BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-340O03
Chromosome15 (Build37)
Map Location 63,709,345 - 63,893,697
singlet/doubletdoublet
Overlap gene9930109F21Rik, LOC665769, 9030605I04Rik, 4933426G20Rik, 0910001A06Rik
Upstream geneLOC100040430, Tsg101-ps, EG239502, EG432959, LOC672194, Mlze, AI987692, Gsdmdc2
Downstream geneDdef1, Adcy8, LOC268812
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-340O03.bB6Ng01-340O03.g
ACCGA124439GA124440
length1,049244
definitionB6Ng01-340O03.b B6Ng01-340O03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,709,345 - 63,710,373)(63,893,453 - 63,893,697)
sequence
gaattccacatcaatcatcagtcagcagaattggtcactgaggtggtcac
aggccaatccgatcttggcaatctcccagctgagattccctcagataact
ctagactgtgtcaagttggcagctggaactaactatggcaggagcagcta
acctgcaaatgcgaatggatagaattaagacagctgggggctgaagagac
ggttcagtgattaagagcatttgatgctttgcagagaaccagtgttcaga
tcccagcattttcactgggtggtttacagccagtcacctgtaactccagc
tccaaggaattgaatgctatcttccagcctcctcaggccctcatgtatgc
atacctacagagacatatatgcacagatatatgacttaaaaataagaaaa
gtaaaaatcttaaaatattcagacatcagcttaacacacacggtccaagt
taacagcatctactgagagaataaatattacccattttcactgagaagat
ccagggatccagctttaaaggttccatcagtggtgtgttagtcagggttc
tctagagtcacagaacttaagggaaattataggaatgacttacagtcttc
tgtccaactaacccaacataggcacctgtgagtgggaagtccaaggatct
agtagtgcctcagtcccatacctctaggtgtttcagctggtcttctgtat
aaactagaatccagaagaagtaggtaacaaccgaagtgccagcaaggaag
tgcaagcaggcaaacaagcaaccttccttctctcattgtccttatatagg
cctcccgcagaaggtgtggcccagattaaaggtgtggataacctcccctg
gacccaccttcttctttacttggaatttgctctgtgccaggctggcctta
aaatcaaaaatgtctttgcctcagtttcctgggattaaaggcatgtacca
tcttggcatgggcctaagcttatcatagtcactgtgcctctcagtcttgg
atgtaaagcctgtgtctgcagcctcaagaattctggagctcaaggtgtg
agcaagtggtgaactcagtggaacacaggctaagtgtagacccctgaccg
tgccctcctcttcccctgctcttccctgcctcctgcccacactcaggctg
cactccaattgccctaagctgtttgaagtccccccagcttcttaggtcct
tgagtctttaaacacttattccaataggagcagcagcaatggtcatagcc
tttctaggttctgtaatagactcattacagtctgttccatttca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_63709345_63710373
seq2: B6Ng01-340O03.b_48_1076

seq1  GAATTCCACATCAATCATCAGTCAGCAGAATTGGTCACTGAGGTGGTCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACATCAATCATCAGTCAGCAGAATTGGTCACTGAGGTGGTCAC  50

seq1  AGGCCAATCCGATCTTGGCAATCTCCCAGCTGAGATTCCCTCAGATAACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCAATCCGATCTTGGCAATCTCCCAGCTGAGATTCCCTCAGATAACT  100

seq1  CTAGACTGTGTCAAGTTGGCAGCTGGAACTAACTATGGCAGGAGCAGCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGACTGTGTCAAGTTGGCAGCTGGAACTAACTATGGCAGGAGCAGCTA  150

seq1  ACCTGCAAATGCGAATGGATAGAATTAAGACAGCTGGGGGCTGAAGAGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGCAAATGCGAATGGATAGAATTAAGACAGCTGGGGGCTGAAGAGAC  200

seq1  GGTTCAGTGATTAAGAGCATTTGATGCTTTGCAGAGAACCAGTGTTCAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCAGTGATTAAGAGCATTTGATGCTTTGCAGAGAACCAGTGTTCAGA  250

seq1  TCCCAGCATTTTCACTGGGTGGTTTACAGCCAGTCACCTGTAACTCCAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGCATTTTCACTGGGTGGTTTACAGCCAGTCACCTGTAACTCCAGC  300

seq1  TCCAAGGAATTGAATGCTATCTTCCAGCCTCCTCAGGCCCTCATGTATGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAGGAATTGAATGCTATCTTCCAGCCTCCTCAGGCCCTCATGTATGC  350

