BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-267N01
Chromosome15 (Build37)
Map Location 19,264,928 - 19,391,981
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG666875
Upstream geneLOC666839, Cdh10, EG666857
Downstream geneLOC621884, LOC100040265
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-267N01.bB6Ng01-267N01.g
ACCGA070836GA070837
length1,0251,158
definitionB6Ng01-267N01.b B6Ng01-267N01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(19,391,306 - 19,391,981)(19,264,928 - 19,266,086)
sequence
gaattcccatacagtggggaataatgaacagaggctatgatacaaaaaat
ctcagagccagctatgagttatgattctttaagatattgatcagtaaggt
taccaggatattctcaaatattacaggttattgtcattgttctagattgt
taaatacatgaaattgttaagtcaatgacattgagaaatcaagccagtac
aactagtaatgtttatcctttatggctagctttcatacttatggaatgtt
ctgtgagtcctacttaaagataggttagttctcaaatgtgtcacggaact
ttgaaatttgtcagctataataatgcatgccccatgaatgtttttttttc
cagtaatgtaagagaaacgagtattcatgggtaacaagccactctctaat
tatatttaaagctagttctatgtgatgaaacttatgattggtattgttaa
ctgggcaaagaacatgtgactggttaggttagagtacccatgagagaacc
aagtattcagctacatggaaacaacaataaactttcctctaaattctttt
cttttcatccatagattagtacatctctcaagtctcatcaaggaaactac
tttttgcagcagatctacatctgaataacatgcagggatcaactctagct
gggacatctatatcacactcttcagtccaaaggcttagaaatcaacagaa
agaggggaaagtaaagaaagtaaaagccagaagtagtggttattgaggcc
aaaacaatgtttgctggacatgacaaggcaatttgcatgtgatattacat
atgctcagcttttcacaagattaaaattgctatgataccagcatgaacaa
agggagaagttctgaagtcctaccactctctgagaaataattggcaattt
gagggctcctggaaggagaggagagtcagctttcagttggaagataccca
tggctaagtagattatcctacacctgtgagtacagagcagcactgatggg
ctctgtgctgtgggaaatccgaaaa
gaattccatgatagcctctccctccacaggatcctccttaggatctctcc
accacagaatcatggtgcaggggtcctaaggcctccctcccctccatgtt
tgccttttgcttgggagctcccaagggttcaggtgagttgcttctgttga
gaggaaaatggatcacttgccacaagaatgcagtcaaggatagagcatgg
gaacataactccagcagagagagctggaggaatactaaaatgcaagtatc
ttggggattttggctggtaggttgccagattagattatcagattaaaata
gattagcactgctcagctcttgtgcatgattaaataaatcttacagtctc
tcgtttccttgggagctagttgggagagagaaaaaccgccacttttcaaa
ttttagtaacatgctagcaaggtgggatcgaacaagtaaagagataaaat
ttttcttctcccaaatcctcacatgtaggcttccagcagaaggcatggtc
cagattcgatcttaattaaagatctggattaaaggtgtgtcttcctactt
caaagatttggacctttccacttcaaattaagtagacgggatttcacatg
tgtgtcctcgactttttgggtctagataactccagatgaaatcaagctga
tagctaagaatgctccttgtgtgtcttgtcacctctggattgcatatgct
tcctatacacttcttgtgcactgctttgctaaagtagattctgtgcaaca
atcacaacacagacaattaaggttttgaaattgctgcaatttatgatcct
attcaatccaagcttaattcgatgtgaccatatagaaaaaataataggat
gggctgacagttgaccccattttaaagtccacatttggataattttaatc
tatttccgttttttatggtttgtgaagttttggtgttgatctacaggctt
tctccactactcccattcctctattctcactatcggtgtcctctcttttt
cactgcctcagtctagaatctgtgggcttcatcatgtcatggtcaactta
ccaagggttgtacacttagagaaacttgggtttttcaattactagtatct
aaccagtacccaatcattcttagctagtcttacgatgtggagcccatctc
cttcctcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_19391306_19391981
seq2: B6Ng01-267N01.b_45_720 (reverse)

seq1  ACTGAAGAGTGTGATATAGATGTCCCAGCTAGAGTTGATCCCTGCATGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAAGAGTGTGATATAGATGTCCCAGCTAGAGTTGATCCCTGCATGTT  50

