BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-050D21.T7 (MSMg01no050_d21.b1) | MSMg01-050D21.TJ (MSMg01no050_d21.g1) |
ACC | AG279384 | AG279385 |
length | 1,012 | 1,195 |
length of high quality (start - end) | 403 (10 - 412) | 384 (71 - 454) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_d21.b1 PHD_FILE: MSMg01no050_d21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:48:17 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_d21.g1 PHD_FILE: MSMg01no050_d21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:48:17 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCCTCTAATTTTGATGACTGCTTTTATTTCTTTAGGAGTTATTGGACTGT
TTAGATGGTTTATCTGATCCTGACTTAACTTTGGTATTTGATATCTGTCT
ACAAAATTGCCCATTTCATCCAGATTTTCCAGTTGTTTTGAGTATAGACT
GTTTTTTATAGCTCCCTTTTCATTTCTAATTTTTGTAATTTAGATACTGT
CTCTGTAACCTCTAGTTAGTCTGGCTAAGGGTTTATCTATCTTGTTGATT
TTCTCAAAGAACAAGCTCCAAGTCTTGCTGATTCTTTGTATAGTTCTTTT
TGTTTCCACTTGGTTGATTTCAGCCATGAGTGTGATTATTTCCTGCCCTC
TACTCCTCTTGGGTGTATTTGCTTTTTTAAAGTTCACTCTTACAAAAAGC
ATTTAATGAAAAGGAGCAAACTGAGAAAAGACAAAAATGAAATATTTGGT
TTGAGTATTGAAGGGGTACCAGGAAGCAAAATGGAACTGAGTCTTATGTT
TTAGTAGATAACAGATTAAGGGAGTGGGACTTTGTGACCAGATCTCACCC
AGTTCAGTTTAAGTCCACGTATAGCATAGTGGTACATACCTTTACTCCAT
GATAGAGAGATAGATAGAGAGATACCAGAGAGATAGAGAGATATATAGTG
ATATTCTTCTCTTTCTTTGCTTCATCTTCCCCTGTTCCTTTATCCATTTC
TGGATATGAAATTTCTTTCCTCTTGCTCTCGATGAAACATCCCTTTTAAT
TTCTGATATATCTTTGTAATCTTTTATTTCTCAATTTTCCATATACTATT
TTCTATACCTTGTTTTTTTTTTATTTTTATATTTATTCTTTTTATCATTT
TTCTACTTTTTCTATCTCTCTTTTTTATTTTCTCTTCTCTTTTTTTCTTT
TTTTCTTTTCTTCTTATTCTTTTTTTACTTCTTCCCTTTTTTCTTCCTTC
TCTTCTTTATTACACTCCTTTCTTTTTAATTCTTATTCTTTTCTTTCTTC
ACTTTTCTTACC
| NNTTATTGATGGATGCGGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTGAAAATACAGCAGGGAATGTTTGGGAA
CATCAGCAGTAGACACATGGGTAAACTATAAATATAGTCAAGAAGCAGAT
AGCCATGCATGTTAGAGCTCAGCTCAATGTACCCTCTTCCTTGATTCTTG
CTGTTCTGTAGAAGAGGTATCAGTCTTCTCTATTAACTTAATATGAATTA
AATCTTGCAAAAGCATTCCCAGAAAATTGGGTTTACACTGATATGGGATC
ATGTCATGATGTCAATTAATATACACACTGATAAAAACAATCACATATTG
TTTGAAATATGAGTTCATCCTCGAACACAAAAGCCAGATAAAGCAGTCCA
ATTATGGGAATAGGATCCACAGGTAGGTATCAGAGTTAAGGAGCCCTTGC
TCCTTTTGTCCCCCCACCCTTATGAAGCACAAGCTGCATATATCACTAGT
AAGTGCAGGAATTCTTGGTTTAACCCATGCTAAAACTTCGGTAAGTGGTT
CAGTCTCTGGGAGCTCCCAAGAGCCCAGGTAATTGGTCTTCCTGTGAAAT
TTCTATCCCTTCAGTTCCCTCAATCTTTCTCCAACTCTTCCATAAGACTC
CCCTTACTCAATGTAATATTTGGCTATGGGTCTCTGCATCTGTTTCAGTC
AGCTATCTAGCTAGAGCCTCTCAGAGGAGAGGTATGCTAAGCTCCTGTCT
ACAACCCTCACAAAGTATTATTTAATAGTAGCAGGTATTGGTTCTTGCCC
ATAGGATCAAGTCCCAAATTTGCGCCCGTCATTTCTTTGTTTGGCTTATT
CCTCAAGAATCTGTTTCCATCCTTTGCCCCCAGAACGTCCTTGCCTATCT
AATTCATGGTCTACAATAATGGTGGTTTCATTTTCCCTCCTTTAAATCCC
CTACCTCCGCTTTATTTTAAAACCCCCTTACCTTTTTTTTGAAATCTTTT
GTTCTCGCTACATTTAAAAATTCAGTCTTTCCTAATATAAAAAACTATTT
TTTTTCTCTTTTCCCCATTTTTCTAATTTTTTTTTTTCTCGGACNCCATT
TTTCTCATCTTTTTATATGGGTGGCCTTTTAAATATGTCTTATTTCCAAT
CATTTTTTTCACAAAAGATAAAACATAATCTTTCTATAACACATA
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 7 10 12 12 16 25 19 28 28 27 30 28 28 28 24 28 28 31 43 43 47 47 43 43 43 43 43 31 36 28 28 22 28 31 37 33 28 36 36 32 40 36 41 41 41 41
36 36 19 19 15 29 24 37 37 43 44 44 48 48 57 44 43 32 32 16 24 11 12 15 24 24 32 32 57 44 44 42 33 31 42 42 50 57 57 59 57 54 54 57 57 57 48 48 48 57
57 54 54 54 57 59 57 57 52 52 52 52 52 54 50 50 37 37 37 44 43 28 28 28 44 44 59 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 43 44 43 33 33 43 43
42 43 43 57 57 57 57 43 43 35 43 43 52 57 57 57 57 57 57 57 45 45 45 57 57 52 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 44 44 35 35 35 44 44 62 62 52 52
52 62 62 62 52 52 52 62 62 52 62 43 43 39 39 39 43 43 45 52 52 62 62 43 39 39 62 39 39 39 62 43 43 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 43 43 52 43 43 39 39
43 62 43 43 43 43 43 52 52 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 43 43 43 44 43 43 39 24 13 13 26 39 44 62 62 62 62
62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 43 62 62 62 62 43 39 35 43 44 62 43 43 43 43 35 35 43 44 62 44 43 31 31 34 41 20 20 16 26 32 34 17 18 18 27
27 31 43 44 43 59 59 59 59 59 43 35 35 39 43 38 43 42 42 42 43 57 43 43 43 43 39 39 42 43 33 22 22 34 43 57 52 52 57 52 38 38 20 20 20 41 41 43 52 52
52 52 57 52 43 43 35 32 22 17 17 17 21 21 11 11 11 26 26 17 18 15 27 12 12 12 18 27 36 42 35 33 33 33 35 35 24 24 12 11 10 20 21 41 42 38 42 33 31 35
42 43 43 42 42 35 42 42 44 42 42 23 41 19 14 9 9 9 12 12 13 11 15 12 10 11 8 8 8 13 25 28 22 16 18 15 15 16 25 13 13 11 12 24 28 33 33 30 30 39
25 25 15 11 11 11 11 11 23 18 15 15 12 12 14 28 28 13 12 11 11 10 10 8 8 8 8 10 19 24 28 39 30 30 17 14 14 16 13 11 17 19 11 11 11 17 10 10 10 10
8 8 8 9 11 8 12 12 19 14 15 11 11 11 8 10 6 6 8 8 9 18 15 20 19 19 26 15 16 12 12 9 8 8 8 8 8 12 12 14 11 12 8 6 6 8 8 8 8 8
13 8 8 11 11 12 11 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 11 11 13 10 19 16 18 16 15 13 11 11 11 11 12 18 11 10 9 9 9 9 9 8 10 10 8 8 8 9 9 8
8 10 13 10 8 8 8 10 10 10 8 12 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 11 11 11 9 9 9 9 9 9 10 10 7 7 8 6 8 8 8 10 10 8 8 8 9 9 10 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 8 8 9 9 9 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 16 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 12 10 10 8 8 8
9 12 9 9 11 9 9 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 7 9 12 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 15 15 18 15 11 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8
8 8 10 8 8 6 7 11 8 10 9 9 9 14 12 14 16 13 16 8 8 6 6 8 8 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 8 8 10 9 9 10 10 12
16 11 11 11 11 11 11 11 10 13 13 16 16 8 10 8 8 10 8 8 8 10 10 15 8 11 11 11 15 14 8 8 8 10 10 8 8 8 6 6 8 8 11 11 8 8 15 15 15 10
10 6 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 10 10 10 10 12 8 8 8 8 8 6 8 8 8 9 9 9 15 11 11 13 15 8 8 8 8 8 8 8 7 7
9 7 11 10 10 8 13 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 12 10 8 8 8 8 6 8 8 10 8 8 6 6 8 8 10 10 12 9 8 8 8 10 8
6 6 8 8 8 6 8 10 8 9 9 9 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 8 9 9 13 8 8 8 15 12 10 9 9 12 11 12 12 10 13 9 11 12 28 26 33 30 30 30 33 30 36 36 50 36 36 42
42 43 43 47 57 43 59 47 47 43 43 39 37 37 39 32 42 39 46 43 43 43 46 43 37 46 42 48 48 48 41 41 39 39 43 44 46 46 54 57 57 57 57 57 46 40 36 28 28 36
44 57 44 42 35 31 28 24 28 30 21 24 32 42 42 47 57 50 50 47 47 47 50 38 50 41 37 37 35 35 35 35 35 43 43 32 32 32 43 43 35 43 43 59 44 57 57 57 44 44
