BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-050P22.T7 (MSMg01no050_p22.b1) | MSMg01-050P22.TJ (MSMg01no050_p22.g1) |
ACC | AG279901 | AG279902 |
length | 1,190 | 1,199 |
length of high quality (start - end) | 502 (40 - 541) | 433 (70 - 502) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_p22.b1 PHD_FILE: MSMg01no050_p22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:50:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_p22.g1 PHD_FILE: MSMg01no050_p22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:50:02 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TTATTCATTGGGCCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGCAATTCT
TTGTTTAGCTCTGTGCCCTTTTTTTTAATGGGGTTATTTGAATTTCTGGA
GTCCAGCTTCTTGAGCTCTTTGTATATATTGGATATGAGTCCCCTATAAG
ATTTAGGATTGGTAAAAATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGCATTTTTGTC
TTATTGACAGTGTCTTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCAATTTCATGAGGTC
CCATTTGTTGATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATTGCTGTTCTGTTTA
GGACTTTTTCCCCTGTGCCCATATCTTTGAGGCTTTCCCCCACTTTCTCC
TCTATTAATTTCAGTGTCTCTGGTCTTATGGCTACATTTCTTTCTCTCGT
CACCTAGCCCCTCTTCTCTTCCAGGTTTCCAAAATGCCTTTCCAGGCTAG
AACCCAGCTTGTGGTCTGCTGGCCGGACACAACACCTTATGATTGGCATC
AGACTGCAAAGTCCACTCTCCGCCCAGGACAGTTTATAGTATGGAGGACC
GAATATGAGGATATAGCAAAGGAAGTGGTTCAAAATTTAGCCTTTAAGAC
CAAGGCAGATAAACCTACTATGAAAATGCTCTTGGGTAGACAGGACTATC
CATCCCCTCAGGACCAAGCTGGTTTAAAAAGGGAAGTACTGGAAGAAGAT
TCTAAGATAGCAGTGGCTGCTTGGTGAAGGCTCCCTCCTGCTGATGGTAA
CACACCTGTATTATCATTAATCAATCAAAACCTAGATGAATTGTATGAAG
AATTTATTGCTAGACTGGAATCAACACCATGCAGGATGCTTCCCTCCTTC
TGAAGGTCTCTGACATACTTATTTAAAACTAATTTTGTATGGGAAAAAAT
GCTCAATCACTCTCTGCCCGGAAATTTATTTTATACCAATCCTGAATTAA
CTTGGTATTTGTGGTAATACCTCACCTTCAATGTCAATTATCCTGTATGC
CCTTCCCCCCTTCCCTGGTTTCCTGAGCGTAAATATTTCTATATGCTTGG
CTGTAATATGGCCAAGGGTTTTAACAATTTTTTCAATGGCCCTTATTGGC
TTCTTAACACCTTTTATTAATGGCAGAGTAAATAAACCTCTCCCAAAAGG
TGTTGTTCTCGGGTTTATTTCTTCTTTTGTCAATACTCCA
| TTTTTAAAGACGGAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAGTCATGACGTATTAAGACTGTGCGTTTTT
AGTGTGAGCGTTTTGCTCTAATCTGGGTAGAAGTGAGACTCTTCAGTCCT
GCTCTGGTTGTAGGGGCCAGGGGCTTTAGTTTCTTCTTGCTCTTTTCCCC
CCTCTGTTATCTTTGCCATTTCATAGTAAATATAACATGCGTCCACATTT
TCCCCCCTGTACCCATTGTTACACAGAAGCCCAGTTTCTGACCTTCATAT
TCACTGTCTCTCCATGTTTTGTGGTGGTACCTTGCTTTGGGGTCTTAAGT
CACTGATGGATTTTCAGATCATCTCTCTCTTTTTTAATTGTTATATGGGG
ATAGCAGGGATGGTTTCCAAGCTCCCGCAGCCCCAGCTCTCAGCCCCCAG
GGCTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCAGTACTTGTTCTGTACACCAGGC
TGGCCTCGAACTCACAGATCTGCTTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGAT
TAAAGGCGTCCAACACTACCAGCTGGCTGGTTTCCAGCTCTTAACCCGTT
CTAGCCCATACACTGGACATGTGAGACTATTTTGATTTCATGCTCTCCCG
TTCTTCTGGCTTGTTGACTTAAACGGCAAGTGTGTGCCCTGACCGTGAGC
ACCGGGCATCATTCTTTTTTTTTCTTAAACATGTTTCTATTACTTTGTCT
CACTGTAGAGTTTCCATCTGCTGTACTCCATCCTCTCTTGACTGAAGTCG
TCTTCTTTATATAGGAACATCTTTTTAATTCGGTGTCTGGCTTTACAGGT
TTCAGAAGTTTCTGTTTCCATTTATCATTTAATGGTGGCGTTGTATTGTG
CACCCCTCCATTTCAGGTTTTTTCTATTAGGATGGACCTTGTAAACTTTC
TACTCCTCCTGGTTTTTAACGGTACCATCTTAATAATTGGGTCTCCCCAT
CGTTCTTTATGAATTAAGTTTTTTTTACTATTTTCCTCCCTCCCCCAGTG
GATTATATCTTGGGTTTTTCTACCCTCTTATAACTTAATGTGCCCCTCCT
TCCGGGGTTCCATGTTTATATTTTTAAACCCCTCCCCCATCTTTCTTCTT
TATATACTCTATGTAATCTCCTCTTTGGTTCCTGCTCTCTCCCTCTCTG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 10 8 8 8 8 8 14 12 10 10 8 8 8 10 8 8 10 11 14 11 8 8 8 11 12 14 17 21 28 25 28 28 33 30 33 33 37 30 24 15 11 11 11 23 21 28 28 28
28 32 34 30 28 30 28 28 28 43 37 25 33 22 22 19 18 13 11 12 11 18 18 29 26 32 37 30 37 37 35 36 33 34 36 27 27 28 35 35 39 39 43 43 48 42 42 35 35 39
32 25 25 22 19 19 12 17 12 11 11 18 20 19 32 29 41 42 47 36 38 37 36 40 32 32 37 42 38 38 25 24 24 36 36 43 48 44 44 40 35 32 35 41 36 30 20 19 14 14
16 28 32 32 32 37 43 43 38 43 28 28 28 43 33 37 43 43 52 52 57 57 57 52 52 44 43 28 28 28 36 36 23 36 36 52 43 43 32 32 29 29 35 44 47 43 43 35 59 37
43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 44 44 43 43 39 39 57 57 57 43 43 31 31 35 35 35 35 43 43 52 45 43 59 43 43 43 47 39 39 26 43 26 43 43 35 35
39 43 62 62 62 62 62 62 52 62 52 52 52 62 62 62 62 52 62 45 43 43 34 19 19 19 23 36 33 38 12 12 13 38 38 52 62 62 52 52 52 52 62 62 62 43 43 39 43 35
39 31 39 39 43 62 62 62 62 62 62 62 44 43 31 31 44 44 43 43 23 29 35 43 31 31 31 39 39 39 39 39 39 39 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 52 62 62 62
62 62 62 62 43 43 39 35 35 43 43 43 38 26 26 26 43 44 44 43 29 15 12 29 33 43 43 43 43 31 35 44 44 62 44 43 31 43 43 62 62 62 52 52 43 43 34 12 8 8
8 19 33 44 44 26 26 26 35 43 44 57 59 59 59 59 59 59 57 57 52 35 35 20 20 20 38 38 44 43 35 35 35 43 39 39 39 42 57 44 44 33 23 23 27 20 20 20 24 24
29 38 38 43 27 20 10 10 12 25 38 43 43 35 35 42 59 52 52 43 43 38 27 27 28 28 32 32 32 27 23 23 27 43 43 43 52 50 50 50 57 57 57 57 50 43 43 32 20 20
20 28 20 37 37 37 27 20 20 20 28 28 37 37 37 43 32 26 16 11 9 9 12 16 32 36 36 37 28 32 32 37 37 37 36 41 23 15 14 30 30 25 19 12 12 12 15 12 10 8
8 8 12 21 37 26 29 20 28 23 33 36 37 37 29 29 30 28 28 19 22 12 13 13 22 19 20 20 20 30 30 28 22 20 34 30 27 27 27 27 25 34 34 37 34 28 18 18 11 22
