BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-284C09
Chromosome15 (Build37)
Map Location 68,124,200 - 68,302,530
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100041000
Upstream geneZfat1
Downstream geneEG665945, EG633752, Khdrbs3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-284C09.bB6Ng01-284C09.g
ACCGA082924GA082925
length9981,021
definitionB6Ng01-284C09.b B6Ng01-284C09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,124,200 - 68,125,111)(68,301,518 - 68,302,530)
sequence
gaattcctctcagatatcttgttatctgtgtgaggctttgatactgtggg
agcggtctcttcatgtggtccagcagttcatagatggagtaaatgttgag
gtggctcactcaaagccctggagctgggcctgggtgacagctgtattatt
cagattgccagttttcctgtgcccatgcttccaaggccagctctcaaatc
tttgcccaggcaagggacatgggtagctctcttgtttgagggagatggaa
aaaggtgggactggctctcatacgcttacactatcagggccagctctcca
acactgtccaggcaagggggctgggccagcttgcccacatactgcaggtg
gtaaggggtacacgggtgtcagcttgctttcttatacactctactcctgg
taccaatttgagtcttaggattttgcttgctgtgataaaagaccacaagc
aaaagcaacttggggacagaaagggtttattttagcttacagttccatat
cacaaaccaccattgaaggacatcagggtaggaaatcaaggcaggaatct
gaaagcaggaactgaagcagaagtcatggaggactgctgctcactgcatt
tctaggtagcctgctcagccttctttattaagaagttcaggacctgccta
ggggtggcaccacccataatgggttgggtcctcccccatcaataatcaag
caaatgcattacaggcttgcccacagagcaatctggtgtatatattttct
ccattgaggttcctttctcccacgcttatgtcaagttgatgaaatgctag
ccagtacacacactttcagatttgttttcactgtgggagtattgtacctg
catgtagatatgtagaacatatgcatgtctggtgttcttgaaggtagaag
aaggcatcagatcctcttttggactgaaattacagatagtgctgggctac
catgtgtgtgctcagaactaaagaagaaacagcaagtgctttaactgc
gaattcctgatctgaattcttttcatcgattatctaagtggcggaactaa
ctgagaattaggcttggaaggtcagtggggtgttcagacaaaagtgcttt
tccaggttcaaggaattttaagtatattaaggtggctgggcatagttaag
catccacctgaaatgggtacccatggtcaagagcatcccgcagaactagt
ccatagtatgagtctgccaggctgtgcataactcaccaatgcttctacat
gcatagagcaagatgggaggaagaaggaattccttgatgtctagctaggc
cagttattagatgaggagcatgaagacaagtgatcatttttttttttttt
tgagatggagtctctcattgaacatggagtttacagatttggctatgctg
gcttgccaatgaactccaaggatctgccccctaacctcagcacctggatt
aggtgcatacaggcatacctggcttttatataggtgttgaggatcccaac
tcaggtcttgcatagtagggactttactgcccgagccagctccatatctc
ctgcagactgttcttagtcatgaccttctgcacataaactaagccacaag
gggaatgaggaatcgcagtataagactcataccagtattcataccacatt
gatagcagttagatagggcttctctgaagcaggtctctgagtgtgtgaga
tctgggagggtgtgggtaagtgcttgctaactgaagagctgggaaagaaa
tgaaggcattcagaggcctgtggataccccgtattcccttatgcatgatg
ctggattctgcctggaagacactttcatcttggaattttgtgactgttcc
cactatatcatggacactaagaaaacgttcccatcacatgtgtgtcttct
gttcctttcctatcacagtagaaagcctgttttccatcatttcgtgcaat
gtttgcaatcaattatgatttcttgcctctctacctcttgccctactgca
atatcacctcctgtaaaatca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_68124200_68125111
seq2: B6Ng01-284C09.b_47_957

seq1  GAATTCCTCTCAGATATCTTGTTATCTGTGTGAGGCTTTGATACTGTGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCTCAGATATCTTGTTATCTGTGTGAGGCTTTGATACTGTGGG  50

seq1  AGCGGTCTCTTCATGTGGTCCAGCAGTTCATAGATGGAGTAAATGTTGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGGTCTCTTCATGTGGTCCAGCAGTTCATAGATGGAGTAAATGTTGAG  100

