BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-286B20
Chromosome15 (Build37)
Map Location 38,766,669 - 38,937,120
singlet/doubletdoublet
Overlap geneBaalc, TOB3L, Fzd6, LOC636952, Cthrc1, Slc25a32
Upstream geneLOC667534, Rrm2b, LOC100041478, Edd1, Odf1, LOC382986, LOC667563, Klf10, Azin1, Siah1-ps2, Atp6v1c1
Downstream geneWdsof1, LOC671215, Rims2, Tm7sf4, Dpys, Lrp12, LOC100039130, LOC670013
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-286B20.bB6Ng01-286B20.g
ACCGA084392GA084393
length1,025953
definitionB6Ng01-286B20.b B6Ng01-286B20.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(38,766,669 - 38,767,694)(38,936,169 - 38,937,120)
sequence
gaattccttttcacatcattaagttgctttcagtggctttgatcagcaaa
ccagtttcaaatttgtctccaaagttcattacccgaggagacttgtagag
tcaatctttcagaatctcaggtttcttaaacatatagtggaaataaaata
atatccaaaggaacagacagatgggcctcctcttatagactgcgatacaa
agaacaatgggaaggagggacaaacatgatagctgggcccacaacacaat
gacctcattaagtggaatgctaatggagcccaaaggctagctggggaagg
gagatggaagggtcttgtattgtctactttgtgcatcagctgactttcag
gagacccagtcatcattgacagagtgcaaggcagtttggggtccacagaa
ccatgttcacgaggttgagtgttctagagaaggtccagatgtctgtctcc
taatccttctctccatatttgagacacagaatgtgttatagtggagagat
ggcagttacctggaaacagcttgatctacatgcttgttttccttgtgcca
cattctgccctcctcacccatcatttcaaagttgtgttttgcacttaaaa
gggtgctagctcttaggccctctaggctttggaatcctcccaacagcatc
atgaccattttataggcaagggaagtaaggcatgcactgtatggcacaga
tagtaccatatacgtgatggagatgaacctggtggatcagagcatcacaa
cgcagggcatggggccatagctcagtgggtaaagtgttttcctaacagca
caaacccttggagttaatccccagtgggcaatgggagtactgagaagatg
aaggtagtgaaagacctccgtggggatacccccacccgagtcacgagata
gcgtgagtgatttggggtgttgcctcacctgagtcagaacatgggggagt
cctcacgtgtggtcttttcagttggagggtcaaggttcaaagctgcattt
tacgatggtgagaaaacaacacgta
gaattcagaaaagttgaggtgttgagctgagcgctgtgatcaatggggtg
ctgacacacgaacgagctctgctttagttaaagccagtgctaactctgtg
tagctcatggtgatactgtacaacttcaggaatccccagggaccatgtta
gtgttcttgagcacttttttaacagctaaaatagattaggaaaaggtaac
aaaaccagttgtctgttagagattttgtaagttttacagtaggaacctga
aactgttttttaacatatatctcaatttcagtctgtaaattcaatcctat
aaaatgatctattgttatcatgtataagagattagttccagaatattacc
aaagtagaaaatgtctgtagaattgaatagcatagttctatatttatcct
cagctattctagattccagaatattccagattgtttgagatggcttggag
aagtgcatttgatgcataataaggtttaaatcaggaggagacggagctgg
gagcacctataagcacatataccagagatccctgttgggaagagaaagca
atgacctgattcctagaagagtttgagatacactcctcatagcttggttt
ttttgttgctgttttgttttgttttaaacccaccccaacatcttcatagc
ttatgatcttttagtagtcatcactatttcgaataactcctactgcattc
cccttaaaagaactgctgcaagtgtgttcctgagcagacacactcacctt
actgagtgtgaaagaacatagtccaaggcaccatgaccctgcagtagagg
agcacacgctgctgctgctgagcgtgcttctggctggacgttgtgtgtcc
taatcactgttgtagtgctgtgagaccaagttcagctctttacaaggaaa
gcattgaatctatacaaaactcagattgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_38766669_38767694
seq2: B6Ng01-286B20.b_46_1070

seq1  GAATTCCTTTTCACATCATTAAGTTGCTTTCAGTGGCTTTGATCAGCAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTTTCACATCATTAAGTTGCTTTCAGTGGCTTTGATCAGCAAA  50

seq1  CCAGTTTCAAATTTGTCTCCAAAGTTCATTACCCGAGGAGACTTGTAGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTTTCAAATTTGTCTCCAAAGTTCATTACCCGAGGAGACTTGTAGAG  100

