BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-176H15.T7 (MSMg01no176_h15.b1) | MSMg01-176H15.TJ (MSMg01no176_h15.g1) |
ACC | AG371163 | AG371164 |
length | 1,277 | 1,265 |
length of high quality (start - end) | 689 (87 - 775) | 381 (69 - 449) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_h15.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_h15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:16 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_h15.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_h15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:16 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TATCCTNNNNNAACACTGGGCGNATAGACTCCTAAGGGAGXXXXXXXXXX
XXXXXXXXTAGCCTTCTTTGGCCCTTTTAATGGACATCTGTGACTCAATT
TACATGTGGAAGTTCTATTACACACATGCTTCATTTAGTTAAATACGTAT
ACAGGTGGAAGTTACTATATCTCTTGCCCTTTGCCTTGCAAATTCCACTC
AATCAATGCCAAGAACAGAACTAAGAAGACATGTTCACCTCTCTTTCCCT
TCACATTCAATGTGACTCAGTTGTGACCCTGAAAGGACAGTACATTCCAT
CTGTCTCACACCTGCCTGGTGTCTGGGATCCATCTCTGGGATTGACAGCA
TCTGTGTCCTCTGATTTCTACTCTTTAGAAAAAAAAAATCAATGCCCACA
TCATATTGTTAACCTTTCAAAAAGCTCAAGAAGAGTGACAAGAAAGCAAA
ATTGCTCCCAGGGAGCTTCAATTGCTGGTGAAAGGCTGATCCAATAAGAC
CTCCTGGCAGAAAGCACAGACATTCCAGGTCATTCCAAATGCCTGTGACA
ATATGTCAGTACACTGTCTGACTGCGTGTGTAGTAGTGACTCTTAATATG
GTTATTTACTAACCATGTGTTGCCATGGAAACAAGGTAAAGCAACATGCT
CTTGAGACACAGAGACTTAGCATGTTAGAGAGGTGGTGCCTAAATCCCAT
TCTACAGCCAGTACGCTGTTCACACAGGCAGACCACACCCCTCTAGGCCT
CCTATTCTTCCTTGGGACATGAGAACCCTGTAGCCACTCATCCTCAAGAC
ATGGTATCCGCTCTCCTCTTGTATTTGAGAAGCATATCATTCTGAGGCTA
AAGGGCGGAGCCAGCCATCTTCTTGACCGGTTGGGCTTACAATTATGTAC
TTGACAAATCTCCAACATGTTTGAACCAGAGAGGAATACGTAAAATTCCT
TCTATGATGCTCTGGTACTCCTGCTTATTGAATTAAATAAACATACTTAC
TTACTTTAATTCCTAACGTTTTGCAGATCAAAAATTTAAAATAATGTTCT
AAAATCCCAATGCTTTCTTTGATTCCTGTTAAATTTGAAATCTTAAGATA
TTGTGTTAACCCTAATCCTTATTGGTTCCCTGAATTTCTTTAAACCTATT
TAAATTTTATCCCTCTTTCATAAAACCGTACTTTCTAAATAAANCCTACT
TCTCTTTAACCCTCTATATATACAATCTTTTTATTATAATACTAATGTTC
GCTGAATTATTCTCTCCCTCCTTATTA
| NNTTATGACGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXATAGCCACTGAGGCTCTCTGTAGAGGATCTGC
ACAAGATCAAATCAGTCAAACCTTTTAACATGGAGTGAGAGCGGCTCCTG
AGGCCCCACATCCAGCTGAAGAGCTACTGGTGGTTGGTAGAGACTGGAGG
AGAAGAAAAATCACTTTTCTTTGAGGGTGGGGGAGGTGATTACTTGCAGG
GTGCCCATGACTCACTGGAAGACACCCCCATATGAGTAGCACTAATTGGA
TACAGTGTATTATTAAACATAAACAAACAAACAAAAAACAAAACGAACAA
ATAAAAATAAATCTCCCTCAATTGGGAGGGAGATGTGTATAATTGTAAGG
TTTCGGCCTGCTTGCTCCTGTTGTGCGTTATTACTTAAATTAGGAAGACT
TGTTTTTTTCTCCCCCCCCATTACCTGCTTCCCCCCTCATAAAAAAAAGG
GGGGTAATAAACCTCATTTTCCTTATCCCATCTATTTTCCTAGGAGTTTA
TCTAGTGTCTGTGCTAAACCATAAAAGCCATTGCAGCTGTAGTCAATTGT
CCTGATGCATAGTGCTGATTGTGCAGAGACATCTCTTAGATCAACAGCTT
GGCTTTATGAATACTTTCCCCAAACATTACGTAAGTGACATTAACCTACA
GCCACTTAATACTTCCTATTGTAATTGCTTATTATCATTATTATTATCAT
TATTATTACTATTACTATTATTATCCTTTCCTTCATGGCTTTCGTCCCTC
CCCTCTCCTCTCCTTCCTCCTCTCTTCTCTCCTCTTCTCCTCCTCTCTTT
TTCTCCCTACCTTTCTCCTCTCTTTTTCTTTTTCTTCCTCTTTTCTTTTC
TTTCTTCTTCTTTCTCTTCTTCTCCCTTTTCCCTCTCCCTCCTCTCTTTT
CTCTTTTCTTTTCCTTTTCTTCTCTTTTTTCTTTTCTTTCTTCTCTCTCT
TCTTTCTCTTCCTCTTCTTTTTTTCTTTTTCTTTCTCTCTTATTTTTCTC
CTCTCCTTCCTCCCCTTCCTCTCCTATTCTCCTTTCTATCTCTTTCATCC
ATCCTCCTCCTTCTTCCCTCCTCTCCCCTCTTTTCTTTCTTTCCTTTATT
GCCCACTCTCATTTCATATTTTTCTCTCCTTCTCCACTCTTCCTTCATCT
CCTCTCTTCTTTTCTCCTTCCCCCTCTTCCTATTCCCTTTCCTCTTTTCT
CTCCTCCCTCACCTT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 8 8 9 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 7 7 8 8 8 9 3 0 3 8 8 8 13 17 10 8 8 8 8 8 8 21 21 22 29 29 33 33 33 33 33 33 39 37 39
39 36 18 15 10 9 9 15 21 37 37 37 48 46 46 47 37 25 22 8 8 8 8 9 9 11 17 12 17 10 10 11 15 11 11 11 23 21 29 31 31 31 31 31 36 36 38 53 53 50
50 47 47 36 28 28 28 28 26 30 23 21 10 10 10 10 8 8 8 10 17 33 33 30 22 22 22 31 31 28 28 28 37 33 36 42 28 28 28 42 42 50 48 54 48 48 42 42 47 48
48 48 47 48 48 57 48 48 48 57 47 47 47 50 50 47 46 46 46 50 46 57 57 57 57 54 57 57 59 57 57 57 54 54 57 57 57 54 54 54 54 57 59 57 57 57 57 57 50 48
48 57 57 54 54 50 57 48 57 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52 57 57 50 50 37 50 50 43 43 52 59 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 39 39 39 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 41 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 39 38 23 14 14 24 29 26 27 43 44 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 45 62 44 62 62 62 45 43 43 62 52 43 43 39 43 43 62 52 62 62 62 62 62
62 62 62 62 57 57 57 57 57 45 45 45 52 52 52 52 44 44 35 35 35 43 43 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 59 59 57 57 57 57 57 59 57 52 52 37 57
57 57 59 59 59 43 32 32 27 44 43 50 50 52 52 52 52 43 43 35 43 43 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 54 54 59 59 57 59 48 48 50 50 37 37 42 42 42
43 59 59 57 48 44 44 44 33 33 33 44 44 48 48 48 48 48 57 59 57 59 57 57 43 43 43 46 46 37 37 35 40 44 35 35 35 44 37 46 54 54 59 59 59 43 43 43 47 42
47 39 39 43 43 57 48 48 43 43 36 36 36 43 43 48 48 48 43 39 39 36 36 37 34 34 25 25 32 34 34 39 39 39 39 37 37 30 32 32 35 35 37 37 43 43 34 34 34 34
34 48 37 37 16 16 12 16 16 27 23 30 24 29 19 31 23 26 15 15 15 28 26 34 30 30 17 17 20 24 23 28 28 28 31 31 33 28 32 32 37 30 30 27 27 28 29 31 37 37
37 39 39 39 35 30 28 28 18 18 14 15 18 21 15 18 18 32 32 36 40 30 28 23 23 20 18 27 23 28 19 19 19 19 25 28 33 33 33 33 33 39 28 37 28 34 28 36 28 30
