BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-106L15.T7 (MSMg01no106_l15.b1) | MSMg01-106L15.TJ (MSMg01no106_l15.g1) |
ACC | AG320730 | AG320731 |
length | 1,275 | 1,297 |
length of high quality (start - end) | 699 (88 - 786) | 609 (91 - 699) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_l15.b1 PHD_FILE: MSMg01no106_l15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:07:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_l15.g1 PHD_FILE: MSMg01no106_l15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:07:35 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCATCTTTTTNNNCACATTGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCAGTACTGCCCCTGGTATCCCTTTATCTCTTTGAGTAAAA
GTTAGGTCACTGCCCTTCACCGGAATTTACCATCACTAAGGAAGAAAGAA
GTTTCTGACCATAGGAGAAACCAGAATAGATATTTAGAATTATAGCTGAG
TTACACCTATATACAGGAATTTACAATGGTTTAGGAAGTAGATCCAGCTG
TGGTTTTAGAGTATTGCATTATTCATGAGATGGTTAGCTAGAACGGAACT
CCCTAATTAGAACCATGACTTGGGTGTGAAAGCCCTTGCCCTAGGAGTGA
AAAGTTCTCACACCTGGCTTCTAAGACTATAGCTGACCTTAGATAGGGCT
GACTCTGTCTCAGTTATTTTATTGCCCAGTTCCTGCCAGTATTTGCGTTT
TCATTTCCTCTGTTCTGTGTAAGAGTCATTAAGCATCCGGTTACCTCATT
TGTACCTTGTGGGTATGTCACCCAACTACCTTGTTGTCTTCTGCATAAAA
AGTCTGTTGTTCGATTTGAAAAATTACACTCAGATTCCACATGAACTCTC
CTGTGTGTGTGTCTGTTTGTCGCTCATCCACGTTTTGCCCACCCGTGTCG
AGAGACCCCGTTCCACGCAGACACAGGGACCCAGAAGGTCTGCGGCAGTC
AGGATGGATGATTGTTTTGATGTGTTCTTGGATTCGGTTAGCGAGAATTT
TATTGAGTATTTTTGCATCGATATTCATAAGGGAAATTGGTTTGAAGTTC
TCTATCTTTGTTGGATCTTTCTGTGGTTAAGGTATCAGAGTAATAGTGGC
TTCTTAAAATGAGTTGGGTAGAGTACCTTCTCCTTCTATTTGGTGGAATT
AGTGGTGCAAACCGGGGATTAGATCTCCTTTGAAGGTCTGAATAAACGCT
GGCCTTAAACCATCTGGGCCTGGGGTTTTTTTTGGTGGGGAGACCTTAAA
GACCGGCTTTTATTTCCTTTAACGAAAGGGGCCATTTTAATCCTTTTATT
TTGATCCTGGTTTTACTTTTGGGACCTGGTTATCTGGCTATAAAAATTGG
TCCCTTTTTGTCCAGATTTTTCCCCTTTTTTTGGGAATATCACCTTTTGT
TAAAAAAGATTCAGAGGGTGTGTTTTAAATATCTTTCGGCGTGGGGGTGT
TGTTCGTCCCTCCTTCCTTTTCGAGAATTTGGTACATAAATAATATTCGC
CTGGCGTCCCATTCCTCAGTATGTG
| NCCCGGTTTTTTTTTTAGAGCATGGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCTTGACACATGCCAATTA
AAAAGCCATGATTCCAGCACTCCCCTAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGA
GTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGGGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTA
TACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACAAAGAAACAAAAAAGACTCCAAGC
ATGTTGCCTTTTTTAGTGATTCCTGCAACGCTGGCACGTTGACTAGCATC
CCATGCTCTACCACTGCTCTTGAAATCTGTTCTTCCTTCCACAGCCTTAT
CCAGGACAGATCCTAGCAATGAGGTTTTCAGAGAGTCAGCACAGCAGGCC
CCATGCTGGGTTTTAGAACAATATGCTATCAAGTCTGGCCTATGACTGAC
AGAGGAACACATTTTCTTTATAATTATACACTGCTGTAAAAGTTGCCTAG
TTGATAAAAGTACTTTTGCTGTGTGAGGCCTTATCAACAATGCTTGCTTT
CTGTCTAGGTTTTTAGGTCTTCTGACAGGTGTCAGGCCTAAGGAAACCAT
GAGACAGTCCCCCTAGTCCCTCGTGCAAACCTTAGTTTCTACCAACCTCA
GACCGGTTCCTGATGGAAGCTGCTGGAGACACCCACTGCTTTTTCATAAC
CGTGGTTTCTGTACGCCCTTCTCATGCTTGTGGAATTGCCTGGACACCCG
TGCTTAAATAGCGCCACCTGCTGGCTGTCCTTTCTCCTTAACCTTATTGA
ATGCCACCCTCTTCTGTTAACTGATCCCTGAGACCTGCTGATCCTTTTAC
TGAGTCTTTACTCTTTTGGGTGGTCCTGCAGGGCCCCTGAAGCCAAAAGA
ACTATTGGTCAAATATATTTTGTTTTTCATAATCCTCATGGAAAGGATAC
CGGCCCCCCAGGTGTTATTCACTTTCCAACTGCTTGATCCCTTTTGGGAC
GATTTTTTTCCAAAAATCTGTCCTTACTCCAAAGGTTTTGCTGGAACTTG
GTGTCTTGGGGAAGGCCTTTTTTTCAAATTTTTATAATGTTTGGTATTTT
GTGCCCTCTTTGGTTGGTTATAATTTCTGTTTTCTTATTTGTATACCTTT
ATCCTAAAAATAATTTTTTCCTGGTGTAAAATTCTATCGTGGGTTTAATT
