BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-123K07.T7 (MSMg01no123_k07.b1) | MSMg01-123K07.TJ (MSMg01no123_k07.g1) |
ACC | AG333195 | AG333196 |
length | 1,273 | 1,286 |
length of high quality (start - end) | 333 (132 - 464) | 332 (133 - 464) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_k07.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_k07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:38 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_k07.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_k07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:39 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | NCCAATATTNNNNNCGAAATTTGGCGCTATAGACTCCTAAGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCACAAGTTAGAATCCACCCTATTAAATAACCCTATTAAAA
ATGGGATATAGAGCTAAACCTTTAAGTATCCACTGAGGAATATTCAACAT
TCTTAGTCATCAAGGGAAATTCAAATCAAAACAACCTTGAAATTCCACCT
CACACTAGTCAGAATGGCTAAGTTCAAAAATTCAGGTGACAGTAGATGCT
GGCAAGGATATAGAGAAGGGCTCCTTCATTGCTGGTAGGATTGCAAGCTG
GTACAACAACCACTCTGAAAATCAGTCTGGCAGTTCCTTAGAAATTTGGA
CATAGTACAATCTGAGGACCCAGCTATACCACTCTAGGGCATCTACCCAA
AAAAAAATGTTCCTACATATAACAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATA
GCAGCCTTATTTATTATACCCCCCCCCCTAGAGAGAACCCAGATATCCCT
CAAAAAAGAAATAGATAGAAAAAATGTTGTACATTTACACAATGGAGTAC
TACTTAGCTATTAAAAACAATGACTTCATGAAATTCACAGCCAAAGGGAA
GGAACTATAAAATACCATCCTGAGTGAGGTAACCCAGTCACAAAAGAAAA
CACATGATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAGACATCCACAGCTTTG
TCTCTATCTCATCTCTATCTCTATCACTCAGTAAACTGACACTGTCATAC
ATTGCCTCACCTTAGCAGGTTTCTGTAACCTTGTGCAGCCTCCATGACCA
TTTTCCTCCTATACTTTTCACCCTTATAATACCAGCACCATGAAGACAAT
TAAAATTGTGCTGCCAGCTCTTTGATCATAGCTATTTGCTGTTTCCCTAC
CAAAGCTGGGAAAAATGCCTTTTCCAGCAGTAGTAACACCAAAGGCTTCG
GTATTTCTGTTTCCATGGGGGTTAGAAAGTCTAATTGAATTTTTATTGGA
CAAAGAGTTTTCTCCTTTAACCAGATCTATGTGAAGAATTAATAATGAAA
CCTTTTTGTATTTCTAAAACGAATTTACTTCCTAAATATTGTCTCCCAGT
AGAATGGCTATTGGGTTCCATTCCCCCCCTAGAAATAATAATTTCAGGGG
CTTTCCACTTTATTTTAAAACTTCTGCGGTTTCTCCCAATACGAATTTAT
CTATACAGCCCCAAAAACTTTTGTTTGTCCAATAACTTCCCTCTATCTTT
TAATAAAAGTGTATTCTTATATC
| AGTTTCTTTNNNNTTCCACGGCTAGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTAACCCGCCTTCCTTGGNG
ANGAACAGCAGNATGGAACCTTAAACTGACCCAACCCTTTCCTCTCCAAC
TTGCTTCTTGGCCGTGATGTTGGTGCAGGAATAGAAACCCTGACTAAGAC
AGTAGGTTTTGTTGATGGATCATTTAAATATCTTAACTAATGCCATGTCT
TCCATTCTGGTTGACCTGTAACTTCTCAGACTTCTCCTACTCTGATTCTG
GCCTTGCCCATGTGTCTTGAATCAGCCAGTGGGAAAGTAGTTAACTACAT
GTAAGTAGAAGCTTGAAGTACCTCTGAGTATTTCCACTGCCACTCACATG
TAGTGTTGATTTTTAGCTGACACTCTTCCATACTTTTAAATGTACTGACA
GGCACCTATCTGTTTTCCTACTCCCCAGGCTTCTACTGCCAGGACATGAC
AATGAGGCATCTCATAGGGAAGTTAGGGTTCATAAAGGGTTGCTACATCC
CAGTCCCACCCCTTTCCCTGACTTCTGCCTGGGAATCCTAGAGCCTGGCT
GCAAAATCATGCTATGTACTACTCTCGACCTCAGTATATTAGTTTGCTTC
