BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-281P10
Chromosome15 (Build37)
Map Location 73,180,049 - 73,325,104
singlet/doubletdoublet
Overlap genePtk2, LOC666053, LOC100040929
Upstream geneKcnk9, 1810044A24Rik, LOC665621, Peg13, LOC100041120, Chrac1, Eif2c2
Downstream geneDennd3, Slc45a4, Gpr20, LOC100040946, pPtp4a3, Gm628, LOC100041273, EG625276, LOC100040966, EG666113, LOC100041307, LOC100040984
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-281P10.bB6Ng01-281P10.g
ACCGA081304GA081305
length1,125993
definitionB6Ng01-281P10.b B6Ng01-281P10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,180,049 - 73,181,175)(73,324,111 - 73,325,104)
sequence
gaattcaactgcttacaggaccagcctgctgcctgctttgggtctccctt
gaatcaacaggaaacacctctagtgccctaactgcctatacttcttgaaa
aggttgagcagtcttgagtcaaaatgggaagatctgagagtcaatctaca
attggcttataaatactacagaagaagtatttgcagccaattaagccaag
caggttcttttcttcatgggaacaaaggatgcaaacagtggcttctgcag
tagtgtatgcagcatatggcttgtatgggatttcctacgtcttggagaca
actttctggttaatcttcccatctctcatctcgtgctgtctccggtctga
ctccactggcgatgtgtggtacttttgagaagctcaaggacagtggccaa
ggctcacactggtcacaaggttcacaaaggtcatcatgcccatccacacc
aagatacagaatacagaatgtgtgactgagttgctgtgtaaagccaagtg
caagttccctggccaccaaaaaatccacacctcaaaacagtagagcttca
ccaagttttatggaaatgaatttgaagacattgtggatgagaagcagctc
acccctgattggctatgagattaataaatacatccatatgtgtaggtccc
tgggcaaatagaaatccctaaacacctcagagcatttagagtgctgagcc
ctaccaattatttatgaataaatctctatctagtggaaggggcaccagaa
tacaaggatagacttccctcttttataatcactgcagatcacacaaaaga
aacaagtgactgtcacttcagaagcagaaaagtagaccaaccaaaaaatt
agtccacacccaggctttagaacaggaagaaattctggactaaggcaaag
aaagaggaagctgaaaaaaaatgaaaagaaagaaaaaaaaaaaaaaaaag
ctgagtaacctaggagaactacctatagaaccatgcaggagagagacacc
ttatgcatctgggtgtttggaattcatttgtctagtgtcataaggaagaa
aaatggtgatttctatcagatcactatctacaattcaatatctaaacact
aacttgcagcacttggccttgcttt
gaattctctggcttgtgctatctgaacgatggtattccaggagtcctggt
tcacactcagtagatgtcactacacaaagaggacaagaaacattagaaga
ctgctgactttcccaggcagtcccactgattccactccataaaatgggaa
gtgatctgcgtggatctcaagcccctgtgtttgctctcaccagaggccct
gtgacttcctgatctgcatggttttgtgtcaacctgtcacaagctaatgt
cccctgagagaagggagcctcagctgagaaaatgcctccataggactggc
gtgcaggcaggcctggatggtattttcttagttagtgatggatggtggag
ggcccagcccattgtgggtggtaccatccctgggctggcaaccctgagtt
caataagaaagaagctgaggaagccatgggaaacaacaagacagtcaaca
gcacattcctgccatggtctctgtgtcagctttggcctccaagtttctgt
tctgtttgagttcctgctctgacttccttcactgatgaacagtgtgatat
ggaagtgtaagccaaataaaccctttcctcccaaacatgctttttggtca
tagtgtctcatcaaagcgattgaaaccataactaagacactcacccccac
cccagctagacactgagacccagtgaagtgtctatgctctgccactgagt
tttccccctactgcctgtccctacatgatttttgtcattgagacctctct
agcaacttgctccatgtgtgtcttgtccacgaccctgggtgaccctcttc
ccaagatgcaccaccccaggatatcggagaagggctgaaggttgagctga
tcaattgccaatagtgtgataggtcatatccatgtaatgaatttatcata
aaccccaaatgaacaagttggaaatccactccccaccccaccccccatga
tggctgcttgcaagggaagcttctaccacctgccctaccctga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_73180049_73181175
seq2: B6Ng01-281P10.b_50_1174

seq1  GAATTCAACTGCTTACAGGACCAGCCTGCTGCCTGCTTTGGGTCTCCCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACTGCTTACAGGACCAGCCTGCTGCCTGCTTTGGGTCTCCCTT  50

seq1  GAATCAACAGGAAACACCTCTAGTGCCCTAACTGCCTATACTTCTTGAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCAACAGGAAACACCTCTAGTGCCCTAACTGCCTATACTTCTTGAAA  100