seq1  ATACCTACAGAGACATATATGCACAGATATATGACTTAAAAATAAGAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTACAGAGACATATATGCACAGATATATGACTTAAAAATAAGAAAA  400

seq1  GTAAAAATCTTAAAATATTCAGACATCAGCTTAACACACACGGTCCAAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAAATCTTAAAATATTCAGACATCAGCTTAACACACACGGTCCAAGT  450

seq1  TAACAGCATCTACTGAGAGAATAAATATTACCCATTTTCACTGAGAAGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAGCATCTACTGAGAGAATAAATATTACCCATTTTCACTGAGAAGAT  500

seq1  CCAGGGATCCAGCTTTAAAGGTTCCATCAGTGGTGTGTTAGTCAGGGTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGATCCAGCTTTAAAGGTTCCATCAGTGGTGTGTTAGTCAGGGTTC  550

seq1  TCTAGAGTCACAGAACTTAAGGGAAATTATAGGAATGACTTACAGTCTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGAGTCACAGAACTTAAGGGAAATTATAGGAATGACTTACAGTCTTC  600

seq1  TGTCCAACTAACCCAACATAGGCACCTGTGAGTGGGAAGTCCAAGGATCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCAACTAACCCAACATAGGCACCTGTGAGTGGGAAGTCCAAGGATCT  650

seq1  AGTAGTGCCTCAGTCCCATACCTCTAGGTGTTTCAGCTGGTCTTCTGTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGTGCCTCAGTCCCATACCTCTAGGTGTTTCAGCTGGTCTTCTGTAT  700

seq1  AAACTAGAATCCAGAAGAAGTAGGTAACAACCGAAGTGCCAGCAAGGAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTAGAATCCAGAAGAAGTAGGTAACAACCGAAGTGCCAGCAAGGAAG  750

seq1  TGCAAGCAGGCAAACAAGCAACCTTCCTTCTCTCATTGTCCTTATATAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAGCAGGCAAACAAGCAACCTTCCTTCTCTCATTGTCCTTATATAGG  800

seq1  CCTCCCGCAGAAGGTGTGGCCCAGATTAAAGGTGTGGATAACCTCCCCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCGCAGAAGGTGTGGCCCAGATTAAAGGTGTGGATAACCTCCCCTG  850

seq1  GACCCAACCTCTTCTTTACTTGGAATTTGCTCTGTGCCAGGCTGGCCTTA  900
      |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCACCTTCTTCTTTACTTGGAATTTGCTCTGTGCCAGGCTGGCCTTA  900

seq1  AAATCAAAAATGTCTTTGCCTCAGTTTCCTGGGATTAAAGGCATGTACCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAAAAATGTCTTTGCCTCAGTTTCCTGGGATTAAAGGCATGTACCA  950

seq1  TCTTGGCATGGGCCTAAGCTTATCATAGTCACTGTGCCTCTCAGTC-TGG  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TCTTGGCATGGGCCTAAGCTTATCATAGTCACTGTGCCTCTCAGTCTTGG  1000

seq1  ATGTAAAGCCTGTGTCTTGCAGCCTCAAGA  1029
      |||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  ATGTAAAGCCTGTGTC-TGCAGCCTCAAGA  1029

seq1: chr15_63893453_63893697
seq2: B6Ng01-340O03.g_81_324 (reverse)

seq1  TGAAATGGAACAGACTGTAATGAGTCTATATACAGAACCTAGAAAGGCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATGGAACAGACTGTAATGAGTCTAT-TACAGAACCTAGAAAGGCTA  49

seq1  TGACCATTGCTGCTGCTCCTATTGGAATAAGTGTTAAAAGACTCAAGGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TGACCATTGCTGCTGCTCCTATTGGAATAAGTGTTTAAAGACTCAAGGAC  99

seq1  CTAAGAAGCTGGGGGGACTTCAAACAGCTTAGGGCAATTGGAGTGCAGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGAAGCTGGGGGGACTTCAAACAGCTTAGGGCAATTGGAGTGCAGCC  149

seq1  TGAGTGTGGGCAGGAGGCAGGGAAGAGCAGGGGAAGAGGAGGGCATGGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TGAGTGTGGGCAGGAGGCAGGGAAGAGCAGGGGAAGAGGAGGGCACGGTC  199

seq1  AGGGGTCTACACTTAGCCTGTGTTCCACTGAGTTCACCACTTGCT  245
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGTCTACACTTAGCCTGTGTTCCACTGAGTTCACCACTTGCT  244