BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-251I19
Chromosome15 (Build37)
Map Location 72,099,132 - 72,248,047
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC383051, 1700010C24Rik, LOC100040847, Col22a1
Downstream geneKcnk9, 1810044A24Rik, LOC665621, Peg13, LOC100041120, Chrac1, Eif2c2, Ptk2, LOC666053
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-251I19.bB6Ng01-251I19.g
ACCGA058781GA058782
length1,1921,060
definitionB6Ng01-251I19.b B6Ng01-251I19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,246,862 - 72,248,047)(72,099,132 - 72,100,193)
sequence
gaattcaaatcccaacaactacatggtgactcacaaccatctgtaatgag
atcggatgccctcttctggtatgtctgaagacagctacagcgtacttaca
tataataagtaaatagatcttttttaaaaaggaatttggaatattaactc
tgttatatgtgtgggttgatcgactttattttatttgactgtggaattca
gtacaccccaggaagaagaagagtttctgtctctgttgacagttccaatg
ttgacatcaaagcagcatcccacctgggaatctgtcccttacttgataca
ggtgttgctgagtttagctcgtaaggatgattcctgttaccccctatagt
aggcatgtgtaggcaatacaataactttgtgtagctcaatgttcaaagtg
acataaagagttttttaactaggaggattaaattacaaaagcatgtgaag
tatcttcatgtgtttgtaataaccattaaagcaatttctctttggtacaa
tcagccagggggctaccttgaaagggtgtgtcaatgttgctcttttgggt
gacagcatactgtcgttaccccttcctgagaataaactgggtcagagaca
cttgtcagcctgtgcaattccttctcagctcccactcctctccctgagtc
cctgctccctgtgcaaggtgtcactgtctctgccttgctatcattgagtt
tgtcttggagtgagacctttatccctctcaccccccttttgaaaactgag
atcagattgtagattctagcttcccctgaagttaagagggcagggagtgg
catttgattaggtataaatgcttgtgtttatcagaatggactgtaaagga
acagggtgctctgctggactctatacattcatccaaacatgggtgaatac
actcaatttttatttgtcagttacacatcaacaaagctggagtaaaggag
gaggaagaggaggaagaaaaagaggagaggaattataggagtaaaacagc
ttctgagtccttgttattgacagcaatcttgcaataagggtttttgagac
gccctttcatgttttctgctgcttctggttagcctggcatgatttaacat
cgaacccaaacccaaactaatcccgagatcaagatcaaactatgcaaaac
ctactgagggttaacaactaacactttcggaacgattgctga
gaattccaggctctcgtactctagaataaatgatcagttatccagcacac
tgtcactccagggacagcactacatggtcatctatactgatatggcctaa
cctggctctagagcagaccccaccatgatgttcagagaaggtgtggaaaa
gagcaactgaaaaagtattttccacagggagctgaagtcctattttctgt
ctttgctttgatgggttaatgagctatgctgcttccacttcctctggagg
taagatgaggagtgtcccaaatgaaagattacttgcagagatcctggaca
agcctccacagaatgacccagtcaaaatgtgtatcaggcttcagcatgcc
tgtaagaaattcttctgagctcccttcaccggacaaccaaagcccaagat
ttcccatgccttatagttctttttctagctgccccctttcaaccccatgc
ccctcctcctaggccttctagacctcagactttccaacctgcagagccct
acgctaacaaacatgtttgccttagaaatcgtcaagacacaggtgtctgc
tacaacagtgaaaaatggacttttaccagccacatcagctatgttacctg
gcaaccataaccctctccagcctctggacccaatgacctagggaaggggt
tcttaacctataggtcacgacccctttaataagaccatactgtgcatcac
atattgacatcatgagtcataacagtagcaaaattacagttataaagtag
caacaaacataattttatggttggggaggcaccacaacataaagacctat
attaaagggtctttatagcattaggagggtcgagaagcactgctctagag
atgaatgcttctgagacctctacagaaggaacagttttgctgtgatactt
ctactagtctagctcttgccactgcggactgtggaaactgggttcctctg
tttcacaagtaggaaactcatgcccttggtggtgaggatgtgatttcctg
tgctgctggggatggtcagaatgagaaaggggtgtctgttaagctgcaga
ggagcgcatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_72246862_72248047
seq2: B6Ng01-251I19.b_44_1235 (reverse)

seq1  TCAGCAATCGTTCAGAATGTTTATGTTGTTAA-CATTTGTAGGTTTTGTT  49
      ||||||||||||| ||| || |  |||||||| | |  ||||||||||  
seq2  TCAGCAATCGTTCCGAAAGTGTTAGTTGTTAACCCTCAGTAGGTTTTGCA  50

seq1  TTGGTTTGTTTTGTTTT---GGTTTGTTTTGGTTTGGTTTGGTTGTTTAA  96
      | | ||  | ||| | |   | || |||| ||||||| || | |||| ||
seq2  TAGTTTGATCTTGATCTCGGGATTAGTTTGGGTTTGGGTTCGATGTTAAA  100

