BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-291J09
Chromosome15 (Build37)
Map Location 68,094,331 - 68,183,460
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100041000
Upstream geneZfat1
Downstream geneEG665945, EG633752, Khdrbs3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-291J09.bB6Ng01-291J09.g
ACCGA088433GA088434
length871940
definitionB6Ng01-291J09.b B6Ng01-291J09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,182,589 - 68,183,460)(68,094,331 - 68,095,260)
sequence
gaattctgtaaagaatctgtttccttaccctgagaagtaaggaagaaaat
agttggctagagttcagaagaggttgttttttgtttaggttttgtgggag
gcggggtgattttgtttatttcttttggtgggatgggtgagacaaagtct
ccaggtctcactatgtagtcttggctggcctggaacttgctatttagact
aggctgaccttgaactaatagagatttacctgtctctgtcccctgagtac
tgatattctgagattaaagatgtatgccactactacaatgcctgtttttt
tttttttttaggagagtttttaaaaagtctttgaaacaatgacatgaaat
tttatgttactatacattgtactggcctctaacattcaccacattatcaa
aaggaatcataaccccctgggaggctaccattcctgtcaaagagtgagcc
taaaaccacacaaaagggcatggaaagcttgtgtgtttaaggacagtcag
gaatgaaaagaaactaggaagcctaagaccagggaaaatataataccaag
aagagcaagttccttgttaggcattttgttgtgttttattttaatctgga
aattctcagcacttctttattaattcttagaaatgatcatatctacacat
gtcattagtgtcataaaattttttttcttgatcttcatggagtgtgaatg
agatgtccctaatatgttcaagcagacccttggtccacagttggtggtga
tgttagggaggctttatatgtggccttgaggaaggaattatgccactggg
gacagactttaaggattaaaagcctcctgctgctaggttaagtgtaccaa
gattccttctaccacttctcg
gaattccaggagaggaggaggtggggagatttgccagggagatgatggac
acatggtacctgagcacaggtaagcatgtgcagaaaggacacatggtacc
tgagcacaggtagccatgtggcagaatgtaggctagaataaatgggctat
tttagttatgatctagtcaagagtagagtctagctatatgctcaagatgt
ttgtaaatgtatttttgagtctgaatcttatttctgggagcatcgggctg
ggaagaagaactagggcataactacaactgacagtgtaagtgcctggtta
gattacatgcttagtatgcataatgtcttagacttggtccccagcacaca
tgtacacacacacacacaaagagagagagagagagagagagagagagaga
gagagagagagagtcctgtagacaaaactgtgtgtgctactttgattatt
aagctatttcaaacgtaaaagatagaaattaagtgttttagcaaataggt
aagttcggtatgtgtgaatttagttcttgaagttctgtgtatctctctac
aaaagcatatatgtatatacatccaggcaggtagttaggtaattatgatt
attgttaagggatttccagaaaaactgggaactgtaaaaaatggggatgc
aggttggggccataaataatccagtggggagagtgaggcaattttgtgtt
acaagtcaatgggttacaagaatagctgagagatcaaatatgtgacacta
ctaattactttgtgctgctgctgctgaagcctacatagcctatcataaac
aacataaacataagcagtgcatcacatacccaagacataacatgcataga
cgtgggggggggggatgcaggtatattttaagttgttacagttcctttcc
tcacccttcctgtgcattggtcccaagggtcctgagatcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_68182589_68183460
seq2: B6Ng01-291J09.b_44_914 (reverse)

seq1  CCAGAAGTGGTAGAAGGAATCTTGATACACTTAAACCTTAGCAGCAGGAG  50
      | |||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||
seq2  CGAGAAGTGGTAGAAGGAATCTTGGTACACTTAA--CCTAGCAGCAGGAG  48

seq1  GCTTTTAATCCTTAAAGTCTGTCCCCAGTGGCATAATTCCTTCCTCAAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTTAATCCTTAAAGTCTGTCCCCAGTGGCATAATTCCTTCCTCAAGG  98

seq1  CCACATAT-AAGCCTCCCTAACATCACCACCAACTGTGGACCAAGGGTCT  149
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATATAAAGCCTCCCTAACATCACCACCAACTGTGGACCAAGGGTCT  148

seq1  GCTTGAACATATTAGGGACATCTCATTCACACTCCATGAAGATCAAGAAA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGAACATATTAGGGACATCTCATTCACACTCCATGAAGATCAAGAAA  198

seq1  AAAAATTTTATGACACTAATGACATGTGTAGATATGATCATTTCTAAGAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTTTATGACACTAATGACATGTGTAGATATGATCATTTCTAAGAA  248

seq1  TTAATAAAGAAGTGCTGAGAATTTCCAGATTAAAATAAAACACAACAAAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATAAAGAAGTGCTGAGAATTTCCAGATTAAAATAAAACACAACAAAA  298

seq1  TGCCTAACAAGGAACTTGCTCTTCTTGGTATTATATTTTCCCTGGTCTTA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTAACAAGGAACTTGCTCTTCTTGGTATTATATTTTCCCTGGTCTTA  348

seq1  GGCTTCCTAGTTTCTTTTCATTCCTGACTGTCCTTAAACACACAAGCTTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCCTAGTTTCTTTTCATTCCTGACTGTCCTTAAACACACAAGCTTT  398

seq1  CCATGCCCTTTTGTGTGGTTTTAGGCTCACTCTTTGACAGGAATGGTAGC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCCCTTTTGTGTGGTTTTAGGCTCACTCTTTGACAGGAATGGTAGC  448

seq1  CTCCCAGGGGGTTATGATTCCTTTTGATAATGTGGTGAATGTTAGAGGCC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCAGGGGGTTATGATTCCTTTTGATAATGTGGTGAATGTTAGAGGCC  498

seq1  AGTACAATGTATAGTAACATAAAATTTCATGTCATTGTTTCAAAGACTTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACAATGTATAGTAACATAAAATTTCATGTCATTGTTTCAAAGACTTT  548

seq1  TTAAAAACTCTCCTAAAAAAAAAAAAAAACAGGCATTGTAGTAGTGGCAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAACTCTCCTAAAAAAAAAAAAAAACAGGCATTGTAGTAGTGGCAT  598

seq1  ACATCTTTAATCTCAGAATATCAGTACTCAGGGGACAGAGACAGGTAAAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTTTAATCTCAGAATATCAGTACTCAGGGGACAGAGACAGGTAAAT  648

seq1  CTCTATTAGTTCAAGGTCAGCCTAGTCTAAATAGCAAGTTCCAGGCCAGC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATTAGTTCAAGGTCAGCCTAGTCTAAATAGCAAGTTCCAGGCCAGC  698

seq1  CAAGACTACATAGTGAGACCTGGAGACTTTGTCTCACCCATCCCACCAAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACTACATAGTGAGACCTGGAGACTTTGTCTCACCCATCCCACCAAA  748

seq1  AGAAATAAACAAAATCACCCCGCCTCCCACAAAACCTAAACAAAAAACAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATAAACAAAATCACCCCGCCTCCCACAAAACCTAAACAAAAAACAA  798

seq1  CCTCTTCTGAACTCTAGCCAACTATTTTCTTCCTTACTTCTCAGGGTAAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTCTGAACTCTAGCCAACTATTTTCTTCCTTACTTCTCAGGGTAAG  848

seq1  GAAACAGATTCTTTACAGAATTC  872
      |||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAGATTCTTTACAGAATTC  871

seq1: chr15_68094331_68095260
seq2: B6Ng01-291J09.g_66_1005

seq1  GAATTCCAGGAGAGGAGGAGGTGGGGAGATTTGCCAGGGAGATGATGGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGAGAGGAGGAGGTGGGGAGATTTGCCAGGGAGATGATGGAC  50

