BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-284E03
Chromosome15 (Build37)
Map Location 57,038,489 - 57,185,315
singlet/doubletdoublet
Overlap geneBC026439
Upstream geneHas2, EG594843, LOC435442, LOC100040067, LOC100039984
Downstream geneZhx2, Derl1, Wdr67, BC030396, 9130401M01Rik, Zhx1, Atad2, LOC665244, 2410187C16Rik, Fbxo32, 8230402K04Rik, Anxa13
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-284E03.bB6Ng01-284E03.g
ACCGA083006GA083007
length1,101975
definitionB6Ng01-284E03.b B6Ng01-284E03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(57,038,489 - 57,039,589)(57,184,346 - 57,185,315)
sequence
gaattctctctgatgacaaatgaactaggaaccaatctgagtgtagcaga
atatcgttaggaataattttctaccctagttctctgggctatccagcctc
tgggtcatggctctccaaaaatgtcagcttgccattgtccatctttagag
ccatgccccctagatgcatagatattcctgctactgaattggaaccatac
atcacctattgcccacctttcctcttcccctcttctacatttcaaagata
tatgtgagtctatggtatattgaagaagaatggactctcttgctttgcga
ttcacataggttgtaaaacgcacaaaccatctcttttctttagacactcc
aatactgtcaggaagacaagaagagaatattcagcattctctactaacat
atctgtagtctgcatgtcctgataagtcacacatggaaactgtagaactg
aatacatttcagtgaacatcttgttgtatctacatgtttgagtctgtttc
ttgtatgaaaatgccaggggtggggggactatctgtgatctcagatttaa
atagagcaagatttctaaaatacatttaactgtgagcattggaagaaaga
gggggaataaaagtcaaaattcctttcagctgtaaatacattctgttctt
tgtaagaagtctatgagattatgcatcaaacttcaatgagaccatttact
accaccccataaaagagaatgatgaagttcccttccagataaatatctcc
ctaatgtaaacccaaactaattcctttacaatatgtgtgttttttctcta
ttgcctacttaaatacaatcttatttcctgtcaattctgactactggcat
cattaatgtagttctgaaaattacttacctagattcatgtctttaacttg
tgtggctttgggaaattgagaaatgacttaagagcactgactactcttcc
agaagttctgagttcaattccaacagccacatgatggctcacaaccatct
gtaaaggatccaatgccttcttctggtgttctgaagaacagcacagtgac
agtggactcacgttaaataaaataaatttttatggttcttatgccagagc
t
gaattctttctatggtttctgtgatgacttttgatatgtacttttgataa
atgctcaaacagttgagactgtgggcactgatggaaatagactaaattaa
ttgtgtattataaatgttgatgagcctttgggggccaggagtagaatatt
atagttctaatagttagctatatgctcaaacaaatatatgacaacaaata
tgtgactccatttggttggtagtgtaacctttaataggtttgatgtagtg
ggatggagtgaggtcatttggcttgtttcctatgtagataccaaagtcct
gacccattctctgtctgtttcaaggctactatgaaatgagaatattcctc
tgacccctgcattcacaagccactcactgcattcattctaggcaagaggc
aaaagacaacaagaaattgaaacctcccaaactgtaagccaaaagagagc
tccatcttgccaagttgtttaaggtattttgctataataatgtaaacctg
aattaacatttagtgtatttatctctattttacaaatgagtgagtgaagt
ccagctgtgttaggtgcatttcatgaggccacctctgatctggtgccaaa
gttgggattcaaatccagccttcatgttgaggctttgtaaattgttcagt
gttgactttcttggggctctgtctctgcctatctccaagagggaaggaat
agctccctatttgaaataatctgcaaacatttgtgttagtatggcccaat
atccctactactatggtcatacctgttaatgacagtaaaccaatgtaatt
tgtttgaaagtaaggatccatgactccagatacatatgcagttgaggatg
gccttatctggcatcagggggaagggaaagcccttggtcttgtgaggctt
gatgtccccagcatatggggtatgctagagcagtgatgtaggagtgaagt
atgttggttggaggagcatcctcat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_57038489_57039589
seq2: B6Ng01-284E03.b_45_1145

seq1  GAATTCTCTCTGATGACAAATGAACTAGGAACCAATCTGAGTGTAGCAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTCTGATGACAAATGAACTAGGAACCAATCTGAGTGTAGCAGA  50

seq1  ATATCGTTAGGAATAATTTTCTACCCTAGTTCTCTGGGCTATCCAGCCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCGTTAGGAATAATTTTCTACCCTAGTTCTCTGGGCTATCCAGCCTC  100