seq1  ATTCAGATGTAGATCTGCTGCAAAAAGTAGTTTCCTTGATGAGACTTGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGATGTAGATCTGCTGCAAAAAGTAGTTTCCTTGATGAGACTTGAG  100

seq1  AGATGTACTAATCTATGGATGAAAAGAAAAGAATTTAGAGGAAAGTTTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTACTAATCTATGGATGAAAAGAAAAGAATTTAGAGGAAAGTTTAT  150

seq1  TGTTGTTTCCATGTAGCTGAATACTTGGTTCTCTCATGGGTACTCTAACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTTTCCATGTAGCTGAATACTTGGTTCTCTCATGGGTACTCTAACC  200

seq1  TAACCAGTCACATGTTCTTTGCCCAGTTAACAATACCAATCATAAGTTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCAGTCACATGTTCTTTGCCCAGTTAACAATACCAATCATAAGTTTC  250

seq1  ATCACATAGAACTAGCTTTAAATATAATTAGAGAGTGGCTTGTTACCCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACATAGAACTAGCTTTAAATATAATTAGAGAGTGGCTTGTTACCCAT  300

seq1  GAATACTCGTTTCTCTTACATTACTGGAAAAAAAAACATTCATGGGGCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATACTCGTTTCTCTTACATTACTGGAAAAAAAAACATTCATGGGGCAT  350

seq1  GCATTATTATAGCTGACAAATTTCAAAGTTCCGTGACACATTTGAGAACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTATTATAGCTGACAAATTTCAAAGTTCCGTGACACATTTGAGAACT  400

seq1  AACCTATCTTTAAGTAGGACTCACAGAACATTCCATAAGTATGAAAGCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTATCTTTAAGTAGGACTCACAGAACATTCCATAAGTATGAAAGCTA  450

seq1  GCCATAAAGGATAAACATTACTAGTTGTACTGGCTTGATTTCTCAATGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATAAAGGATAAACATTACTAGTTGTACTGGCTTGATTTCTCAATGTC  500

seq1  ATTGACTTAACAATTTCATGTATTTAACAATCTAGAACAATGACAATAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGACTTAACAATTTCATGTATTTAACAATCTAGAACAATGACAATAAC  550

seq1  CTGTAATATTTGAGAATATCCTGGTAACCTTACTGATCAATATCTTAAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAATATTTGAGAATATCCTGGTAACCTTACTGATCAATATCTTAAAG  600

seq1  AATCATAACTCATAGCTGGCTCTGAGATTTTTTGTATCATAGCCTCTGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCATAACTCATAGCTGGCTCTGAGATTTTTTGTATCATAGCCTCTGTT  650

seq1  CATTATTCCCCACTGTATGGGAATTC  676
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATTCCCCACTGTATGGGAATTC  676

seq1: chr15_19264928_19266086
seq2: B6Ng01-267N01.g_67_1224

seq1  GAATTCCATGATAGCCTCTCCCTCCACAGGATCCTCCTTAGGATCTCTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATGATAGCCTCTCCCTCCACAGGATCCTCCTTAGGATCTCTCC  50

seq1  ACCACAGAATCATGGTGCAGGGGTCCTAAGGCCTCCCTCCCCTCCATGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACAGAATCATGGTGCAGGGGTCCTAAGGCCTCCCTCCCCTCCATGTT  100

seq1  TGCCTTTTGCTTGGGAGCTCCCAAGGGTTCAGGTGAGTTGCTTCTGTTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTTTGCTTGGGAGCTCCCAAGGGTTCAGGTGAGTTGCTTCTGTTGA  150

seq1  GAGGAAAATGGATCACTTGCCACAAGAATGCAGTCAAGGATAGAGCATGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAAAATGGATCACTTGCCACAAGAATGCAGTCAAGGATAGAGCATGG  200

seq1  GAACATAACTCCAGCAGAGAGAGCTGGAGGAATACTAAAATGCAAGTATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATAACTCCAGCAGAGAGAGCTGGAGGAATACTAAAATGCAAGTATC  250

seq1  TTGGGGATTTTGGCTGGTAGGTTGCCAGATTAGATTATCAGATTAAAATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGATTTTGGCTGGTAGGTTGCCAGATTAGATTATCAGATTAAAATA  300