seq1  TCAATGCCAGGCTACCCAGAAGCAAGCAG-AAACATGAA--GGCGTCTCC  143
      || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||||| 
seq2  TC-ATGCCAGGCTAACCAGAAGC-AGCAGAAAACATGAAAGGGCGTCTCA  148

seq1  AAAAACCCTATTGCAAGATTGCTGTC-ATAACAAGGACTCAGAGCCTGTT  192
      |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||
seq2  AAAACCCTTATTGCAAGATTGCTGTCAATAACAAGGACTCAGAAGCTGTT  198

seq1  TTACTCCTATTATTCCTCTTCCTCTTTTTCTTCCTCCTCTTCCTCCTCCT  242
      |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTCCTATAATTCCTC-TCCTCTTTTTCTTCCTCCTCTTCCTCCTCCT  247

seq1  TTACTCCAGCTTTGTTGATGTGTAACTGACAAATAAAAATTGAGTGTATT  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTCCAGCTTTGTTGATGTGTAACTGACAAATAAAAATTGAGTGTATT  297

seq1  CA-CCATGTTTGGATGAATGTATAGAGTCCAGCAGAGCACCCTGTTCCTT  341
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCATGTTTGGATGAATGTATAGAGTCCAGCAGAGCACCCTGTTCCTT  347

seq1  TACAGTCCATTCTGATAAACACAAGCATTTATACCTAATCAAATGCCACT  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGTCCATTCTGATAAACACAAGCATTTATACCTAATCAAATGCCACT  397

seq1  CCCTGCCCTCTTAACTTCAGGGGAAGCTAGAATCTACAATCTGATCTCAG  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGCCCTCTTAACTTCAGGGGAAGCTAGAATCTACAATCTGATCTCAG  447

seq1  TTTTCAAAAGGGGGGTGAGAGGGATAAAGGTCTCACTCCAAGACAAACTC  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCAAAAGGGGGGTGAGAGGGATAAAGGTCTCACTCCAAGACAAACTC  497

seq1  AATGATAGCAAGGCAGAGACAGTGACACCTTGCACAGGGAGCAGGGACTC  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGATAGCAAGGCAGAGACAGTGACACCTTGCACAGGGAGCAGGGACTC  547

seq1  AGGGAGAGGAGTGGGAGCTGAGAAGGAATTGCACAGGCTGACAAGTGTCT  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGAGGAGTGGGAGCTGAGAAGGAATTGCACAGGCTGACAAGTGTCT  597

seq1  CTGACCCAGTTTATTCTCAGGAAGGGGTAACGACAGTATGCTGTCACCCA  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACCCAGTTTATTCTCAGGAAGGGGTAACGACAGTATGCTGTCACCCA  647

seq1  AAAGAGCAACATTGACACACCCTTTCAAGGTAGCCCCCTGGCTGATTGTA  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGCAACATTGACACACCCTTTCAAGGTAGCCCCCTGGCTGATTGTA  697

seq1  CCAAAGAGAAATTGCTTTAATGGTTATTACAAACACATGAAGATACTTCA  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGAGAAATTGCTTTAATGGTTATTACAAACACATGAAGATACTTCA  747

seq1  CATGCTTTTGTAATTTAATCCTCCTAGTTAAAAAACTCTTTATGTCACTT  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTTTTGTAATTTAATCCTCCTAGTTAAAAAACTCTTTATGTCACTT  797

seq1  TGAACATTGAGCTACACAAAGTTATTGTATTGCCTACACATGCCTACTAT  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACATTGAGCTACACAAAGTTATTGTATTGCCTACACATGCCTACTAT  847

seq1  AGGGGGTAACAGGAATCATCCTTACGAGCTAAACTCAGCAACACCTGTAT  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGTAACAGGAATCATCCTTACGAGCTAAACTCAGCAACACCTGTAT  897

seq1  CAAGTAAGGGACAGATTCCCAGGTGGGATGCTGCTTTGATGTCAACATTG  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTAAGGGACAGATTCCCAGGTGGGATGCTGCTTTGATGTCAACATTG  947

seq1  GAACTGTCAACAGAGACAGAAACTCTTCTTCTTCCTGGGGTGTACTGAAT  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGTCAACAGAGACAGAAACTCTTCTTCTTCCTGGGGTGTACTGAAT  997

seq1  TCCACAGTCAAATAAAATAAAGTCGATCAACCCACACATATAACAGAGTT  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACAGTCAAATAAAATAAAGTCGATCAACCCACACATATAACAGAGTT  1047

seq1  AATATTCCAAATTCCTTTTTAAAAAAGATCTATTTACTTATTATATGTAA  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTCCAAATTCCTTTTTAAAAAAGATCTATTTACTTATTATATGTAA  1097

seq1  GTACGCTGTAGCTGTCTTCAGACATACCAGAAGAGGGCATCCGATCTCAT  1141
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACGCTGTAGCTGTCTTCAGACATACCAGAAGAGGGCATCCGATCTCAT  1147

seq1  TACAGATGGTTGTGAGTCACCATGTAGTTGTTGGGATTTGAATTC  1186
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGATGGTTGTGAGTCACCATGTAGTTGTTGGGATTTGAATTC  1192