23 29 32 30 34 28 28 28 36 36 41 37 30 21 18 14 14 23 30 25 34 28 28 18 21 18 18 14 16 17 17 11 11 11 18 21 37 37 41 41 41 41 41 39 37 29 21 25 17 19
19 21 18 11 11 13 20 21 21 26 15 15 10 9 11 23 23 15 12 16 12 12 14 22 28 25 28 14 14 14 16 17 8 10 12 13 13 9 13 11 16 16 20 23 18 16 16 18 14 23
19 16 14 11 13 11 8 8 8 8 8 10 13 34 32 23 21 19 19 21 13 14 12 17 15 15 12 15 8 8 8 8 8 9 10 9 22 18 15 11 19 15 13 13 15 20 13 13 12 15
19 25 19 30 22 17 14 12 12 13 19 19 10 17 11 10 10 8 8 8 25 21 14 9 9 9 9 9 9 11 16 17 19 18 16 17 10 8 8 8 8 8 10 9 8 10 12 10 12 10
17 10 10 10 10 15 15 23 21 12 8 8 10 8 8 10 11 12 12 10 10 17 15 12 12 12 17 14 12 12 9 8 8 6 6 8 8 9 10 10 12 16 11 9 9 9 9 10 10 8
8 8 8 10 10 16 10 10 8 8 8 6 8 8 8 8 8 10 10 21 19 16 12 8 9 8 8 8 7 6 11 10 22 18 16 17 19 19 12 13 10 10 10 6 6 8 10 10 8 6
6 7 8 9 10 10 10 12 11 10 10 10 9 9 10 11 11 11 15 10 10 9 9 10 9 9 10 10 10 10 10 9 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12
12 8 6 6 8 8 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 6 6 12 10 15 10 10 12 10 9 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 9 10 10 11 11 11 8 8 6 6 8
8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 14 10 8 8 12 8 8 8 12 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 6 6 6 6 6 8 8 11 11 18 3 0 3 6 6 6 6 8
8 10 9 9 8 10 10 10 10 10 11 10 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 6 6 6 8 10 10 10 9 9 8 8 6 9 8 8 8 6 6 10 10 10 10 6 6 6 6
6 8 6 9 9 10 10 14 10 9 9 12 12 14 14 11 11 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 10 9 7 9 9 9 10 13 8 8 9 8 11 11 19 19 19 10 10 10 15 21 29 28 28 28 35 35 35 34 34 34 37 39 39 43
48 48 48 43 57 48 43 43 43 33 33 40 43 43 39 39 32 22 12 12 12 32 32 34 34 34 36 36 48 48 47 42 42 42 42 36 42 38 19 15 17 20 31 32 57 57 44 42 39 35
42 42 57 57 57 44 44 37 37 37 43 43 41 38 50 50 47 47 48 27 27 15 21 24 15 27 24 38 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 43 43 43 43 43 50
50 59 59 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 52 45 45 52 52 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 43 39 57 57 57 59
62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 31 31 31 43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 57 59 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 37 37 39 57 57 57 52 52 57 57 59 59 57 54 54 57 59 52 52 52 57 54 54 54 59 57 52 52
50 59 50 50 39 39 39 59 50 68 57 68 57 57 57 50 48 48 50 57 57 54 48 42 42 35 35 31 31 36 37 44 47 48 48 59 48 48 48 57 57 59 57 57 57 57 48 44 44 47
59 59 59 54 54 54 54 54 48 42 41 28 41 41 43 48 41 41 24 32 32 48 59 48 59 59 43 37 32 25 25 29 34 43 47 50 59 48 48 57 48 48 59 59 47 30 23 15 12 12
12 12 12 11 11 15 16 30 34 46 48 48 59 48 48 48 57 48 48 48 59 59 29 23 15 15 15 27 32 48 57 48 48 57 59 59 47 43 43 43 59 59 48 47 34 28 28 20 22 22
9 9 9 10 10 19 11 13 8 8 6 6 8 7 8 9 9 9 7 8 9 19 29 59 46 39 30 28 23 18 18 13 12 8 13 8 8 8 8 10 9 11 12 13 13 16 14 15 12 10
12 8 8 8 10 11 18 24 38 32 20 32 32 59 59 59 59 59 47 48 48 59 59 59 59 59 48 57 48 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 48 43 43 37 37 44 32 27
18 15 15 23 21 30 32 36 36 27 32 13 13 15 18 24 20 28 26 33 33 42 44 43 43 43 44 47 48 48 42 44 42 31 31 35 35 42 35 44 36 35 32 30 30 35 42 44 44 44
37 39 32 44 25 19 19 21 24 37 39 29 32 17 22 23 37 37 43 32 23 11 11 9 15 15 16 30 30 39 23 21 21 19 25 17 19 10 10 10 20 19 22 26 19 15 15 18 23 27
24 20 20 24 29 37 37 37 32 25 22 24 30 32 39 39 40 40 34 32 25 30 23 23 23 23 34 30 30 19 15 15 19 19 24 28 26 26 12 12 10 12 11 14 20 32 26 26 17 17
15 18 10 10 10 10 13 11 15 17 19 23 30 31 33 37 34 28 26 28 19 17 12 10 8 8 8 8 8 13 17 29 23 19 11 12 12 15 22 19 18 18 14 23 19 18 11 11 11 11
17 18 15 13 13 11 11 11 16 15 23 11 13 6 6 8 8 10 8 13 13 11 11 11 13 12 8 8 8 8 7 10 6 6 8 8 8 8 8 8 17 11 8 8 6 6 8 8 6 7
12 12 14 12 10 7 6 8 8 8 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 8 10 9 9 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 7 9 10 8 13 10
11 11 11 11 10 9 13 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 9 9 9 10 15 13 11 11 10 10 10 10 9 9 9 10 10 10 11 10 10 10 8 8 8
8 8 8 8 8 12 8 10 8 8 11 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 13 11 8 8 6 7 10 8 12 8 10 9 9 7 7 8 8 8 8 8 11 15 10 10 8 9 10 10 9
10 10 10 10 12 11 11 11 11 8 8 12 8 6 7 8 8 8 8 9 9 8 8 7 7 8 8 11 11 11 11 10 10 8 8 6 6 10 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 13 12
10 9 10 8 8 8 8 8 10 8 9 9 10 15 9 10 10 10 10 15 9 8 8 10 12 10 10 10 10 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 9 9 9 10
9 12 12 13 8 8 8 8 10 10 10 9 8 8 10 10 10 8 6 6 8 8 8 9 9 8 10 8 8 8 10 15 15 12 10 10 10 9 9 8 10 8 8 8 8 8 7 6 8 8
8 8 8 8 8 10 10 7 6 8 8 8 12 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 7 8 8 8 8 6 6 8 13 26 19 10 8 6 6 8 10 10 9 8 8 8 8 10 10 9
11 9 11 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 12 9 10 8 8 8 8 8 8 7 7 7 6 8 8 9 8 8 8 15 15 10 10 8 11 7 6 8 8 8 8
8 10 8 10 9 8 8 7 6 8 8 6 6 7 11 15 8 8 14 15 14 14 10 13 15 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 12 12 10 10 10 13 10 10 10 13 10 10 8 11 11
14 15 10 8 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 6 |