seq1  GATTAGCACTGCTCAGCTCTTGTGCATGATTAAATAAATCTTACAGTCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAGCACTGCTCAGCTCTTGTGCATGATTAAATAAATCTTACAGTCTC  350

seq1  TCGTTTCCTTGGGAGCTAGTTGGGAGAGAGAAAAACCGCCACTTTTCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTTTCCTTGGGAGCTAGTTGGGAGAGAGAAAAACCGCCACTTTTCAAA  400

seq1  TTTTAGTAACATGCTAGCAAGGTGGGATCGAACAAGTAAAGAGATAAAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGTAACATGCTAGCAAGGTGGGATCGAACAAGTAAAGAGATAAAAT  450

seq1  TTTTCTTCTCCCAAATCCTCACATGTAGGCTTCCAGCAGAAGGCATGGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTTCTCCCAAATCCTCACATGTAGGCTTCCAGCAGAAGGCATGGTC  500

seq1  CAGATTCGATCTTAATTAAAGATCTGGATTAAAGGTGTGTCTTCCTACTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATTCGATCTTAATTAAAGATCTGGATTAAAGGTGTGTCTTCCTACTT  550

seq1  CAAAGATTTGGACCTTTCCACTTCAAATTAAGTAGACGGGATTTCACATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGATTTGGACCTTTCCACTTCAAATTAAGTAGACGGGATTTCACATG  600

seq1  TGTGTCCTCGACTTTTTGGGTCTAGATAACTCCAGATGAAATCAAGCTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCCTCGACTTTTTGGGTCTAGATAACTCCAGATGAAATCAAGCTGA  650

seq1  TAGCTAAGAATGCTCCTTGTGTGTCTTGTCACCTCTGGATTGCATATGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTAAGAATGCTCCTTGTGTGTCTTGTCACCTCTGGATTGCATATGCT  700

seq1  TCCTATACACTTCTTGTGCACTGCTTTGCTAAAGTAGATTCTGTGCAACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATACACTTCTTGTGCACTGCTTTGCTAAAGTAGATTCTGTGCAACA  750

seq1  ATCACAACACAGACAATTAAGGTTTTGAAATTGCTGCAATTTATGATCCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACAACACAGACAATTAAGGTTTTGAAATTGCTGCAATTTATGATCCT  800

seq1  ATTCAATCCAAGCTTAATTCGATGTGACCATATAGAAAAAATAATAGGAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAATCCAAGCTTAATTCGATGTGACCATATAGAAAAAATAATAGGAT  850

seq1  GGGCTGACAGTTGACCCCATTTTAAAGTCCACATTTGGATAATTTTAATC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTGACAGTTGACCCCATTTTAAAGTCCACATTTGGATAATTTTAATC  900

seq1  TATTTCCGTTTTTTATGGTTTTGTGAAGTTTTGGTGTTGATCTACAGGCT  950
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTCCGTTTTTTATGG-TTTGTGAAGTTTTGGTGTTGATCTACAGGCT  949

seq1  TTCTCCACTACTCCCATTCCTCTATTCTCACTATTCGGTGTCCTCTCTTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TTCTCCACTACTCCCATTCCTCTATTCTCACTA-TCGGTGTCCTCTCTTT  998

seq1  TTCACTGCCTCAGTTCTAGAATCTGTGGGCTTTCATCATGTCATGGTCAA  1050
      ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TTCACTGCCTCAG-TCTAGAATCTGTGGGC-TTCATCATGTCATGGTCAA  1046

seq1  CTTACCAAAGGTGGTACACTTAGAGAAAACT-GGTTTTTCATTTCCTAGT  1099
      |||||||| ||| |||||||||||||||  | ||||||||| || |||||
seq2  CTTACCAAGGGTTGTACACTTAGAGAAACTTGGGTTTTTCAATTACTAGT  1096

seq1  ATCTAACAATTA-CCAATCATTCTATAGCTAGGGCTACGATTGTGAGCCC  1148
      ||||||| | || ||||||||||| |||||||   ||||||   ||||||
seq2  ATCTAACCAGTACCCAATCATTCT-TAGCTAGTCTTACGATGTGGAGCCC  1145

seq1  ATCTCC--CCTCC  1159
      ||||||  |||||
seq2  ATCTCCTTCCTCC  1158