seq1  AGGTTGAGCAGTCTTGAGTCAAAATGGGAAGATCTGAGAGTCAATCTACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTGAGCAGTCTTGAGTCAAAATGGGAAGATCTGAGAGTCAATCTACA  150

seq1  ATTGGCTTATAAATACTACAGAAGAAGTATTTGCAGCCAATTAAGCCAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGCTTATAAATACTACAGAAGAAGTATTTGCAGCCAATTAAGCCAAG  200

seq1  CAGGTTCTTTTCTTCATGGGAACAAAGGATGCAAACAGTGGCTTCTGCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTTCTTTTCTTCATGGGAACAAAGGATGCAAACAGTGGCTTCTGCAG  250

seq1  TAGTGTATGCAGCATATGGCTTGTATGGGATTTCCTACGTCTTGGAGACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGTATGCAGCATATGGCTTGTATGGGATTTCCTACGTCTTGGAGACA  300

seq1  ACTTTCTGGTTAATCTTCCCATCTCTCATCTCGTGCTGTCTCCGGTCTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCTGGTTAATCTTCCCATCTCTCATCTCGTGCTGTCTCCGGTCTGA  350

seq1  CTCCACTGGCGATGTGTGGTACTTTTGAGAAGCTCAAGGACAGTGGCCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCACTGGCGATGTGTGGTACTTTTGAGAAGCTCAAGGACAGTGGCCAA  400

seq1  GGCTCACACTGGTCACAAGGTTCACAAAGGTCATCATGCCCATCCACACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCACACTGGTCACAAGGTTCACAAAGGTCATCATGCCCATCCACACC  450

seq1  AAGATACAGAATACAGAATGTGTGACTGAGTTGCTGTGTAAAGCCAAGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATACAGAATACAGAATGTGTGACTGAGTTGCTGTGTAAAGCCAAGTG  500

seq1  CAAGTTCCCTGGCCACCAAAAAATCCACACCTCAAAACAGTAGAGCTTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTCCCTGGCCACCAAAAAATCCACACCTCAAAACAGTAGAGCTTCA  550

seq1  CCAAGTTTTATGGAAATGAATTTGAAGACATTGTGGATGAGAAGCAGCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTTTTATGGAAATGAATTTGAAGACATTGTGGATGAGAAGCAGCTC  600

seq1  ACCCCTGATTGGCTATGAGATTAATAAATACATCCATATGTGTAGGTCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCTGATTGGCTATGAGATTAATAAATACATCCATATGTGTAGGTCCC  650

seq1  TGGGCAAATAGAAATCCCTAAACACCTCAGAGCATTTAGAGTGCTGAGCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCAAATAGAAATCCCTAAACACCTCAGAGCATTTAGAGTGCTGAGCC  700

seq1  CTACCAATTATTTATGAATAAATCTCTATCTAGTGGAAGGGGCACCAGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCAATTATTTATGAATAAATCTCTATCTAGTGGAAGGGGCACCAGAA  750

seq1  TACAAGGATAGACTTCCCTCTTTTATAATCACTGCAGATCACACAAAAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGGATAGACTTCCCTCTTTTATAATCACTGCAGATCACACAAAAGA  800

seq1  AACAAGTGACTGTCACTTCAGAAGCAGAAAAGTAGACCAACCAAAAAATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGTGACTGTCACTTCAGAAGCAGAAAAGTAGACCAACCAAAAAATT  850

seq1  AGTCCACACCCAGGCTTTAGAACAGGAAGAAATTCTGGACTAAGGGCAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  AGTCCACACCCAGGCTTTAGAACAGGAAGAAATTCTGGACTAA-GGCAAA  899

seq1  GAAAGAGGAAGCTGAAAAAAAAGGAAAAGAAAG--AAAAAAAAAAAAAAA  948
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||
seq2  GAAAGAGGAAGCTGAAAAAAAATGAAAAGAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAA  949

seq1  GCTGAGTAACCTAGGAGGAACTACCTATAGAACCATGCAGGAGAGAGACA  998
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGTAACCTAGGA-GAACTACCTATAGAACCATGCAGGAGAGAGACA  998

seq1  CCTTATGCATCTGGGTGTTT-GAATTCATTTGTCTAGTGGTTCATAAGGG  1047
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| 
seq2  CCTTATGCATCTGGGTGTTTGGAATTCATTTGTCTAGTG--TCATAAGGA  1046

seq1  AGAAAAATGGGTGATTTCTAACCAAGGATCACTATCTTACCATTTCAATA  1097
      |||||||| ||||||||||| |    |||||||||||   || |||||||
seq2  AGAAAAAT-GGTGATTTCTATC---AGATCACTATCT--ACAATTCAATA  1090

seq1  TCTTAACACTAACTTGCAGCACT-----TTGCTTT  1127
      ||| |||||||||||||||||||     |||||||
seq2  TCTAAACACTAACTTGCAGCACTTGGCCTTGCTTT  1125