35 35 35 33 33 33 33 33 33 43 43 43 43 43 43 24 32 18 19 34 34 34 39 43 43 43 52 52 43 32 19 24 18 35 35 34 38 43 52 57 57 44 43 35 35 35 44 44 57 57
57 57 52 52 52 57 57 62 62 62 62 43 44 43 45 62 62 62 62 44 44 35 35 35 43 44 62 62 52 52 52 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62
62 62 62 62 62 62 52 43 47 39 35 35 35 43 59 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 62 44 52 52 57 57 57 44 57 39 39 39 57 57 52 52 57 57 52 52 42 42 43 43
52 52 45 45 45 52 52 59 57 57 57 57 44 44 33 43 43 52 52 52 57 57 57 52 57 57 57 59 59 57 52 52 57 57 59 59 68 59 59 54 57 50 57 43 43 43 52 52 59 57
57 59 57 57 54 54 54 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 44 44 44 43 43 43 43 43 44 43 43 43 44 44 48 48 48 47 42 42 37 37 42 32 25 21 21 15
18 15 28 15 15 15 24 24 42 44 48 57 48 48 48 48 57 54 54 48 40 37 28 28 28 33 40 36 39 32 32 28 43 43 48 44 57 59 48 48 48 48 48 48 46 32 41 34 18 18
11 11 9 9 14 15 10 6 6 6 6 10 10 11 12 14 14 23 30 59 59 59 43 37 37 37 30 30 32 34 35 35 28 28 28 20 24 11 10 8 8 8 6 6 6 7 10 8 11 13
19 30 37 48 46 47 39 39 35 37 39 59 59 59 59 39 35 35 39 59 48 42 36 36 36 36 42 48 48 41 37 23 23 23 23 20 13 13 10 10 12 17 29 31 36 44 25 25 25 30
44 32 32 21 24 24 27 24 24 18 19 32 24 24 33 42 42 32 25 25 23 23 23 32 32 42 37 37 35 24 24 30 30 32 25 32 35 37 43 50 50 38 36 17 17 24 36 38 47 35
37 37 50 43 43 44 44 57 57 57 50 57 43 43 42 42 42 47 44 57 46 48 48 48 38 29 24 22 21 16 32 25 19 11 11 11 25 25 44 39 43 43 32 32 19 19 19 32 32 44
37 30 32 29 37 37 31 36 42 39 26 28 14 14 14 28 28 24 24 15 15 12 19 19 23 41 30 24 15 15 11 12 16 27 25 26 19 12 12 16 22 30 25 31 30 24 15 11 11 11
18 18 20 24 24 22 19 15 9 9 9 15 12 10 11 11 18 22 31 31 21 16 10 11 11 15 15 12 16 16 12 12 12 12 16 12 13 12 15 11 11 12 15 13 12 8 8 8 10 10
10 8 8 6 6 6 6 12 14 10 11 11 11 16 13 10 9 10 19 14 13 24 28 28 13 10 8 8 8 8 8 9 12 12 10 11 10 10 10 10 12 9 9 11 17 25 18 16 12 10
10 11 8 8 8 8 8 6 6 7 8 12 12 15 13 13 12 12 9 9 10 10 10 10 8 8 8 8 9 9 9 10 8 8 10 8 8 8 9 11 11 18 14 12 10 9 10 10 11 12
12 18 10 10 8 8 10 8 11 11 10 8 8 8 10 13 15 13 12 8 8 8 8 9 9 9 9 10 13 11 11 9 10 9 8 8 8 11 11 11 13 11 11 11 9 8 10 8 6 6
8 8 10 10 10 8 10 9 10 10 11 11 10 8 8 12 13 13 12 8 9 10 10 10 10 10 17 15 14 14 15 13 15 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 11 8 8
6 6 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 10 10 12 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 10 8 8 8 9 9 12 10 9 8 8 8 9 12 15 16 28 27 30 30 17 13
8 6 8 6 6 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 8 8 6 6 6 6 6 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 12 19 9 8 8 8 8 8 10 10 10
20 24 13 10 10 8 8 8 12 21 21 12 14 8 8 9 9 12 13 12 11 9 10 9 9 11 11 18 19 14 14 13 13 16 9 11 13 10 10 9 10 9 9 3 0 3 6 6 8 8
10 8 8 12 8 8 6 7 10 15 8 10 8 8 7 7 7 9 8 10 6 6 6 8 6 10 10 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 8 8 10 12 10 8 12 8 9 8 6 6 6
6 6 6 8 8 11 11 11 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 10 7 6 6 6 8 6 8 6 6 6 6 13 7 9 8 7 6 8 6 6 6 6 8 8 6 |