BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-311B18
Chromosome15 (Build37)
Map Location 76,149,783 - 76,303,103
singlet/doubletdoublet
Overlap geneExosc4, Gpaa1, Cyc1, Sharpin, Maf1, EG626280, Brp16, Tssk5, Bop1, Scx
Upstream geneLOC100041107, 9030619P08Rik, Ly6h, Gpihbp1, Zfp41, 2810039B14Rik, Top1mt, Rhpn1, Mafa, Zc3h3, LOC672572, Gsdmdc1, Naprt1, Eef1d, Tigd5, Pycrl, Tsta3, Zfp623, Eif2s3x-ps1, Zfp707, 2410075B13Rik, Mapk15, AA409316, K230010J24Rik, Scrib, 2410104I19Rik, Nrbp2, Eppk1, BC024139, Plec1, LOC671535, Grina, Spatc1, LOC100041269, Oplah
Downstream geneHsf1, Dgat1, Scrt1, LOC666497, EG666504, Fbxl6, Gpr172b, Adck5, Cpsf1, Slc39a4, Vps28, Nfkbil2, Cyhr1, Kifc2, Foxh1, Ppp1r16a, Gpt1, Mfsd3, Recql4, Lrrc14, Lrrc24, C030006K11Rik, D15Wsu169e, Zfp251, Zfp7, Commd5, Rpl8, Zfp647, 1110038F14Rik, Mb, Apol6, Rbm9, LOC100042318, Apol3, BC020489, BC085284, LOC624454, EG666639
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-311B18.bB6Ng01-311B18.g
ACCGA102908GA102909
length1,1561,112
definitionB6Ng01-311B18.b B6Ng01-311B18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,149,783 - 76,150,929)(76,302,008 - 76,303,103)
sequence
gaattcactaagtagccaatgacaacctaaacttctggtccttgggcagg
gaaccctctgcagagcatgggacccagcttcacgaggttaaattgggcag
cagtcagttttggctcaaggaaaccagtcacctattgacaaactgttatt
ctggttgttctgatgtggaaatagcgtctagcaacacagctgcctccttc
tggtgcctgttctaacacgaggagctgatgaaattgcctaataggtattg
gtaattcaagaggaatggaagattagtcatgaacaagaaagtgagatggc
tgttaaatcacttaattggtatatacgatacgtgaaaaaaaaaagctgtt
accaggtttcttcaaagttcacaaagccccaagaatttacagaatatttt
atctgtaagagctggtatctggactgaacttatctaaactcctgcttttt
ttccttagactgatttcttaaagattcatgtatcttctgcatatgcatgt
tctgcctgagtgtatgaaaatgcatcatatgcaagccaagttcccatgga
ggtcagaaggcgatgtgggacccctagaactagaggtcaggatggttgtg
aaccaccgtggtggtattctttaccagtgagctctctctccagccccaaa
cctcagctttttaaactgtgggtcatgaacaacttcactgttatcatgtt
tctaaacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaaccgtg
cacactttttgcacacacatactacgctcgctgcctgacacatcaactta
gatttgagcatattacatattgaagtgtttaaactgtgacacaagctttc
ctgaactcttcctggaaatattctgtaaagttttagtttttatgacttaa
ctttataggcacacaatactttaattacagaaaacaagaattttagtatt
tggctatcaacatccctcgacacgggaagcacaaataactctatcttggg
cttggattctgttaggatgtttaatctattttttttttcccttttccggt
tattcatgtgtggtggtatatagtgggggtgcatgcatctatgtggggcg
tccatgctcacgggcttactggtctgtactaccgtatgggagaaccaata
ggtcga
gaattctctcagcttcccgagtcccgcccttcccctgcctccctgctccc
tacttgtcttctgtcatagactgtgaaggagggagcaattgctccctacc
tgtctcagagctgcacactgtcaaacagtcgcacatggaagtcagaggtg
aggctgggtaaagaaggatcatgtgtccctgttctgtagtgtcatcttgt
ggggcagagggatgtgtatcctacagggtctgctacattctaccctagga
agctgtatattgagttctggtgagagcgtgcagagcactgtcacttgtgt
tacggtcctgagatggtagttcggggctatcaaagcctgtttccagggcc
gtgtaatgtccccatgggctgctttgtcctcgtggtaaagcagtcacagc
cctttcaggtttaagaaggacagccttctaggctagggtaggaggagcat
aaagatttctagatatgttttatttgttattattgcatgtgtgaatacag
gtgtgcttgtgccacagcatatgtgtgtggtcaggggacatcttgtgaga
attgactctattcttccagtgtgggatttggggatcattaggctgtcagg
gttgcatagcaagtatttttaccggttgagctatctcactgaccttgtca
tgttttaaaatgtctacagtcgccctgcccaacgtggaactactcttctc
ccaggttcctccctgatgagcagctagaccttgtgtcgtgtgctgtgtca
accctgggctagccctgtctcctttctgtcagccctgagcccctcacata
gctccacatgggaatgtctggtcatgtgcagccagaccccagtatttggg
tgagctttggtagagacaaggtctggcccttttgtttattttgtttgctt
ggtttttaaattctattttaatgtgcattgatgtttttgccctgtgatgt
ctgtctggtgtgaacaagtgtcagatcccctggatcttgttagctacaga
cagtgttgagctgcattgtgattgcttggtaactgaacccgggttctttg
gcagaggcagccagtgctctcctgacaactgagccaccttctccagaccc
ctttttgtttta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_76149783_76150929
seq2: B6Ng01-311B18.b_45_1200