seq1: chr15_73324111_73325104
seq2: B6Ng01-281P10.g_70_1062 (reverse)

seq1  TCAGGGTAGGGCAGGTGGTAGAAGC-TCCCTTGCAAAGCAGCCATCATGG  49
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
seq2  TCAGGGTAGGGCAGGTGGTAGAAGCTTCCCTTGC-AAGCAGCCATCATGG  49

seq1  GGGGTGGGGTGGGGAGTGGGGATTCCCAACCTTGTCCTTTTGGGGTTTAT  99
      |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||
seq2  GGGGTGGGGTGGGGAGT--GGATTTCCAA-CTTGTTCATTTGGGGTTTAT  96

seq1  GATAAATTCATTACATGGATATGACCTATCACACTATTGGCAATTGATCA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAATTCATTACATGGATATGACCTATCACACTATTGGCAATTGATCA  146

seq1  GCTCAACCTTCAGCCCTTCTCCGATATCCTGGGGTGGTGCATCTTGGGAA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAACCTTCAGCCCTTCTCCGATATCCTGGGGTGGTGCATCTTGGGAA  196

seq1  GAGGGTCACCCAGGGTCGTGGACAAGACACACATGGAGCAAGTTGCTAGA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGTCACCCAGGGTCGTGGACAAGACACACATGGAGCAAGTTGCTAGA  246

seq1  GAGGTCTC-ATGAC-AAAATCATGTAGGGACAGGCAGTAGGGGGAAAACT  297
      |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTCTCAATGACAAAAATCATGTAGGGACAGGCAGTAGGGGGAAAACT  296

seq1  CAGTGGCAGAGCATAGACACTTCACTGGGTCTCAGTGTCTAGCTGGGGTG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGCAGAGCATAGACACTTCACTGGGTCTCAGTGTCTAGCTGGGGTG  346

seq1  GGGGTGAGTGTCTTAGTTATGGTTTCAATCGCTTTGATGAGACACTATGA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTGAGTGTCTTAGTTATGGTTTCAATCGCTTTGATGAGACACTATGA  396

seq1  CCAAAAAGCATGTTTGGGAGGAAAGGGTTTATTTGGCTTACACTTCCATA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAAAGCATGTTTGGGAGGAAAGGGTTTATTTGGCTTACACTTCCATA  446

seq1  TCACACTGTTCATCAGTGAAGGAAGTCAGAGCAGGAACTCAAACAGAACA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACTGTTCATCAGTGAAGGAAGTCAGAGCAGGAACTCAAACAGAACA  496

seq1  GAAACTTGGAGGCCAAAGCTGACACAGAGACCATGGCAGGAATGTGCTGT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTTGGAGGCCAAAGCTGACACAGAGACCATGGCAGGAATGTGCTGT  546

seq1  TGACTGTCTTGTTGTTTCCCATGGCTTCCTCAGCTTCTTTCTTATTGAAC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTGTCTTGTTGTTTCCCATGGCTTCCTCAGCTTCTTTCTTATTGAAC  596

seq1  TCAGGGTTGCCAGCCCAGGGATGGTACCACCCACAATGGGCTGGGCCCTC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGGTTGCCAGCCCAGGGATGGTACCACCCACAATGGGCTGGGCCCTC  646

seq1  CACCATCCATCACTAACTAAGAAAATACCATCCAGGCCTGCCTGCACGCC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATCCATCACTAACTAAGAAAATACCATCCAGGCCTGCCTGCACGCC  696

seq1  AGTCCTATGGAGGCATTTTCTCAGCTGAGGCTCCCTTCTCTCAGGGGACA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCTATGGAGGCATTTTCTCAGCTGAGGCTCCCTTCTCTCAGGGGACA  746

seq1  TTAGCTTGTGACAGGTTGACACAAAACCATGCAGATCAGGAAGTCACAGG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTTGTGACAGGTTGACACAAAACCATGCAGATCAGGAAGTCACAGG  796

seq1  GCCTCTGGTGAGAGCAAACACAGGGGCTTGAGATCCACGCAGATCACTTC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTGGTGAGAGCAAACACAGGGGCTTGAGATCCACGCAGATCACTTC  846

seq1  CCATTTTATGGAGTGGAATCAGTGGGACTGCCTGGGAAAGTCAGCAGTCT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTTATGGAGTGGAATCAGTGGGACTGCCTGGGAAAGTCAGCAGTCT  896

seq1  TCTAATGTTTCTTGTCCTCTTTGTGTAGTGACATCTACTGAGTGTGAACC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATGTTTCTTGTCCTCTTTGTGTAGTGACATCTACTGAGTGTGAACC  946

seq1  AGGACTCCTGGAATACCATCGTTCAGATAGCACAAGCCAGAGAATTC  994
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACTCCTGGAATACCATCGTTCAGATAGCACAAGCCAGAGAATTC  993