BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-315P01
Chromosome15 (Build37)
Map Location 25,692,080 - 25,823,556
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMyo10, Ppia-ps15_175.1, 1810015C04Rik
Upstream geneLOC100040529, 9230109A22Rik, 4930445E18Rik, Basp1, EG432939, LOC100040583, LOC100040602
Downstream geneZfp622, AK162044, Fbxl7, LOC622531
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-315P01.bB6Ng01-315P01.g
ACCGA106459GA106460
length4301,092
definitionB6Ng01-315P01.b B6Ng01-315P01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(25,692,080 - 25,692,515)(25,822,457 - 25,823,556)
sequence
agatgctccgccacacctggcctccacttacgtatttctgagacttgtgt
aacactatcttgtggattctttttggtgcttgcgatgatgaaacttgaga
aatggctctgcttgagacagcctctgaacagctggagagtcaggtggtct
ggcttcccaccagggtggctttcaggaccgggcctgcctcttctgcttct
gtaagcaaaagtaactaatctgttaactggtgtgattccagcctccctgc
caggcagagcccctcctccaccattgaatagtccctgaatgagatctccc
cgggttggcgaggatgctatctgcatgctctccaccaagctgctcccaag
cccactccttaacggatagccagattctatcctttatagatcccattagc
cattttagttttctgaactccggcctgctg

gaattcatagtgcaaaaaaaatcattggggaaaggatacaattaaggtca
tgaccagcaaagttcgtatctgtagccaagaatgtgggaagtgagcagct
cagagagggaaagaggcatcaggtcccagaaagctctgctgcccaggact
ttactggctgctgttgtgagcagaagcagggtctctgagtgattcatggg
agctgccatgaccccacagctgcttctagatatagcttgcaacgaagcct
atgtctccctaagaggagccgagtgcagccagcactgtgctgggctggaa
gccctgctgccatctccagccagccattcacaaggctcaattgggccttt
gtcctaaaagactcagtgaagagggacaaagaaggccctagggtttcccc
agccagtccttggagagagcagaagaagggagcccatcttttcctttttt
tccttttgtcaaacatagaaatgctatgctcactcagtgagaaccccagg
aggaagatgagcctgctgtagaggcctggtcagggatgaaggcagagtcc
acatcctcattagaaaatggtgcttacaagtaaccttgcctcaaaaagac
acttgtcatagcctgactgatgagaaggcagagtccaggatgtcctgact
gtgccagctaaacaggggagacagccacagtgaagactgtcactcacggt
aacctttcacctgaaccagattcaaatctgtggcataagaatgggttctc
aggggaaggaagaaccatccagagactgccccacccggggatccatcctg
taaacagccaccaaacccagacactattgcatatgccagcaagattttgc
tgacaggaccctgatatcgctgtctctggtgaggctatgccactgcctag
caaatacagaagtggatgctcacagtcatctatgggtggaacacagggcc
ccaatggaggagctagagaaagtacccaagagctaaagggggctgcacca
tataggagacacatttgaacctaacagtacccccagagcttgtgtctcta
gctgcatatgtagcagaagattgcttagttcggcaccactgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_25692080_25692515
seq2: B6Ng01-315P01.b_45_480

seq1  GAATTCAGATGCTCCGCCACACCTGGCCTCCACTTACGTATTTCTGAGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGATGCTCCGCCACACCTGGCCTCCACTTACGTATTTCTGAGAC  50

seq1  TTGTGTAACACTATCTTGTGGATTCTTTTTGGTGCTTGCGATGATGAAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTAACACTATCTTGTGGATTCTTTTTGGTGCTTGCGATGATGAAAC  100

seq1  TTGAGAAATGGCTCTGCTTGAGACAGCCTCTGAACAGCTGGAGAGTCAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGAAATGGCTCTGCTTGAGACAGCCTCTGAACAGCTGGAGAGTCAGG  150

seq1  TGGTCTGGCTTCCCACCAGGGTGGCTTTCAGGACCGGGCCTGCCTCTTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCTGGCTTCCCACCAGGGTGGCTTTCAGGACCGGGCCTGCCTCTTCT  200

seq1  GCTTCTGTAAGCAAAAGTAACTAATCTGTTAACTGGTGTGATTCCAGCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTGTAAGCAAAAGTAACTAATCTGTTAACTGGTGTGATTCCAGCCT  250

seq1  CCCTGCCAGGCAGAGCCCCTCCTCCACCATTGAATAGTCCCTGAATGAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGCCAGGCAGAGCCCCTCCTCCACCATTGAATAGTCCCTGAATGAGA  300

seq1  TCTCCCCGGGTTGGCGAGGATGCTATCTGCATGCTCTCCACCAAGCTGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCCGGGTTGGCGAGGATGCTATCTGCATGCTCTCCACCAAGCTGCT  350

seq1  CCCAAGCCCACTCCTTAACGGATAGCCAGATTCTATCCTTTATAGATCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGCCCACTCCTTAACGGATAGCCAGATTCTATCCTTTATAGATCCC  400

seq1  ATTAGCCATTTTAGTTTTCTGAACTCCGGCCTGCTG  436
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGCCATTTTAGTTTTCTGAACTCCGGCCTGCTG  436


seq1: chr15_25822457_25823556
seq2: B6Ng01-315P01.g_69_1160 (reverse)