seq1  GAATTCACTAAGTAGCCAATGACAACCTAAACTTCTGGTCCTTGGGCAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTAAGTAGCCAATGACAACCTAAACTTCTGGTCCTTGGGCAGG  50

seq1  GAACCCTCTGCAGAGCATGGGACCCAGCTTCACGAGGTTAAATTGGGCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCCTCTGCAGAGCATGGGACCCAGCTTCACGAGGTTAAATTGGGCAG  100

seq1  CAGTCAGTTTTGGCTCAAGGAAACCAGTCACCTATTGACAAACTGTTATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCAGTTTTGGCTCAAGGAAACCAGTCACCTATTGACAAACTGTTATT  150

seq1  CTGGTTGTTCTGATGTGGAAATAGCGTCTAGCAACACAGCTGCCTCCTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTGTTCTGATGTGGAAATAGCGTCTAGCAACACAGCTGCCTCCTTC  200

seq1  TGGTGCCTGTTCTAACACGAGGAGCTGATGAAATTGCCTAATAGGTATTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGCCTGTTCTAACACGAGGAGCTGATGAAATTGCCTAATAGGTATTG  250

seq1  GTAATTCAAGAGGAATGGAAGATTAGTCATGAACAAGAAAGTGAGATGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATTCAAGAGGAATGGAAGATTAGTCATGAACAAGAAAGTGAGATGGC  300

seq1  TGTTAAATCACTTAATTGGTATATACGATACGTGAAAAAAAAAAGCTGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAAATCACTTAATTGGTATATACGATACGTGAAAAAAAAAAGCTGTT  350

seq1  ACCAGGTTTCTTCAAAGTTCACAAAGCCCCAAGAATTTACAGAATATTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGGTTTCTTCAAAGTTCACAAAGCCCCAAGAATTTACAGAATATTTT  400

seq1  ATCTGTAAGAGCTGGTATCTGGACTGAACTTATCTAAACTCCTGCTTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTAAGAGCTGGTATCTGGACTGAACTTATCTAAACTCCTGCTTTTT  450

seq1  TTCCTTAGACTGATTTCTTAAAGATTCATGTATCTTCTGCATATGCATGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTAGACTGATTTCTTAAAGATTCATGTATCTTCTGCATATGCATGT  500

seq1  TCTGCCTGAGTGTATGAAAATGCATCATATGCAAGCCAAGTTCCCATGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCTGAGTGTATGAAAATGCATCATATGCAAGCCAAGTTCCCATGGA  550

seq1  GGTCAGAAGGCGATGTGGGACCCCTAGAACTAGAGGTCAGGATGGTTGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCAGAAGGCGATGTGGGACCCCTAGAACTAGAGGTCAGGATGGTTGTG  600

