BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-110F06.T7 (MSMg01no110_f06.b1) | MSMg01-110F06.TJ (MSMg01no110_f06.g1) |
ACC | AG323282 | AG323283 |
length | 726 | 701 |
length of high quality (start - end) | 283 (46 - 328) | 570 (75 - 644) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no110_f06.b1 PHD_FILE: MSMg01no110_f06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:13:53 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no110_f06.g1 PHD_FILE: MSMg01no110_f06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:13:53 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCTCATATTTAAGGATAAACACATACTTTAATTTCCTTAGACCCACT
AGTAGTGAACCGACTTCACCTTACATAGTGAATGAAAATGTTATACTTTG
AGTTCTTCTGGATTAAAGTGAACAGTGCTGTTAGGGAAAGAAAGGCCTGC
ATTCTAATCTGGAAAATGAACTCTGAATGAGGGACTTCATTACATTTATC
TATCTGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTCTGT
TTTATCTAATCTTCACTACAAATAAGAACCAGTCTGCTAGAAGGGATAAA
GGTTGCCTGGTAATCATGAACAATTATAAAAACATGTCCTAGCCTGAATA
TTTATATCAAATCACTAAGGATCAGTGGTGTTATTGCATTCATCTACCAA
AACAAGATTGTTTACTTAAGATGTATGCTTGATATGAAGTGAGGCATACA
CTTATTGATACATTGCTCAGCTGTTAAAGTTTTTGCTCCGTATTCTAAGC
CTTAACACCGCATGCCGCAATTCCAATTCTTTTTGCCCCATATTTATTAT
TACTTAAAAACTCCCCCCCGGACAATCAATAATCTACACTAAATTTTAGT
GATTATTATCTCACCTAATTTTCTTAATTTATATTAAAACAACCCTACCC
CTAAATCGTTTATAATTTTCGCCCTA
| ATGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGAACTCTTCAGCTGGGGAACGGTGG
TAATGAAGTGTTCCCACAACACAGACTGTTGAGAAGGATTCAACTGCGTG
AATTCAGAACTCTTCAGCTGGGGAACAGGGTACCCGTAAGTATAGCTTTA
CAAGGTAAGTCTGGTCTTGAACTTTCTAACGAAATTCAAGACAGTCTATC
AGAAGTAAAGTGGGAAATAGCTTTACAAGGTACGCCTGGCCTTGAACTTT
CTAACGAAATTCAAGACAGTCTATCAGAAGTAAAGTGGGAAATAGCTTTA
CAAGGTAAGTCTGGTCTTGAACTTTCTAACGAAATTCAAGACAGTCTATC
AGAAGTAAAGTGGGAAATAGCTTTACAAGGTATGTTTGGCCTTGAACTTT
CTCTAGTGTTAGGAGCCTTTTTGTTCTTTTTCACATGTTATCAAGTGGTT
AAGGTAGGGCTGAAAATTCTGGATGAAATTCAGGGCAATCTATCAGAAGT
AAAGCGGGGAGAGAGAGTAGGAGCAAAGAGGAAATATGGTACACAAAATA
AGTATACAGGCCTTTCCACGGGTCTTGAACCCGAGGAAAAGTTTAGGTCA
GGTAAGAATACCTGGCGAGAGATTAGAAGGAAGGAGAAGGAATAAGAACA
G
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 7 7 7 15 19 43 41 37 37 32 31 31 30 32 33 33 33 39 37 37 37 43 31 24 24 24 15 15 17 12 11 11 20 20 35 42 42 34 34 28 36 36 40 41 57 57 43
43 47 47 68 68 68 68 54 43 37 37 37 24 24 16 29 32 57 57 57 50 50 50 50 48 48 57 57 59 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 57 57 47 47 47 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 43 43 46 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 51 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 39 57 43 57
57 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68
68 57 57 57 57 54 59 59 59 59 57 57 44 44 43 47 43 59 57 57 57 57 47 47 43 47 47 57 54 48 48 57 48 48 48 57 48 57 57 59 59 59 54 54 54 54 47 47 43 43
43 46 46 48 48 43 43 43 36 43 43 39 39 39 39 35 40 40 30 30 30 32 30 28 18 13 13 24 22 24 19 13 13 13 28 21 21 15 11 11 11 11 11 12 15 15 29 29 37 32
30 30 28 28 23 20 18 30 17 14 13 13 13 11 11 13 13 10 10 16 15 19 25 33 33 37 22 21 12 12 12 18 24 36 39 46 37 37 24 22 12 12 11 12 15 28 24 35 35 42
36 42 30 30 30 44 28 24 22 17 18 24 17 17 17 24 18 12 11 11 15 21 19 16 13 12 10 10 10 9 14 14 20 26 33 35 36 36 24 24 20 23 23 28 28 23 21 23 15 14
14 14 21 21 12 13 13 15 15 19 22 25 17 19 11 12 15 10 9 10 12 14 13 13 13 11 10 14 15 15 24 21 12 11 11 11 10 10 10 17 16 11 10 9 9 9 9 13 11 8
8 8 8 8 12 10 10 8 8 8 8 9 9 10 8 10 10 10 10 10 10 10 13 13 13 11 12 11 11 11 12 12 8 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12
12 13 18 12 12 11 11 10 8 8 8 8 8 11 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 12 13 11 15 8 10 8 13 12 12 12 11 13 11 10 10 10 11 10 8 9 9 15 10 10
8 9 9 10 11 13 12 12 11 11 12 9 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 10 10 14 11 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 10 14 13 13 10 9 10 10 8 8 10 8
8 8 8 9 12 8 9 10 10 10 8 10 10 10 10 8 11 7 9 10 10 10 10 9 9 9 9 8 12 8 9 8 8 10 15 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 12 11
11 11 11 10 9 8 10 7 9 10 8 10 10 10 15 23 12 13 8 8 7 7 9 9 9 9 | Open.Hide. 9 17 10 8 8 8 9 12 12 20 18 24 37 37 37 47 40 39 43 43 37 39 47 39 47 39 43 30 32 17 20 15 28 24 31 32 24 22 23 25 30 33 44 68 68 68 54 51 50 50
50 50 51 68 68 48 48 37 41 24 21 28 28 35 48 44 57 54 47 47 57 50 48 41 41 41 50 57 57 68 68 50 50 50 48 48 50 59 59 59 59 57 57 57 57 57 43 43 43 59
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 50 50 50 50 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 57
40 42 39 34 24 44 44 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 68 68 68 68 62 68
68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 54 54 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 45 45 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68
68 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 59 59 57 52 52 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 59 43 43
31 35 35 42 42 43 52 57 43 43 33 33 33 44 44 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 43 43 43 44 47 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 54 57 59 59 57 57 57 57 57 54 47 48 48 48 48 44 43 28 25 25 36 36 48 48 48 57
57 54 48 47 47 42 48 42 42 42 36 39 43 43 43 43 43 43 40 40 43 43 43 43 43 37 37 37 37 37 37 35 35 31 29 34 28 28 28 36 36 39 34 32 23 23 20 25 32 36
36 36 39 39 37 37 30 30 30 33 37 37 37 40 47 41 37 37 30 25 25 28 32 28 30 30 30 30 30 32 37 37 37 37 37 37 32 37 36 37 37 37 37 37 30 35 33 33 33 33
28 28 36 43 39 39 32 32 32 37 47 34 34 32 34 30 28 30 26 24 14 14 14 17 19 30 40 40 41 41 39 27 24 15 15 15 24 30 34 27 22 22 14 21 15 14 11 12 10 13
13 15 19 21 21 15 13 13 16 19 22 30 21 15 11 11 11 21 22 23 23 20 18 17 10 10 10 12 12 17 17 14 9 8 8 9 8 8 9 9 9 9 9 10 12 12 15 11 11 11
11 |