BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-249J08
Chromosome15 (Build37)
Map Location 20,061,296 - 20,232,061
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG666875, LOC621884, LOC100040265
Downstream geneAcot10, LOC100040302, Cdh12
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-249J08.bB6Ng01-249J08.g
ACCGA057366GA057367
length2461,102
definitionB6Ng01-249J08.b B6Ng01-249J08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(20,061,296 - 20,061,533)(20,230,966 - 20,232,061)
sequence
atttacaatatttttgactattccactccctctccaactccttctatatc
cttcctactaaattcctctcctcttctttattgtagttatgctacatata
taggtagttatactacatatatattaaatacaatatatagttatatatac
attatacataatatatcactatactattttatatttatatatatatatat
atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat

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ggagctagaagatagtgttagttaaggaagaagagtgaatgtttgagttt
caagaccttacgctgcatgcctcacaacctgccttatgcttgcatctata
aa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_20061296_20061533
seq2: B6Ng01-249J08.b_48_285

seq1  GAATTCATTTACAATATTTTTGACTATTCCACTCCCTCTCCAACTCCTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT  238
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT  238


seq1: chr15_20230966_20232061
seq2: B6Ng01-249J08.g_66_1167 (reverse)

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      ||||| ||||||| |||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||
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        |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||
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      ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||
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      |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTTTCCAAATACAGCATTATTCTTCTGGACATATTTGTATATCCTG  348

seq1  GACATTCATATTTTAAAAGAACAAATATAAAAATGAATCCATATTCCAGC  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AATAGATTTTGAAGGGGGTTCTTAAGTGTAAATGAGGGTATAAGTTGAAA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGATTTTGAAGGGGGTTCTTAAGTGTAAATGAGGGTATAAGTTGAAA  448

seq1  CCCTGATAGCATAGTGTTGGTGTTTAAAGATGAGAAAGATTAAATTATGA  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGATAGCATAGTGTTGGTGTTTAAAGATGAGAAAGATTAAATTATGA  498

seq1  TTATAAAGCTCTAGGAAAAGTGCCATGAGAAGATTTACTTCACACAGGCC  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAAAGCTCTAGGAAAAGTGCCATGAGAAGATTTACTTCACACAGGCC  548

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AATATATTTACTCTATAGTTCTCTGCTATGGAGGTCCTGAAAAAAATGAT  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATATTTACTCTATAGTTCTCTGCTATGGAGGTCCTGAAAAAAATGAT  648

seq1  ACAAAGAAGTAAAGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTT  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGAAGTAAAGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTT  698

seq1  ATAAAAATTAACTCTATTGCATCCATCTCAATATTCTTTCATTTTATTAA  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAATTAACTCTATTGCATCCATCTCAATATTCTTTCATTTTATTAA  748

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  GATTCCATTGTTAGATTGAATAATTTTCCACTTCCTATTCTATCATTTTA  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCATCATATTAAATATTTCTGTGTCTTCTCACACACAATTGGGAGA  1098

seq1  ATTC  1096
      ||||
seq2  ATTC  1102


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