TATGCTGCTGCAATGAAAGACTGACCTCAGTAACTTAGGGAAGAGTTTAT
TTGGCTTAAAGGTTCCAGGCCATCATCCGGAGAGGGCACCTTTGGAGCTC
AATTCAGGAACCCAGAAGCATGAATGGAAGCAGATCTGTTGGAGGAACCT
CGCATAATAATGTATTTGATAGTAAAAGTATAACCTCCCTCGCGAAGCTT
TACTGCTTACCAATGACCTCTATCTGTACTAAAGTTCTTTGATCTATATA
GACTTTGCACCCCCGCTAATTTTTGGCGTATGAAGGTGCTTTTATCTTCC
CGTCCTTTGTCAACTCATTTTCTATTTTCAAACCCCCTTATTTCATCTCC
TCTCCTTTCTTACTTCTCTCTTGCTCCCCATCTCCTCCACCTCTGCCAAC
TACTCCCCCAACTTCTCTTCTAACTCCCTATTTGCTGTTTCTCTTCTCTC
CTTTTCTTCTCCCCCTATCTCCCTATTCTCTCCCTATTTCCCTTCACTCT
TTTCCCTCTCCTCTCACCTCTTCTCTCCTTCGCTCTCCTCATCCATCTCT
TTCTTTCCCCTCTTCCTCCTACCTCTCTCTCTATCGCAATCCTTACACTC
TCCTCTCTTTCTCTTTCATTCTCTTCTCCGCCAGTA
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 8 9 9 9 3 0 0 0 0 0 3 7 6 6 7 7 6 6 8 8 8 10 8 7 6 6 8 8 17 19 8 8 8 13 8 8 8 21 21 28 32 32 35 37 42 53
47 47 43 37 37 40 40 23 23 13 9 9 19 23 33 35 35 31 30 37 37 42 29 25 13 10 9 8 8 8 8 8 8 10 17 15 20 20 24 24 33 33 36 35 35 50 50 50 50 50
53 53 53 50 50 53 53 53 33 33 33 31 31 30 23 23 10 12 11 13 10 11 10 13 9 9 9 13 15 10 11 11 18 22 37 37 40 39 43 43 44 53 44 44 40 40 43 43 43 57
57 53 53 53 50 50 50 57 53 68 54 54 54 54 54 54 54 59 59 59 59 59 57 54 54 57 57 57 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 48 48 48 48 59 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 52 57 57 57 59 57 57 68 57
57 57 59 59 57 68 68 68 68 57 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57
54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 42 42 28 42 42 57 57 68 57 57 57 57 57
57 57 68 68 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 50 53 50 50 54 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48
48 59 59 59 59 37 31 23 12 12 11 11 11 11 12 12 23 28 41 47 48 48 48 59 57 43 44 43 36 36 43 59 57 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59
48 48 48 48 47 59 59 47 47 27 27 12 11 11 11 11 11 11 11 11 12 12 13 11 12 8 17 15 15 11 21 27 36 47 59 59 59 59 34 32 23 23 23 32 32 39 30 25 21 14
14 15 28 23 17 17 13 15 12 11 11 12 12 15 30 32 47 46 59 48 48 48 59 59 59 59 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 59 48 48 59 59 68 57 57 57 54 54 54 57 57
57 54 54 47 47 43 43 43 34 32 28 28 28 40 40 47 44 48 48 48 44 57 47 48 42 59 42 47 47 47 57 57 57 59 59 59 59 48 48 44 32 32 12 12 12 29 28 43 43 50
44 48 57 57 57 57 57 59 52 52 43 42 43 43 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 52 52 52 57 52 52 52 52 52 52 52 52 43 43 52 57 57 57
52 52 52 57 57 57 54 52 57 52 52 52 52 52 57 57 57 50 50 43 37 35 44 44 43 27 27 24 32 24 24 24 27 27 33 33 42 42 48 57 57 48 48 48 57 57 57 57 48 41
41 41 42 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 44 43 28 24 24 36 42 68 68 68 68 57 59 43 35 35 37 42 37 39 42 43 34 24 21 12 12 19 29 28 30 30 37 29 28