seq1  TGGGTCATGGCTCTCCAAAAATGTCAGCTTGCCATTGTCCATCTTTAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTCATGGCTCTCCAAAAATGTCAGCTTGCCATTGTCCATCTTTAGAG  150

seq1  CCATGCCCCCTAGATGCATAGATATTCCTGCTACTGAATTGGAACCATAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCCCCCTAGATGCATAGATATTCCTGCTACTGAATTGGAACCATAC  200

seq1  ATCACCTATTGCCCACCTTTCCTCTTCCCCTCTTCTACATTTCAAAGATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACCTATTGCCCACCTTTCCTCTTCCCCTCTTCTACATTTCAAAGATA  250

seq1  TATGTGAGTCTATGGTATATTGAAGAAGAATGGACTCTCTTGCTTTGCGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGAGTCTATGGTATATTGAAGAAGAATGGACTCTCTTGCTTTGCGA  300

seq1  TTCACATAGGTTGTAAAACGCACAAACCATCTCTTTTCTTTAGACACTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACATAGGTTGTAAAACGCACAAACCATCTCTTTTCTTTAGACACTCC  350

seq1  AATACTGTCAGGAAGACAAGAAGAGAATATTCAGCATTCTCTACTAACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACTGTCAGGAAGACAAGAAGAGAATATTCAGCATTCTCTACTAACAT  400

seq1  ATCTGTAGTCTGCATGTCCTGATAAGTCACACATGGAAACTGTAGAACTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTAGTCTGCATGTCCTGATAAGTCACACATGGAAACTGTAGAACTG  450

seq1  AATACATTTCAGTGAACATCTTGTTGTATCTACATGTTTGAGTCTGTTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACATTTCAGTGAACATCTTGTTGTATCTACATGTTTGAGTCTGTTTC  500

seq1  TTGTATGAAAATGCCAGGGGTGGGGGGACTATCTGTGATCTCAGATTTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATGAAAATGCCAGGGGTGGGGGGACTATCTGTGATCTCAGATTTAA  550

seq1  ATAGAGCAAGATTTCTAAAATACATTTAACTGTGAGCATTGGAAGAAAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGCAAGATTTCTAAAATACATTTAACTGTGAGCATTGGAAGAAAGA  600

seq1  GGGGGAATAAAAGTCAAAATTCCTTTCAGCTGTAAATACATTCTGTTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGAATAAAAGTCAAAATTCCTTTCAGCTGTAAATACATTCTGTTCTT  650

seq1  TGTAAGAAGTCTATGAGATTATGCATCAAACTTCAATGAGACCATTTACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGAAGTCTATGAGATTATGCATCAAACTTCAATGAGACCATTTACT  700

seq1  ACCACCCCATAAAAGAGAATGATGAAGTTCCCTTCCAGATAAATATCTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACCCCATAAAAGAGAATGATGAAGTTCCCTTCCAGATAAATATCTCC  750

seq1  CTAATGTAAACCCAAACTAATTCCTTTACAATATGTGTGTTTTTTCTCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATGTAAACCCAAACTAATTCCTTTACAATATGTGTGTTTTTTCTCTA  800

seq1  TTGCCTACTTAAATACAATCTTATTTCCTGTCAATTCTGACTACTGGCAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTACTTAAATACAATCTTATTTCCTGTCAATTCTGACTACTGGCAT  850

seq1  CATTAATGTAGTTCTGAAAATTACTTACCTAGATTCATGTCTTTAACTTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAATGTAGTTCTGAAAATTACTTACCTAGATTCATGTCTTTAACTTG  900

seq1  TGTGGCTTTGGGAAATTGAGAAATGACTTAAGAGCACTGACTACTCTTCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCTTTGGGAAATTGAGAAATGACTTAAGAGCACTGACTACTCTTCC  950

seq1  AGAAGTTCTGAGTTCAATTCCAACAGCCACATGATGGCTCACAACCATCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTTCTGAGTTCAATTCCAACAGCCACATGATGGCTCACAACCATCT  1000

seq1  GTAAAGGGATCCAATGCCCTCTTCTGGTGTTCTGAAG-ACAGCAACAGTG  1049
      ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||
seq2  GTAAA-GGATCCAATGCCTTCTTCTGGTGTTCTGAAGAACAGC-ACAGTG  1048

seq1  ACAGTGGACTCACGTAAAATAAAAATAAATTTTATGGT--CTATGCCCAG  1097
      ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||   |||| ||||
seq2  ACAGTGGACTCACGTTAAATAAAATAAATTTTTATGGTTCTTATG-CCAG  1097