seq1  ACATGGTACCTGAGCACAGGTAAGCATGTGCAGAAAGGACACATGGTACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGTACCTGAGCACAGGTAAGCATGTGCAGAAAGGACACATGGTACC  100

seq1  TGAGCACAGGTAGCCATGTGGCAGAATGTAGGCTAGAATAAATGGGCTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCACAGGTAGCCATGTGGCAGAATGTAGGCTAGAATAAATGGGCTAT  150

seq1  TTTAGTTATGATCTAGTCAAGAGTAGAGTCTAGCTATATGCTCAAGATGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTTATGATCTAGTCAAGAGTAGAGTCTAGCTATATGCTCAAGATGT  200

seq1  TTGTAAATGTATTTTTGAGTCTGAATCTTATTTCTGGGAGCATCGGGCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAAATGTATTTTTGAGTCTGAATCTTATTTCTGGGAGCATCGGGCTG  250

seq1  GGAAGAAGAACTAGGGCATAACTACAACTGACAGTGTAAGTGCCTGGTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAAGAACTAGGGCATAACTACAACTGACAGTGTAAGTGCCTGGTTA  300

seq1  GATTACATGCTTAGTATGCATAATGTCTTAGACTTGGTCCCCAGCACACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTACATGCTTAGTATGCATAATGTCTTAGACTTGGTCCCCAGCACACA  350

seq1  TGTACACACACACACACAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACACACACACACACAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  400

seq1  GAGAGAGAGAGAGTCCTGTAGACAAAACTGTGTGTGCTACTTTGATTATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGAGAGAGTCCTGTAGACAAAACTGTGTGTGCTACTTTGATTATT  450

seq1  AAGCTATTTCAAACGTAAAAGATAGAAATTAAGTGTTTTAGCAAATAGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTATTTCAAACGTAAAAGATAGAAATTAAGTGTTTTAGCAAATAGGT  500

seq1  AAGTTCGGTATGTGTGAATTTAGTTCTTGAAGTTCTGTGTATCTCTCTAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTCGGTATGTGTGAATTTAGTTCTTGAAGTTCTGTGTATCTCTCTAC  550

seq1  AAAAGCATATATGTATATACATCCAGGCAGGTAGTTAGGTAATTATGATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCATATATGTATATACATCCAGGCAGGTAGTTAGGTAATTATGATT  600

seq1  ATTGTTAAGGGATTTCCAGAAAAACTGGGAACTGTAAAAAATGGGGATGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTAAGGGATTTCCAGAAAAACTGGGAACTGTAAAAAATGGGGATGC  650

seq1  AGGTTGGGGCCATAAATAATCCAGTGGGGAGAGTGAGGCAA-TTTGTGTT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  AGGTTGGGGCCATAAATAATCCAGTGGGGAGAGTGAGGCAATTTTGTGTT  700

seq1  ACAAGTCAATGGGTTACAAGAATAGCTGAGAGATCAAATATGTGACACTA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTCAATGGGTTACAAGAATAGCTGAGAGATCAAATATGTGACACTA  750

seq1  CTAATTACTTTGTGCTGCTGCTGCTGAAGCCTACATAGCCTATCATAAAC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATTACTTTGTGCTGCTGCTGCTGAAGCCTACATAGCCTATCATAAAC  800

seq1  AACATAAACATAAGCAGTGCATCACATACCCAAGACATAACATGCATAGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATAAACATAAGCAGTGCATCACATACCCAAGACATAACATGCATAGA  850

seq1  CGT--GGGGGGGGGATGCAGG--TAATTTAAG-TGTTACAGTTCCTTT-C  893
      |||  ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||| |
seq2  CGTGGGGGGGGGGGATGCAGGTATATTTTAAGTTGTTACAGTTCCTTTCC  900

seq1  TCAGCCTTCCTGTGCAT--GTCCCAAGGGT-CTGAGATCC  930
      ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||
seq2  TCACCCTTCCTGTGCATTGGTCCCAAGGGTCCTGAGATCC  940