15 19 26 27 33 25 25 25 30 33 37 28 28 23 28 32 47 48 40 37 19 19 12 19 19 18 27 23 30 20 20 18 34 23 18 18 11 11 11 18 12 14 17 30 30 43 43 48 34 34
28 28 28 36 29 35 32 32 32 28 22 15 10 10 10 12 12 18 23 25 30 30 25 26 32 21 12 12 12 10 14 18 15 15 16 24 26 20 23 12 9 9 15 12 9 9 9 8 15 22
17 18 15 18 16 17 11 19 12 21 21 14 10 10 8 8 10 16 18 28 24 27 17 11 10 13 9 9 10 10 20 19 21 19 19 19 19 14 14 10 9 9 9 17 9 8 8 10 8 9
11 16 10 10 8 8 10 12 10 16 13 20 14 13 12 13 11 11 11 13 13 9 9 9 9 9 9 10 16 8 8 8 11 8 8 10 15 21 21 14 14 23 15 12 8 8 8 12 10 9
9 9 10 19 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 9 12 11 11 11 10 10 9 9 12 15 20 19 19 10 9 11 9 9 9 9 11 12 20
19 16 13 12 6 7 6 6 8 8 10 10 8 8 8 9 9 9 9 14 14 17 18 11 12 11 9 10 8 6 6 6 8 10 9 9 10 8 10 10 8 8 10 9 14 15 17 13 11 12
17 10 10 10 9 6 8 6 6 8 8 10 12 15 12 9 8 8 8 8 8 12 10 9 9 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 10 8 11 11 11 13 11 11 10 10 12 10 13 10 11
10 10 10 10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 7 9 9 11 9 9 9 10 12 10 10 8 8 8 8 8
10 12 9 9 10 10 10 13 11 10 8 10 8 8 8 9 9 9 9 12 15 12 7 8 6 6 6 8 9 9 9 10 12 13 14 13 11 8 10 11 9 8 8 8 8 11 10 8 8 6
8 8 6 6 8 8 10 13 12 10 10 10 9 11 11 10 11 14 11 13 13 11 10 10 8 8 10 10 13 22 28 23 14 11 8 8 7 6 6 8 8 8 8 9 9 10 8 8 8 7
6 7 8 8 8 15 15 15 8 10 9 9 8 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 8 10 8 6 6 6 6 6 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 10 6 8 8 13 7 9 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 6 6 8 8 9 9 11 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 15 11 8 8 3 0 3 15 14 14 14 14 19 26 19 28 22 24 24 21 15 10 10 12 25 19 43
39 36 35 39 39 48 59 59 59 47 42 32 28 23 23 24 22 19 16 15 15 24 28 42 46 43 48 41 41 37 41 41 42 43 37 37 32 36 28 21 19 21 38 38 42 47 42 41 37 32
32 22 29 24 18 10 15 15 19 24 28 28 42 37 35 35 35 24 30 24 28 36 44 44 44 37 37 35 35 37 37 43 28 28 22 32 32 43 50 52 52 50 50 50 41 37 37 35 42 42
35 35 35 57 38 57 44 44 28 32 32 43 43 52 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 39 28 21 11 21 16 13 38 26 39 39 35 39 39 43 43 52 52 52 57 57 57 57
57 57 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 43 43 35 39 39 62 62 52 62 43 43 33 43 39 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 52 52 43 43 43 43
62 62 62 62 62 62 43 43 43 43 43 43 62 62 57 57 57 57 68 57 57 57 54 54 57 44 43 35 35 35 47 44 57 57 57 57 57 59 57 57 57 52 52 57 57 52 52 52 57 57
57 57 57 57 57 38 43 31 35 35 43 43 43 43 35 35 35 44 44 59 52 52 52 57 57 38 27 15 12 12 13 23 14 13 15 15 12 30 24 43 43 43 23 23 43 44 43 48 48 50
44 43 23 28 36 36 44 30 30 14 19 19 29 41 48 48 48 43 47 39 39 39 32 32 20 20 20 41 34 59 57 57 57 59 59 59 59 43 39 39 37 37 37 37 37 32 30 15 12 12
11 12 12 15 22 26 33 33 33 33 27 27 23 23 23 34 34 46 46 43 43 43 43 43 39 39 33 33 30 30 23 28 28 28 21 22 11 10 10 19 16 12 23 23 34 30 34 32 19 19
11 11 11 13 19 28 35 32 32 28 20 15 15 12 12 12 24 27 37 30 25 25 28 32 24 30 18 23 10 10 10 17 17 37 32 25 25 25 17 17 11 11 11 16 24 32 32 30 17 17
17 27 18 20 20 32 22 18 14 18 18 20 30 20 23 25 32 37 35 35 36 50 50 43 30 16 16 16 28 32 35 35 35 35 37 36 37 30 24 24 23 12 9 9 9 24 18 30 28 36
28 21 19 11 11 11 11 18 12 11 11 10 10 10 11 21 19 29 28 19 17 14 14 15 20 12 11 11 12 23 34 32 23 15 10 10 10 10 12 28 27 59 30 27 11 11 18 18 30 32
41 28 28 13 12 12 11 9 9 12 16 13 15 16 10 10 17 21 17 17 21 24 20 18 8 8 8 8 8 22 30 48 48 48 48 32 26 12 12 10 10 19 8 8 8 8 8 9 13 16
15 10 6 6 8 6 7 8 7 7 10 8 11 11 23 18 20 12 15 12 10 10 9 10 12 16 13 19 13 13 11 11 10 16 18 20 25 24 26 24 28 20 15 13 10 10 8 8 8 8
8 8 9 13 10 10 10 12 10 11 12 10 20 20 30 30 30 23 23 10 10 10 14 10 10 11 8 10 9 9 10 10 10 14 15 9 9 9 17 8 10 8 8 8 8 8 10 10 13 10
8 8 10 8 8 6 7 8 8 18 18 14 10 10 9 8 8 8 8 8 8 9 12 9 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 10 11 9 9 10 10 10 9 9 9 9 9 9 8
8 8 8 8 8 12 12 10 10 14 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 13 12 12 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 13 12 13 13 10 15 8 8 8 8 8 8 13
12 16 10 8 8 8 8 10 10 10 8 8 7 7 9 10 10 8 8 8 11 15 10 10 8 8 8 10 11 11 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 8 8 11 10 6 6
8 8 8 8 8 9 11 10 10 10 10 10 13 11 11 10 12 11 10 13 10 9 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 9 8 8 6 6 11 12 9 9 10 13 10 10 10 10 10 10 10
8 8 8 10 8 7 6 10 8 8 8 8 13 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 9 11 12 10 9 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 7 7 8 8 13 18 9 9 9 9 9 9 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 11 10 9 9 9 8 8 8 8
6 6 8 8 8 8 8 8 9 12 12 11 9 9 9 10 13 8 8 8 8 8 8 8 7 7 10 8 11 11 11 11 8 11 15 15 10 8 8 8 8 6 9 8 8 8 10 8 8 10
10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 10 8 8 8 8 9 8 10 8 8 10 13 10 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 10 11 11 15
8 8 8 10 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 12 9 14 14 15 15 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 12 13 8 10 10 9 9 10 12 12 9 9 9 9 |