30 30 30 37 46 47 37 37 27 20 20 19 25 19 12 12 18 15 18 27 28 33 26 26 17 19 20 28 28 36 32 34 35 24 24 24 19 20 20 24 31 37 37 37 37 37 33 35 30 16
16 14 10 11 8 12 20 11 19 19 24 24 26 33 33 33 30 18 16 11 8 8 8 8 10 15 11 10 9 8 8 8 9 9 10 13 18 26 13 20 10 10 8 8 8 10 15 10 11 11
14 11 19 11 11 19 23 27 30 27 32 20 19 10 19 17 8 8 8 18 18 21 21 20 16 10 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 15 15 8 8 8 9 10 16 25 13 9 8 8 8
10 14 12 12 19 23 24 16 14 9 10 9 8 8 8 10 8 10 6 6 8 8 18 13 10 10 10 8 7 7 7 8 8 9 9 9 9 10 8 9 10 15 10 16 16 18 15 12 12 9
9 10 10 10 17 27 19 17 10 8 8 8 11 10 10 10 10 9 8 8 11 8 10 8 9 8 14 15 15 11 10 15 16 16 16 16 16 22 16 16 20 20 19 13 14 14 9 9 9 12
11 11 10 9 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 10 8 9 9 9 9 10 8 8 6 8 8 8 10 8 8 6 6 10 10 9 8 6 6 6 8 6 8 9 10 10 10 11 8 8 8
8 6 6 10 8 10 9 15 11 11 10 8 8 8 8 8 9 10 10 10 8 8 13 8 8 8 9 10 10 12 12 10 10 8 10 12 14 13 10 8 8 8 8 10 11 11 11 11 12 13
9 9 6 10 8 8 8 8 8 8 10 13 12 9 9 9 9 9 9 8 9 9 10 15 21 20 10 8 8 8 8 8 10 10 10 8 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10
10 10 10 9 9 9 9 9 10 12 9 10 10 10 14 14 12 13 13 13 12 12 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 19 19 13 13 10 10 10 12 10 11 11 8 8 7
7 12 12 8 8 6 6 6 6 10 10 12 12 15 8 8 7 7 11 8 10 15 19 12 17 10 12 12 12 10 10 12 13 11 11 11 11 14 10 11 8 6 6 6 6 10 8 10 10 8
6 6 6 6 8 8 13 10 10 8 8 6 6 8 15 15 12 8 8 8 8 6 6 | Open.Hide. 6 6 6 8 8 8 9 9 3 0 0 0 0 3 6 6 6 6 7 9 6 6 6 6 10 10 6 6 8 10 17 10 9 13 8 8 9 9 9 8 13 13 12 8 8 8 21 19 22 17
17 24 28 32 35 35 37 33 37 37 35 35 35 36 36 35 36 33 44 39 50 37 23 23 11 9 8 8 8 8 8 8 12 11 10 12 10 10 10 10 11 11 19 23 29 21 21 3 0 3
3 0 3 25 27 44 47 44 25 25 3 0 3 23 23 22 10 10 8 8 8 10 10 11 10 11 8 10 6 6 6 6 11 18 25 34 42 33 33 33 41 47 47 53 38 42 42 42 43 43
57 43 34 29 25 25 25 30 28 43 43 57 43 43 43 43 47 43 68 54 54 57 57 57 54 57 54 57 57 54 54 54 57 57 54 59 57 44 44 43 48 48 57 46 40 37 44 44 47 57
46 44 44 43 43 43 43 43 47 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 59 59 59 57 57 57 54 57 57 57 57 57 52 43 43 50 50 54 57 57 57 57 57 59 54 52 52 52 52 52 52
52 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 59 57 57 57 57 57 52 59 59 59 57 57 57 52 52 52 57 57 59 57 57 57 59 59 57 57 57
57 57 43 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 57 59 57 57 57 57 57 44 44 37 42 42 35 35 42 59 57 57 57 57 57 48 46 44
43 43 43 44 41 44 43 44 44 32 32 39 59 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 59 57 54 54 54 54 54 57 59 59 59 57 59 59 59 59 59 48 48 48 59 48 57 57 57 48 48
