BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-307K24
Chromosome15 (Build37)
Map Location 15,097,184 - 15,241,359
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040033
Upstream geneLOC674819, LOC100040024
Downstream geneLOC100040046, EG239341, LOC100040087, LOC624183
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-307K24.bB6Ng01-307K24.g
ACCGA100393GA100394
length4301,111
definitionB6Ng01-307K24.b B6Ng01-307K24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(15,097,184 - 15,097,618)(15,240,247 - 15,241,359)
sequence
cttgtctgtccttagtgagagacctgatgcccctgagaaggaagatggta
gagccgtgaggtggaagttgttatatgttttgagaagcaccccttggagg
tgaagtggaggaggacagggtgggggatgtgtggagcagagaccaggaag
gaggcaacatttgaaatgtaaataaataaaataattaagaaaaaatattt
aatcaattaatttgtgcacctatcatagggaaatatttgaaatttattta
tgtcaggttttatgaaaattctaatcttgtaaaaatgaatttttaatttc
catagaatatgaaaaaacacataccatacagcaatatagagctatatcta
tatttgtagataggttaattcgtcagatcaatagagacctactatacatg
catacattcatacatacgtacataaatact
gaattcattcttttgcttgctttctctctttttggtattaagattcatga
aactcatttctaataccgagtctctaggtaccttaggtcttgacagtcta
tatgaacaccatagtgcaattagggtgtatttacacctgtgaatcatttc
atgtgcctgataatactcaggaacaattgtattttttttagtaaaacgac
ctatgctatattacactggcctttgtaaaatcgatcacttagggaatata
gtgttaatgagtcagtctttctttagggagaatatcctgattaatccaca
accatggtaatatataggattgatcctaaaacttaattcacattgcaaat
cagcaattaaatttgataatgtgtcctaaaggtattcgagatattttgtt
ccatgctctgagcccttattctataaaaattcaattatgtacaccttcat
tctttgtttccattaggtttatgatatgactcttaaatttaaacttatat
gttatataaaatgtcatgttgctcagagttctttttaatagaccttcaat
ttcccaaatggttgtagcaactaaattaataaattgtatctataggcttg
tttgcctataaattagattgcaaagtagagaatttgaatatgttatagct
atatcacctttttgttacaaagaacattaatagttctatagtattgagcc
ttatgaatcatgagtaaacatagatgtactggctcattgtatttaataat
atatactggcttagaatgtgatagcccacatgtaataggatataaataaa
aaataattgtcatgatcaagtttctctcttagatatgtagatgctatatc
ttcacataaatgtatacacatatatattcacacacatactattcttgttc
tctgcgattagggttgaacaaagaaccttttccacatcagctgcttaaag
gcccactttttactacatggagtgttgagagacacatgcatgcatgtaag
ccgaagagagtgttttcttatggtgtgtacttaatatttacctttgtaga
tatggtacaatgctggagcattactataccatgttgtgttgcctattcca
caaaatagtct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_15097184_15097618
seq2: B6Ng01-307K24.b_45_479

seq1  GAATTCCTTGTCTGTCCTTAGTGAGAGACCTGATGCCCCTGAGAAGGAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTGTCTGTCCTTAGTGAGAGACCTGATGCCCCTGAGAAGGAAG  50

seq1  ATGGTAGAGCCGTGAGGTGGAAGTTGTTATATGTTTTGAGAAGCACCCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTAGAGCCGTGAGGTGGAAGTTGTTATATGTTTTGAGAAGCACCCCT  100

seq1  TGGAGGTGAAGTGGAGGAGGACAGGGTGGGGGATGTGTGGAGCAGAGACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGTGAAGTGGAGGAGGACAGGGTGGGGGATGTGTGGAGCAGAGACC  150

seq1  AGGAAGGAGGCAACATTTGAAATGTAAATAAATAAAATAATTAAGAAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGGAGGCAACATTTGAAATGTAAATAAATAAAATAATTAAGAAAAA  200

seq1  ATATTTAATCAATTAATTTGTGCACCTATCATAGGGAAATATTTGAAATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTAATCAATTAATTTGTGCACCTATCATAGGGAAATATTTGAAATT  250

seq1  TAAGTATGTCAGGTCTTATGAAAATTCTAATCTTGTAAAAATGAATTTTT  300
      ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATGTCAGGTTTTATGAAAATTCTAATCTTGTAAAAATGAATTTTT  300

seq1  AATTTCCATAGAATATGAAAAAACACATACCATACAGCAATATAGATCTA  350
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AATTTCCATAGAATATGAAAAAACACATACCATACAGCAATATAGAGCTA  350

seq1  TATCTATATTTGTAGAAAGGTTAATTTGTCAGATAAATAGAAATATACTA  400
      |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |  |||||
seq2  TATCTATATTTGTAGATAGGTTAATTCGTCAGATCAATAGAGACCTACTA  400

seq1  TACATGCATACATACATACATACATACATAAATAC  435
      ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
seq2  TACATGCATACATTCATACATACGTACATAAATAC  435

seq1: chr15_15240247_15241359
seq2: B6Ng01-307K24.g_67_1177 (reverse)