seq1  GTGGCTCACTCAAAGCCCTGGAGCTGGGCCTGGGTGACAGCTGTATTATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCTCACTCAAAGCCCTGGAGCTGGGCCTGGGTGACAGCTGTATTATT  150

seq1  CAGATTGCCAGTTTTCCTGTGCCCATGCTTCCAAGGCCAGCTCTCAAATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATTGCCAGTTTTCCTGTGCCCATGCTTCCAAGGCCAGCTCTCAAATC  200

seq1  TTTGCCCAGGCAAGGGACATGGGTAGCTCTCTTGTTTGAGGGAGATGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCCAGGCAAGGGACATGGGTAGCTCTCTTGTTTGAGGGAGATGGAA  250

seq1  AAAGGTGGGACTGGCTCTCATACGCTTACACTATCAGGGCCAGCTCTCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTGGGACTGGCTCTCATACGCTTACACTATCAGGGCCAGCTCTCCA  300

seq1  ACACTGTCCAGGCAAGGGGGCTGGGCCAGCTTGCCCACATACTGCAGGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGTCCAGGCAAGGGGGCTGGGCCAGCTTGCCCACATACTGCAGGTG  350

seq1  GTAAGGGGTACACGGGTGTCAGCTTGCTTTCTTATACACTCTACTCCTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGGGGTACACGGGTGTCAGCTTGCTTTCTTATACACTCTACTCCTGG  400

seq1  TACCAATTTGAGTCTTAGGATTTTGCTTGCTGTGATAAAAGACCACAAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAATTTGAGTCTTAGGATTTTGCTTGCTGTGATAAAAGACCACAAGC  450

seq1  AAAAGCAACTTGGGGACAGAAAGGGTTTATTTTAGCTTACAGTTCCATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCAACTTGGGGACAGAAAGGGTTTATTTTAGCTTACAGTTCCATAT  500

seq1  CACAAACCACCATTGAAGGACATCAGGGTAGGAAATCAAGGCAGGAATCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAACCACCATTGAAGGACATCAGGGTAGGAAATCAAGGCAGGAATCT  550

seq1  GAAAGCAGGAACTGAAGCAGAAGTCATGGAGGACTGCTGCTCACTGCATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGCAGGAACTGAAGCAGAAGTCATGGAGGACTGCTGCTCACTGCATT  600

seq1  TCTAGGTAGCCTGCTCAGCCTTCTTTATTAAGAAGTTCAGGACCTGCCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGTAGCCTGCTCAGCCTTCTTTATTAAGAAGTTCAGGACCTGCCTA  650

seq1  GGGGTGGCACCACCCATAATGGGTTGGGTCCTCCCCCATCAATAATCAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTGGCACCACCCATAATGGGTTGGGTCCTCCCCCATCAATAATCAAG  700

seq1  CAAATGCATTACAGGCTTGCCCACAGAGCAATCTGGTGTATATATTTTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGCATTACAGGCTTGCCCACAGAGCAATCTGGTGTATATATTTTCT  750

seq1  CCATTGAGGTTCCTTTCTCCCACGCTTATGTCAAGTTGATGAAATGCTAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTGAGGTTCCTTTCTCCCACGCTTATGTCAAGTTGATGAAATGCTAG  800

seq1  CCAGTACACACACTTTCAGATTTGTTTTCACTGTGGGAGTATTGTACCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTACACACACTTTCAGATTTGTTTTCACTGTGGGAGTATTGTACCTG  850

seq1  CATGTAGATATGTAGAACATATGCATGTCTGGTGTTCTTGAAGGTTAGAA  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CATGTAGATATGTAGAACATATGCATGTCTGGTGTTCTTGAAGG-TAGAA  899

seq1  GAAGGCATCAGA  912
      ||||||||||||
seq2  GAAGGCATCAGA  911

seq1: chr15_68301518_68302530
seq2: B6Ng01-284C09.g_71_1091 (reverse)

seq1  TGATTTTACA-GAGATGATATTGCAGTAGGGCAAGA-GTAGAGA-GCAAG  47
      |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
seq2  TGATTTTACAGGAGGTGATATTGCAGTAGGGCAAGAGGTAGAGAGGCAAG  50

seq1  AAATCATAAATTGATTGCAAACATTGCACGAAATGATGGAAAACA-GCTT  96
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AAATCAT-AATTGATTGCAAACATTGCACGAAATGATGGAAAACAGGCTT  99

seq1  TCTACTGTGATAGG-AAGGAACAG-AGACCCACATGTGATGGGAACGTTT  144
      |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||
seq2  TCTACTGTGATAGGAAAGGAACAGAAGACACACATGTGATGGGAACGTTT  149

seq1  TCTTAGTGTCCATGATATAGTGGGAACAGTCACAAAATTCCAAGATG-AA  193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TCTTAGTGTCCATGATATAGTGGGAACAGTCACAAAATTCCAAGATGAAA  199

seq1  GTGTCTTCCAGGCAGAATCCAGCATCATGCATAA-GGAATACGGGGTATC  242
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GTGTCTTCCAGGCAGAATCCAGCATCATGCATAAGGGAATACGGGGTATC  249

seq1  CACAGGCCTCTGAATGCCTTCATTTC-TTCCCAGCTCTTCAGTTAGCAAG  291
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGCCTCTGAATGCCTTCATTTCTTTCCCAGCTCTTCAGTTAGCAAG  299

seq1  CACTTACCCACACCCTCCCAGATCTCACACACTCAGAGACCTGCTTCAGA  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTACCCACACCCTCCCAGATCTCACACACTCAGAGACCTGCTTCAGA  349

seq1  GAAGCCCTATCTAACTGCTATCAATGTGGTATGAATACTGGTATGAGTCT  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCCCTATCTAACTGCTATCAATGTGGTATGAATACTGGTATGAGTCT  399

seq1  TATACTGCGATTCCTCATTCCCCTTGTGGCTTAGTTTATGTGCAGAAGGT  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACTGCGATTCCTCATTCCCCTTGTGGCTTAGTTTATGTGCAGAAGGT  449

seq1  CATGACTAAGAACAGTCTGCAGGAGATATGGAGCTGGCTCGGGCAGTAAA  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGACTAAGAACAGTCTGCAGGAGATATGGAGCTGGCTCGGGCAGTAAA  499

seq1  GTCCCTACTATGCAAGACCTGAGTTGGGATCCTCAACACCTATATAAAAG  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCTACTATGCAAGACCTGAGTTGGGATCCTCAACACCTATATAAAAG  549

seq1  CCAGGTATGCCTGTATGCACCTAATCCAGGTGCTGAGGTTAGGGGGCAGA  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTATGCCTGTATGCACCTAATCCAGGTGCTGAGGTTAGGGGGCAGA  599

seq1  TCCTTGGAGTTCATTGGCAAGCCAGCATAGCCAAATCTGTAAACTCCATG  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGGAGTTCATTGGCAAGCCAGCATAGCCAAATCTGTAAACTCCATG  649

seq1  TTCAATGAGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAATGATCACTTGTCTT  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATGAGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAATGATCACTTGTCTT  699

seq1  CATGCTCCTCATCTAATAACTGGCCTAGCTAGACATCAAGGAATTCCTTC  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTCCTCATCTAATAACTGGCCTAGCTAGACATCAAGGAATTCCTTC  749

seq1  TTCCTCCCATCTTGCTCTATGCATGTAGAAGCATTGGTGAGTTATGCACA  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCCCATCTTGCTCTATGCATGTAGAAGCATTGGTGAGTTATGCACA  799

seq1  GCCTGGCAGACTCATACTATGGACTAGTTCTGCGGGATGCTCTTGACCAT  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGCAGACTCATACTATGGACTAGTTCTGCGGGATGCTCTTGACCAT  849

seq1  GGGTACCCATTTCAGGTGGATGCTTAACTATGCCCAGCCACCTTAATATA  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTACCCATTTCAGGTGGATGCTTAACTATGCCCAGCCACCTTAATATA  899

seq1  CTTAAAATTCCTTGAACCTGGAAAAGCACTTTTGTCTGAACACCCCACTG  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAAATTCCTTGAACCTGGAAAAGCACTTTTGTCTGAACACCCCACTG  949

seq1  ACCTTCCAAGCCTAATTCTCAGTTAGTTCCGCCACTTAGATAATCGATGA  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTCCAAGCCTAATTCTCAGTTAGTTCCGCCACTTAGATAATCGATGA  999

seq1  AAAGAATTCAGATCAGGAATTC  1013
      ||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAATTCAGATCAGGAATTC  1021