BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-285D10
Chromosome15 (Build37)
Map Location 3,142,153 - 3,331,660
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG666167, Sepp1, LOC100039139, Ghr
Upstream geneLOC674207, LOC666163
Downstream geneLOC223278, Fbxo4, AW549877, LOC100039196, Oxct1, Plcxd3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-285D10.bB6Ng01-285D10.g
ACCGA083720GA083721
length9861,140
definitionB6Ng01-285D10.b B6Ng01-285D10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(3,330,687 - 3,331,660)(3,142,153 - 3,143,289)
sequence
gaattcttcagagtctagttgtttataaaggattcagtcagcgattcagt
aagtaaacatgggttctggtgattgtttttaaggagacagtgtttatgtt
ggctctctctagaagccaaatgagtggtaaactctccctgattcacaggc
agcactaatctccaaatgatgccatgaagcctagtggtgcactccatccc
ccctctttgctttcagaaacagcaggcaggacgaattgtgtactttatac
aaaggaaatggaggtagagagaagacagcttactgggcactctcagtgga
ccaatagagagtacagtgtatccattcttggtttaacaaaactaaactag
tgtagtgtagaggtttgcctgcaatcatggctcttgggaagttgcagcat
gaaggtcagtagttcaagaccagcctcagttacataacaaagccaaggtg
aatctgagctatgtgagaccctgcctcaggaagaaataaacttagacaat
tcttcaaacagccaagtcaatattcacttgtcagtgacacttctccaagc
tcaaacgcccaaataaagactataatcatcacaatgtacatgttatcact
gttacacagtggctgttttcacaatgagtagctggaaagaagaagggctc
tttagaaaaagataaatatccagtcgtaacatttctaaaacgatccttca
atttctaacagtgttctaagccataagtggcaaatctacatttcctacct
acatacaacaaatcttccccctctcctcacgtttcagccactattagtaa
gacctctgtaacaaaggtctttttgatttacattatgtagtatgttcttc
tgtttcttggggcagggactttttttttttaagatttatttattattaca
gttgtacataaagtacactgtagctgacttcagatgcaaccaaaaaggag
ggcgtcaaatctcattaaagggtgggtggggtgagg
gaattcacttttggatatttgaactaacttttggggttggaggaaatgga
ggttcctttggacctgacggtcctatgcttatgcaaggaagcctagtgat
actggagtcccaatcattgattgcctaaagagaagaattactcaatgaag
gcaatttaaactttggttcaatgttgaggaaagtaaagaaattcaatgcc
ttctgggatagactggagctacagtggagaatctgaagtactactagacc
agagtgactagactagagtgaggagagctctttctcggaacactcgacaa
atatccatctgctccatgtgtgtggctggggcttgatctcagggcctgtc
ttgtgctcactaagcctcagcctcaccactgagatgccttcccacattct
aactcttattttgataccacatctcactgtgcagccctggctgtcttgga
actcactatgcatatctgcctttgccatgtcttcctcccaaagtctgatt
tataaatgcttgtttaaaaattgatggactttacagtagaaaatggattt
gggcttggggtgttggtgcctgtcttgatcccagcactcaggaggcagag
gttagtggatctctgagagtttgatgccagcctggtctacagagtgagtt
ccagtccagtcggcttcatagaatgaccatgcttcagacagaatgaaaca
aaaccaaaaaagaatggattttaattgagttcccaagtcataaaacagat
ttgaatttaggcacaatcaaggtgtctatttgtgtgtgtatacatttgcc
tgtgcacacatgtatgaagaacacatgttgacatcagttatcttcctatg
ttgatgtctgcctgccttttgttttttcttttttgagatcatgtctttaa
ttgaactgaaagttggccattggcctagggtggcctgtgagctctcagaa
ttatgcctctctcagctccttttttccagagagccacagctacagtggag
cccacctcattacttggggttctaggatataaaacaggattcttggatca
tccttcactgagccagcatcagaccttctattttaagtcctcctgaatat
gaaaagattctttctctcagtcagctccacccattttgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_3330687_3331660
seq2: B6Ng01-285D10.b_44_1028 (reverse)

seq1  CTCACC---ACCACCC-TTAATGAGATCTGACGCCCTC--TTTTGG-TGC  43
      ||||||    |||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||
seq2  CTCACCCCACCCACCCTTTAATGAGATTTGACGCCCTCCTTTTTGGTTGC  50

seq1  ATCTGAAGTCAGCTACAGTGTAC-TTATGTAC-ACTGTAATAATAAATAA  91
      ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
seq2  ATCTGAAGTCAGCTACAGTGTACTTTATGTACAACTGTAATAATAAATAA  100

seq1  ATCTT--AAAAAAAAAGTCCCTGCCCCAAGAAACAGAAGAACATACTACA  139
      |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTAAAAAAAAAAAGTCCCTGCCCCAAGAAACAGAAGAACATACTACA  150