seq1  TCAATCTTTCAGAATCTCAGGTTTCTTAAACATATAGTGGAAATAAAATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATCTTTCAGAATCTCAGGTTTCTTAAACATATAGTGGAAATAAAATA  150

seq1  ATATCCAAAGGAACAGACAGATGGGCCTCCTCTTATAGACTGCGATACAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCAAAGGAACAGACAGATGGGCCTCCTCTTATAGACTGCGATACAA  200

seq1  AGAACAATGGGAAGGAGGGACAAACATGATAGCTGGGCCCACAACACAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAATGGGAAGGAGGGACAAACATGATAGCTGGGCCCACAACACAAT  250

seq1  GACCTCATTAAGTGGAATGCTAATGGAGCCCAAAGGCTAGCTGGGGAAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTCATTAAGTGGAATGCTAATGGAGCCCAAAGGCTAGCTGGGGAAGG  300

seq1  GAGATGGAAGGGTCTTGTATTGTCTACTTTGTGCATCAGCTGACTTTCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGGAAGGGTCTTGTATTGTCTACTTTGTGCATCAGCTGACTTTCAG  350

seq1  GAGACCCAGTCATCATTGACAGAGTGCAAGGCAGTTTGGGGTCCACAGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACCCAGTCATCATTGACAGAGTGCAAGGCAGTTTGGGGTCCACAGAA  400

seq1  CCATGTTCACGAGGTTGAGTGTTCTAGAGAAGGTCCAGATGTCTGTCTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTTCACGAGGTTGAGTGTTCTAGAGAAGGTCCAGATGTCTGTCTCC  450

seq1  TAATCCTTCTCTCCATATTTGAGACACAGAATGTGTTATAGTGGAGAGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCCTTCTCTCCATATTTGAGACACAGAATGTGTTATAGTGGAGAGAT  500

seq1  GGCAGTTACCTGGAAACAGCTTGATCTACATGCTTGTTTTCCTTGTGCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGTTACCTGGAAACAGCTTGATCTACATGCTTGTTTTCCTTGTGCCA  550

seq1  CATTCTGCCCTCCTCACCCATCATTTCAAAGTTGTGTTTTGCACTTAAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTGCCCTCCTCACCCATCATTTCAAAGTTGTGTTTTGCACTTAAAA  600

seq1  GGGTGCTAGCTCTTAGGCCCTCTAGGCTTTGGAATCCTCCCAACAGCATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGCTAGCTCTTAGGCCCTCTAGGCTTTGGAATCCTCCCAACAGCATC  650

seq1  ATGACCATTTTATAGGCAAGGGAAGTAAGGCATGCACTGTATGGCACAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCATTTTATAGGCAAGGGAAGTAAGGCATGCACTGTATGGCACAGA  700

seq1  TAGTACCATATACGTGATGGAGATGAACCTGGTGGATCAGAGCATCACAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTACCATATACGTGATGGAGATGAACCTGGTGGATCAGAGCATCACAA  750

seq1  CGCAGGGCATGGGGCCATAGCTCAGTGGGTAAAGTGTTTTCCTAACAGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCAGGGCATGGGGCCATAGCTCAGTGGGTAAAGTGTTTTCCTAACAGCA  800

seq1  CAAACCCTTGGAGTTAATCCCCAGTGGGCAATGGGAGTACTGAGAAGATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCCTTGGAGTTAATCCCCAGTGGGCAATGGGAGTACTGAGAAGATG  850

seq1  AAGGTAGTGAAAGACCTCCGTGGGGATACCCCCACCCGAGTCACGAGATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTAGTGAAAGACCTCCGTGGGGATACCCCCACCCGAGTCACGAGATA  900

seq1  GCGTGAGTGATTTGGGGTGTTGCCTCACCTGAGTCAGAACATGGGGGAGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGTGAGTGATTTGGGGTGTTGCCTCACCTGAGTCAGAACATGGGGGAGT  950

seq1  CCTCACGTGTGGGTCTTTCAGTTGGAGGGTCAAAGTTCAAAGCTGCAATT  1000
      ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||
seq2  CCTCACGTGTGGTCTTTTCAGTTGGAGGGTCAAGGTTCAAAGCTGC-ATT  999

seq1  TTACGATGGTGAGAAAACAACACGTA  1026
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACGATGGTGAGAAAACAACACGTA  1025