seq1  AACCACCGTGGTGGTATTCTTTACCAGTGAGCTCTCTCTCCAGCCCCAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCACCGTGGTGGTATTCTTTACCAGTGAGCTCTCTCTCCAGCCCCAAA  650

seq1  CCTCAGCTTTTTAAACTGTGGGTCATGAACAACTTCACTGTTATCATGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGCTTTTTAAACTGTGGGTCATGAACAACTTCACTGTTATCATGTT  700

seq1  TCTAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAACCGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAACCGTG  750

seq1  CACACTTTTTGCACACACATACTACGCTCGCTGCCTGACACATCAACTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTTTTTGCACACACATACTACGCTCGCTGCCTGACACATCAACTTA  800

seq1  GATTTGAGCATATTACATATTGAAGTGTTT-AACTGTGACACAAGCTTTC  849
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GATTTGAGCATATTACATATTGAAGTGTTTAAACTGTGACACAAGCTTTC  850

seq1  CTGAAACTCTTCCTGGAAATATTCTGTAAAGTTTTAGTTTTTATGACTTA  899
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTG-AACTCTTCCTGGAAATATTCTGTAAAGTTTTAGTTTTTATGACTTA  899

seq1  ACTTTATAGGCACACAATAC-TTAATTACAGAAAACAAGAATTTTAGTAT  948
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTATAGGCACACAATACTTTAATTACAGAAAACAAGAATTTTAGTAT  949

seq1  TTTGCTATCAACATCCCTCGACAC-GGAAGCACAAATTACTCTATCTTTG  997
      || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
seq2  TTGGCTATCAACATCCCTCGACACGGGAAGCACAAATAACTCTATCTTGG  999

seq1  GCTTGGATTCTGTTAGGATGTTTAATCTTATTTTTTTTTCCTTTTTCC-G  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |
seq2  GCTTGGATTCTGTTAGGATGTTTAATCTATTTTTTTTTTCCCTTTTCCGG  1049

seq1  TTATTCATGTGT-GTGGTATATTAGTGTGTGTGCATGCATCTATGT-GGG  1094
      |||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||
seq2  TTATTCATGTGTGGTGGTATA-TAGTGGGGGTGCATGCATCTATGTGGGG  1098

seq1  TGTCCATGCTCACGG--CTACCTGTCTGTACATACGTAT-GGAGA--CCA  1139
       ||||||||||||||   |||  ||||||||   ||||| |||||  | |
seq2  CGTCCATGCTCACGGGCTTACTGGTCTGTACTACCGTATGGGAGAACCAA  1148

seq1  TAGGTCGA  1147
      ||||||||
seq2  TAGGTCGA  1156

seq1: chr15_76302008_76303103
seq2: B6Ng01-311B18.g_67_1178 (reverse)

seq1  TAAAAC-AAAAGGGGTCTGGAG-AGGTGGCTCAGTGGTTAAGAAGAGCAC  48
      |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | | || |||||||
seq2  TAAAACAAAAAGGGGTCTGGAGAAGGTGGCTCAGTTG-TCAGGAGAGCAC  49

seq1  TGGCTG-CTCTTGCAAAGAACCCGGGTTCAGTTTCC-AGCATCCACATGG  96
      |||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||  ||||  |
seq2  TGGCTGCCTCTGCCAAAGAACCCGGGTTCAGTTACCAAGCAATCACAATG  99

seq1  CAGCTCACAACTGTCTGTAACTA--CAGTTCCAGGGGATCTGACACT--G  142
      |||||||  |||||||||| |||   || ||||||||||||||||||   
seq2  CAGCTCAACACTGTCTGTAGCTAACAAGATCCAGGGGATCTGACACTTGT  149

seq1  TCACA-CAGACAGACATCACAGG--CAAAACATCAATGCACA-TAAAATA  188
      ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||
seq2  TCACACCAGACAGACATCACAGGGCAAAAACATCAATGCACATTAAAATA  199

seq1  GAATTTAAAAA-CAAGCAAAC-AAATAAACAAAAGGGCCAGACCTTGGTC  236
      ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GAATTTAAAAACCAAGCAAACAAAATAAACAAAAGGGCCAGACCTT-GTC  248

