BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-268M11
Chromosome15 (Build37)
Map Location 52,055,997 - 52,174,401
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC665219, Slc30a8
Upstream geneLOC100039662, Eif3s3, LOC100039679, D530033C11Rik, Rad21, Aard, LOC100039720
Downstream geneLOC100039748, Thrap6, LOC100039745, Ext1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-268M11.bB6Ng01-268M11.g
ACCGA071547GA071548
length995746
definitionB6Ng01-268M11.b B6Ng01-268M11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(52,055,997 - 52,056,990)(52,173,656 - 52,174,401)
sequence
gaattcagctcagaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaggagcaacac
tacctagggacaggatattgggaacagactctaagtaggtgagacaaatc
ctagaacactcactgtaagaatggcctggaagcagcaggcagaaaagcag
atttgattttacaatggtatctagtcacagaaaatagcagactctttggg
ggcaggaaacacacaaaatggaatcacagcatgccagggagattgtcctg
ttcttcagtaatacggttcttaaagaaagggctattccattttgatagct
cagcagcagaaggaccaagatgaattggaagaaactctgagcagagtaat
gagtggataagtagcttctgatggaggaattgacgatgtataatgctttc
aaggaaccatcatcatagttttccattacaatgctaggaacaagagacac
caagtatggagtgaaattacttggctgcagagagatttagtggaagatga
ttgcatatggttaaggatatcagaaaatagtttaaccttgggagaatcaa
tttatcaacaaaatgatcaaccaaacaagaagtacgaacaacttaccata
aactagatatcttttcgtcagtagtctcagctatggggtgctatgataat
ataaactataatccctttgccttgactattctttgttatttcttgaggtt
tttttaacttgtgttttctcttgtctgcagtagtcatttttcatctcctg
acacaagatcttaaagaaagggctattccattttaactcacatcttcttc
taggccagatcttaagtcccacaaagcaatacagacaactaagaaatact
gagagtaggagcatatcaattggtttatccaattctaaatggtcagctct
gaaaacatacatacaagtaactttatacaggttgagcatgttgtacttat
gtatttaggaatgtatgtatgtatatatgtatgtatgtatgtatg
gaattcccattttccatctgcaaccaaacatatggaacacataaatttct
tttatgagccctaacattaccatcgagccctagatgaatctcaactaagt
gttggacaatggagaagcatattaaggaaggagagggcagagaggttgac
ctgatttcagtactcagaagaatgaggtacgatgttttgacagaaatgat
gttttgaaagctgggggaattcagtgtctcaaagcaaagaatcctatgct
gtgtcactcacttcagtggctcagaattctgaccatgcaaaggaaggggc
agagggtgagtcagaacatcagaactgacagatggtgtataaaagtactt
ggcaacatctgggagtttttttgtcttaagatttttaaatcttcatttta
agttgattttcaatttaccatctagatcctctgagtgagctgactaaaga
tgtggaattttccaaaaaataaaatgagaaatttcagagaattaactaga
agtcatgagtcaattcctttggtagatacatcacgctcccaccatcatga
ttgcctgaaatactgtgcatttggagggacccatggctccagccgcatac
gtgcagaggatggccttgtgggtcgtcaatgggaggggaggcccttggtc
ctgtgagggattagtgctccagtgtaggggaatgccaatacagggaagtg
ggagtggatcagttagggagcaggaggatggtagatgggatgggga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_52055997_52056990
seq2: B6Ng01-268M11.b_45_1039

seq1  GAATTCAGCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGCAACAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGCAACAC  50

seq1  TACCTAGGGACAGGATATTGGGAACAGACTCTAAGTAGGTGAGACAAATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTAGGGACAGGATATTGGGAACAGACTCTAAGTAGGTGAGACAAATC  100

seq1  CTAGAACACTCACTGTAAGAATGGCCTGGAAGCAGCAGGCAGAAAAGCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAACACTCACTGTAAGAATGGCCTGGAAGCAGCAGGCAGAAAAGCAG  150

seq1  ATTTGATTTTACAATGGTATCTAGTCACAGAAAATAGCAGACTCTTTGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGATTTTACAATGGTATCTAGTCACAGAAAATAGCAGACTCTTTGGG  200

seq1  GGCAGGAAACACACAAAATGGAATCACAGCATGCCAGGGAGATTGTCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGAAACACACAAAATGGAATCACAGCATGCCAGGGAGATTGTCCTG  250

seq1  TTCTTCAGTAATACGGTTCTTAAAGAAAGGGCTATTCCATTTTGATAGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCAGTAATACGGTTCTTAAAGAAAGGGCTATTCCATTTTGATAGCT  300

seq1  CAGCAGCAGAAGGACCAAGATGAATTGGAAGAAACTCTGAGCAGAGTAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGCAGAAGGACCAAGATGAATTGGAAGAAACTCTGAGCAGAGTAAT  350

seq1  GAGTGGATAAGTAGCTTCTGATGGAGGAATTGACGATGTATAATGCTTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGATAAGTAGCTTCTGATGGAGGAATTGACGATGTATAATGCTTTC  400

seq1  AAGGAACCATCATCATAGTTTTCCATTACAATGCTAGGAACAAGAGACAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAACCATCATCATAGTTTTCCATTACAATGCTAGGAACAAGAGACAC  450

seq1  CAAGTATGGAGTGAAATTACTTGGCTGCAGAGAGATTTAGTGGAAGATGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTATGGAGTGAAATTACTTGGCTGCAGAGAGATTTAGTGGAAGATGA  500

