BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-176C11.T7 (MSMg01no176_c11.b1) | MSMg01-176C11.TJ (MSMg01no176_c11.g1) |
ACC | AG370932 | AG370933 |
length | 1,223 | 1,170 |
length of high quality (start - end) | 558 (133 - 690) | 625 (135 - 759) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_c11.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_c11.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:47:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_c11.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_c11.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:47:34 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | CATTCCNTTNNNNAACAGTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
CGCGGAATTCATTTCTAGACATATCACCAATAAAAGGCTTAGCTAAGNAT
TCAAACAACTTTGAAACTGTTTAATAAGCACTAGAATTGAGGCAGTAATA
AAAATATATTTGGAAAAATAAGAATCTAGCAGGCCCAGGTGGATTCAGAG
CTTGAAAGGTATCAGACCTTTCAAGAATAAGTAATATGGATTGTTTATCA
AACTCCTTCATAAACTAGAATTGGATATAATGCTACCAAGATCTTTATGA
AACCAGTGTTAGTCTGTTACCTAAACCAGATAAAGGCACAATAAAGGGAA
CAAAATTGTAGGCTATTGTGATGGTTTGTATATTCTTGGACCAGTGAGTG
GCAACATTTGTTTATGTGGCCTTGTTGGAATAGGTATGACCTGGTTGGAG
CAGGTGTGTCACTGTGGGTGTGAGCTTAAGACTCTCACTCCAGTTGATTA
GAAGTCAGTCTTCCACTAGTAGCCTTTGGTTGAAGACATAGAACTCTCAG
CTCTGCCTGCACCATGACAGCCTGGACGCTGCCATGCTCCCACCTTGATG
ATAATGGACTGAACCTCTGAACCTGTAAGCTAGCCCCAATTAAATGTTTG
TTTGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGCTTTTTTTATAAGGCCTGCCTCGGTC
ATGGTGTCTGTTCACAGCAGTAAAACCCTAACTAAGACAGCTATTAATGC
ACATAGATATAAAAATTCTCAATAATAGCTTGAAAACTGAATTCCAAATA
CATGAAAAATTATCCCCCATGATTAACTTGACTTTATTACTGGGATGCCA
TACCCAGTCAACATATGTAACTCAATAAATAGTACGTATTGTAAGTGAAC
TTATAGACAAAAATTACATGTCTTTCTAAATAGATCCCGAAAAGACTATT
GACCAAATTTCACCATCCCTTCCTGATAAAAGTCCTGAAATAAGTATGGA
ATACCAAGAACCTTTTCTCCAAAATAATAAAGGGGAATTTATTTTTAAAA
CCAGCCTCCCCGGATTTATATTATTTTTTTTCTCTTAAGGGATTTTCCCC
CTCTATTCGGGAGGTCCCCTCCTTATTCCTATTTTAAAAAGACAAACTTT
TTTAATTTACCTCTAGAATATTCCCACATGCTTCTGTGGAAGACTGGTTA
TAAAAAGAGAATTTCTTTCAAGG
| CCCAATCTTNTTNTTTAGATGTGAGCCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCCTAAAACCGCCTTCCTTGGN
GATGAACAGCAGTATGGAACCTTAAACTGACCTAACCCTTTCCTCTCCAA
CTTGCTTCTTGGCCGTGATGTTGGTGCAGGAATAGAAACCCTGACTAAGA
CAGTAGGTTTTGTTGATGGATCATTTAAATATCTTAACTAATGCCATGTC
TTCCATTCTGGTTGACCTGTAACTTCTCAGACTTCTCCTACTCTGATTCT
GGCCTTGCCCATGTGTCTTGAATCAGCCAGTGGGAAAGTAGTTAACTACA
TGTAAGTAGAAGCTTGAAGTACCTCTGAGTATTTCCACTGCCACTCACAT
GTAGTGTTGATTTCTAGCTGACACTCTTCCATACTTTTAAATGTACTGAC
AGGCACCTATCTGTATCCCTACTTAACAGGCTTCTACTGCCAGGACATGA
CATTGTGTCATCTCATAGGGAAGTTAGGGTTCATAAAGGGTTGCTACATC
CCAGTCCCACCCCTTTCCCTGACTTCTGCCTGGGAATCCTAGAGCCTGGC
TGCAAAATCATGCTATGTACTACTCTCGACCTCAGTATATTAGTTTGCTT
CTATGCTGCTGCAATGAAAGACTGACCTCAGTAACTTAGGGAAGAGTTTA
TTTGGCTTAAAGGTTCCAGGCCATCATCCGGAGAGGGCACCTTTGGAGCT
CAATTCAGGAACCCACAAGCATGAATGGAAGCAGATCTGGTGGAGGAATC
TTGCATAATAATGTATTTGATAGGAAAAGTATAAACTCCCGGTGTGAAGC
TTTACAGTTTACGAATGACTTCCTATCTGTACAGAAATTTTGCTGATCTA
TATAGAACTTTGAACTCCAGGAAAATTTTGGCGTACGGAAGTGCTTTTTA
TTTTTCAAGTTCCTTTATAAAATAAATTTTTTATCTTCAGAAAACTCCTA
CCTTTTAACACTATATCAATTATCTTCCCCTAAAATTATTCTTCCCTCGG
GCCCCTCACCAAAGGTGCTAAACTGGGCACACAAAACCCTCCCCTCCAAT
TTATACCAACTATTATAAACCCCTCTCAATATTGTGGGCCTTTTTTGAAC
TCCTCCTCACTTGCGCCGGG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 3 0 3 3 0 0 0 0 3 10 9 6 6 6 8 8 9 13 10 8 8 8 8 8 13 22 19 8 8 8 8 10 13 24 28 42 33 32 33 33 33 36 42 48 48
50 43 50 53 47 47 43 43 47 47 47 50 38 35 35 31 31 30 30 42 41 39 23 21 9 9 9 9 9 9 9 12 11 8 8 8 8 8 10 10 9 9 10 21 19 18 3 0 3 25
27 44 47 47 50 59 44 44 44 31 31 31 33 33 21 21 9 9 9 9 9 9 10 9 10 10 17 17 12 12 11 12 11 21 25 43 47 50 50 50 48 48 43 39 36 39 44 44 53 53
53 53 50 50 50 53 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 50 48 48 47 47 47 57 57 59 59 59 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59
59 57 57 43 43 37 50 50 57 57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 46 43 43 43 43 43 47 59 54 54 57 59 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 57 57 68 57 57 68 68 68 68 54 54 54 57 57 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 57 57 57 57 50 50 50 50 50 48 48 48 48
48 48 48 48 47 47 27 25 10 10 9 9 9 11 18 25 28 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 57 48 48 48 48 48 50 50 48 48 43 43 48 48 57 25 26 11
11 11 25 21 32 41 43 43 43 43 47 47 47 59 47 57 44 43 41 42 37 37 42 42 57 47 57 59 59 54 54 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 54 57 57 57 57 57
59 59 50 50 54 57 59 59 52 52 57 59 59 57 52 52 57 52 52 59 52 52 54 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 68 57 57 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 27 27 11 12 12 38 38 59 57 52 52 52 57 57 57 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 54 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 54
54 59 57 57 57 43 46 43 43 48 59 59 59 59 59 57 48 48 50 50 48 48 43 28 24 12 12 12 27 27 48 57 48 48 48 43 23 23 11 11 12 23 23 23 11 11 9 12 13 15
19 24 34 32 35 35 43 43 48 43 39 39 30 30 30 37 37 39 35 35 35 39 39 37 37 32 34 26 23 16 18 19 22 25 20 23 20 24 24 28 30 15 20 18 30 23 23 9 11 9
12 12 18 18 23 23 11 12 11 13 13 17 30 30 30 30 15 15 15 19 15 32 34 59 59 47 35 18 13 9 9 9 15 9 11 11 16 21 25 9 9 9 8 8 8 10 19 8 8 8
8 12 13 28 22 37 25 14 14 10 11 11 12 9 10 11 9 11 12 22 17 15 20 20 19 10 6 6 8 22 24 13 13 8 8 8 15 9 10 10 10 9 8 8 8 15 15 10 10 10
12 8 8 8 8 9 10 9 9 9 8 11 8 8 8 10 8 11 15 16 21 12 12 12 12 12 18 26 15 15 15 12 10 10 10 12 12 13 8 8 8 8 19 11 12 10 11 10 9 12
12 15 15 17 11 12 12 13 23 28 34 22 25 18 14 18 18 19 24 18 18 20 24 25 21 15 14 10 15 8 8 8 15 8 8 8 8 10 10 14 14 11 8 8 8 8 8 10 10 14
8 12 8 8 8 8 9 23 13 10 9 9 10 9 9 8 8 8 8 11 13 11 10 11 9 9 8 8 9 9 11 10 13 9 9 9 8 8 8 8 8 8 16 15 10 8 8 9 8 8
10 8 8 8 8 10 14 15 11 10 10 10 11 12 21 10 10 10 10 11 13 13 12 15 13 8 10 8 9 9 11 12 10 13 9 10 9 8 17 8 11 11 13 12 11 11 12 13 18 13
12 8 8 8 8 10 8 8 8 8 7 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 11 15 11 12 15 15 15 11 10 10 10 8 6 7 7 10 9 9 9 9 10 8 10 12 12 12 17 9
9 8 8 8 8 8 7 6 8 6 9 9 8 8 13 15 10 10 8 8 8 10 13 14 9 9 10 10 15 12 12 15 8 9 9 9 10 10 10 10 8 8 8 6 6 6 7 12 17 37
19 17 7 6 6 6 10 10 8 8 8 8 6 11 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 6 6 8 9 11 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8
8 6 10 8 9 8 8 8 8 8 10 10 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 6 | Open.Hide. 9 9 8 8 8 8 8 8 3 0 3 3 0 3 7 7 7 9 7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 7 17 10 9 6 6 6 6 8 7 9 8 8 10 8 8 8 19 11 12
8 17 15 28 28 35 35 34 31 33 28 29 29 35 35 36 36 53 50 50 50 59 42 32 27 18 11 12 10 10 10 10 9 12 13 18 12 9 8 8 8 8 10 23 18 27 21 21 3 0
3 23 23 37 37 37 50 50 50 33 31 31 30 28 25 21 23 10 10 9 10 10 11 13 13 10 11 10 12 10 12 10 8 8 13 19 39 44 50 50 50 53 53 53 53 53 53 53 53 53
50 48 50 50 47 51 51 47 47 43 57 59 57 51 47 50 50 50 50 68 68 50 50 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 59 59 48 57 47 57 57 47 47 42 42 42 47 54
57 57 57 57 44 44 32 41 41 44 44 57 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 59 57 57 57 52 57 52
57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 52 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59
57 57 57 57 52 52 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 48 48 57 57 57 57 57 48 47 42 44 42 42 42 37 37 42 47 59 57 57 59 59 59 57
54 57 57 59 48 44 44 43 43 57 43 43 48 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 54 54 54 54 68 68 48 57 48 48 48 59 48 48 48 59 57 57 59 59 59 59 59 59
59 59 41 34 28 18 23 11 10 9 9 10 11 9 11 21 21 37 39 46 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 48 48 48 43 43 43 43 59 43 43 43 43 36
43 59 59 48 42 42 39 39 48 57 48 57 54 54 57 59 59 59 57 57 57 57 46 46 43 44 47 57 59 59 59 59 59 57 57 43 43 43 57 44 47 44 43 43 43 50 50 48 50 50
57 57 57 57 57 57 50 48 52 57 57 59 59 57 57 57 59 57 57 43 43 52 52 52 52 59 52 52 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59 59 59 52 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 59 44 43 38 31 31 43 44 57 57 59 59 54 54 57 59 50 43 35 35 35 44 44 43 36 38 38 38 43 43 43 43 43 33 33 33
43 43 43 43 43 33 29 29 44 36 43 44 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 57 57 57 57 47 44 44 39 42 23 19 9 9 9 9 17 34 57 46 59 39
35 35 47 59 59 54 59 59 43 39 39 35 43 43 48 48 54 57 48 48 48 48 43 48 46 46 43 39 30 24 24 24 23 28 33 37 37 32 32 30 29 29 28 28 30 30 28 31 35 37
37 37 37 33 36 36 37 39 32 28 23 32 28 33 33 59 47 43 43 43 43 43 25 24 11 11 11 26 23 33 33 28 28 28 37 30 26 14 18 18 21 10 10 10 11 11 22 34 34 43
39 32 32 22 23 16 14 14 14 17 15 20 22 19 17 9 9 9 9 17 17 22 20 17 16 23 12 10 15 10 10 10 15 12 12 22 22 24 17 22 23 20 20 23 28 31 28 21 17 11
11 11 19 17 12 12 12 12 12 12 16 18 18 18 14 23 19 22 22 11 11 8 10 10 9 18 23 28 28 28 25 19 11 9 9 9 10 10 15 10 14 12 8 8 8 8 8 8 8 8
19 21 13 14 10 11 10 8 9 10 11 8 10 8 8 10 13 8 8 8 10 11 10 10 8 8 8 8 9 12 6 6 8 8 9 15 14 15 14 13 14 14 11 11 14 19 11 8 8 8
10 10 10 7 7 9 9 10 15 22 12 14 9 9 9 9 10 10 10 8 7 8 8 8 9 12 14 16 14 8 8 8 6 10 6 6 6 6 9 9 10 10 11 10 9 11 9 12 13 14
20 15 15 8 8 8 8 10 16 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 16 13 13 8 10 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 10 8 9 9 9 9 10 9
9 9 11 10 10 10 9 10 12 8 8 10 10 10 13 10 10 10 12 12 9 8 8 12 11 8 8 9 8 9 9 9 12 10 10 8 8 8 8 8 8 11 11 13 8 8 8 8 8 10
11 10 11 10 11 6 6 8 8 8 8 11 10 9 9 9 8 8 8 8 12 11 11 10 9 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 11 11 11 12 12 9 9 8 8 11 10
10 10 8 6 6 6 8 8 8 6 8 8 8 6 6 8 8 9 9 11 8 8 8 10 8 8 6 6 8 10 6 6 8 8 8 6 6 6 6 10 10 16 10 11 11 10 9 9 9 9
9 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 11 9 8 6 6 6 6 8 6 |