seq1  TAATGTAAATCAAAAAGACCTTTGTTACAGAGGTCTTACTAATAGTGGCT  189
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTAAATCAAAAAGACCTTTGTTACAGAGGTCTTACTAATAGTGGCT  200

seq1  GAAACGTGAGGAGAGGGGGAAGATTTGTTGTATGTAGGTAGGAAATGTAG  239
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACGTGAGGAGAGGGGGAAGATTTGTTGTATGTAGGTAGGAAATGTAG  250

seq1  ATTTGCCACTTATGGCTTAGAACACTGTTAGAAATTGAAGGATCGTTTTA  289
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGCCACTTATGGCTTAGAACACTGTTAGAAATTGAAGGATCGTTTTA  300

seq1  GAAATGTTACGACTGGATATTTATCTTTTTCTAAAGAGCCCTTCTTCTTT  339
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGTTACGACTGGATATTTATCTTTTTCTAAAGAGCCCTTCTTCTTT  350

seq1  CCAGCTACTCATTGTGAAAACAGCCACTGTGTAACAGTGATAACATGTAC  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCTACTCATTGTGAAAACAGCCACTGTGTAACAGTGATAACATGTAC  400

seq1  ATTGTGATGATTATAGTCTTTATTTGGGCGTTTGAGCTTGGAGAAGTGTC  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTGATGATTATAGTCTTTATTTGGGCGTTTGAGCTTGGAGAAGTGTC  450

seq1  ACTGACAAGTGAATATTGACTTGGCTGTTTGAAGAATTGTCTAAGTTTAT  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGACAAGTGAATATTGACTTGGCTGTTTGAAGAATTGTCTAAGTTTAT  500

seq1  TTCTTCCTGAGGCAGGGTCTCACATAGCTCAGATTCACCTTGGCTTTGTT  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCCTGAGGCAGGGTCTCACATAGCTCAGATTCACCTTGGCTTTGTT  550

seq1  ATGTAACTGAGGCTGGTCTTGAACTACTGACCTTCATGCTGCAACTTCCC  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAACTGAGGCTGGTCTTGAACTACTGACCTTCATGCTGCAACTTCCC  600

seq1  AAGAGCCATGATTGCAGGCAAACCTCTACACTACACTAGTTTAGTTTTGT  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCCATGATTGCAGGCAAACCTCTACACTACACTAGTTTAGTTTTGT  650

seq1  TAAACCAAGAATGGATACACTGTACTCTCTATTGGTCCACTGAGAGTGCC  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACCAAGAATGGATACACTGTACTCTCTATTGGTCCACTGAGAGTGCC  700

seq1  CAGTAAGCTGTCTTCTCTCTACCTCCATTTCCTTTGTATAAAGTACACAA  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAGCTGTCTTCTCTCTACCTCCATTTCCTTTGTATAAAGTACACAA  750

seq1  TTCGTCCTGCCTGCTGTTTCTGAAAGCAAAGAGGGGGGATGGAGTGCACC  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGTCCTGCCTGCTGTTTCTGAAAGCAAAGAGGGGGGATGGAGTGCACC  800

seq1  ACTAGGCTTCATGGCATCATTTGGAGATTAGTGCTGCCTGTGAATCAGGG  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGGCTTCATGGCATCATTTGGAGATTAGTGCTGCCTGTGAATCAGGG  850

seq1  AGAGTTTACCACTCATTTGGCTTCTAGAGAGAGCCAACATAAACACTGTC  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTTACCACTCATTTGGCTTCTAGAGAGAGCCAACATAAACACTGTC  900

seq1  TCCTTAAAAACAATCACCAGAACCCATGTTTACTTACTGAATCGCTGACT  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTAAAAACAATCACCAGAACCCATGTTTACTTACTGAATCGCTGACT  950

seq1  GAATCCTTTATAAACAACTAGACTCTGAAGAATTC  974
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCCTTTATAAACAACTAGACTCTGAAGAATTC  985

seq1: chr15_3142153_3143289
seq2: B6Ng01-285D10.g_69_1208

seq1  GAATTCACTTTTGGATATTTGAACTAACTTTTGGGGTTGGAGGAAATGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTTTGGATATTTGAACTAACTTTTGGGGTTGGAGGAAATGGA  50

seq1  GGTTCCTTTGGACCTGACGGTCCTATGCTTATGCAAGGAAGCCTAGTGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCCTTTGGACCTGACGGTCCTATGCTTATGCAAGGAAGCCTAGTGAT  100

seq1  ACTGGAGTCCCAATCATTGATTGCCTAAAGAGAAGAATTACTCAATGAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGAGTCCCAATCATTGATTGCCTAAAGAGAAGAATTACTCAATGAAG  150