seq1  TTGCATATGGTTAAGGATATCAGAAAATAGTTTAACCTTGGGAGAATCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCATATGGTTAAGGATATCAGAAAATAGTTTAACCTTGGGAGAATCAA  550

seq1  TTTATCAACAAAATGATCAACCAAACAAGAAGTACGAACAACTTACCATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCAACAAAATGATCAACCAAACAAGAAGTACGAACAACTTACCATA  600

seq1  AACTAGATATCTTTTCGTCAGTAGTCTCAGCTATGGGGTGCTATGATAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAGATATCTTTTCGTCAGTAGTCTCAGCTATGGGGTGCTATGATAAT  650

seq1  ATAAACTATAATCCCTTTGCCTTGACTATTCTTTGTTATTTCTTGAGGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACTATAATCCCTTTGCCTTGACTATTCTTTGTTATTTCTTGAGGTT  700

seq1  TTTTTAACTTGTGTTTTCTCTTGTCTGCAGTAGTCATTTTTCATCTCCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAACTTGTGTTTTCTCTTGTCTGCAGTAGTCATTTTTCATCTCCTG  750

seq1  ACACAAGATCTTAAAGAAAGGGCTATTCCATTTTAACTCACATCTTCTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAGATCTTAAAGAAAGGGCTATTCCATTTTAACTCACATCTTCTTC  800

seq1  TAGGCCAGATCTTAAGTCCCACAAAGCAATACAGACAACTAAGAAATACT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCCAGATCTTAAGTCCCACAAAGCAATACAGACAACTAAGAAATACT  850

seq1  GAGAGTAGGAGCATATCAATTGG-TTATCCAATTCTAAATGGTCAGCTCT  899
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGTAGGAGCATATCAATTGGTTTATCCAATTCTAAATGGTCAGCTCT  900

seq1  GAAAACATACATACAAGTAACTTTATACAGGTTGAGCATGTTGTACTTAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACATACATACAAGTAACTTTATACAGGTTGAGCATGTTGTACTTAT  950

seq1  GTATTTAGGAATGTATGTATGTATATATGTATGTATGTATGTATG  994
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTAGGAATGTATGTATGTATATATGTATGTATGTATGTATG  995

seq1: chr15_52173656_52174401
seq2: B6Ng01-268M11.g_69_814 (reverse)

seq1  TCCCCATCCCATCTACCATCCTCCTGCTCCCTAACTGATCCACTCCCACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCATCCCATCTACCATCCTCCTGCTCCCTAACTGATCCACTCCCACT  50

seq1  TCCCTGTATTGGCATTCCCCTACACTGGAGCACTAATCCCTCACAGGACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGTATTGGCATTCCCCTACACTGGAGCACTAATCCCTCACAGGACC  100

seq1  AAGGGCCTCCCCTCCCATTGACGACCCACAAGGCCATCCTCTGCACGTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCCTCCCCTCCCATTGACGACCCACAAGGCCATCCTCTGCACGTAT  150

seq1  GCGGCTGGAGCCATGGGTCCCTCCAAATGCACAGTATTTCAGGCAATCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGCTGGAGCCATGGGTCCCTCCAAATGCACAGTATTTCAGGCAATCAT  200

seq1  GATGGTGGGAGCGTGATGTATCTACCAAAGGAATTGACTCATGACTTCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTGGGAGCGTGATGTATCTACCAAAGGAATTGACTCATGACTTCTA  250

seq1  GTTAATTCTCTGAAATTTCTCATTTTATTTTTTGGAAAATTCCACATCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATTCTCTGAAATTTCTCATTTTATTTTTTGGAAAATTCCACATCTT  300

seq1  TAGTCAGCTCACTCAGAGGATCTAGATGGTAAATTGAAAATCAACTTAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCAGCTCACTCAGAGGATCTAGATGGTAAATTGAAAATCAACTTAAA  350

seq1  ATGAAGATTTAAAAATCTTAAGACAAAAAAACTCCCAGATGTTGCCAAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGATTTAAAAATCTTAAGACAAAAAAACTCCCAGATGTTGCCAAGT  400

seq1  ACTTTTATACACCATCTGTCAGTTCTGATGTTCTGACTCACCCTCTGCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTATACACCATCTGTCAGTTCTGATGTTCTGACTCACCCTCTGCCC  450

seq1  CTTCCTTTGCATGGTCAGAATTCTGAGCCACTGAAGTGAGTGACACAGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTTTGCATGGTCAGAATTCTGAGCCACTGAAGTGAGTGACACAGCA  500

seq1  TAGGATTCTTTGCTTTGAGACACTGAATTCCCCCAGCTTTCAAAACATCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGATTCTTTGCTTTGAGACACTGAATTCCCCCAGCTTTCAAAACATCA  550

seq1  TTTCTGTCAAAACATCGTACCTCATTCTTCTGAGTACTGAAATCAGGTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTCAAAACATCGTACCTCATTCTTCTGAGTACTGAAATCAGGTCA  600

seq1  ACCTCTCTGCCCTCTCCTTCCTTAATATGCTTCTCCATTGTCCAACACTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTCTGCCCTCTCCTTCCTTAATATGCTTCTCCATTGTCCAACACTT  650

seq1  AGTTGAGATTCATCTAGGGCTCGATGGTAATGTTAGGGCTCATAAAAGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGAGATTCATCTAGGGCTCGATGGTAATGTTAGGGCTCATAAAAGAA  700

seq1  ATTTATGTGTTCCATATGTTTGGTTGCAGATGGAAAATGGGAATTC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATGTGTTCCATATGTTTGGTTGCAGATGGAAAATGGGAATTC  746