seq1  AGACTATTTTGT-GATTAGCACACA-AACATTGTATAGTAAATGCTCAAG  48
      |||||||||||| || |||   ||| ||||| ||||||| ||||||| ||
seq2  AGACTATTTTGTGGAATAGGCAACACAACATGGTATAGT-AATGCTCCAG  49

seq1  CATGGTACCATTATCTACAAAGGTTAAATA-TAAGTACAACAACATAAG-  96
      ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| 
seq2  CATTGTACCA-TATCTACAAAGG-TAAATATTAAGTAC-ACACCATAAGA  96

seq1  AAACACTCTCTTCGGCTTAACATGCATTCCATGTGTCTCTCAACACTCCA  146
      |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||
seq2  AAACACTCTCTTCGGCTT-ACATGCA-TGCATGTGTCTCTCAACACTCCA  144

seq1  TGTAGTAAAAAGTGGGCCTTTAGGCAGCTGATGTGG-AAAGGTTCTTTGT  195
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGTAGTAAAAAGTGGGCCTTTAAGCAGCTGATGTGGAAAAGGTTCTTTGT  194

seq1  TCAACCCCTAATCGCAGAGAACAAGAATAGTATGTGTGTGAATATATATG  245
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAA-CCCTAATCGCAGAGAACAAGAATAGTATGTGTGTGAATATATATG  243

seq1  TGTATACATTTATGTGAAGATATAGCATCTACATATCTAAGAGAGAAACT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATACATTTATGTGAAGATATAGCATCTACATATCTAAGAGAGAAACT  293

seq1  TGATCATGACAATTATTTTTTATTTATATCCTATTACATGTGGGCTATCA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCATGACAATTATTTTTTATTTATATCCTATTACATGTGGGCTATCA  343

seq1  CATTCTAAGCCAGTATATATTATTAAATACAATGAGCCAGTACATCTATG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTAAGCCAGTATATATTATTAAATACAATGAGCCAGTACATCTATG  393

seq1  TTTACTCATGATTCATAAGGCTCAATACTATAGAACTATTAATGTTCTTT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTCATGATTCATAAGGCTCAATACTATAGAACTATTAATGTTCTTT  443

seq1  GTAACAAAAAGGTGATATAGCTATAACATATTCAAATTCTCTACTTTGCA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACAAAAAGGTGATATAGCTATAACATATTCAAATTCTCTACTTTGCA  493

seq1  ATCTAATTTATAGGCAAACAAGCCTATAGATACAATTTATTAATTTAGTT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAATTTATAGGCAAACAAGCCTATAGATACAATTTATTAATTTAGTT  543

seq1  GCTACAACCATTTGGGAAATTGAAGGTCTATTAAAAAGAACTCTGAGCAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACAACCATTTGGGAAATTGAAGGTCTATTAAAAAGAACTCTGAGCAA  593

seq1  CATGACATTTTATATAACATATAAGTTTAAATTTAAGAGTCATATCATAA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGACATTTTATATAACATATAAGTTTAAATTTAAGAGTCATATCATAA  643

seq1  ACCTAATGGAAACAAAGAATGAAGGTGTACATAATTGAATTTTTATAGAA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTAATGGAAACAAAGAATGAAGGTGTACATAATTGAATTTTTATAGAA  693

seq1  TAAGGGCTCAGAGCATGGAACAAAATATCTCGAATACCTTTAGGACACAT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGGCTCAGAGCATGGAACAAAATATCTCGAATACCTTTAGGACACAT  743

seq1  TATCAAATTTAATTGCTGATTTGCAATGTGAATTAAGTTTTAGGATCAAT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAAATTTAATTGCTGATTTGCAATGTGAATTAAGTTTTAGGATCAAT  793

seq1  CCTATATATTACCATGGTTGTGGATTAATCAGGATATTCTCCCTAAAGAA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATATATTACCATGGTTGTGGATTAATCAGGATATTCTCCCTAAAGAA  843

seq1  AGACTGACTCATTAACACTATATTCCCTAAGTGATCGATTTTACAAAGGC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGACTCATTAACACTATATTCCCTAAGTGATCGATTTTACAAAGGC  893

seq1  CAGTGTAATATAGCATAGGTCGTTTTACTAAAAAAAATACAATTGTTCCT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTAATATAGCATAGGTCGTTTTACTAAAAAAAATACAATTGTTCCT  943

seq1  GAGTATTATCAGGCACATGAAATGATTCACAGGTGTAAATACACCCTAAT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTATTATCAGGCACATGAAATGATTCACAGGTGTAAATACACCCTAAT  993

seq1  TGCACTATGGTGTTCATATAGACTGTCAAGACCTAAGGTACCTAGAGACT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACTATGGTGTTCATATAGACTGTCAAGACCTAAGGTACCTAGAGACT  1043

seq1  CGGTATTAGAAATGAGTTTCATGAATCTTAATACCAAAAAGAGAGAAAGC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTATTAGAAATGAGTTTCATGAATCTTAATACCAAAAAGAGAGAAAGC  1093

seq1  AAGCAAAAGAATGAATTC  1113
      ||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAAAGAATGAATTC  1111