TTATTCTTTGTCCTACTTTGTGTTATTTAATGTGCTGTATCTAAATAACT
TATGTGTTTCTTCTTATCCTCTTTGTCTTGCTGATTCTCTTATCTCT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 10 9 3 0 0 0 3 8 8 7 7 13 13 10 10 12 11 8 8 8 6 6 8 19 17 14 17 17 18 18 22 24 24 28 35 36 34 34 34 34 34 37 43
50 53 53 47 47 47 40 40 37 57 37 35 35 38 35 35 36 36 33 31 28 28 28 22 19 8 8 7 7 8 8 9 8 12 9 10 13 19 26 29 30 31 29 32 36 36 38 38 42 57
50 50 50 50 50 50 50 47 47 42 42 42 42 42 47 36 23 17 12 12 21 19 24 24 40 36 47 47 48 48 41 47 47 47 41 41 50 50 50 57 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68
59 57 57 57 57 57 57 57 57 47 57 47 47 47 57 57 57 59 57 57 57 54 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 50 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 68 68 57 57 57 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68
68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 62 62 59 47 39 39 39 43 43 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59
59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 54 54 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 57 57 57 59 59 57
57 57 57 57 54 47 57 47 47 48 48 48 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 43 43 43 46 46 57 57 48 48 48 47 48 48 54 54 54 44 40 24 24 24 33
33 48 48 54 54 54 48 47 43 43 43 40 43 35 30 30 37 37 36 36 37 35 35 37 37 30 37 33 36 37 37 37 37 32 28 31 34 37 37 39 40 39 37 43 39 34 28 25 25 36
36 43 48 48 48 48 48 42 37 37 37 23 22 19 23 24 24 37 34 34 28 23 19 17 10 10 12 19 30 37 37 39 39 44 39 37 37 37 37 37 39 43 43 43 28 32 19 19 9 9
11 26 26 43 43 30 30 17 17 24 30 37 39 37 23 20 12 12 13 17 15 10 10 10 15 12 14 19 24 32 29 29 27 29 16 18 18 21 17 12 17 11 11 16 23 29 41 40 40 39
32 31 28 23 25 29 32 30 30 22 22 21 20 13 15 10 10 9 9 15 13 15 15 15 11 9 9 9 9 9 14 17 15 15 16 16 17 15 19 16 10 8 8 8 10 10 10 9 10 10
12 9 12 8 8 8 8 10 17 17 22 14 14 18 25 30 30 15 15 13 13 11 16 11 13 11 12 11 11 11 11 11 11 15 15 10 14 14 15 22 11 11 10 11 11 15 9 9 9 8
8 8 8 8 8 8 8 12 12 10 9 7 7 8 8 10 11 12 11 14 9 9 8 11 8 8 8 8 11 17 14 14 10 8 8 8 8 8 8 10 10 9 10 10 13 15 18 10 10 10
9 9 8 11 7 8 8 7 6 8 8 10 8 9 9 10 10 9 8 8 11 9 10 8 10 10 15 22 25 22 22 10 6 6 6 6 8 6 10 12 11 11 10 12 14 12 12 12 14 10
10 12 10 10 11 12 19 11 9 9 9 10 14 14 13 13 14 10 11 11 12 8 8 8 10 10 14 11 12 10 10 10 10 8 10 8 8 8 8 10 13 13 11 13 12 9 9 9 10 10
17 12 9 10 10 8 8 8 8 9 12 16 10 10 10 13 12 9 12 9 9 9 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 17 11 12 15 15 10 10
11 10 10 10 15 18 9 12 6 6 8 12 8 8 6 6 8 10 10 12 10 10 10 10 16 22 17 20 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 11 8 8 8
8 8 12 12 12 10 9 9 9 10 10 9 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 9 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 6 6 6 6 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 6 6 6 8
8 8 8 8 10 10 8 6 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 6 6 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 9 9 11 11 9 12 11 9 12 16 9 9 6 6 6 8 8 8 9 8 9 9 7 6 6 6 6 10 17 11 12 13 8 8 9 9 12 12 19 23 15 15 8 10 10
19 19 22 22 24 28 28 28 35 37 37 34 34 34 34 29 36 53 36 41 41 37 37 37 47 39 23 18 9 9 9 11 11 9 8 8 8 8 10 10 21 21 29 29 30 37 47 47 53 50
50 50 59 59 57 53 42 42 38 38 36 36 33 41 37 37 42 33 23 21 10 10 12 12 11 12 10 10 10 15 21 31 37 37 39 46 43 43 43 48 48 57 59 53 47 50 47 47 48 57
57 50 50 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 57 54 50 43 43 48 48 41 41 40 46 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 44 40 25 25 28 32 32
32 32 46 57 48 48 50 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 59 52 52 52 52 52 57 57 57 52 52 57 57 57 59 54 54 54 59 59 57 57 57 52 57 57 57 59
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62
62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 62
62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 39 43 43 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 39 39 23 13 13 13 17 23 29 43 44 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 52 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 62 62 62 62 62 62 44 44 35 35 35 43 43 62 43 43 21 21 21 43 43 43 44 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 52 45 45 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 52 52 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 44 44 35 39 39
44 44 44 44 27 33 33 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 43 43 32 32 32 44 44 57 57 38 32 14 14 24 27 21 28 28 44 43 52 52 52 43 43
43 28 28 28 36 36 44 44 50 50 50 54 50 50 50 50 39 37 37 37 37 32 25 20 17 20 28 32 43 44 44 43 48 44 57 57 57 59 57 57 47 46 37 38 28 22 24 21 27 22
28 24 33 33 37 36 47 35 37 37 39 39 33 37 37 39 30 30 17 17 19 32 34 46 43 24 24 11 11 10 17 17 33 33 43 43 48 48 48 48 46 59 59 25 18 11 11 10 11 15
11 11 11 11 11 15 24 21 21 15 19 22 16 14 12 14 14 29 29 33 42 47 31 32 23 19 19 15 25 25 22 22 21 29 29 29 28 28 32 28 32 11 8 8 8 8 11 23 30 19
17 12 12 10 10 8 8 8 10 14 21 30 21 21 18 18 16 23 21 13 13 9 9 9 11 10 12 12 14 20 19 14 13 11 11 17 21 24 11 10 10 9 9 10 14 15 26 25 19 19
17 26 23 19 12 15 11 12 12 18 18 22 29 23 18 8 8 8 8 8 12 19 13 8 8 8 8 12 16 20 9 9 9 8 8 10 6 6 6 6 8 8 11 15 8 9 11 8 8 8
8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 7 7 8 13 11 11 11 15 15 10 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 21 26 29 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8
8 8 8 8 8 17 13 9 9 9 8 12 11 9 9 9 15 13 14 14 19 13 17 16 19 10 10 11 12 12 12 12 12 8 10 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8
10 10 12 10 8 8 8 10 8 10 8 6 6 6 8 8 10 6 7 7 10 10 10 10 10 10 11 11 9 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 10 19 19 19 8 8 8 8 10 8
8 8 8 10 10 8 8 10 8 8 8 8 10 10 8 9 9 9 9 10 10 8 10 8 8 8 9 10 8 10 10 9 10 9 10 10 14 19 15 13 13 10 12 12 15 10 8 8 8 6
8 8 8 8 8 10 11 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 10 19 13 10 8 6 8 8 8 8 8 9 10 17 15 12 10 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10
10 8 8 8 10 13 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 7 7 6 6 8 8 9 9 9 9 9 8 8 8 7 8 7 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 6
6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 15 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 6 7 8 8 10 11 9 9 12
8 10 8 8 8 11 8 8 8 8 8 10 10 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9
9 9 9 9 9 10 8 13 7 9 7 7 8 8 8 8 8 10 10 6 7 6 10 8 10 9 9 7 7 8 8 9 9 12 11 10 10 10 10 7 6 6 8 6 7 15 7 |