BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124F24.T7 (MSMg01no124_f24.b1) | MSMg01-124F24.TJ (MSMg01no124_f24.g1) |
ACC | AG333745 | AG333746 |
length | 1,272 | 1,216 |
length of high quality (start - end) | 268 (130 - 397) | 436 (116 - 551) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_f24.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_f24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:23 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_f24.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_f24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:24 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | GGGTTATTTNNNNAACATTTGTCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCTACCATAAGGCAGCCCTCTTCAAAGCCCCAGTTGTTTTTA
CGTTGTGGCCAGAGCCCTTTGATTAAGCGACATTGTGATGGTTTCCACAA
CTGGAATAGATTTGAAGTGTGAGGTGTTAAAGCAACCTCGGCTGTCATCA
TGACATTTCCCTGGAACATGGAAAAGGCAGTAGTTTGATTGACAACTTCC
CTATTTTCCATTAAAGCTGCTTGACTAAAATTCAGTTGAAGCAACACTTG
GTGGGATTCTAGAAGTGGTACAGTGTTGCCCAGCCAGGATCTCAGGACTG
TGGGAATTACAGTAATGACTTCTTGATCTGACCTGAGACTCTGAGACTCT
GCCTTACTTGGGGCAGTTGCTCTTGTGCCGCAGTACAGGGCTGTTAACTA
TTGTTATTTTGTTCCCCCCCCTGCTTGCTGTCATCACACTTGACAGATGG
AGCCTTTATAAAAGAAGACACAATGTTAAAAGCTTGCCCACGTCCAATGT
AGCATTAATATACCACTATGAATAAATTCTGTCCAGTGATTAACCCATTG
CCAGTGCCCTCAGAGGGAAAATGATATAATCCAACAAGTTCCAAGTTTAT
CTACATCTATCTGCGTTGCTGTACGCACTACAAAGCATAACACCCACTTT
GGAGGAAAATCTGGTAACTTCTGACAAAATGAAATCAAGTTTCCCTTATG
AACTCGCCTGGATAAAAAGCCACCGGATTCTTTTAAAACACACTCCATGC
TAAATCATGCTTTTGCTATATTGTGAAAAATTTGCTCTATATTAAATTAA
TCTATTTTTACTGTGTCTTGCATTTGTTGCACACTCCCTCTTTTAACTAA
TCAAACCCTTCTCTCTTAATACCCTTCTACTCCTCTCCCCGTCGTCGTGA
ATTATCTTTATATCGTCGTCTAAACCCCAAAAATTTCTTATACTCCTGTT
TATATTTCAAATCCCCTTGTAATTTTTTTGTTTAATCTTATAATATACCT
ACAATTGTACCTCTCCACAGATTCTTCCATCACATTTCTCCTTTTGCCCC
AATATCAATTCTTACTGTGTCTCAATTTTATAACTCCCTATCGTCCTTCT
GAAAATATCTCAAACCCATCCTCTCTCTCCCCTCTCGATAGCTTATATAG
CCCGTCATTATATCTCTTCTGCATTCTTCAANGATGCTTTCTTTCCATAT
ATACTTCCTCTCTCTATATATN
| CCATGCGAGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXCCCTTTTAACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAGNACCT
GCCCTAATGTTCCACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAA
CCCTGAGATTGCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCA
GGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCA
TTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCCGTCTGGC
GGTTCCTCAGAAAACTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCACTACCT
CTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAGGACACATG
CTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGTTAG
AACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATC
TACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATT
CCTAGCCAAACGGATGGACCCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACA
CATTCACAAAGGAACTCACACAATATGTACTCACTGATAAGTGGATATCA
GCCCCAAACCTAGGATACCCCAGATATAAGATACAATTTCCTAAACACCT
GAAACTCATGAAAAATGAAGACCGAAGTGTGGACCCCTATGCCCCTCCTT
ACAAGTGGGAAACAAACCACCCTTGGAAGGAGTTACAGAAACCCACGTTT
GGAGCTGAAATGAAAGGATGGACCCCGTAAAGACTACCCTATCCCAGGGA
CTCCCCCCCCTTAATTCAGCACCCAAACCCTGAACCCCTTGCCTAACCTT
ACCAAGATTTTTATCCAAAAGGACCCCACATGGAACCTGTCCTCCTTGGG
AAAACTATGCCCCGGCCCCTAACCAACCCCACAAAGTGGCATGCCTTCCC
CGTCCTCCTAAGGGAATGGAATTCACCCGTCCTCCCCAAGGGAAAGAATC
CTGGCAAAAAATTTACTCCCCGGGAAGCTTAAAGGGGATTTCTTGCCCCC
CCTATTAGTTGGGAATTCACTCTTTTACCTAAAACTTATTTCCGTAACTC
CCCGGAAGACTCTCTTTGCAACCTAATGCTCTCCTCATATGTTATTCACC
ATACATAGTCCCCCTA
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 8 7 8 7 8 3 0 0 0 0 3 6 6 6 7 7 6 6 8 8 15 19 16 12 10 8 8 8 15 9 8 8 8 12 15 8 10 13 28 29 34 34 31 31 27 32 20
20 15 15 16 18 20 23 23 17 15 8 7 7 7 8 13 17 15 19 16 17 21 10 9 9 9 10 8 9 9 11 11 17 22 30 37 34 39 33 33 28 30 28 29 28 30 34 34 33 28
22 22 20 28 24 20 20 18 28 28 21 18 12 12 8 8 8 8 12 10 10 8 10 10 12 9 9 11 11 13 28 32 33 33 33 33 33 37 39 35 35 30 33 37 37 40 47 43 43 43
39 39 30 30 30 32 32 33 25 25 37 37 37 36 25 24 22 28 28 28 28 25 25 25 36 34 48 48 48 37 37 30 30 30 22 22 11 11 12 11 11 15 23 32 41 39 39 33 37 35
35 39 39 36 43 43 48 43 48 42 39 39 36 36 43 43 47 47 28 22 12 12 12 28 28 43 37 32 36 23 23 23 28 28 25 22 22 36 41 41 44 41 47 44 32 32 31 39 35 39
39 47 57 47 47 47 57 41 41 41 57 57 57 46 43 43 43 43 39 39 43 47 47 37 37 32 43 43 44 57 50 44 43 24 24 17 24 32 33 27 19 24 18 18 20 38 38 38 38 20
20 24 32 35 35 43 44 43 43 43 32 27 27 33 33 43 37 37 32 32 43 33 28 28 35 42 40 44 42 41 41 20 20 20 24 25 24 24 28 32 32 30 27 17 18 18 32 32 44 30
30 30 26 24 28 32 32 39 39 28 29 24 28 23 21 21 28 23 25 33 36 41 46 43 43 57 48 37 32 28 23 23 23 18 19 13 11 11 16 19 34 28 30 19 15 15 23 23 22 25
12 9 9 11 11 11 11 11 16 12 12 28 28 35 37 39 35 39 39 40 40 43 47 48 48 48 39 37 30 21 18 13 13 13 28 28 32 26 17 17 17 26 21 31 23 32 30 34 28 25
25 25 32 17 14 9 9 8 9 9 6 6 8 9 10 12 9 12 10 10 22 22 31 37 32 40 40 43 43 37 37 28 28 21 28 18 18 19 12 12 11 11 9 9 7 8 8 8 8 10
12 12 13 13 21 30 30 43 32 32 22 22 17 25 17 17 17 20 24 24 28 20 20 24 30 36 25 25 25 28 28 23 23 23 41 24 24 15 12 12 24 26 37 37 32 35 24 28 12 12
11 11 11 21 21 20 20 20 22 30 37 23 23 20 31 12 12 10 10 10 24 24 25 28 23 20 20 23 19 20 20 21 28 19 23 19 14 14 15 18 21 28 29 29 22 24 25 27 23 18
11 11 11 10 10 10 10 10 10 22 18 11 11 11 16 12 12 12 18 15 14 19 14 14 14 19 23 21 28 25 22 21 28 15 15 15 13 10 10 20 19 13 12 13 13 19 25 42 24 31
23 23 23 20 20 21 30 29 30 16 12 10 8 8 8 12 12 19 10 10 10 10 12 15 17 18 11 12 12 32 19 24 18 13 13 13 13 15 10 10 8 8 8 10 12 12 10 17 21 19
13 10 12 12 12 12 10 10 19 9 9 9 15 12 14 14 17 11 19 24 11 11 10 21 12 11 11 8 8 8 8 10 10 15 10 9 9 9 9 11 11 11 16 11 12 12 21 22 15 12
12 12 11 11 9 10 9 9 10 9 9 9 10 13 12 19 19 11 11 11 11 11 12 12 12 11 11 8 8 9 9 11 12 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 13 19 19 23 23 13 12
10 12 9 10 9 14 12 13 10 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 10 8 8 10 10 9 9 9 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 11 8 8 8 8 8 8
8 13 10 8 8 8 10 16 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8
8 8 8 13 10 10 10 9 9 10 8 8 10 7 6 8 8 10 10 10 9 10 8 8 10 13 10 8 8 6 6 10 10 12 6 6 8 8 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 6 6
8 8 10 8 6 6 8 10 8 8 10 10 10 10 11 10 8 8 8 6 6 8 8 11 11 15 10 12 12 10 8 8 6 6 8 8 11 15 10 10 10 10 10 10 11 17 10 10 10 10
9 9 9 9 9 10 10 10 10 11 11 13 13 10 8 9 9 9 9 12 11 11 11 9 12 12 11 11 10 10 9 9 10 8 8 6 6 8 8 10 11 9 9 9 9 8 8 8 8 8
8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 7 7 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 9 8 8 6 6 8 10 9 9 9 10 10 9 8 8 8 8 8 9 12 11
8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 13 17 10 8 6 6 6 6 10 8 8 8 6 7 9 8 8 8 10 6 6 8
6 6 8 8 9 9 8 11 7 9 8 6 10 9 8 8 6 6 8 12 10 8 6 8 6 6 8 8 10 11 11 13 7 6 6 6 8 8 8 8 6 6 10 6 6 6 6 6 8 6
6 8 12 10 7 7 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 9 10 7 7 7 8 6 6 6 3 0 3 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 9 9 8 8 6 7 10
15 19 8 6 6 8 12 12 18 14 12 10 10 11 9 6 8 6 10 9 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 7 8 8 19 21 17 9 10 8 8 15 12 12 11 10 12 8 8 8 9 13 15 17 28 20 26 26 30 29 32 33 34 28 39 27 25 18 23 34 34
44 50 50 41 41 18 23 18 18 12 12 14 14 15 15 11 14 11 15 11 11 11 10 11 17 21 36 53 50 50 47 57 36 36 29 29 30 30 33 33 39 39 27 27 3 0 3 21 21 10
10 8 8 8 8 8 10 16 12 15 21 15 13 12 12 21 21 34 30 36 37 37 43 43 42 42 48 48 48 48 57 57 54 57 57 57 54 43 42 32 22 28 15 17 17 26 30 35 35 37
40 39 37 27 29 30 30 48 57 44 44 43 43 43 57 57 39 39 39 37 33 28 37 32 32 32 28 31 42 42 47 42 44 32 24 32 24 32 29 43 43 47 47 57 57 57 50 43 35 32
35 35 41 43 43 52 52 43 43 26 24 13 24 24 33 24 24 16 32 32 24 32 35 43 47 52 52 52 52 57 57 57 57 52 52 43 43 33 35 29 28 28 35 43 43 43 43 39 33 33
33 44 43 52 43 43 35 35 35 43 43 52 57 57 57 57 39 39 35 44 31 43 33 43 43 35 35 35 43 39 39 39 43 43 52 62 62 62 62 62 45 43 43 43 43 52 43 62 43 62
62 62 62 52 62 62 62 62 52 38 38 34 34 39 43 43 52 62 62 62 43 43 33 31 43 31 43 43 52 43 43 62 62 62 62 39 43 43 62 43 29 21 11 9 9 11 33 33 43 43
31 31 31 36 38 39 43 43 62 52 62 62 62 62 62 62 52 52 43 43 43 43 52 62 62 62 62 62 43 43 43 43 43 43 39 39 38 38 24 21 12 12 11 12 11 12 15 16 20 44
43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 43 43 39 28 21 22 32 24 35 43 43 52 52 52 52 27 27 9 9 9 27 16 23 16 30 28 24 24 24 15 12 12 12 13 24
24 43 43 38 18 13 13 13 19 19 43 43 44 43 36 23 23 43 43 44 42 42 33 32 32 32 32 28 23 23 29 32 28 25 25 40 40 44 44 42 42 32 25 25 18 26 15 20 20 32
25 44 41 43 43 24 24 9 9 9 23 23 12 15 19 28 28 36 32 31 23 18 18 13 21 22 37 37 34 28 13 13 13 24 28 32 37 30 28 28 30 37 37 35 35 31 25 25 17 19
17 21 23 30 21 21 13 13 14 18 18 14 18 26 34 28 30 22 23 20 18 19 16 28 23 24 19 16 12 12 19 15 20 20 31 28 22 22 12 12 12 23 21 24 19 19 11 18 12 28
21 28 21 23 9 16 19 22 12 14 20 10 10 10 13 17 11 12 11 11 10 12 19 20 20 29 31 36 31 26 31 28 28 28 33 39 39 27 21 12 12 12 15 15 19 14 12 8 8 8
8 8 8 8 8 10 10 27 19 16 21 12 11 11 19 18 18 18 16 15 10 10 16 16 31 34 29 24 11 13 11 18 18 17 20 19 21 24 24 24 18 15 15 9 9 9 8 8 10 10
12 19 15 15 10 10 8 8 8 8 12 13 23 28 28 28 22 19 11 11 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 10 11 17 13 22 21 23 10 11 11 21 13 12 8 8 10 13 10 10
10 19 15 14 12 12 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 9 9 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 11 11 13 21 26 19 8 8 8 8 10 12 12 7 7 10 8 8 8 8
8 8 8 10 10 10 10 10 11 16 11 15 17 18 18 20 20 17 13 11 11 11 17 8 8 8 8 8 8 8 10 14 10 10 13 12 14 9 10 11 13 8 10 13 10 19 17 10 8 6
6 6 8 10 12 18 20 23 19 11 10 13 13 8 8 7 7 8 8 10 10 10 14 14 12 10 8 8 8 8 10 8 8 8 12 12 12 12 12 10 10 10 11 11 9 8 8 10 8 8
8 15 12 12 10 10 10 12 16 21 24 19 23 13 16 9 10 10 12 11 9 11 10 10 8 15 6 8 8 8 17 12 11 11 11 11 11 13 11 11 12 12 11 10 6 8 6 6 8 8
9 9 9 9 10 10 10 13 15 10 12 10 11 10 10 10 16 14 14 11 9 8 10 8 9 12 13 10 10 9 9 9 12 10 10 10 10 12 12 11 15 15 13 14 10 10 12 12 10 9
9 9 10 8 8 8 8 10 8 10 10 11 10 9 9 8 8 11 11 9 9 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 13 15 17 10 10 10 10 11 10 10 9 9 8 6 6 6 8
8 10 8 8 6 6 8 8 16 12 11 8 8 7 6 8 8 10 11 12 11 11 11 11 11 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 11 6 8 8 8 6 6 8 10 21 23 28
23 10 8 8 10 8 8 8 8 11 11 12 9 9 9 8 8 8 8 6 6 6 6 8 12 11 11 11 12 11 15 15 10 11 10 15 10 8 8 8 7 8 9 10 9 9 9 9 12 10
7 12 7 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 10 10 8 9 8 8 10 8 8 8 8 7 8 8 8 9
9 9 8 8 10 11 11 10 11 10 10 9 9 10 10 9 |