seq1  AGCT  1101
      ||||
seq2  AGCT  1101

seq1: chr15_57184346_57185315
seq2: B6Ng01-284E03.g_67_1041 (reverse)

seq1  ATGAGGATGCTCCTCC-ACCAACTTAC-TCACTCCTACATCACTGCTCTA  48
      |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGGATGCTCCTCCAACCAACATACTTCACTCCTACATCACTGCTCTA  50

seq1  GCAT-CCCCTTATGCT-GGGACATCAAGCCTCCACAAGACCAAGGGCTTT  96
      |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GCATACCCCATATGCTGGGGACATCAAGCCT-CACAAGACCAAGGGCTTT  99

seq1  CCC-TCCCCCTGATGCCAGATAAGGCCATCCTCAACTGCATATGTATCTG  145
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTCCCCCTGATGCCAGATAAGGCCATCCTCAACTGCATATGTATCTG  149

seq1  GAGTCATGGATCCTTACTTTCAAACAAATTACATTGGTTTACTGTCATTA  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCATGGATCCTTACTTTCAAACAAATTACATTGGTTTACTGTCATTA  199

seq1  ACAGGTATGACCATAGTAGTAGGGATATT-GGCCATACTAACACAAATGT  244
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGTATGACCATAGTAGTAGGGATATTGGGCCATACTAACACAAATGT  249

seq1  TTGCAGATTATTTCAAATAGGGAGCTATTCCTTCCCTCTTGGAGATAGGC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGATTATTTCAAATAGGGAGCTATTCCTTCCCTCTTGGAGATAGGC  299

seq1  AGAGACAGAGCCCCAAGAAAGTCAACACTGAACAATTTACAAAGCCTCAA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACAGAGCCCCAAGAAAGTCAACACTGAACAATTTACAAAGCCTCAA  349

seq1  CATGAAGGCTGGATTTGAATCCCAACTTTGGCACCAGATCAGAGGTGGCC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAAGGCTGGATTTGAATCCCAACTTTGGCACCAGATCAGAGGTGGCC  399

seq1  TCATGAAATGCACCTAACACAGCTGGACTTCACTCACTCATTTGTAAAAT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGAAATGCACCTAACACAGCTGGACTTCACTCACTCATTTGTAAAAT  449

seq1  AGAGATAAATACACTAAATGTTAATTCAGGTTTACATTATTATAGCAAAA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATAAATACACTAAATGTTAATTCAGGTTTACATTATTATAGCAAAA  499

seq1  TACCTTAAACAACTTGGCAAGATGGAGCTCTCTTTTGGCTTACAGTTTGG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTTAAACAACTTGGCAAGATGGAGCTCTCTTTTGGCTTACAGTTTGG  549

seq1  GAGGTTTCAATTTCTTGTTGTCTTTTGCCTCTTGCCTAGAATGAATGCAG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTTTCAATTTCTTGTTGTCTTTTGCCTCTTGCCTAGAATGAATGCAG  599

seq1  TGAGTGGCTTGTGAATGCAGGGGTCAGAGGAATATTCTCATTTCATAGTA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGGCTTGTGAATGCAGGGGTCAGAGGAATATTCTCATTTCATAGTA  649

seq1  GCCTTGAAACAGACAGAGAATGGGTCAGGACTTTGGTATCTACATAGGAA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGAAACAGACAGAGAATGGGTCAGGACTTTGGTATCTACATAGGAA  699

seq1  ACAAGCCAAATGACCTCACTCCATCCCACTACATCAAACCTATTAAAGGT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGCCAAATGACCTCACTCCATCCCACTACATCAAACCTATTAAAGGT  749

seq1  TACACTACCAACCAAATGGAGTCACATATTTGTTGTCATATATTTGTTTG  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTACCAACCAAATGGAGTCACATATTTGTTGTCATATATTTGTTTG  799

seq1  AGCATATAGCTAACTATTAGAACTATAATATTCTACTCCTGGCCCCCAAA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATATAGCTAACTATTAGAACTATAATATTCTACTCCTGGCCCCCAAA  849

seq1  GGCTCATCAACATTTATAATACACAATTAATTTAGTCTATTTCCATCAGT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCATCAACATTTATAATACACAATTAATTTAGTCTATTTCCATCAGT  899

seq1  GCCCACAGTCTCAACTGTTTGAGCATTTATCAAAAGTACATATCAAAAGT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCACAGTCTCAACTGTTTGAGCATTTATCAAAAGTACATATCAAAAGT  949

seq1  CATCACAGAAACCATAGAAAGAATTC  970
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACAGAAACCATAGAAAGAATTC  975