTGTGTTGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAGTTGCCAGCAGCTCCTCCTGAGGTGTGGCCTTGTTTGTGTTGGG  600

seq1  TCACAGGCATTCCCCTGAGTTATGAGGTCCTTTCACTGTGTTCTGATTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGGCATTCCCCTGAGTTATGAGGTCCTTTCACTGTGTTCTGATTTG  650

seq1  TCACTTTGTGTTTCAACTGACAACCTGAGAAGACAGATGTCTGCCAGCGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTTTGTGTTTCAACTGACAACCTGAGAAGACAGATGTCTGCCAGCGC  700

seq1  ACTGATGGATTGTTATGGAATTC  723
      |||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGATGGATTGTTATGGAATTC  723

seq1: chr15_85962722_85963844
seq2: B6Ng01-246F11.g_68_1192

seq1  GAATTCTCATATCATTAGCATCAAGGTACCAACCTGATGCCAGCCCAAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCATATCATTAGCATCAAGGTACCAACCTGATGCCAGCCCAAGC  50

seq1  GTGCCCTGACACTTTGGCTTGAGGGTACAACCTGTCACAGATACCTCAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCCTGACACTTTGGCTTGAGGGTACAACCTGTCACAGATACCTCAAG  100

seq1  ACTGGGTTGTCCAGTCAGCCTTCTGGAAAGGTGTCCAGTAAATGCCTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGGTTGTCCAGTCAGCCTTCTGGAAAGGTGTCCAGTAAATGCCTGAG  150

seq1  ATGCGGAGTCTCCTCCTCTGCTGCAGGCTTGGTGTAGGGAAAGCTGCCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCGGAGTCTCCTCCTCTGCTGCAGGCTTGGTGTAGGGAAAGCTGCCAT  200

seq1  AAGTCAGTAAGGACTGCAGTTTGGTTTGGTTACCGTCAGAGGAAAGCCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCAGTAAGGACTGCAGTTTGGTTTGGTTACCGTCAGAGGAAAGCCCC  250

seq1  CGTCGCCCTGACACTAGGCGACCTCACTCCTAACAGGCCTCCTTCCCCAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCGCCCTGACACTAGGCGACCTCACTCCTAACAGGCCTCCTTCCCCAC  300

seq1  CCCTTCCGTGGACTCTGTGTGTATTCCCGGTGCTGGGATGGAACCAGGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTCCGTGGACTCTGTGTGTATTCCCGGTGCTGGGATGGAACCAGGGC  350

seq1  TGGCCTGTGCCGGGTGAACACTATGTCACCATCAGCCCACACTTGGACCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTGTGCCGGGTGAACACTATGTCACCATCAGCCCACACTTGGACCT  400

seq1  GCTCTGCTGGTCCCTCGTGGATGTGGTTACATCTTTAACAAGTTGGTGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGCTGGTCCCTCGTGGATGTGGTTACATCTTTAACAAGTTGGTGCT  450

seq1  GCCAGGCACCAGCCTAGGTCAAGGCCCAGGTATTCCCAGAGGAAGGAAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGGCACCAGCCTAGGTCAAGGCCCAGGTATTCCCAGAGGAAGGAAAT  500

seq1  CCCAGGTCTGTTTCCTCTATCAGTGTGCGAGAATGGCTGGCGCTGCTGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGTCTGTTTCCTCTATCAGTGTGCGAGAATGGCTGGCGCTGCTGCC  550

seq1  TCATTAACCGAGACCGGAAGATGCCCACGGACTACATCAGGAACGGGGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTAACCGAGACCGGAAGATGCCCACGGACTACATCAGGAACGGGGTT  600

seq1  CTGTATGTGACAGAGAAGTGAGTGATGCCACAGGCCCAAGCACGACTGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTATGTGACAGAGAAGTGAGTGATGCCACAGGCCCAAGCACGACTGTC  650

seq1  GGGGAGGAAGTGGGAGAGGGTCTTCCCCGGGTCCCAGACACACGCCCAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAGGAAGTGGGAGAGGGTCTTCCCCGGGTCCCAGACACACGCCCAGG  700

seq1  TCCAGCAAGCAGGTTCCGCAGTGCTCTGGCCCAACCTCTGTTCCACACTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCAAGCAGGTTCCGCAGTGCTCTGGCCCAACCTCTGTTCCACACTC  750

seq1  TGCCTAGCTCTCTGGACTTCCTAACTCCATTCCCTGGCCAGCCCTGCCCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTAGCTCTCTGGACTTCCTAACTCCATTCCCTGGCCAGCCCTGCCCT  800

seq1  CCCTTGGGCTCATGAATTCTCTCATTTGGGATGCTCGTGTGGGGTTCGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTGGGCTCATGAATTCTCTCATTTGGGATGCTCGTGTGGGGTTCGTG  850

seq1  GCTATTCAGATGGACAAGGGGTAGAATC-TCTCAGAAAGTGGGCTTT-AT  898
      ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||
seq2  GCTATTCAGATGGAC-AGGGGTAGAATCTTCTCAGAAAGTGGGCTTTAAT  899

seq1  AGTG-ACCTTTGAGGGTCCAGTCCATGTGGCTTGCTGTCTGAGGCTAGGC  947
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  AGTGAACCTTTGAGGGTCCAGTCCATGTGGCTTGCTGTCTGA-GCTAGGC  948

seq1  TAA-CGGTAGC-TTTGGCCTTTCTCCACTCCATGGGACTATAAAGCACTT  995
      ||| ||||||| |||||||||||  |||  |||||||||||||  |||||
seq2  TAATCGGTAGCTTTTGGCCTTTCCTCACCTCATGGGACTATAAGCCACTT  998

seq1  TGTCCATGCTATGCCTCAGCACCTTGT-GAGATCT--GAGGGAGGGCTAC  1042
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||
seq2  TGTCCATGCTATGCCTCAGCACCTTGTGGAGATCTTGGAGGGAGGGCTAC  1048

seq1  AACAGGGGTAGGGTACATAAATGGCCATCCTCATGGGACCCTTTACCATC  1092
       |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| 
seq2  -ACA-TGGTA-GGTACATAAATGGCCATCCTCATGGGACCATT--ACATT  1093

seq1  CTGTCCCCCACACCTG-CAGCAATAGTCATAG  1123
      |||   |||| ||||| || ||||||||||||
seq2  CTGGGTCCCAAACCTGTCATCAATAGTCATAG  1125