seq1: chr15_38936169_38937120
seq2: B6Ng01-286B20.g_69_1021 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACACACACACACAATCTGAGTTTTGTATAGATTCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACAATCTGAGTTTTGTATAGATTCAA  50

seq1  TGCTTTCCTTTGTAAGAGCTG-ACTTGGTCTCACAGCACTACAACAGTGA  99
      ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTCCTTGTAAAGAGCTGAACTTGGTCTCACAGCACTACAACAGTGA  100

seq1  TTAGGACACACAACGTCCAGCCAGAAGCACGCTCAGCAGCAGCAGCGTGT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGACACACAACGTCCAGCCAGAAGCACGCTCAGCAGCAGCAGCGTGT  150

seq1  GCTCCTCTACTGCAGGGTCATGGTGCCTTGGACTATGTTCTTTCACACTC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTCTACTGCAGGGTCATGGTGCCTTGGACTATGTTCTTTCACACTC  200

seq1  AGTAAGGTGAGTGTGTCTGCTCAGGAACACACTTGCAGCAGTTCTTTTAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAGGTGAGTGTGTCTGCTCAGGAACACACTTGCAGCAGTTCTTTTAA  250

seq1  GGGGAATGCAGTAGGAGTTATTCGAAATAGTGATGACTACTAAAAGATCA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAATGCAGTAGGAGTTATTCGAAATAGTGATGACTACTAAAAGATCA  300

seq1  TAAGCTATGAAGATGTTGGGGTGGGTTTAAAACAAAACAAAACAGCAACA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCTATGAAGATGTTGGGGTGGGTTTAAAACAAAACAAAACAGCAACA  350

seq1  AAAAAACCAAGCTATGAGGAGTGTATCTCAAACTCTTCTAGGAATCAGGT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACCAAGCTATGAGGAGTGTATCTCAAACTCTTCTAGGAATCAGGT  400

seq1  CATTGCTTTCTCTTCCCAACAGGGATCTCTGGTATATGTGCTTATAGGTG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCTTTCTCTTCCCAACAGGGATCTCTGGTATATGTGCTTATAGGTG  450

seq1  CTCCCAGCTCCGTCTCCTCCTGATTTAAACCTTATTATGCATCAAATGCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCAGCTCCGTCTCCTCCTGATTTAAACCTTATTATGCATCAAATGCA  500

seq1  CTTCTCCAAGCCATCTCAAACAATCTGGAATATTCTGGAATCTAGAATAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCCAAGCCATCTCAAACAATCTGGAATATTCTGGAATCTAGAATAG  550

seq1  CTGAGGATAAATATAGAACTATGCTATTCAATTCTACAGACATTTTCTAC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGATAAATATAGAACTATGCTATTCAATTCTACAGACATTTTCTAC  600

seq1  TTTGGTAATATTCTGGAACTAATCTCTTATACATGATAACAATAGATCAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTAATATTCTGGAACTAATCTCTTATACATGATAACAATAGATCAT  650

seq1  TTTATAGGATTGAATTTACAGACTGAAATTGAGATATATGTTAAAAAACA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAGGATTGAATTTACAGACTGAAATTGAGATATATGTTAAAAAACA  700

seq1  GTTTCAGGTTCCTACTGTAAAACTTACAAAATCTCTAACAGACAACTGGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCAGGTTCCTACTGTAAAACTTACAAAATCTCTAACAGACAACTGGT  750

seq1  TTTGTTACCTTTTCCTAATCTATTTTAGCTGTTAAAAAAGTGCTCAAGAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTACCTTTTCCTAATCTATTTTAGCTGTTAAAAAAGTGCTCAAGAA  800

seq1  CACTAACATGGTCCCTGGGGATTCCTGAAGTTGTACAGTATCACCATGAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAACATGGTCCCTGGGGATTCCTGAAGTTGTACAGTATCACCATGAG  850

seq1  CTACACAGAGTTAGCACTGGCTTTAACTAAAGCAGAGCTCGTTCGTGTGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACAGAGTTAGCACTGGCTTTAACTAAAGCAGAGCTCGTTCGTGTGT  900

seq1  CAGCACCCCATTGATCACAGCGCTCAGCTCAACACCTCAACTTTTCTGAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACCCCATTGATCACAGCGCTCAGCTCAACACCTCAACTTTTCTGAA  950

seq1  TTC  952
      |||
seq2  TTC  953