BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-316A06
Chromosome15 (Build37)
Map Location 26,062,782 - 26,167,492
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene9230109A22Rik, 4930445E18Rik, Basp1, EG432939, LOC100040583, Myo10, LOC100040602, Ppia-ps15_175.1, 1810015C04Rik, Zfp622
Downstream geneAK162044, Fbxl7, LOC622531, LOC625311
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-316A06.bB6Ng01-316A06.g
ACCGA106516GA106517
length1,1211,145
definitionB6Ng01-316A06.b B6Ng01-316A06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,166,369 - 26,167,492)(26,062,782 - 26,063,948)
sequence
gaattcactccctctaataaattaaaagtagaaaaaaattaaatgaatga
atgagtatcatgaccaaaagaaatctagggagagaagggtttatttggtt
tgtagcttacagtccatcatcaagggatgtaacagcaagtgttcactgca
ggtacctagaggccagaaccaaggctgacatcatggaggaatgttgctta
ctggcttgcatcctctggtttaattatctgcctatcttatacagaccagc
cctacctacctagggatggcaccaaccacactaggctggacccttctaca
tcaactaacaattaaaaatgctttgcagacatggccataggccaatatga
tctgagaaattcttcagttgatgtttcctcctcctgggtgactctaatct
tatgccaagttgacagctgaagatatctcaaacaagtagcaaaatgtaaa
tttcaagtaaaatatgtatctatgatttctgtataagcaaacatcttttc
ttactccagatccaagttgtatgtaacaaattatgacatggatttcaaac
atgagtcctctttgaaatgagagaaataaccgaaataatagagacaccaa
taataaatatctatcaatcataaaacatggcaaattctatgaagatgtgc
tagtgataggggctctgtatcttcaacaagaatcacttttccttcagcct
gacttttataacagacgacgttatggacaaactccactcccaacacctcc
tcctaacctacttaatcagcatactgtgtgatattagaatgtgcatcaaa
aatctcatgattactcttcaacagtttgataaatccagagtgaatttaac
tgtgattggtattaagttgtctgctgtctcctggaggtgaaggaatttga
gcattgtttgtttgttttaaggatttattttattttacatactttttatg
tatgtgtatgtgaatatatgtatacaagtaccatagagggccagaagtgg
ggcataaggccccagaggctggattacacatgttttgtggtgccactgat
gtgatgctaaaatctaaatgccagttgttctactctcagctactgggttg
taagtttatagcattgcgagg
gaattctcacttatgcacctatacccacataccctttcttccattttcat
tccttcctacatacttcttcccttatgcccacaaaattaaaaaaatattc
cagtgggaaatatatcttagaaaagatatcttctttgtttttaagcatct
atcacatttctcatctttcctttgagggtggtctccatgtaaacaatatt
cttcttcacatccattcattctgtcatccattccattatttcttggatgc
catcaagaattctaaagagctctttctggagtcattgccatggactgagt
gtctgtacccatctcacttcaaattcacatgttgaagtatccatgtgatg
atttttggagataaagcctttggaagatcattagatttacatgaagttgt
gagcagtagaaaaggctaaccagagtcctcctgatggtattcataatcct
gtgtaaaaagggcagagagctctcctcttctctttcattcttctgtttac
ttaaaaggcagcacatggtcctcatcagtgccaggtattatctatttccc
tgcaatcccatgcagattccaggattcaattcagttaactacttaaactg
tagacttctactactccttaaataagctgacgtgtgactctcttcaaaag
tcatgacagtgctacaaatgatcagcaccctaatgttaactgtttccaga
ggtgaggacattcacaaagctgaggaggttaaaatgaggatttatggctt
ggcatattcccaatatgattggtgaacccaccagaaagatacttacatgt
cataaatgttgaagtgtcatgaatgtagatgttaaagcgtccagcagagc
aaaagtaccaacaggaagggagaggagaggaaaggcacagtagagggctg
tgggagacaataggattgatgcatgtaatgtcacgctcatgtaacttccc
tgagttaaatcttaaaaaaaaaaaaaagagtagcttgggacactgacaca
cacagagctcagattcagcttcagaagaaaataccttgtctttacatcag
tctccagagtcagagggaaaccaaccaaaccaaacaacaaaccaaaacga
accaatctatggtggtgaagctaggctctgatctgaggtgttggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_26166369_26167492
seq2: B6Ng01-316A06.b_44_1164 (reverse)

seq1  CCTCGCAAATGCTATAAAACTTTACAA-CCAGTAGCCTGGAGAGGTAG-A  48
      |||||| |||||||||||   |||||| ||||||||   |||| |||| |
seq2  CCTCGC-AATGCTATAAA--CTTACAACCCAGTAGC--TGAGA-GTAGAA  44

seq1  CAACTGGCATTTAGATTTTAGCATCCACATCAAGTGGCA-CAC-AAACAT  96
      |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||
seq2  CAACTGGCATTTAGATTTTAGCAT-CACATC-AGTGGCACCACAAAACAT  92

seq1  GTGTAATTCCAGCTTCTGGGGCCTTATG-CCCACTTCTGG-CCTCTATGG  144
      |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
seq2  GTGTAA-TCCAGCCTCTGGGGCCTTATGCCCCACTTCTGGCCCTCTATGG  141

seq1  TACTTGTATACATATATTCACATACACATACATAAAAAGTATGTAAAATA  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTGTATACATATATTCACATACACATACATAAAAAGTATGTAAAATA  191

seq1  AAATAAATCCTTAAAACAAACAAACAATGCTCAAATTCCTTCACCTCCAG  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAATCCTTAAAACAAACAAACAATGCTCAAATTCCTTCACCTCCAG  241

seq1  GAGACAGCAGACAACTTAATACCAATCACAGTTAAATTCACTCTGGATTT  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACAGCAGACAACTTAATACCAATCACAGTTAAATTCACTCTGGATTT  291

seq1  ATCAAACTGTTGAAGAGTAATCATGAGATTTTTGATGCACATTCTAATAT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAACTGTTGAAGAGTAATCATGAGATTTTTGATGCACATTCTAATAT  341

seq1  CACACAGTATGCTGATTAAGTAGGTTAGGAGGAGGTGTTGGGAGTGGAGT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACAGTATGCTGATTAAGTAGGTTAGGAGGAGGTGTTGGGAGTGGAGT  391

seq1  TTGTCCATAACGTCGTCTGTTATAAAAGTCAGGCTGAAGGAAAAGTGATT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCCATAACGTCGTCTGTTATAAAAGTCAGGCTGAAGGAAAAGTGATT  441

seq1  CTTGTTGAAGATACAGAGCCCCTATCACTAGCACATCTTCATAGAATTTG  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTGAAGATACAGAGCCCCTATCACTAGCACATCTTCATAGAATTTG  491

seq1  CCATGTTTTATGATTGATAGATATTTATTATTGGTGTCTCTATTATTTCG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTTTTATGATTGATAGATATTTATTATTGGTGTCTCTATTATTTCG  541

seq1  GTTATTTCTCTCATTTCAAAGAGGACTCATGTTTGAAATCCATGTCATAA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTTCTCTCATTTCAAAGAGGACTCATGTTTGAAATCCATGTCATAA  591

seq1  TTTGTTACATACAACTTGGATCTGGAGTAAGAAAAGATGTTTGCTTATAC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTACATACAACTTGGATCTGGAGTAAGAAAAGATGTTTGCTTATAC  641

seq1  AGAAATCATAGATACATATTTTACTTGAAATTTACATTTTGCTACTTGTT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATCATAGATACATATTTTACTTGAAATTTACATTTTGCTACTTGTT  691

seq1  TGAGATATCTTCAGCTGTCAACTTGGCATAAGATTAGAGTCACCCAGGAG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATATCTTCAGCTGTCAACTTGGCATAAGATTAGAGTCACCCAGGAG  741

seq1  GAGGAAACATCAACTGAAGAATTTCTCAGATCATATTGGCCTATGGCCAT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAAACATCAACTGAAGAATTTCTCAGATCATATTGGCCTATGGCCAT  791

seq1  GTCTGCAAAGCATTTTTAATTGTTAGTTGATGTAGAAGGGTCCAGCCTAG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCAAAGCATTTTTAATTGTTAGTTGATGTAGAAGGGTCCAGCCTAG  841

seq1  TGTGGTTGGTGCCATCCCTAGGTAGGTAGGGCTGGTCTGTATAAGATAGG  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTTGGTGCCATCCCTAGGTAGGTAGGGCTGGTCTGTATAAGATAGG  891

seq1  CAGATAATTAAACCAGAGGATGCAAGCCAGTAAGCAACATTCCTCCATGA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATAATTAAACCAGAGGATGCAAGCCAGTAAGCAACATTCCTCCATGA  941

seq1  TGTCAGCCTTGGTTCTGGCCTCTAGGTACCTGCAGTGAACACTTGCTGTT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAGCCTTGGTTCTGGCCTCTAGGTACCTGCAGTGAACACTTGCTGTT  991

seq1  ACATCCCTTGATGATGGACTGTAAGCTACAAACCAAATAAACCCTTCTCT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCCCTTGATGATGGACTGTAAGCTACAAACCAAATAAACCCTTCTCT  1041

seq1  CCCTAGATTTCTTTTGGTCATGATACTCATTCATTCATTTAATTTTTTTC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAGATTTCTTTTGGTCATGATACTCATTCATTCATTTAATTTTTTTC  1091

seq1  TACTTTTAATTTATTAGAGGGAGTGAATTC  1124
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTTAATTTATTAGAGGGAGTGAATTC  1121

seq1: chr15_26062782_26063948
seq2: B6Ng01-316A06.g_66_1210

seq1  GAATTCTCACTTATGCACCTATACCCACATACCCTTTCTTCCATTTTCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCACTTATGCACCTATACCCACATACCCTTTCTTCCATTTTCAT  50

seq1  TCCTTCCTACATACTTCTTCCCTTATGCCCACAAAATTAAAAAAATATTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCCTACATACTTCTTCCCTTATGCCCACAAAATTAAAAAAATATTC  100

seq1  CAGTGGGAAATATATCTTAGAAAAGATATCTTCTTTGTTTTTAAGCATCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGGAAATATATCTTAGAAAAGATATCTTCTTTGTTTTTAAGCATCT  150

seq1  ATCACATTTCTCATCTTTCCTTTGAGGGTGGTCTCCATGTAAACAATATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACATTTCTCATCTTTCCTTTGAGGGTGGTCTCCATGTAAACAATATT  200

seq1  CTTCTTCACATCCATTCATTCTGTCATCCATTCCATTATTTCTTGGATGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTCACATCCATTCATTCTGTCATCCATTCCATTATTTCTTGGATGC  250

seq1  CATCAAGAATTCTAAAGAGCTCTTTCTGGAGTCATTGCCATGGACTGAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAAGAATTCTAAAGAGCTCTTTCTGGAGTCATTGCCATGGACTGAGT  300

seq1  GTCTGTACCCATCTCACTTCAAATTCACATGTTGAAGTATCCATGTGATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTACCCATCTCACTTCAAATTCACATGTTGAAGTATCCATGTGATG  350

seq1  ATTTTTGGAGATAAAGCCTTTGGAAGATCATTAGATTTACATGAAGTTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTGGAGATAAAGCCTTTGGAAGATCATTAGATTTACATGAAGTTGT  400

seq1  GAGCAGTAGAAAAGGCTAACCAGAGTCCTCCTGATGGTATTCATAATCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGTAGAAAAGGCTAACCAGAGTCCTCCTGATGGTATTCATAATCCT  450

seq1  GTGTAAAAAGGGCAGAGAGCTCTCCTCTTCTCTTTCATTCTTCTGTTTAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAAAAAGGGCAGAGAGCTCTCCTCTTCTCTTTCATTCTTCTGTTTAC  500

seq1  TTAAAAGGCAGCACATGGTCCTCATCAGTGCCAGGTATTATCTATTTCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAGGCAGCACATGGTCCTCATCAGTGCCAGGTATTATCTATTTCCC  550

seq1  TGCAATCCCATGCAGATTCCAGGATTCAATTCAGTTAACTACTTAAACTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAATCCCATGCAGATTCCAGGATTCAATTCAGTTAACTACTTAAACTG  600

seq1  TAGACTTCTACTACTCCTTAAATAAGCTGACGTGTGACTCTCTTCAAAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACTTCTACTACTCCTTAAATAAGCTGACGTGTGACTCTCTTCAAAAG  650

seq1  TCATGACAGTGCTACAAATGATCAGCACCCTAATGTTAACTGTTTCCAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGACAGTGCTACAAATGATCAGCACCCTAATGTTAACTGTTTCCAGA  700

seq1  GGTGAGGACATTCACAAAGCTGAGGAGGTTAAAATGAGGATTTATGGCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGGACATTCACAAAGCTGAGGAGGTTAAAATGAGGATTTATGGCTT  750

seq1  GGCATATTCCCAATATGATTGGTGAACCCACCAGAAAGATACTTACATGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATATTCCCAATATGATTGGTGAACCCACCAGAAAGATACTTACATGT  800

seq1  CATAAATGTTGAAGTGTCATGAATGTAGATGTTAAAGCGTCCAGCAGAGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAATGTTGAAGTGTCATGAATGTAGATGTTAAAGCGTCCAGCAGAGC  850

seq1  AAAAGTACCAACAGGAAGGGAGAGGAGAGGAAAGGCACAGTAGAGGGCTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTACCAACAGGAAGGGAGAGGAGAGGAAAGGCACAGTAGAGGGCTG  900

seq1  TGGGAGACAATAGGATTGATGCATGTAATGTCACGCTCATGTAACTTCCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGACAATAGGATTGATGCATGTAATGTCACGCTCATGTAACTTCCC  950

seq1  TGAGTTAAAATCTTAAAAAAAAAAAAAAAGAGTAGCTTGGGACACTGACA  1000
      |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTT-AAATCTT-AAAAAAAAAAAAAAGAGTAGCTTGGGACACTGACA  998

seq1  CACACAGAGCTCAGGATTTCAGCCTCAGAAGAAATAACCTTGGTCTTTTA  1050
      ||||||||||||||   |||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||
seq2  CACACAGAGCTCAG--ATTCAGCTTCAGAAGAAAATACCTT-GTC-TTTA  1044

seq1  CATCCAGTCTCCAGAGTCAAGAGGGAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAC  1100
      ||| |||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||| ||||||   
seq2  CAT-CAGTCTCCAGAGTC-AGAGGGAAACC--AACCAAACCAAACAA---  1087

seq1  AAAACAAAAACAAAAACAAAACCTATGTGTGTTTTGTAGGCTAAGCCTCC  1150
       |||| ||||| ||     || ||||| ||| |    | |||| ||   |
seq2  CAAACCAAAACGAA---CCAATCTATG-GTGGT---GAAGCTAGGC--TC  1128

seq1  TGATCTGAGGTGTTGGG  1167
      |||||||||||||||||
seq2  TGATCTGAGGTGTTGGG  1145