seq1  CCAGTGGTGGCCGACTAGGCCATCTTCTGCTACATATGCAGCTAGAGACA  50
      ||||||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGGTGCCGAACTAAGCAATCTTCTGCTACATATGCAGCTAGAGACA  50

seq1  CAAGCTCTGGGGGTACTGGTTAGTTCATATTGTTGTTCCTCCTATATGGT  100
      |||||||||||||||||| |  ||||| |    |||  ||||||||||| 
seq2  CAAGCTCTGGGGGTACTGTTAGGTTCAAA----TGTGTCTCCTATATGG-  95

seq1  TGCAGCCCCCTTTAGCTCCTTGGGTACTTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGG  150
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGCAGCCCCCTTTAGCT-CTTGGGTACTTTCTCTAGCTCCTCCATT-GGG  143

seq1  GCCCTGTGTTCCACCCAATAGATGACTGTGAGCATCCACTTCTGTATTTG  200
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTGTGTTCCACCC-ATAGATGACTGTGAGCATCCACTTCTGTATTTG  192

seq1  CTAGGCAGTGGCATAGCCTCACCAGAGACAGCGATATCAGGGTCCTGTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGCAGTGGCATAGCCTCACCAGAGACAGCGATATCAGGGTCCTGTCA  242

seq1  GCAAAATCTTGCTGGCATATGCAATAGTGTCTGGGTTTGGTGGCTGTTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAATCTTGCTGGCATATGCAATAGTGTCTGGGTTTGGTGGCTGTTTA  292

seq1  CAGGATGGATCCCCGGGTGGGGCAGTCTCTGGATGGTTCTTCCTTCCCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATGGATCCCCGGGTGGGGCAGTCTCTGGATGGTTCTTCCTTCCCCT  342

seq1  GAGAACCCATTCTTATGCCACAGATTTGAATCTGGTTCAGGTGAAAGGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACCCATTCTTATGCCACAGATTTGAATCTGGTTCAGGTGAAAGGTT  392

seq1  ACCGTGAGTGACAGTCTTCACTGTGGCTGTCTCCCCTGTTTAGCTGGCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGTGAGTGACAGTCTTCACTGTGGCTGTCTCCCCTGTTTAGCTGGCAC  442

seq1  AGTCAGGACATCCTGGACTCTGCCTTCTCATCAGTCAGGCTATGACAAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGGACATCCTGGACTCTGCCTTCTCATCAGTCAGGCTATGACAAGT  492

seq1  GTCTTTTTGAGGCAAGGTTACTTGTAAGCACCATTTTCTAATGAGGATGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTTTGAGGCAAGGTTACTTGTAAGCACCATTTTCTAATGAGGATGT  542

seq1  GGACTCTGCCTTCATCCCTGACCAGGCCTCTACAGCAGGCTCATCTTCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTCTGCCTTCATCCCTGACCAGGCCTCTACAGCAGGCTCATCTTCCT  592

seq1  CCTGGGGTTCTCACTGAGTGAGCATAGCATTTCTATGTTTGACAAAAGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGGTTCTCACTGAGTGAGCATAGCATTTCTATGTTTGACAAAAGGA  642

seq1  AAAAAAGGAAAAGATGGGCTCCCTTCTTCTGCTCTCTCCAAGGACTGGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAGGAAAAGATGGGCTCCCTTCTTCTGCTCTCTCCAAGGACTGGCT  692

seq1  GGGGAAACCCTAGGGCCTTCTTTGTCCCTCTTCACTGAGTCTTTTAGGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAAACCCTAGGGCCTTCTTTGTCCCTCTTCACTGAGTCTTTTAGGAC  742

seq1  AAAGGCCCAATTGAGCCTTGTGAATGGCTGGCTGGAGATGGCAGCAGGGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCCCAATTGAGCCTTGTGAATGGCTGGCTGGAGATGGCAGCAGGGC  792

seq1  TTCCAGCCCAGCACAGTGCTGGCTGCACTCGGCTCCTCTTAGGGAGACAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGCCCAGCACAGTGCTGGCTGCACTCGGCTCCTCTTAGGGAGACAT  842

seq1  AGGCTTCGTTGCAAGCTATATCTAGAAGCAGCTGTGGGGTCATGGCAGCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTCGTTGCAAGCTATATCTAGAAGCAGCTGTGGGGTCATGGCAGCT  892

seq1  CCCATGAATCACTCAGAGACCCTGCTTCTGCTCACAACAGCAGCCAGTAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGAATCACTCAGAGACCCTGCTTCTGCTCACAACAGCAGCCAGTAA  942

seq1  AGTCCTGGGCAGCAGAGCTTTCTGGGACCTGATGCCTCTTTCCCTCTCTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCTGGGCAGCAGAGCTTTCTGGGACCTGATGCCTCTTTCCCTCTCTG  992

seq1  AGCTGCTCACTTCCCACATTCTTGGCTACAGATACGAACTTTGCTGGTCA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCTCACTTCCCACATTCTTGGCTACAGATACGAACTTTGCTGGTCA  1042

seq1  TGACCTTAATTGTATCCTTTCCCCAATGATTTTTTTTGCACTATGAATTC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCTTAATTGTATCCTTTCCCCAATGATTTTTTTTGCACTATGAATTC  1092


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |