BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-123N04.T7 (MSMg01no123_n04.b1) | MSMg01-123N04.TJ (MSMg01no123_n04.g1) |
ACC | AG333332 | AG333333 |
length | 1,269 | 1,557 |
length of high quality (start - end) | 333 (131 - 463) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_n04.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_n04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:34:04 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_n04.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_n04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:34:04 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | ACCCTACTNNGTTCATTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCG
CGGAATTCCTTAAATTTTGTATGACATTTACAATGCCTATCTTCTATTAC
TCTTTCACCCTCTTCCCTTCCATTACCCCAGCATCGCTTCAAAGCATCTT
GCTAATGAATAAGTAAATAAAGGCAAATATATTCCAAGAAATTGGGCAGT
GCAACCATGTCCCTATTTACATCTTTCAATTCTTTGGTGATTACTATCAA
CATACTACTCATTTAATGGAAATGTAACCTAAACTCCTAACATCATGCGT
GGAATAACACCCAGAAAATTCCTGCAAAATAACAGGAGAATTAAATGATT
GTAGGTCAAAGCATTATTTGCTCTAGGATGTGTTGTTTTCTAATTTTATA
TATTGTTACTGATATTGTATCCTTGAAATTCAGGACTGAATGTATTAGTC
TTTTTTTAATACTGAAAATTGTAAAATATAATTAATACATATATATTATT
ACATAAGATAAAAAATATATATGCATAGAAAATTGAAGTATTTAAAATTA
ACATCATGTAGTAAAAGGTAATTTACATCTTTGTCCATGCAATTACTCAT
TTTAAATTTGTTATTTAAACATGTATTCTTTAACCCATTTTCTGAAATTA
TATAGCCATCAAAGTTTCTAGCACTTATATCAATTTTAAAATTTATGCTA
ACAATTCCATTTGTATAATAACCAATAACCCAGAATGTTTTTTTAATTTT
ATACATCATCTTTATTTTATTTTACAATGAGCAACGCCTCCCTTCTGAAA
CACCTAAAAATGTGCGCAGTAAAGCCTCCCTCCGCAAAAATATTATCACC
ACCTTATGCACATGCCCCGGATCACTCCCACCCTGGCTCCCCATCCACCC
GACACCCACTTCTAGCCACCCTCTCCACCCCATTCCTCCACCAAACATTC
ATTTCCCTTGTCCCTCCCCGAACCCCCCAACTCCCTACCGCCAAAAACCC
CAACCCCCCCTTTTTTGCCACCCCACCCCACTTCTCGCACCACCATTCCC
CCCTACACTCCTTGTTCTTACAACCCCCAATCTTAACTCTAACTCTTCTC
AAACACCCTCGCATGTCCAATAACTGTACCTCGCATTTACACCCTCCCCT
CGCCCTCTCGTCCTGTCCCCTACCTACCATACCCGGTCCTCCTCCACTCT
CCTCGAGCGCTCTTCCCTCTCCTTTCCTCTCAATCCCCTCTCCTCTCCTT
ATACATCGCCCTCCCCTCG
| NAATTTCTTCCTGCCTGCGCCGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXNGACCTCTACAGGCTCCTCCAACTCGAAGTGCCCAANGTG
AGGATGCCCTCTTTCCCCCCTTCCCAGAGACAAGAAAGCAATCCATAAGT
GGGGAGCGGATGCGAGGGAGGGAATTGCGCAGCCCCTCCTCCCCCCCTCC
TCCCCCCCCCCCCCTTCTTCCTCTCTCCTCCTCCCCCTCCTCCCCCTCCC
CCCTCCCTCCCCTCCTTCCCCTTTCCCTCTCCCCCCCTTCCCCCCTCCCC
CTCTTCCCCCCCCCTCCCCCCTCCCTTTCTCCCCCCCTCCTCTCCCCCCC
TCCCCCCCTCCTTTCCCCCCCCCCCCCCCCTCTCTCCCCCTCTCCCCCTC
CTCTCCCTCTCCCCTCTCTCCTCCTCCCCCCCTCCTCTCCTCTCCTCCTC
CCTTTTTTTTTTTCTCCCCCCCCCCTCTTCCCCTCTCCCCCTTCCTCCCC
GCTCCTCTCCCCCCCCCCCCCCCTTCTTCTTCCCCCCCCCCCCCTCCTTC
CTCCCCTCTCCCCCCTCCCCCCCTTCCCTCTCCTCCCCCTCTTCTCTTCC
CTCTCCTTCTCCCTCCCTCCCTCTCTTTCCCCTCCTCCCCTCCCCTTCTT
TTCTTCTCTCTTCTCCTTCTTTCTCTCTCCCTCCCCTCCCTCCTCTCCCC
CCCCCCCCTTTCTCCTCCCCCCTCCCTCCCTCCTCCTCCCTCCCCTCCCC
CTCCTCCTCCTTCCTCCCTCTCTCCCCTCCCTCCTCCTCCCCCTCCTCCT
CTCCTCCTCCTCTTCTCCCTCTCCCTCTTCCTCTCCCCCCTTCTCCTCTT
CCCCCCCCCCCCCCTCCCCCTTCCCCCCCCCCCCCTCCTCTCTCCCCCCT
CTCTCCTCTTTCTTTTCTCTCCCTCCCCCCTCTCCTCCCCCCCCTTTCCC
CCTCCTCCTCCTCTCTCTCTCCCCCCTCCCCTCCTCCCTCCCCCCCCTCC
CTCCCCCCCTCCTCTCCTTCCCCTCCCTTCCTCCTTCCGCCTCTCCTCCC
CCTCCTCCTCCGCCCTCTCCCTTTCCTCCCCTCCTCTCCCCCTCCTCCTC
CCTTCCCCCCTCCTTTCCTCTCCCCCTCCCCTCTCCCCCTCCTCCCTCCC
CCCCCTTCTCTCTCCTCCCCCCCTTCTCCCTCCCTCTCCCCTCCTCTCCC
CCCTTCCTCTCTCCCTCCTCCTTTCCCTCCCCCCCTCCCCCTCCTCCCTC
CCCCCCTCCTCCTCCCTCCCCCCCTCTCCCCCCCCCCTTCCCTTTCCCCC
CCTCTCCCTCCCCCCTCCTCCCCCTCCCCCTCACCCTCCTCTCTCTCCCC
CTCTCTCTTTCTCCCCTTCCCTCCCCTCTCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTC
TCCCTTCCCCCTCTTCCCTCCTCACCCCCTCTCTCTCTCCTTCCTCTCCC
CTCCCTCCCTTCCCCTTCCCTCCCCTTCTCTTCCCCCTCTTCCCCCTTCC
TCCTCCTTTCCCCCCTCCCTCCCTCTCCCCTTCCTCCTCTCTCCTCCCTC
TCTCTCC
|
quality values | Open.Hide. 6 8 8 8 6 6 6 3 0 0 3 9 8 6 6 8 7 9 10 10 12 11 12 9 7 6 6 8 10 19 8 8 8 13 13 20 21 28 30 28 20 28 20 20 27 28 25 24 13 13
13 11 17 28 23 20 11 11 10 13 14 21 24 33 59 59 43 31 31 31 30 21 15 11 10 10 9 10 10 10 9 14 9 9 10 10 10 10 25 25 25 28 22 20 20 20 32 32 42 36
36 43 39 39 44 43 50 36 33 33 33 33 33 31 28 19 14 9 9 8 8 8 8 10 11 10 10 10 10 10 12 30 30 34 31 37 30 25 31 31 37 42 47 59 59 37 37 32 32 32
42 32 32 33 42 43 68 50 50 48 48 39 42 35 37 42 36 47 47 41 39 41 41 27 27 25 36 37 48 57 57 57 44 44 28 28 28 44 44 57 57 57 57 44 44 40 22 24 15 16
16 36 36 23 28 14 15 15 32 32 32 32 32 32 35 44 44 44 44 32 24 24 22 23 24 38 32 43 43 57 57 59 59 52 50 43 38 38 43 50 50 52 57 52 52 43 44 43 43 43
39 43 43 52 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 52 43 43 43 43 52 57 57 57 38 38 22 22 14 28 32 35 38 43 31 31 31 39 39 57 57 39 39 39 43 35 35 35
43 43 62 62 62 62 52 52 52 52 43 44 43 43 35 43 43 52 62 52 52 45 27 21 12 12 12 43 44 43 43 43 35 35 35 43 35 39 39 43 43 43 35 35 35 62 62 62 43 39
27 27 41 43 23 23 17 22 15 28 14 14 14 39 39 62 62 39 39 17 14 14 15 15 11 18 18 43 43 35 35 35 35 35 31 31 31 39 39 31 31 31 43 41 41 43 62 43 41 41
43 43 43 43 39 39 15 13 21 24 35 23 38 38 43 43 35 35 35 38 38 35 35 35 43 43 43 35 39 43 43 35 35 43 47 43 62 44 44 35 35 26 38 38 43 44 35 24 24 17
36 36 52 52 52 52 62 33 32 12 15 15 21 24 14 28 18 18 15 18 12 18 18 43 43 52 52 47 47 35 35 27 35 26 20 18 13 12 12 12 18 15 20 20 27 38 42 43 39 39
39 42 32 38 27 23 23 27 32 24 17 20 14 14 14 27 24 35 38 43 28 19 24 15 15 15 13 24 23 32 27 35 35 35 32 41 20 18 18 13 19 21 15 14 14 21 21 20 20 14
17 20 10 10 10 17 17 24 24 11 11 11 15 15 24 26 35 30 28 25 28 25 25 32 32 24 24 25 36 36 36 36 23 16 27 19 19 18 24 13 13 13 21 17 23 26 30 30 30 22
28 25 25 17 17 17 24 23 30 23 22 19 18 18 18 15 14 14 24 24 24 22 13 11 11 12 13 14 14 15 13 8 10 8 8 8 9 11 22 23 26 14 13 12 23 19 25 25 28 28
25 19 14 10 10 10 10 10 15 12 12 13 13 18 15 15 19 12 10 8 10 8 9 10 11 15 27 30 29 25 13 13 13 13 19 24 25 22 18 18 18 18 18 20 24 24 24 20 15 13
11 9 9 10 10 10 11 8 10 12 10 11 14 19 19 19 24 14 11 8 8 8 8 8 10 10 11 11 11 11 11 11 10 10 10 10 10 10 13 15 15 19 20 21 15 15 12 10 12 10
10 8 8 8 8 8 10 10 16 11 12 12 23 16 16 16 16 16 14 15 15 24 29 28 22 22 19 23 10 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 13 10 14 11 12 12 13 8 8 8
7 9 10 13 10 11 11 19 11 11 9 8 8 10 10 6 6 6 6 9 10 10 10 8 8 8 8 10 10 10 9 9 11 10 10 10 10 10 10 10 11 11 13 8 10 6 7 8 8 9
9 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 9 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 10 10 11 11 15 11 11 10 10 8 10 8
8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 13 8 8 8 10 8 8 10 7 6 8 8 12 13 13 15 15 12 13 11 9 9 9 9 9 10 12 12 11 10 9 9 9
9 9 11 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 9 11 13 11 10 8 8 8 8 10 10 8 12 7 7 8 10 6 6 8 8 8 10 15 11 11 11 21 21
12 12 11 12 11 8 8 8 8 8 10 10 12 11 16 10 9 8 6 6 6 8 8 10 10 11 9 12 9 9 8 8 8 8 9 9 9 10 8 10 10 8 10 10 10 10 10 9 9 9
8 10 6 8 8 8 8 10 10 8 10 8 8 8 8 9 8 8 7 6 13 8 10 10 14 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 9 9 6 6 6 6 8 8 9 9 9 8 10 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6
6 6 8 11 8 8 8 8 9 8 8 10 8 8 8 8 8 22 13 13 9 6 6 7 7 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 12 9 9 9 9 8 10 9 9
9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 10 12 9 9 12 9 9 13 13 12 9 7 8 8 9 17 9 9 12 8 8 8 8 10 8 7 7 7 8 10 10 13 8 8 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 7 8 12 17 15 8 6 6 | Open.Hide. 0 3 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 11 9 8 7 7 10 11 8 7 6 8 10 8 8 8 8 8 8 15 8 13 15 21 19 17 17 24 23 21 14 14 19 9 9 11 13 15 30
41 59 59 59 30 36 23 16 8 3 0 3 8 6 10 12 11 7 6 6 6 8 8 9 11 11 12 12 11 11 11 8 10 6 6 6 15 23 37 37 37 26 30 12 8 3 0 3 14 15
25 33 42 47 43 27 21 10 8 8 8 8 16 21 31 39 37 17 15 8 8 6 6 8 11 13 28 32 25 25 11 11 11 12 33 34 25 28 12 11 10 15 8 6 6 8 13 17 19 20
23 24 28 21 15 8 6 6 11 8 13 8 8 8 8 12 17 18 15 30 22 22 22 29 15 13 8 8 8 8 10 10 10 13 13 9 9 11 15 15 10 12 12 15 8 8 6 6 8 11
15 10 12 9 9 11 14 16 14 13 8 8 8 8 8 13 16 29 19 19 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 11 12 19 14 11 11 11 8
8 8 6 6 8 8 7 7 8 10 10 10 10 16 15 19 19 13 10 8 8 8 8 8 10 11 7 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 7 9 10 11 10 10
8 9 6 8 8 8 8 8 11 11 16 12 8 8 6 6 12 10 11 11 10 10 11 10 10 10 11 11 10 10 10 11 10 10 8 8 6 6 6 10 10 12 19 21 25 19 18 8 8 8
8 8 10 10 8 8 13 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 10 9 14 10 11 11 11 16 19 16 16 16 10 8 8 8 8 8 8 11 11 14 15 15 12 11 8 9 9 10 10 10 10
10 8 8 6 6 8 8 6 6 8 13 15 15 12 10 8 8 6 6 6 13 13 10 8 8 8 10 8 10 10 10 10 8 8 7 7 9 9 10 8 10 8 9 9 13 22 19 14 12 12
11 11 11 12 11 10 10 11 10 10 11 9 8 8 8 8 10 11 15 15 18 19 12 12 12 12 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 9 8 8 9 9 9 9 9 10 10 9
9 9 8 8 7 8 9 9 10 10 12 17 17 14 9 9 9 9 10 10 16 10 10 10 14 14 14 15 15 9 10 10 16 12 14 9 9 9 19 17 12 8 12 8 8 8 8 8 8 10
10 9 15 13 13 11 10 13 18 12 15 11 19 15 13 8 8 8 8 12 13 17 12 12 16 17 20 19 11 8 8 8 8 10 8 9 9 13 10 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10
7 8 8 8 9 15 8 6 6 8 8 8 8 8 8 11 12 14 12 21 12 12 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 8 12 9 10 9 9 8 10 10 10 10 12 8 8
8 9 15 8 8 8 10 10 8 9 9 9 12 12 12 8 8 8 8 11 13 13 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 15 13 15 10 9 6 8 6 7 11 12 9 9 10 10 11 9