seq1  TCTACC-AAGCTCACC--AATACTGGGGTCTGGCTGCACATGACCAGACA  283
      |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACCAAAGCTCACCCAAATACTGGGGTCTGGCTGCACATGACCAGACA  298

seq1  TT-CCATGTGGAGCTATGTGAGGGGCTCAGGGCTGACAGAAAGGAGACAG  332
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCATGTGGAGCTATGTGAGGGGCTCAGGGCTGACAGAAAGGAGACAG  348

seq1  GGCTAGCCCAGGGTTGACACAGCACACGACACAAGGTCTAGCTGCTCATC  382
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAGCCCAGGGTTGACACAGCACACGACACAAGGTCTAGCTGCTCATC  398

seq1  AGGGAGGAACCTGGGAGAAGAGTAGTTCCACGTTGGGCAGGGCGACTGTA  432
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGGAACCTGGGAGAAGAGTAGTTCCACGTTGGGCAGGGCGACTGTA  448

seq1  GACATTTTAAAACATGACAAGGTCAGTGAGATAGCTCAACCGGTAAAAAT  482
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATTTTAAAACATGACAAGGTCAGTGAGATAGCTCAACCGGTAAAAAT  498

seq1  ACTTGCTATGCAACCCTGACAGCCTAATGATCCCCAAATCCCACACTGGA  532
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGCTATGCAACCCTGACAGCCTAATGATCCCCAAATCCCACACTGGA  548

seq1  AGAATAGAGTCAATTCTCACAAGATGTCCCCTGACCACACACATATGCTG  582
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAGAGTCAATTCTCACAAGATGTCCCCTGACCACACACATATGCTG  598

seq1  TGGCACAAGCACACCTGTATTCACACATGCAATAATAACAAATAAAACAT  632
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCACAAGCACACCTGTATTCACACATGCAATAATAACAAATAAAACAT  648

seq1  ATCTAGAAATCTTTATGCTCCTCCTACCCTAGCCTAGAAGGCTGTCCTTC  682
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAGAAATCTTTATGCTCCTCCTACCCTAGCCTAGAAGGCTGTCCTTC  698

seq1  TTAAACCTGAAAGGGCTGTGACTGCTTTACCACGAGGACAAAGCAGCCCA  732
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACCTGAAAGGGCTGTGACTGCTTTACCACGAGGACAAAGCAGCCCA  748

seq1  TGGGGACATTACACGGCCCTGGAAACAGGCTTTGATAGCCCCGAACTACC  782
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGACATTACACGGCCCTGGAAACAGGCTTTGATAGCCCCGAACTACC  798

seq1  ATCTCAGGACCGTAACACAAGTGACAGTGCTCTGCACGCTCTCACCAGAA  832
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCAGGACCGTAACACAAGTGACAGTGCTCTGCACGCTCTCACCAGAA  848

seq1  CTCAATATACAGCTTCCTAGGGTAGAATGTAGCAGACCCTGTAGGATACA  882
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAATATACAGCTTCCTAGGGTAGAATGTAGCAGACCCTGTAGGATACA  898

seq1  CATCCCTCTGCCCCACAAGATGACACTACAGAACAGGGACACATGATCCT  932
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCTCTGCCCCACAAGATGACACTACAGAACAGGGACACATGATCCT  948

seq1  TCTTTACCCAGCCTCACCTCTGACTTCCATGTGCGACTGTTTGACAGTGT  982
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTACCCAGCCTCACCTCTGACTTCCATGTGCGACTGTTTGACAGTGT  998

seq1  GCAGCTCTGAGACAGGTAGGGAGCAATTGCTCCCTCCTTCACAGTCTATG  1032
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTCTGAGACAGGTAGGGAGCAATTGCTCCCTCCTTCACAGTCTATG  1048

seq1  ACAGAAGACAAGTAGGGAGCAGGGAGGCAGGGGAAGGGCGGGACTCGGGA  1082
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAGACAAGTAGGGAGCAGGGAGGCAGGGGAAGGGCGGGACTCGGGA  1098

seq1  AGCTGAGAGAATTC  1096
      ||||||||||||||
seq2  AGCTGAGAGAATTC  1112