seq1: chr15_72099132_72100193
seq2: B6Ng01-251I19.g_65_1124

seq1  GAATTCCAGGCTCTCGTACTCTAGAATAAATGATCAGTTATCCAGCACAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGCTCTCGTACTCTAGAATAAATGATCAGTTATCCAGCACAC  50

seq1  TGTCACTCCAGGGACAGCACTACATGGTCATCTATACTGATATGGCCTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACTCCAGGGACAGCACTACATGGTCATCTATACTGATATGGCCTAA  100

seq1  CCTGGCTCTAGAGCAGACCCCACCATGATGTTCAGAGAAGGTGTGGAAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCTCTAGAGCAGACCCCACCATGATGTTCAGAGAAGGTGTGGAAAA  150

seq1  GAGCAACTGAAAAAGTATTTTCCACAGGGAGCTGAAGTCCTATTTTCTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAACTGAAAAAGTATTTTCCACAGGGAGCTGAAGTCCTATTTTCTGT  200

seq1  CTTTGCTTTGATGGGTTAATGAGCTATGCTGCTTCCACTTCCTCTGGAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCTTTGATGGGTTAATGAGCTATGCTGCTTCCACTTCCTCTGGAGG  250

seq1  TAAGATGAGGAGTGTCCCAAATGAAAGATTACTTGCAGAGATCCTGGACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATGAGGAGTGTCCCAAATGAAAGATTACTTGCAGAGATCCTGGACA  300

seq1  AGCCTCCACAGAATGACCCAGTCAAAATGTGTATCAGGCTTCAGCATGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCCACAGAATGACCCAGTCAAAATGTGTATCAGGCTTCAGCATGCC  350

seq1  TGTAAGAAATTCTTCTGAGCTCCCTTCACCGGACAACCAAAGCCCAAGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGAAATTCTTCTGAGCTCCCTTCACCGGACAACCAAAGCCCAAGAT  400

seq1  TTCCCATGCCTTATAGTTCTTTTTCTAGCTGCCCCCTTTCAACCCCATGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCATGCCTTATAGTTCTTTTTCTAGCTGCCCCCTTTCAACCCCATGC  450

seq1  CCCTCCTCCTAGGCCTTCTAGACCTCAGACTTTCCAACCTGCAGAGCCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCCTCCTAGGCCTTCTAGACCTCAGACTTTCCAACCTGCAGAGCCCT  500

seq1  ACGCTAACAAACATGTTTGCCTTAGAAATCGTCAAGACACAGGTGTCTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCTAACAAACATGTTTGCCTTAGAAATCGTCAAGACACAGGTGTCTGC  550

seq1  TACAACAGTGAAAAATGGACTTTTACCAGCCACATCAGCTATGTTACCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAACAGTGAAAAATGGACTTTTACCAGCCACATCAGCTATGTTACCTG  600

seq1  GCAACCATAACCCTCTCCAGCCTCTGGACCCAATGACCTAGGGAAGGGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACCATAACCCTCTCCAGCCTCTGGACCCAATGACCTAGGGAAGGGGT  650

seq1  TCTTAACCTATAGGTCACGACCCCTTTAATAAGACCATACTGTGCATCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAACCTATAGGTCACGACCCCTTTAATAAGACCATACTGTGCATCAC  700

seq1  ATATTGACATCATGAGTCATAACAGTAGCAAAATTACAGTTATAAAGTAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGACATCATGAGTCATAACAGTAGCAAAATTACAGTTATAAAGTAG  750

seq1  CAACAAACATAATTTTATGGTTGGGGAGGCACCACAACATAAAGACCTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAACATAATTTTATGGTTGGGGAGGCACCACAACATAAAGACCTAT  800

seq1  ATTAAAGGGTCTTTATAGCATTAGGAGGGTCGAGAAGCACTGCTCTAGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAGGGTCTTTATAGCATTAGGAGGGTCGAGAAGCACTGCTCTAGAG  850

seq1  ATGAATGCTTCTGAGACCTCTACAGAAGGAACAGTTTTTGCTGTGATACT  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ATGAATGCTTCTGAGACCTCTACAGAAGGAACAG-TTTTGCTGTGATACT  899

seq1  TCTACTAGTCTAGCTCTTGCCACTGCGGACTGTGGAAACTGGGTTCCTCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACTAGTCTAGCTCTTGCCACTGCGGACTGTGGAAACTGGGTTCCTCT  949

seq1  GTTTCACAAGTAGGAAACCCATGCCCTTGGT-GTGAGGATGTGA-TTCCT  998
      |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||
seq2  GTTTCACAAGTAGGAAACTCATGCCCTTGGTGGTGAGGATGTGATTTCCT  999

seq1  GTGGCTGCTGGGGATGTTCAGAATGAGAAAGGGGTGTCTGTTAAGCTGGC  1048
      || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  
seq2  GT-GCTGCTGGGGATGGTCAGAATGAGAAAGGGGTGTCTGTTAAGCTG--  1046

seq1  AAGAGGAGCGCATG  1062
       |||||||||||||
seq2  CAGAGGAGCGCATG  1060