9 10 10 13 26 10 10 8 8 8 8 12 12 8 8 6 6 6 6 10 15 10 10 11 12 10 8 8 8 8 6 6 7 6 10 8 13 8 10 12 10 8 8 9 9 8 13 10 10 12
10 10 12 19 15 20 17 11 8 9 13 10 11 11 9 9 9 8 13 8 8 8 8 9 9 10 10 19 12 14 13 13 10 10 11 10 10 8 8 10 10 12 13 8 7 7 8 8 8 8
8 11 13 8 8 6 6 7 10 8 11 9 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 9 11 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 9 9 9 9 10 10 11 8 8 6 6 7 7 6 6 8
8 11 13 12 12 12 16 19 11 11 12 14 10 8 10 9 8 12 10 11 11 11 11 11 19 19 19 19 15 15 12 12 10 10 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 8 10 16 13 8 8
8 9 15 8 10 8 8 6 6 8 8 8 9 10 10 8 8 8 19 8 8 8 8 8 10 10 14 8 8 6 6 8 8 10 6 6 8 8 12 14 16 12 15 10 8 8 8 8 8 8
12 10 10 11 17 10 10 8 8 11 11 11 11 10 9 9 9 10 9 13 13 15 12 11 16 13 25 16 13 10 10 9 10 9 9 9 10 9 9 10 10 11 15 13 13 13 11 13 10 8
8 8 8 12 15 16 11 9 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 7 6 11 13 12 7 7 8 6 6 8 8 12 11 16 8 8 7 6 8 8 9 9 9 9 8 8 10 10 10 12 23
13 12 9 7 6 6 8 8 11 9 9 9 9 10 8 15 6 7 8 6 9 10 9 9 11 16 16 12 11 9 12 15 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 17 8 6 6 8
8 9 9 10 9 9 10 10 10 8 8 8 10 8 15 15 28 28 23 24 14 14 18 15 15 10 11 11 8 8 8 8 8 10 14 13 10 9 9 9 9 9 9 11 10 13 8 8 8 10
15 15 10 10 8 8 8 6 6 7 8 8 8 8 13 13 20 17 19 25 26 18 23 19 19 8 8 8 8 8 12 10 10 10 12 10 10 10 10 9 10 10 10 8 8 8 10 10 10 8
8 13 9 11 15 18 9 9 17 10 10 10 10 10 6 6 9 13 12 12 8 8 8 10 21 15 11 9 9 9 10 15 22 13 8 6 7 6 6 17 12 11 8 13 8 6 8 12 16 26
16 21 15 14 9 13 14 11 9 12 10 10 8 8 9 9 11 11 15 13 19 18 17 9 9 9 9 9 12 11 10 10 10 9 14 11 12 10 8 8 8 10 11 16 16 11 11 10 9 10
10 8 6 6 8 8 11 11 11 11 12 10 8 8 10 12 9 9 10 11 13 10 10 11 19 10 13 13 12 8 6 8 6 6 10 6 6 8 6 6 8 6 9 9 13 10 12 14 12 12
11 9 12 8 8 8 19 13 8 10 10 16 11 15 12 9 9 9 11 10 12 13 18 13 12 8 8 8 8 13 15 14 9 8 8 6 8 8 8 8 8 6 7 10 12 14 20 20 27 22
22 18 15 13 11 11 11 11 10 10 10 22 10 8 8 8 8 13 9 8 8 8 9 9 11 14 12 13 10 10 7 7 10 8 8 6 8 6 7 8 8 8 10 10 10 8 8 9 10 10
7 7 8 12 21 15 12 15 15 8 8 8 8 8 10 10 17 9 9 12 12 16 15 12 8 8 8 8 9 9 10 10 10 14 7 10 9 9 6 7 8 8 11 18 15 12 8 8 8 9
9 10 9 8 8 8 8 8 11 11 10 10 8 8 8 8 8 13 13 8 8 11 8 6 6 6 6 8 8 10 13 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 9 10 14 10 13 13
13 10 10 12 16 10 10 |