48 48 46 59 30 27 12 11 11 11 16 14 13 12 11 11 16 23 34 41 50 48 43 43 43 48 48 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 48 48 59 43 43 48 48 57 48
42 39 39 37 37 39 30 37 24 24 13 15 15 16 10 10 10 10 16 12 8 8 8 8 8 16 22 23 34 41 48 50 41 59 48 48 43 34 25 18 12 12 12 12 18 16 16 23 16 16
12 11 9 8 8 8 8 8 10 10 26 32 34 32 37 43 39 39 39 39 43 47 59 40 40 37 35 35 37 40 37 43 37 40 37 39 35 37 37 47 59 39 43 43 46 46 47 43 46 42
39 35 32 37 39 57 46 47 43 44 34 42 28 28 28 44 44 57 57 57 57 57 54 59 59 59 57 57 42 37 28 28 28 32 40 43 44 32 32 15 19 19 43 43 43 43 23 23 23 43
43 35 43 43 52 52 43 43 35 35 43 47 43 52 41 46 35 35 35 37 43 50 50 37 37 37 37 44 44 42 41 28 28 21 28 36 38 42 42 42 16 27 17 19 19 43 43 43 43 43
32 29 29 43 43 57 57 57 57 57 52 52 43 43 43 43 43 21 21 11 11 11 28 32 32 18 16 12 16 16 23 21 21 15 24 24 11 11 18 24 27 27 24 18 22 19 21 29 20 21
24 30 22 28 28 36 36 23 23 36 36 33 37 39 42 39 36 37 30 33 30 19 19 12 15 15 19 17 12 16 12 12 12 25 15 15 12 19 18 28 32 32 30 19 14 12 12 12 13 15
16 15 12 15 11 8 8 10 19 19 15 13 12 10 10 10 10 11 10 15 15 19 14 14 18 18 15 15 14 14 14 12 12 9 9 9 10 12 12 12 14 10 10 10 12 9 9 9 8 8
8 8 10 10 10 9 9 12 9 9 10 10 22 17 19 21 19 19 18 9 8 8 8 8 8 13 8 8 8 10 10 8 10 8 10 10 11 10 8 11 11 16 11 11 8 8 8 8 8 8
10 10 10 10 10 10 10 11 11 8 8 8 13 14 14 9 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 10 10 10 10 10 12 11 11 11 11 10 11 10 10 10 6 6 8 8 9 12 9 9 9
8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 13 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 10 10 8 8 8 8 13 12 10 8 8 8 8 8 8 10
8 7 7 8 8 9 9 9 9 9 9 9 11 10 10 9 9 9 7 10 8 8 8 8 8 9 9 13 13 12 11 10 13 13 11 11 11 12 10 9 9 10 10 9 8 8 6 6 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 12 12 11 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 13 8 8 8 10 10 10 10 10 9
9 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 10 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 9 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8
8 8 10 13 13 10 10 10 13 15 9 9 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 12 11 13 13 11 11 11 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 8 9 9 10 8
8 10 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 11 8 8 6 6 13 15 12 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 13 11 10
10 10 10 10 15 10 10 9 9 8 13 6 6 6 6 8 8 9 8 8 10 10 12 12 12 10 10 10 14 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 8 8 11 6 8 8
8 8 8 10 11 11 15 15 9 9 10 12 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 7 6 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 |