BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-269B05
Chromosome15 (Build37)
Map Location 70,057,865 - 70,122,714
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC383050
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-269B05.bB6Ng01-269B05.g
ACCGA071767GA071768
length884675
definitionB6Ng01-269B05.b B6Ng01-269B05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,121,830 - 70,122,714)(70,057,865 - 70,058,539)
sequence
gaattctgagcattcatcaggtaaaaatataattcccattgatgatatat
ggactcattccatcttgcgcttcatcaggtaaaaatataattcccattga
tgatatatggactcattccatcttgcgctcttgaggcacccatttaagac
ttcttatatgccttttttctactttcctgaccactacacacttccatata
aatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgaa
tatgtaaacatatatatgaacacacatacaaacacttgaacattactatg
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cagaaattcaattaaaaataagtgaatatcactggttctaactcctaccc
taatatttttctactacaagttaattaaatcactaggtcatcttgggagt
tctataattttagaaacagtactaaactttatcatgttgcagcctgtgtc
tgtactcagatcaccgcttcagaaactcagagctttatatgaaataccaa
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ttcttcttatgacttgtcagttgaaggcatacttacaaagaaaaaatata
atatgagaaaattgtacacatgtcttggaagcatatttcaagttcttact
taggattgtggaaatgtcaaaggacctaaaatttcaggaataaattaaca
tttctaattctgctattaagtgtagtacagttttgaggacttttatttat
cattcataggcatagaataactagcccagatatttaatttatgacatatt
atatactgatatatatatatatatatatacacatacatgtatatatgtat
atatatatgtgtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_70121830_70122714
seq2: B6Ng01-269B05.b_44_927 (reverse)

seq1  TACATACACACTATATATATATATATATTTATATACATACATACATACTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATACACACTATATATATATATATATTTATATACATACATACATACTA  50

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      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTATG-AATCAATATGATTGAAAACTATAGCATAAAATGTATTCTGA  99

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGGTCCTTGGCTGAAGAGCTATTGTCATTTGATATCTGCCAAGAGA  149

seq1  AGAGGTACATTTCCTTGGAGAAATTGGGACATTGGCCGGTTGTTCAAGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGTACATTTCCTTGGAGAAATTGGGACATTGGCCGGTTGTTCAAGTC  199

seq1  AGTATGGATGACTCAAAATGCATGAACATGTGCATAGCACTAAATGAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATGGATGACTCAAAATGCATGAACATGTGCATAGCACTAAATGAAAT  249

seq1  TGGCAGGATTATTTGTGTAGATAGCTAGAACATTGGAGGAGGAGAGGGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGGATTATTTGTGTAGATAGCTAGAACATTGGAGGAGGAGAGGGTG  299

seq1  GATATGGTGAATATACATTGCATTTTATATGATAGTTTCAAAGAATGAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATGGTGAATATACATTGCATTTTATATGATAGTTTCAAAGAATGAAA  349

seq1  AATTAAAAATCACATTATGAAATTTGCAGAAAAATGAACGCAGCTTTTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAAAATCACATTATGAAATTTGCAGAAAAATGAACGCAGCTTTTGG  399

seq1  GATAGCATTGGAAATGTAATTGAGGAAAATACGTAATAAAAGAAAAAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGCATTGGAAATGTAATTGAGGAAAATACGTAATAAAAGAAAAAAAA  449

seq1  AAAGAAAATGTATTAAGCGAGGAAACCTGAATTGCAACAAGCACACTACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAAATGTATTAAGCGAGGAAACCTGAATTGCAACAAGCACACTACA  499

seq1  GTTTTTCCTTCACATGTGAATCATATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTCCTTCACATGTGAATCATATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGT  549

seq1  ATATATGTATATATATGTATATAAATACATATATACATAGTAATGTTCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATGTATATATATGTATATAAATACATATATACATAGTAATGTTCAA  599

seq1  GTGTTTGTATGTGTGTTCATATATATGTTTACATATTCATATATATATAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTGTATGTGTGTTCATATATATGTTTACATATTCATATATATATAT  649

seq1  ATATATATATATATATATATATATATATATATATTTATATGGAAGTGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATATATATATATATATATATATATATTTATATGGAAGTGTGT  699

seq1  AGTGGTCAGGAAAGTAGAAAAAAGGCATATAAGAAGTCTTAAATGGGTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTCAGGAAAGTAGAAAAAAGGCATATAAGAAGTCTTAAATGGGTGC  749

seq1  CTCAAGAGCGCAAGATGGAATGAGTCCATATATCATCAATGGGAATTATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGAGCGCAAGATGGAATGAGTCCATATATCATCAATGGGAATTATA  799

seq1  TTTTTACCTGATGAAGCGCAAGATGGAATGAGTCCATATATCATCAATGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTACCTGATGAAGCGCAAGATGGAATGAGTCCATATATCATCAATGG  849

seq1  GAATTATATTTTTACCTGATGAATGCTCAGAATTC  885
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTATATTTTTACCTGATGAATGCTCAGAATTC  884


seq1: chr15_70057865_70058539
seq2: B6Ng01-269B05.g_65_739

seq1  GAATTCTCCTATTACTATAAAATTAGATACTAAAACCCCCATATTTAAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTATTACTATAAAATTAGATACTAAAACCCCCATATTTAAGA  50

seq1  TACACACATTACTTATAAGAGCTCACCTAGTGATGGAGGCTGATTACATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACACATTACTTATAAGAGCTCACCTAGTGATGGAGGCTGATTACATT  100

seq1  CAGAAATTCAATTAAAAATAAGTGAATATCACTGGTTCTAACTCCTACCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAATTCAATTAAAAATAAGTGAATATCACTGGTTCTAACTCCTACCC  150

seq1  TAATATTTTTCTACTACAAGTTAATTAAATCACTAGGTCATCTTGGGAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATTTTTCTACTACAAGTTAATTAAATCACTAGGTCATCTTGGGAGT  200

seq1  TCTATAATTTTAGAAACAGTACTAAACTTTATCATGTTGCAGCCTGTGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATAATTTTAGAAACAGTACTAAACTTTATCATGTTGCAGCCTGTGTC  250

seq1  TGTACTCAGATCACCGCTTCAGAAACTCAGAGCTTTATATGAAATACCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACTCAGATCACCGCTTCAGAAACTCAGAGCTTTATATGAAATACCAA  300

seq1  TAAATTGGGAAATTCTAAAACAATATGTTAGAGATAGGAGCATATCATGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTGGGAAATTCTAAAACAATATGTTAGAGATAGGAGCATATCATGG  350

seq1  TTCTTCTTATGACTTGTCAGTTGAAGGCATACTTACAAAGAAAAAATATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCTTATGACTTGTCAGTTGAAGGCATACTTACAAAGAAAAAATATA  400

seq1  ATATGAGAAAATTGTACACATGTCTTGGAAGCATATTTCAAGTTCTTACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAGAAAATTGTACACATGTCTTGGAAGCATATTTCAAGTTCTTACT  450

seq1  TAGGATTGTGGAAATGTCAAAGGACCTAAAATTTCAGGAATAAATTAACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGATTGTGGAAATGTCAAAGGACCTAAAATTTCAGGAATAAATTAACA  500

seq1  TTTCTAATTCTGCTATTAAGTGTAGTACAGTTTTGAGGACTTTTATTTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTAATTCTGCTATTAAGTGTAGTACAGTTTTGAGGACTTTTATTTAT  550

seq1  CATTCATAGGCATAGAATAACTAGCCCAGATATTTAATTTATGACATATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCATAGGCATAGAATAACTAGCCCAGATATTTAATTTATGACATATT  600

seq1  ATATACTGATATATATATATATATATATACACATACATGTATATATGTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTG  675
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTG  675


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