seq1  GCAATTTAAACTTTGGTTCAATGTTGAGGAAAGTAAAGAAATTCAATGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATTTAAACTTTGGTTCAATGTTGAGGAAAGTAAAGAAATTCAATGCC  200

seq1  TTCTGGGATAGACTGGAGCTACAGTGGAGAATCTGAAGTACTACTAGACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGGATAGACTGGAGCTACAGTGGAGAATCTGAAGTACTACTAGACC  250

seq1  AGAGTGACTAGACTAGAGTGAGGAGAGCTCTTTCTCGGAACACTCGACAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGACTAGACTAGAGTGAGGAGAGCTCTTTCTCGGAACACTCGACAA  300

seq1  ATATCCATCTGCTCCATGTGTGTGGCTGGGGCTTGATCTCAGGGCCTGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCATCTGCTCCATGTGTGTGGCTGGGGCTTGATCTCAGGGCCTGTC  350

seq1  TTGTGCTCACTAAGCCTCAGCCTCACCACTGAGATGCCTTCCCACATTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGCTCACTAAGCCTCAGCCTCACCACTGAGATGCCTTCCCACATTCT  400

seq1  AACTCTTATTTTGATACCACATCTCACTGTGCAGCCCTGGCTGTCTTGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTTATTTTGATACCACATCTCACTGTGCAGCCCTGGCTGTCTTGGA  450

seq1  ACTCACTATGCATATCTGCCTTTGCCATGTCTTCCTCCCAAAGTCTGATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACTATGCATATCTGCCTTTGCCATGTCTTCCTCCCAAAGTCTGATT  500

seq1  TATAAATGCTTGTTTAAAAATTGATGGACTTTACAGTAGAAAATGGATTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAATGCTTGTTTAAAAATTGATGGACTTTACAGTAGAAAATGGATTT  550

seq1  GGGCTTGGGGTGTTGGTGCCTGTCTTGATCCCAGCACTCAGGAGGCAGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTTGGGGTGTTGGTGCCTGTCTTGATCCCAGCACTCAGGAGGCAGAG  600

seq1  GTTAGTGGATCTCTGAGAGTTTGATGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGTGGATCTCTGAGAGTTTGATGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTT  650

seq1  CCAGTCCAGTCGGCTTCATAGAATGACCATGCTTCAGACAGAATGAAACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTCCAGTCGGCTTCATAGAATGACCATGCTTCAGACAGAATGAAACA  700

seq1  AAACCAAAAAAGAATGGATTTTAATTGAGTTCCCAAGTCATAAAACAGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCAAAAAAGAATGGATTTTAATTGAGTTCCCAAGTCATAAAACAGAT  750

seq1  TTGAATTTAGGCACAATCAAGGTGTCTATTTGTGTGTGTATACATTTGCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAATTTAGGCACAATCAAGGTGTCTATTTGTGTGTGTATACATTTGCC  800

seq1  TGTGCACACATGTATGAAGAACACATGTTGACATCAGTTATCTTCCTATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCACACATGTATGAAGAACACATGTTGACATCAGTTATCTTCCTATG  850

seq1  TTGATGTCTGCCTGCCTTTTGTTTTTTC-TTTTTGAGATCATGTCTTTAA  899
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGTCTGCCTGCCTTTTGTTTTTTCTTTTTTGAGATCATGTCTTTAA  900

seq1  TTGAACTGAAAGTT-GCCATTGG-CTAGGGTGG-CTGTGAGCTCTCAGAA  946
      |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TTGAACTGAAAGTTGGCCATTGGCCTAGGGTGGCCTGTGAGCTCTCAGAA  950

seq1  -TATGCCTCTCTCAG--CCCTTTTTCCAGAGAGCCACAGCTACAGT-GAG  992
       ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTATGCCTCTCTCAGCTCCTTTTTTCCAGAGAGCCACAGCTACAGTGGAG  1000

seq1  CCCACCTCATTACTT-GGGTTCTAGGGATAT-AAACAGATTTTCTGGATT  1040
      ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||  |||| |
seq2  CCCACCTCATTACTTGGGGTTCTA-GGATATAAAACAGGATTCTTGGA-T  1048

seq1  CATCCTTCACTGAGCCAGCAATCAAGACCTCTAATTTTAAGT-CTTCTGA  1089
      ||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| || ||||
seq2  CATCCTTCACTGAGCCAGC-ATC-AGACCTTCTATTTTAAGTCCTCCTGA  1096

seq1  AATTATGAAAAGATTTTTTTCCTTCTCAGTCAGCT-CACACATTTTGTG  1137
      |  |||||||||||| |||    |||||||||||| ||| |||||||||
seq2  A--TATGAAAAGATTCTTT---CTCTCAGTCAGCTCCACCCATTTTGTG  1140