BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-342H02
Chromosome15 (Build37)
Map Location 25,982,431 - 25,983,522
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream gene9230109A22Rik, 4930445E18Rik, Basp1, EG432939, LOC100040583, Myo10, LOC100040602, Ppia-ps15_175.1, 1810015C04Rik, Zfp622
Downstream geneAK162044, Fbxl7, LOC622531, LOC625311
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-342H02.bB6Ng01-342H02.g
ACCGA125528GA125529
length1,09184
definitionB6Ng01-342H02.b B6Ng01-342H02.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcaaggaagatggggtatcctctctgttctctacactgacacaaag
gtctcctccatgctgaaattggtcaggatgctaacgtctctttctttggc
aaagatttacccctttctactcattgtctccctttctcatttctcattct
ctgtgattaagtaaagcttgatgttagcaccattgaaggctgaggtcatt
tcacagtgcatactaatttgccctggtctgcctgtaaagtgttttcagat
ctcaagcccaatgcattttgttgctggatgtttagaaaacgccatgtata
acacaagttgtcactcctgtggcagactccttctagaagtgataatgaac
ctggcgatgtttgtacaaaaggataaagtctcaataagtcacagctttcc
tctggcaggccattatcactatcaagacagtctgcagtacctgcagattg
ggtaagaacaaaagcatcctttacagatgtctgatatcttactgcagagt
cctcattcccccagccccaagaatgaatcacttgtcagaggaaattatgc
agataactttcatgcagctacgctgataacaaattaacactcagagtagc
tatgtgcattcattgtactgatacaagtcaacttgtctgatgcagcttaa
tatccttcagggtaataatgatttacatcaactgtgtagagacaccaggg
aggcccttctcgccatctggaaagtgacacctttgtttccctgttttcag
tatccactctttatgctgaggttgcaggtcctggtggtgtctcacagctg
gttataacatcatcactgctgaggggaatgtaatgattgcttatcacatg
tagtttttgtggcattctcagaggttcatagaactataaaccctcagaaa
actatggtggttcagaaagtagcatacagagcccacttgctcattttcta
agagagtttacaggtgatccagtcaagtaactggttactgaattttaata
cttctatcatctaatctattgtgtttgcaaatcatctatttgtcctgaca
taacataatctcaaggaggttatttttttcttagctatgtc

cagggcagggaggtgggagtgggtgggtgggcagagtaacctcatagaag
cagggggagggaggatgggatggggattttgatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_25982431_25983522
seq2: B6Ng01-342H02.b_47_1137

seq1  GAATTCAAGGAAGATGGGGTATCCTCTCTGTTCTCTACACTGACACAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGAAGATGGGGTATCCTCTCTGTTCTCTACACTGACACAAAG  50

seq1  GTCTCCTCCATGCTGAAATTGGTCAGGATGCTAACGTCTCTTTCTTTGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCTCCATGCTGAAATTGGTCAGGATGCTAACGTCTCTTTCTTTGGC  100

seq1  AAAGATTTACCCCTTTCTACTCATTGTCTCCCTTTCTCATTTCTCATTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGATTTACCCCTTTCTACTCATTGTCTCCCTTTCTCATTTCTCATTCT  150

seq1  CTGTGATTAAGTAAAGCTTGATGTTAGCACCATTGAAGGCTGAGGTCATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGATTAAGTAAAGCTTGATGTTAGCACCATTGAAGGCTGAGGTCATT  200

seq1  TCACAGTGCATACTAATTTGCCCTGGTCTGCCTGTAAAGTGTTTTCAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGTGCATACTAATTTGCCCTGGTCTGCCTGTAAAGTGTTTTCAGAT  250

seq1  CTCAAGCCCAATGCATTTTGTTGCTGGATGTTTAGAAAACGCCATGTATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGCCCAATGCATTTTGTTGCTGGATGTTTAGAAAACGCCATGTATA  300

seq1  ACACAAGTTGTCACTCCTGTGGCAGACTCCTTCTAGAAGTGATAATGAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAGTTGTCACTCCTGTGGCAGACTCCTTCTAGAAGTGATAATGAAC  350

seq1  CTGGCGATGTTTGTACAAAAGGATAAAGTCTCAATAAGTCACAGCTTTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCGATGTTTGTACAAAAGGATAAAGTCTCAATAAGTCACAGCTTTCC  400

seq1  TCTGGCAGGCCATTATCACTATCAAGACAGTCTGCAGTACCTGCAGATTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGCAGGCCATTATCACTATCAAGACAGTCTGCAGTACCTGCAGATTG  450

seq1  GGTAAGAACAAAAGCATCCTTTACAGATGTCTGATATCTTACTGCAGAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAGAACAAAAGCATCCTTTACAGATGTCTGATATCTTACTGCAGAGT  500

seq1  CCTCATTCCCCCAGCCCCAAGAATGAATCACTTGTCAGAGGAAATTATGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCATTCCCCCAGCCCCAAGAATGAATCACTTGTCAGAGGAAATTATGC  550

seq1  AGATAACTTTCATGCAGCTACGCTGATAACAAATTAACACTCAGAGTAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAACTTTCATGCAGCTACGCTGATAACAAATTAACACTCAGAGTAGC  600

seq1  TATGTGCATTCATTGTACTGATACAAGTCAACTTGTCTGATGCAGCTTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGCATTCATTGTACTGATACAAGTCAACTTGTCTGATGCAGCTTAA  650

seq1  TATCCTTCAGGGTAATAATGATTTACATCAACTGTGTAGAGACACCAGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCTTCAGGGTAATAATGATTTACATCAACTGTGTAGAGACACCAGGG  700

seq1  AGGCCCTTCTCGCCATCTGGAAAGTGACACCTTTGTTTCCCTGTTTTCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCCTTCTCGCCATCTGGAAAGTGACACCTTTGTTTCCCTGTTTTCAG  750

seq1  TATCCACTCTTTATGCTGAGGTTGCAGGTCCTGGTGGTGTCTCACAGCTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCACTCTTTATGCTGAGGTTGCAGGTCCTGGTGGTGTCTCACAGCTG  800

seq1  GTTATAACATCATCACTGCTGAGGGGAATGTAATGATTGCTTATCACATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATAACATCATCACTGCTGAGGGGAATGTAATGATTGCTTATCACATG  850

seq1  TAGTTTTTGTGGCATTCTCAGAGGTTCATAGAACTATAAA-CCTCAGAAA  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TAGTTTTTGTGGCATTCTCAGAGGTTCATAGAACTATAAACCCTCAGAAA  900

seq1  ACTATGGTGGTTCAGAAAGTAGCATACAGAGCCAACTTGCTCATTTTCTA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ACTATGGTGGTTCAGAAAGTAGCATACAGAGCCCACTTGCTCATTTTCTA  950

seq1  AGAGGAGTTTACAGGTGATCCAGTCAAGTAACTGGTTAACTGAATTTTAA  999
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AGA-GAGTTTACAGGTGATCCAGTCAAGTAACTGGTT-ACTGAATTTTAA  998

seq1  TACTTCTATCATCTAATCTATTGTGTTTGCAAATCATCTAATTTGTCCTT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
seq2  TACTTCTATCATCTAATCTATTGTGTTTGCAAATCATCT-ATTTGTCC-T  1046

seq1  GACATAACCATAATCTCAA-GAGGTTATTTTTT--CTAGCTATGTC  1092
      ||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||
seq2  GACATAA-CATAATCTCAAGGAGGTTATTTTTTTCTTAGCTATGTC  1091


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |