BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-326C22
Chromosome15 (Build37)
Map Location 12,623,715 - 12,736,743
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039772, Npr3, LOC381002, Sub1, LOC100040027, Zfr, LOC100040052, LOC100040066, Mtmr12, LOC100039846, Golph3, Pdzd2, LOC100040109
Downstream gene6030458C11Rik, Rnasen, Cdh6, LOC100039907, LOC666686, LOC239338, LOC666708
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-326C22.bB6Ng01-326C22.g
ACCGA114054GA114055
length1,0121,116
definitionB6Ng01-326C22.b B6Ng01-326C22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,623,715 - 12,624,706)(12,735,621 - 12,736,743)
sequence
gaattccacatgtgcatacacaggtgagaggtagatcgaatctaagatag
gtctggcccccatagactcatgtgctggaatggcactataaggaggaagt
gtatcaatgtgtaggtgggttttgaggtctcctatgctcaagctccaccc
agtttggaagatagcctcttccttgctgcctgaggatcaggatgtagcac
tcagggctcctccagcaccatgtctgcccgcattctgccatgcttcccac
tatgatgacaatggactaaacctctgaaactgtaagccagctccaatgaa
atgtttttatttataagagttgccttggtcatggtgtttcttcacagcaa
tgaagccctagctaagataccacatgtgcacatacatgtgagagacagag
cgtgcttacattgaatcccacgtgtacacacacataaagtcaggggtttt
ttaaggaacagattcccctcccccttcttctctccagctttcctccctcc
ctgtcccacttggccatgtgaagatgcagaaagaactccacaagccagga
agacagccctcactagaatcagccatgctggtgccctgatttcagctttc
tagcctcttttaagtcactaaatccttggtattttgttatagcggcgtta
gcagattgatactaacaagtagagtgctgcttcgacaaataactaaaaat
atggaggtatttttggagctagtattttgggacagagatggtaagaattt
taaggagcatgataactaggaaaactcgtgtcaacgaataggatgttggt
acaaatattaaaaatgaaaaaaaaaaactgtggtgatttgactgagaatt
ccaccctacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacggctcatatgttcgatacttggtctttggctgttggaattgtctgag
aagattaaggaggtgtgcctgttggagggagtatgtctcttggatatgct
tgatgttttcaa
gaattccaggtgcttgatgaacatgtccttgtaggcagagagcacattac
tcctgtaattcggctatcaggctgcatggctacctcggtggtggacgagg
gagttgcaggccccgaagaggaaagaagcaatccttactcctgccagtct
caagatgagttttgggagtttggacatgtctcaacctcaccgttgtccca
ggcctgttccccaagtcacacctctcacttgccccacacaccagctttct
ttctctgtttgatgacataagaaaggtcacttcagcgactgggccttacc
tttcagttctgatcaatagccaatagccttgacaatagcctgtgatgttt
aggggactgtctatggaacccctttgccaacccagtaacatttttaatct
tgtacgtacatggtcaaggatggttggatcttttgtgatctgacatgaat
aagacctgaagagaatcatgttccaaagaggaaagcataacctttgacat
cattttccaagaactgtgtctatgaagtttagatccctaaagttaccctg
cgttgggtgagcattgctgaccactgaagcagcgacgtttcttccccacc
tctggttctttccatccacttagaagcacagctatagccctgcgctgcct
ctctattccttcctgggtcaaagagtaaatgaaggaacatgggatctttt
cttctagaaggatttgttctgctgtcttcatcctccgatgcaaagttttg
aaagtaggcctatgatggtttgtctatccttggaccagggagtggcacca
tctggaggtgtggccttgttggaataggtgtgacctggttggaatgggtg
tgtcactgtgggtgtgggtataagatcctcaccctagttgcctggaagtc
aatctcccactagcagcctttggatgaagatgtagaactctcagtctgcc
tgcgccatgacagcctgatgctgcatgctcccaccttgatgaatatggac
tgaactttggactgtgaacctgtaagccagccccaataatgttgtttttt
ataagacctggacctggtcatgatgtctgtcacatcagtaaacccttact
aagaacaaggccccaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_12623715_12624706
seq2: B6Ng01-326C22.b_52_1040

seq1  GAATTCCACATGTGCATACACAGGTGAGAGGTAGATCGAATCTAAGATAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACATGTGCATACACAGGTGAGAGGTAGATCGAATCTAAGATAG  50

seq1  GTCTGGCCCCCATAGACTCATGTGCTGGAATGGCACTATAAGGAGGAAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGGCCCCCATAGACTCATGTGCTGGAATGGCACTATAAGGAGGAAGT  100

seq1  GTATCAATGTGTAGGTGGGTTTTGAGGTCTCCTATGCTCAAGCTCCACCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCAATGTGTAGGTGGGTTTTGAGGTCTCCTATGCTCAAGCTCCACCC  150

seq1  AGTTTGGAAGATAGCCTCTTCCTTGCTGCCTGAGGATCAGGATGTAGCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGGAAGATAGCCTCTTCCTTGCTGCCTGAGGATCAGGATGTAGCAC  200

seq1  TCAGGGCTCCTCCAGCACCATGTCTGCCCGCATTCTGCCATGCTTCCCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGGCTCCTCCAGCACCATGTCTGCCCGCATTCTGCCATGCTTCCCAC  250

seq1  TATGATGACAATGGACTAAACCTCTGAAACTGTAAGCCAGCTCCAATGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATGACAATGGACTAAACCTCTGAAACTGTAAGCCAGCTCCAATGAA  300

seq1  ATGTTTTTATTTATAAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTTTCTTCACAGCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTTTATTTATAAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTTTCTTCACAGCAA  350

seq1  TGAAGCCCTAGCTAAGATACCACATGTGCACATACATGTGAGAGACAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCCCTAGCTAAGATACCACATGTGCACATACATGTGAGAGACAGAG  400

seq1  CGTGCTTACATTGAATCCCACGTGTACACACACATAAAGTCAGGGGTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGCTTACATTGAATCCCACGTGTACACACACATAAAGTCAGGGGTTTT  450

seq1  TTAAGGAACAGATTCCCCTCCCCCTTCTTCTCTCCAGCTTTCCTCCCTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGAACAGATTCCCCTCCCCCTTCTTCTCTCCAGCTTTCCTCCCTCC  500

seq1  CTGTCCCACTTGGCCATGTGAAGATGCAGAAAGAACTCCACAAGCCAGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCCACTTGGCCATGTGAAGATGCAGAAAGAACTCCACAAGCCAGGA  550

seq1  AGACAGCCCTCACTAGAATCAGCCATGCTGGTGCCCTGATTTCAGCTTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGCCCTCACTAGAATCAGCCATGCTGGTGCCCTGATTTCAGCTTTC  600

seq1  TAGCCTCTTTTAAGTCACTAAATCCTTGGTATTTTGTTATAGCGGCGTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCTCTTTTAAGTCACTAAATCCTTGGTATTTTGTTATAGCGGCGTTA  650

seq1  GCAGATTGATACTAACAAGTAGAGTGCTGCTTCGACAAATAACTAAAAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATTGATACTAACAAGTAGAGTGCTGCTTCGACAAATAACTAAAAAT  700

seq1  ATGGAGGTATTTTTGGAGCTAGTATTTTGGGACAGAGATGGTAAGAATTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGGTATTTTTGGAGCTAGTATTTTGGGACAGAGATGGTAAGAATTT  750

seq1  TAAGGAGCATGATAACTAGGAAAACTCGTGTCAACGAATAGGATGTTGGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGAGCATGATAACTAGGAAAACTCGTGTCAACGAATAGGATGTTGGT  800

seq1  ACAAATATTAAAAATG-AAAAAAAAAACTGTGGTGATTTGACTGAGAATT  849
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATATTAAAAATGAAAAAAAAAAACTGTGGTGATTTGACTGAGAATT  850

seq1  CCACCCCTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  899
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCA-CCCTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  899

seq1  ACACAGGCTCATATGTTCGAATACTTGGTCTTTGGCTGTTGGAATTGTCT  949
      |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAC-GGCTCATATGTTCG-ATACTTGGTCTTTGGCTGTTGGAATTGTCT  947

seq1  GAGAAGGATTAGGAGGTGTGGCCTGTTGGAGGGAGTATGTCTC  992
      ||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGATTAAGGAGGTGT-GCCTGTTGGAGGGAGTATGTCTC  989

seq1: chr15_12735621_12736743
seq2: B6Ng01-326C22.g_68_1183 (reverse)

seq1  TTGGGGCCTTG-TCTTAGTTAGGGTTTTACTGATGTGAACAGACACCATG  49
      ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||
seq2  TTGGGGCCTTGTTCTTAGTAAGGG-TTTACTGATGTG-ACAGACATCATG  48

seq1  ACCAAGT-CAAGTCTTATAAAAAACAACATTTAATTGGGGCTGGCTTACA  98
      |||| || || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||
seq2  ACCAGGTCCAGGTCTTATAAAAAACAACATT--ATTGGGGCTGGCTTACA  96

seq1  GGTTCACAGGTTCAAAGGTTCAGTCCATTATCATCAAGGTGGGAGCATGG  148
      |||||||||  || || |||||||||||  |||||||||||||||||| |
seq2  GGTTCACAG--TCCAAAGTTCAGTCCATATTCATCAAGGTGGGAGCAT-G  143

seq1  CAGCATCCAGGCTGTCATGGCGCAGGCAGACCTGAGAGTTCTACATCTTC  198
      |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CAGCAT-CAGGCTGTCATGGCGCAGGCAGA-CTGAGAGTTCTACATCTTC  191

seq1  ATCCAAAGGCTGCTAGTGGGAGATTGACTTCCAGGCAACTAGGGTGAGGA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAAAGGCTGCTAGTGGGAGATTGACTTCCAGGCAACTAGGGTGAGGA  241

seq1  TCTTATACCCACACCCACAGTGACACACCCATTCCAACCAGGTCACACCT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTATACCCACACCCACAGTGACACACCCATTCCAACCAGGTCACACCT  291

seq1  ATTCCAACAAGGCCACACCTCCAGATGGTGCCACTCCCTGGTCCAAGGAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCAACAAGGCCACACCTCCAGATGGTGCCACTCCCTGGTCCAAGGAT  341

seq1  AGACAAACCATCATAGGCCTACTTTCAAAACTTTGCATCGGAGGATGAAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAACCATCATAGGCCTACTTTCAAAACTTTGCATCGGAGGATGAAG  391

seq1  ACAGCAGAACAAATCCTTCTAGAAGAAAAGATCCCATGTTCCTTCATTTA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCAGAACAAATCCTTCTAGAAGAAAAGATCCCATGTTCCTTCATTTA  441

seq1  CTCTTTGACCCAGGAAGGAATAGAGAGGCAGCGCAGGGCTATAGCTGTGC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTGACCCAGGAAGGAATAGAGAGGCAGCGCAGGGCTATAGCTGTGC  491

seq1  TTCTAAGTGGATGGAAAGAACCAGAGGTGGGGAAGAAACGTCGCTGCTTC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAGTGGATGGAAAGAACCAGAGGTGGGGAAGAAACGTCGCTGCTTC  541

seq1  AGTGGTCAGCAATGCTCACCCAACGCAGGGTAACTTTAGGGATCTAAACT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTCAGCAATGCTCACCCAACGCAGGGTAACTTTAGGGATCTAAACT  591

seq1  TCATAGACACAGTTCTTGGAAAATGATGTCAAAGGTTATGCTTTCCTCTT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAGACACAGTTCTTGGAAAATGATGTCAAAGGTTATGCTTTCCTCTT  641

seq1  TGGAACATGATTCTCTTCAGGTCTTATTCATGTCAGATCACAAAAGATCC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAACATGATTCTCTTCAGGTCTTATTCATGTCAGATCACAAAAGATCC  691

seq1  AACCATCCTTGACCATGTACGTACAAGATTAAAAATGTTACTGGGTTGGC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATCCTTGACCATGTACGTACAAGATTAAAAATGTTACTGGGTTGGC  741

seq1  AAAGGGGTTCCATAGACAGTCCCCTAAACATCACAGGCTATTGTCAAGGC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGGGTTCCATAGACAGTCCCCTAAACATCACAGGCTATTGTCAAGGC  791

seq1  TATTGGCTATTGATCAGAACTGAAAGGTAAGGCCCAGTCGCTGAAGTGAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGGCTATTGATCAGAACTGAAAGGTAAGGCCCAGTCGCTGAAGTGAC  841

seq1  CTTTCTTATGTCATCAAACAGAGAAAGAAAGCTGGTGTGTGGGGCAAGTG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTTATGTCATCAAACAGAGAAAGAAAGCTGGTGTGTGGGGCAAGTG  891

seq1  AGAGGTGTGACTTGGGGAACAGGCCTGGGACAACGGTGAGGTTGAGACAT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGTGTGACTTGGGGAACAGGCCTGGGACAACGGTGAGGTTGAGACAT  941

seq1  GTCCAAACTCCCAAAACTCATCTTGAGACTGGCAGGAGTAAGGATTGCTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAAACTCCCAAAACTCATCTTGAGACTGGCAGGAGTAAGGATTGCTT  991

seq1  CTTTCCTCTTCGGGGCCTGCAACTCCCTCGTCCACCACCGAGGTAGCCAT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCTCTTCGGGGCCTGCAACTCCCTCGTCCACCACCGAGGTAGCCAT  1041

seq1  GCAGCCTGATAGCCGAATTACAGGAGTAATGTGCTCTCTGCCTACAAGGA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCCTGATAGCCGAATTACAGGAGTAATGTGCTCTCTGCCTACAAGGA  1091

seq1  CATGTTCATCAAGCACCTGGAATTC  1123
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTCATCAAGCACCTGGAATTC  1116