BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-057P20.T7 (MSMg01no057_p20.b1) | MSMg01-057P20.TJ (MSMg01no057_p20.g1) |
ACC | AG285011 | AG285012 |
length | 713 | 719 |
length of high quality (start - end) | 603 (37 - 639) | 502 (72 - 573) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no057_p20.b1 PHD_FILE: MSMg01no057_p20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:00:07 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no057_p20.g1 PHD_FILE: MSMg01no057_p20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:00:08 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCGAGAATCCGCGGAATTCTACAA
GACCTTTCCAGAAGACCTGATACCAATTTTCCTCAAACTGTTGCATAAAA
TAGAAAGAGAAGGAACACTACTTAACTTGTTCGATGAAGCCACAATTACT
CTGATACCTAAACAACACAAGGACACAACCAAAAAAGAGAACTTCAGACC
AATCTTGCTTATGAATATCGATGCAAAAATACTCAATAAAATTCTTGCAA
ACTAAATCCAAGAACACATCAAAACCATCATTTACAACTGTTGCTATAAA
TCTCCAACCCAAATAAGCCTGGACAATGAAAACACAACTCAATTAATATG
AACACAAGCTTTGTGCCTAGATTGGGCAGATCTACCACTACACTACCATC
TTCTCTATATAACAGACCCCTTAGAACTTGGGGTTTCTCTAGGCCATGTG
CTCTTCTTGTACTTCCATAGACCTCTCTCTCTCAAAACCTTCAGCTCCAC
CTTCCCCTCTTTTCTGCCCAATCACTGGCACTAGCCTTTATTTATAAATT
AAGGTGGGAAGAAGGTTTACAGGAAATCACCTGAATGCTGACTCACTCCT
TGTTTACAACCCCTCACAGGAGAACTGAATTAACATCAAATAAAATTAGC
CTCAGGGCTATCTGCAACACATCAGATCAAGTAGGCTTCATCTCAGAGAT
GAAAGATTGGCTC
| AATACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTGGGACTTGTTATTTCCATTTGAGTTT
TATAATTTTTCCCCTCCACCATTTCCTTTGAAGAAGAATGGCCTTGGACT
TTCGATGGGGGAGTTCACTCACTCTGTAGGTTTCTGTCAGTGATGCAGCC
ATTTTAATGCTATTAATTCTGCTGATTGATGATCTTCTATTCTATTTTCA
CCACCTCTTTCATTGTTTGATGCTTGTCATGGTAGTATTCTCTAAATCAT
GGTTAAGTTTATGTCTTGGCAAATTATCATATTTTTATTCTACTTAAATT
ATTTTCAATGACATTATTACTGGAGTTTAGAAAAACTTCTGATGTATATA
TCTTAATTTTGAGACCCTCTATTTGGATGAAAATATGTCTCAGCTTCCAA
GACTCTCATAATGGGCATTTCCTTTCAAGTGCTATTTGCCTTTTTCAGCC
CCTTTCTTTGTATATTACTAAAGAGATTTGTACTTATTTCTAACAAGAAA
ACTGGATGTGCGTAATATTAAATTTACAGAATGAAAATAATGAATCGCGT
TAAGAAGCCTTCCTACTCTTCATGTTTTGTATAGCAAAGTTGAGAGTATT
TGGTATTAATTCCCTGATTCTCGGCATACTATTAAAGGTGAATCCCTTTT
GTCCCTGTGTCGTCTAATC
|
quality values | Open.Hide.18 23 28 28 23 23 19 13 8 8 8 8 17 17 26 22 12 9 9 10 22 21 21 10 10 10 12 11 8 8 8 8 8 8 12 16 21 30 23 33 33 33 33 36 36 36 31 27 27 27
27 34 30 21 13 6 6 6 6 6 9 23 23 29 26 29 32 33 37 37 37 50 33 33 36 36 36 57 57 57 57 37 42 37 40 40 47 57 57 50 50 42 42 42 42 50 50 68 68 50
53 48 48 48 53 57 68 68 57 57 57 54 54 44 43 39 39 37 39 43 44 48 57 57 57 57 57 68 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 48 57 48 54 54 57 57 59 57 57 50
50 50 50 50 50 50 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 57 57 68 57 57 57 57 52 57 57 68 68
57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52
62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 43 43 39 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 47 44 28 20 14 16 29 32 32 39 43 43 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 62 62
62 62 62 62 43 43 39 43 43 57 57 57 39 39 39 44 35 35 31 31 31 43 43 35 43 43 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57
59 59 59 57 57 57 57 44 44 23 21 13 12 12 12 26 38 43 52 52 41 41 59 44 43 43 43 52 50 50 52 43 43 47 59 57 57 57 59 59 59 57 57 57 48 46 46 43 47 47
59 59 59 59 59 59 47 47 43 44 44 47 47 54 59 59 59 34 25 11 11 11 25 32 57 59 57 57 59 48 48 43 46 46 57 57 57 48 48 57 57 57 54 54 54 57 57 57 59 48
48 43 57 48 48 48 48 48 48 48 57 57 57 59 59 59 48 48 48 41 41 41 47 37 34 28 20 20 34 34 39 47 47 47 40 40 47 43 48 57 59 59 59 48 48 48 48 48 43 43
43 35 35 35 35 35 41 33 33 31 29 32 32 39 43 39 43 43 43 43 43 48 43 43 43 37 39 37 35 35 37 42 42 43 46 46 43 43 43 57 59 59 57 57 57 57 48 48 48 43
47 43 43 47 39 39 30 30 30 37 37 47 39 37 33 39 39 40 34 37 30 30 25 27 30 32 35 25 31 39 39 39 47 30 24 24 18 18 15 21 23 23 18 18 18 16 18 24 24 25
25 26 23 20 22 24 20 23 28 32 33 35 24 28 23 24 19 21 21 19 19 17 17 10 15 15 20 20 28 32 28 28 21 17 14 13 13 21 14 14 15 26 22 22 12 12 12 15 19 28
16 17 17 19 18 27 32 21 9 8 8 7 7 | Open.Hide. 8 8 8 8 9 9 9 13 19 11 11 9 19 17 31 26 28 37 37 37 37 39 37 37 39 39 37 29 23 15 9 9 12 11 11 11 10 10 10 10 10 10 15 13 13 12 10 11 14 26
21 36 36 53 44 33 33 33 21 19 10 10 11 11 11 10 16 22 30 33 33 41 41 43 43 43 39 39 47 47 50 50 53 53 57 47 50 37 37 36 36 33 37 42 42 42 42 48 48 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 48 48 41 41 41 42 50 46 50 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 32 32 30 30 32 38 46 57 57 57 54 54 54 57 57
57 57 57 38 38 50 50 50 59 57 50 50 43 52 52 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 42 42 43
43 52 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 45 45 45 57 57 57 57 57 57 57 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 45 57 46 57 57 52 52 57 57 57 52 52 57 52 57 45 52 52 52 52 43 43 35 39 33 35 39 43 43 52 52 52 57 52 52 52 57 57 52 43
42 43 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 29 31 43 44 59 54 57 44 44 33 41 43 43 43 43 35 35 35 43 47 57 52 48 48 57 50 50 44 43 43 43 43 43 35 35 35 37 42
43 47 47 39 39 35 35 35 37 42 35 33 33 35 42 42 43 42 42 28 28 18 18 18 24 22 21 27 14 15 18 31 28 35 37 32 39 39 43 39 39 35 37 41 43 47 43 43 33 33
30 32 32 43 30 35 35 35 43 40 37 28 28 18 19 9 9 9 12 13 20 23 30 28 31 28 28 34 34 25 25 30 37 37 39 39 39 36 36 28 28 24 14 14 18 24 28 23 28 28
32 39 43 40 40 29 25 25 40 36 39 31 31 30 31 37 33 33 32 37 37 42 42 32 31 20 19 20 16 19 13 15 15 28 26 37 37 44 44 48 48 42 47 37 37 28 36 28 28 28
28 32 36 32 33 25 25 23 23 23 23 23 28 28 28 35 39 37 37 28 23 22 23 21 18 20 24 29 23 22 25 29 21 21 32 37 37 36 36 35 35 25 24 24 24 25 25 28 25 23
28 28 28 28 25 23 28 21 17 11 10 10 10 14 21 25 28 28 28 26 19 19 18 18 21 22 12 12 12 25 21 28 24 20 12 10 10 10 10 10 15 11 11 13 9 10 10 12 10 14
16 12 12 12 12 12 15 14 20 26 32 37 37 23 19 11 11 11 16 14 12 13 12 14 14 23 11 13 6 6 8 8 12 12 13 13 18 18 22 19 13 17 11 11 11 21 21 31 25 25
25 20 19 21 22 16 10 11 9 9 8 8 8 8 13 18 15 18 14 18 18 15 12 10 9 9 9 9 9 13 18 18 19 20 23 23 20 23 20 18 18 12 11 8 8 8 8 8 8 10
10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 14 12 15 8 8 10 8 |